MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 4115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002944	ACGCC	2	10	1227384	1227393	20 %	0 %	20 %	60 %	41407267
1002	NC_002944	CGGCC	2	10	1227754	1227763	0 %	0 %	40 %	60 %	41407267
1003	NC_002944	CGGCG	2	10	1227925	1227934	0 %	0 %	60 %	40 %	41407267
1004	NC_002944	GCAGG	2	10	1229239	1229248	20 %	0 %	60 %	20 %	41407268
1005	NC_002944	GCCGC	2	10	1231721	1231730	0 %	0 %	40 %	60 %	41407270
1006	NC_002944	GCCAA	2	10	1234215	1234224	40 %	0 %	20 %	40 %	41407274
1007	NC_002944	GAACC	2	10	1234382	1234391	40 %	0 %	20 %	40 %	41407274
1008	NC_002944	GCGCC	2	10	1238004	1238013	0 %	0 %	40 %	60 %	41407276
1009	NC_002944	AGGCC	2	10	1238442	1238451	20 %	0 %	40 %	40 %	41407276
1010	NC_002944	CCTGG	2	10	1241410	1241419	0 %	20 %	40 %	40 %	41407279
1011	NC_002944	CAGCG	2	10	1242925	1242934	20 %	0 %	40 %	40 %	41407281
1012	NC_002944	CCGGG	2	10	1245450	1245459	0 %	0 %	60 %	40 %	41407283
1013	NC_002944	GGCCG	2	10	1245847	1245856	0 %	0 %	60 %	40 %	41407283
1014	NC_002944	GCCAG	2	10	1246032	1246041	20 %	0 %	40 %	40 %	41407283
1015	NC_002944	GGGCC	2	10	1246144	1246153	0 %	0 %	60 %	40 %	41407283
1016	NC_002944	GCAGC	2	10	1246213	1246222	20 %	0 %	40 %	40 %	41407283
1017	NC_002944	TCGCT	2	10	1247226	1247235	0 %	40 %	20 %	40 %	41407285
1018	NC_002944	ATGCG	2	10	1248337	1248346	20 %	20 %	40 %	20 %	41407285
1019	NC_002944	GCCGA	2	10	1248961	1248970	20 %	0 %	40 %	40 %	41407286
1020	NC_002944	GGCGC	2	10	1249668	1249677	0 %	0 %	60 %	40 %	41407286
1021	NC_002944	GCGCC	2	10	1251799	1251808	0 %	0 %	40 %	60 %	41407288
1022	NC_002944	CCCGG	2	10	1252204	1252213	0 %	0 %	40 %	60 %	41407289
1023	NC_002944	GCTGG	2	10	1252228	1252237	0 %	20 %	60 %	20 %	41407289
1024	NC_002944	CTTCG	2	10	1254117	1254126	0 %	40 %	20 %	40 %	41407292
1025	NC_002944	CGCGG	2	10	1255188	1255197	0 %	0 %	60 %	40 %	41407293
1026	NC_002944	CGGCC	2	10	1257059	1257068	0 %	0 %	40 %	60 %	41407295
1027	NC_002944	CCGCG	2	10	1257134	1257143	0 %	0 %	40 %	60 %	41407295
1028	NC_002944	TGGAC	2	10	1257395	1257404	20 %	20 %	40 %	20 %	41407295
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1031	NC_002944	CGCGC	2	10	1259947	1259956	0 %	0 %	40 %	60 %	41407298
1032	NC_002944	GCCGC	2	10	1260687	1260696	0 %	0 %	40 %	60 %	161611206
1033	NC_002944	CGATG	2	10	1261023	1261032	20 %	20 %	40 %	20 %	161611206
1034	NC_002944	GCGCC	2	10	1261478	1261487	0 %	0 %	40 %	60 %	161611206
1035	NC_002944	CCCAG	2	10	1262279	1262288	20 %	0 %	20 %	60 %	161611206
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1037	NC_002944	ACCGC	2	10	1268848	1268857	20 %	0 %	20 %	60 %	41407305
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1039	NC_002944	GGCCG	2	10	1271757	1271766	0 %	0 %	60 %	40 %	41407308
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1041	NC_002944	TTGCG	2	10	1272932	1272941	0 %	40 %	40 %	20 %	41407309
1042	NC_002944	CGGCG	2	10	1273202	1273211	0 %	0 %	60 %	40 %	41407310
1043	NC_002944	GCCGA	2	10	1273392	1273401	20 %	0 %	40 %	40 %	41407310
1044	NC_002944	TTGCC	2	10	1277345	1277354	0 %	40 %	20 %	40 %	41407315
1045	NC_002944	GCCGC	2	10	1280378	1280387	0 %	0 %	40 %	60 %	41407320
1046	NC_002944	GCTCG	2	10	1282052	1282061	0 %	20 %	40 %	40 %	41407321
1047	NC_002944	GCCCC	2	10	1284145	1284154	0 %	0 %	20 %	80 %	41407323
1048	NC_002944	GGCCG	2	10	1285316	1285325	0 %	0 %	60 %	40 %	41407323
1049	NC_002944	GGCGC	2	10	1288568	1288577	0 %	0 %	60 %	40 %	41407325
1050	NC_002944	CGGCG	2	10	1288889	1288898	0 %	0 %	60 %	40 %	41407326
1051	NC_002944	GGGCC	2	10	1289375	1289384	0 %	0 %	60 %	40 %	41407326
1052	NC_002944	CGCGG	2	10	1290611	1290620	0 %	0 %	60 %	40 %	41407327
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1055	NC_002944	GTTGG	2	10	1295353	1295362	0 %	40 %	60 %	0 %	41407330
1056	NC_002944	TTGGG	2	10	1298212	1298221	0 %	40 %	60 %	0 %	41407333
1057	NC_002944	CGAAC	2	10	1299680	1299689	40 %	0 %	20 %	40 %	41407334
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1059	NC_002944	GGCCC	2	10	1301415	1301424	0 %	0 %	40 %	60 %	41407336
1060	NC_002944	GCCGC	2	10	1306403	1306412	0 %	0 %	40 %	60 %	41407338
1061	NC_002944	GCACC	2	10	1306745	1306754	20 %	0 %	20 %	60 %	41407338
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1072	NC_002944	GGCCG	2	10	1327070	1327079	0 %	0 %	60 %	40 %	41407344
1073	NC_002944	GGGGT	2	10	1329602	1329611	0 %	20 %	80 %	0 %	41407346
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1075	NC_002944	CCGCG	2	10	1330693	1330702	0 %	0 %	40 %	60 %	41407347
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1081	NC_002944	GCGCG	2	10	1352622	1352631	0 %	0 %	60 %	40 %	41407367
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1092	NC_002944	GTCCG	2	10	1367222	1367231	0 %	20 %	40 %	40 %	41407377
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1098	NC_002944	GCGCC	2	10	1370997	1371006	0 %	0 %	40 %	60 %	41407380
1099	NC_002944	GGCGC	2	10	1372325	1372334	0 %	0 %	60 %	40 %	41407381
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1104	NC_002944	GCGTC	2	10	1382658	1382667	0 %	20 %	40 %	40 %	41407391
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1107	NC_002944	GGCGA	2	10	1383545	1383554	20 %	0 %	60 %	20 %	41407391
1108	NC_002944	CGGCT	2	10	1384297	1384306	0 %	20 %	40 %	40 %	41407392
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1111	NC_002944	GCTGG	2	10	1386135	1386144	0 %	20 %	60 %	20 %	41407395
1112	NC_002944	GCGGT	2	10	1388171	1388180	0 %	20 %	60 %	20 %	41407397
1113	NC_002944	CGGTG	2	10	1388946	1388955	0 %	20 %	60 %	20 %	41407399
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1122	NC_002944	GCCGA	2	10	1404622	1404631	20 %	0 %	40 %	40 %	41407412
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1124	NC_002944	GCCGC	2	10	1405581	1405590	0 %	0 %	40 %	60 %	41407413
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