MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 4115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002944	GCAGC	2	10	1841764	1841773	20 %	0 %	40 %	40 %	41407782
1502	NC_002944	CGCGG	2	10	1842556	1842565	0 %	0 %	60 %	40 %	41407782
1503	NC_002944	GCCGA	2	10	1843392	1843401	20 %	0 %	40 %	40 %	41407783
1504	NC_002944	CGGCC	2	10	1846790	1846799	0 %	0 %	40 %	60 %	41407785
1505	NC_002944	GATCT	2	10	1849076	1849085	20 %	40 %	20 %	20 %	41407786
1506	NC_002944	ACCCA	2	10	1849614	1849623	40 %	0 %	0 %	60 %	41407787
1507	NC_002944	CGCGC	2	10	1850142	1850151	0 %	0 %	40 %	60 %	41407787
1508	NC_002944	TCGCC	2	10	1850940	1850949	0 %	20 %	20 %	60 %	41407788
1509	NC_002944	CGGCC	2	10	1851036	1851045	0 %	0 %	40 %	60 %	41407788
1510	NC_002944	CGGCA	2	10	1852293	1852302	20 %	0 %	40 %	40 %	41407790
1511	NC_002944	GCTGG	2	10	1853026	1853035	0 %	20 %	60 %	20 %	41407791
1512	NC_002944	CGCTG	2	10	1854415	1854424	0 %	20 %	40 %	40 %	41407792
1513	NC_002944	CGCTG	2	10	1854483	1854492	0 %	20 %	40 %	40 %	41407792
1514	NC_002944	GATTC	2	10	1854742	1854751	20 %	40 %	20 %	20 %	41407792
1515	NC_002944	GCCGG	2	10	1855764	1855773	0 %	0 %	60 %	40 %	41407793
1516	NC_002944	GGTCG	2	10	1856469	1856478	0 %	20 %	60 %	20 %	41407794
1517	NC_002944	GCCGC	2	10	1856607	1856616	0 %	0 %	40 %	60 %	41407794
1518	NC_002944	GCGCC	2	10	1857133	1857142	0 %	0 %	40 %	60 %	41407795
1519	NC_002944	ACACC	2	10	1857420	1857429	40 %	0 %	0 %	60 %	41407796
1520	NC_002944	GGCAC	2	10	1857605	1857614	20 %	0 %	40 %	40 %	41407796
1521	NC_002944	CTGCA	2	10	1858479	1858488	20 %	20 %	20 %	40 %	41407797
1522	NC_002944	GGGCC	2	10	1858592	1858601	0 %	0 %	60 %	40 %	41407797
1523	NC_002944	GCCTG	2	10	1858669	1858678	0 %	20 %	40 %	40 %	41407797
1524	NC_002944	CGATT	2	10	1859010	1859019	20 %	40 %	20 %	20 %	41407797
1525	NC_002944	CGCGG	2	10	1859186	1859195	0 %	0 %	60 %	40 %	41407798
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1527	NC_002944	CGGCG	2	10	1860427	1860436	0 %	0 %	60 %	40 %	41407799
1528	NC_002944	GGTCA	2	10	1861087	1861096	20 %	20 %	40 %	20 %	41407799
1529	NC_002944	CGCGG	2	10	1861686	1861695	0 %	0 %	60 %	40 %	41407799
1530	NC_002944	CAGTT	2	10	1863476	1863485	20 %	40 %	20 %	20 %	41407802
1531	NC_002944	GCTGC	2	10	1863953	1863962	0 %	20 %	40 %	40 %	41407803
1532	NC_002944	CTGGA	2	10	1864646	1864655	20 %	20 %	40 %	20 %	41407804
1533	NC_002944	CTTGC	2	10	1866727	1866736	0 %	40 %	20 %	40 %	41407807
1534	NC_002944	GCGCG	2	10	1871526	1871535	0 %	0 %	60 %	40 %	41407811
1535	NC_002944	GGTGG	2	10	1872607	1872616	0 %	20 %	80 %	0 %	41407812
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1537	NC_002944	GGCCA	2	10	1876196	1876205	20 %	0 %	40 %	40 %	41407814
1538	NC_002944	CGCGG	2	10	1877034	1877043	0 %	0 %	60 %	40 %	41407815
1539	NC_002944	GCACG	2	10	1877147	1877156	20 %	0 %	40 %	40 %	41407815
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1544	NC_002944	CAGTG	2	10	1886984	1886993	20 %	20 %	40 %	20 %	41407824
1545	NC_002944	GCTGA	2	10	1891279	1891288	20 %	20 %	40 %	20 %	41407827
1546	NC_002944	TTGCG	2	10	1892432	1892441	0 %	40 %	40 %	20 %	41407828
1547	NC_002944	TGCGC	2	10	1893288	1893297	0 %	20 %	40 %	40 %	41407829
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1549	NC_002944	CACCC	3	15	1894759	1894773	20 %	0 %	0 %	80 %	41407831
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1551	NC_002944	CTGGC	2	10	1897404	1897413	0 %	20 %	40 %	40 %	41407833
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1553	NC_002944	CGGGG	2	10	1899643	1899652	0 %	0 %	80 %	20 %	41407836
1554	NC_002944	CCGGC	2	10	1899798	1899807	0 %	0 %	40 %	60 %	41407836
1555	NC_002944	GGCCC	2	10	1900404	1900413	0 %	0 %	40 %	60 %	41407836
1556	NC_002944	CATGA	2	10	1900910	1900919	40 %	20 %	20 %	20 %	41407836
1557	NC_002944	CGTCC	2	10	1902074	1902083	0 %	20 %	20 %	60 %	41407836
1558	NC_002944	ATGCG	2	10	1902927	1902936	20 %	20 %	40 %	20 %	41407837
1559	NC_002944	ACCGA	2	10	1905163	1905172	40 %	0 %	20 %	40 %	41407839
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1568	NC_002944	CCGCG	2	10	1913775	1913784	0 %	0 %	40 %	60 %	41407848
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1572	NC_002944	CGCGG	2	10	1918711	1918720	0 %	0 %	60 %	40 %	41407853
1573	NC_002944	CGGTC	2	10	1919710	1919719	0 %	20 %	40 %	40 %	41407855
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1581	NC_002944	GGCCG	2	10	1927859	1927868	0 %	0 %	60 %	40 %	41407863
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1598	NC_002944	GGCCG	2	10	1954962	1954971	0 %	0 %	60 %	40 %	41407890
1599	NC_002944	GGTGT	2	10	1955158	1955167	0 %	40 %	60 %	0 %	41407890
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1604	NC_002944	GGGCT	2	10	1964986	1964995	0 %	20 %	60 %	20 %	41407894
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1610	NC_002944	GCCCG	2	10	1967994	1968003	0 %	0 %	40 %	60 %	41407894
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1998	NC_002944	ACGCG	2	10	2375105	2375114	20 %	0 %	40 %	40 %	41408242
1999	NC_002944	CGGAA	2	10	2376358	2376367	40 %	0 %	40 %	20 %	41408243
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