MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 4115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_002944	GTGGG	2	10	2380182	2380191	0 %	20 %	80 %	0 %	41408247
2002	NC_002944	ACCGG	2	10	2380261	2380270	20 %	0 %	40 %	40 %	41408247
2003	NC_002944	GCCAG	2	10	2394153	2394162	20 %	0 %	40 %	40 %	41408259
2004	NC_002944	GTGCA	2	10	2394838	2394847	20 %	20 %	40 %	20 %	41408260
2005	NC_002944	CGGTG	2	10	2397138	2397147	0 %	20 %	60 %	20 %	41408262
2006	NC_002944	GCCGC	2	10	2398713	2398722	0 %	0 %	40 %	60 %	41408264
2007	NC_002944	CCGGC	2	10	2399739	2399748	0 %	0 %	40 %	60 %	41408266
2008	NC_002944	GGTCG	2	10	2401083	2401092	0 %	20 %	60 %	20 %	41408268
2009	NC_002944	CGCGG	2	10	2404600	2404609	0 %	0 %	60 %	40 %	41408269
2010	NC_002944	CCGAG	2	10	2405606	2405615	20 %	0 %	40 %	40 %	41408269
2011	NC_002944	CGCGG	2	10	2405728	2405737	0 %	0 %	60 %	40 %	41408269
2012	NC_002944	GGCCG	2	10	2406670	2406679	0 %	0 %	60 %	40 %	41408270
2013	NC_002944	CCGCG	2	10	2409119	2409128	0 %	0 %	40 %	60 %	41408271
2014	NC_002944	GCGCG	2	10	2409903	2409912	0 %	0 %	60 %	40 %	41408271
2015	NC_002944	GCGTC	2	10	2411424	2411433	0 %	20 %	40 %	40 %	41408271
2016	NC_002944	GATTC	2	10	2411721	2411730	20 %	40 %	20 %	20 %	41408271
2017	NC_002944	GCGCG	2	10	2414944	2414953	0 %	0 %	60 %	40 %	41408272
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2019	NC_002944	TCGGT	2	10	2418883	2418892	0 %	40 %	40 %	20 %	41408275
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2022	NC_002944	CGATT	2	10	2426670	2426679	20 %	40 %	20 %	20 %	41408282
2023	NC_002944	CGCGC	2	10	2427149	2427158	0 %	0 %	40 %	60 %	41408283
2024	NC_002944	TCTTG	2	10	2428608	2428617	0 %	60 %	20 %	20 %	41408285
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2030	NC_002944	CCGAT	2	10	2435478	2435487	20 %	20 %	20 %	40 %	41408290
2031	NC_002944	CGCAA	2	10	2436820	2436829	40 %	0 %	20 %	40 %	41408291
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2033	NC_002944	CGGTC	2	10	2438550	2438559	0 %	20 %	40 %	40 %	41408292
2034	NC_002944	CGAAG	2	10	2440591	2440600	40 %	0 %	40 %	20 %	41408293
2035	NC_002944	TGCAT	2	10	2442075	2442084	20 %	40 %	20 %	20 %	41408295
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2037	NC_002944	GCCGC	2	10	2443524	2443533	0 %	0 %	40 %	60 %	41408296
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2039	NC_002944	CCGGC	2	10	2445736	2445745	0 %	0 %	40 %	60 %	41408298
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2049	NC_002944	GCCAG	2	10	2468746	2468755	20 %	0 %	40 %	40 %	41408319
2050	NC_002944	GGCGC	2	10	2469338	2469347	0 %	0 %	60 %	40 %	41408319
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2053	NC_002944	CCGCC	2	10	2473729	2473738	0 %	0 %	20 %	80 %	41408323
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2057	NC_002944	GCTCG	2	10	2479659	2479668	0 %	20 %	40 %	40 %	41408328
2058	NC_002944	TGGCC	2	10	2480375	2480384	0 %	20 %	40 %	40 %	41408328
2059	NC_002944	TTGCG	2	10	2482203	2482212	0 %	40 %	40 %	20 %	41408328
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