MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 1891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020834	AACAG	2	10	2596	2605	60 %	0 %	20 %	20 %	472335241
2	NC_020834	TGTGG	2	10	2999	3008	0 %	40 %	60 %	0 %	472335241
3	NC_020834	GATAT	2	10	3757	3766	40 %	40 %	20 %	0 %	472335242
4	NC_020834	AATTA	2	10	5873	5882	60 %	40 %	0 %	0 %	472335242
5	NC_020834	AGAAA	2	10	6399	6408	80 %	0 %	20 %	0 %	472335243
6	NC_020834	CTCTT	2	10	7302	7311	0 %	60 %	0 %	40 %	472335244
7	NC_020834	AGAAA	2	10	7744	7753	80 %	0 %	20 %	0 %	472335244
8	NC_020834	AATTC	2	10	7769	7778	40 %	40 %	0 %	20 %	472335244
9	NC_020834	TTTAA	2	10	9138	9147	40 %	60 %	0 %	0 %	472335245
10	NC_020834	ATTAC	2	10	10337	10346	40 %	40 %	0 %	20 %	472335246
11	NC_020834	TTCAG	2	10	11085	11094	20 %	40 %	20 %	20 %	472335247
12	NC_020834	CAAGA	2	10	11384	11393	60 %	0 %	20 %	20 %	472335247
13	NC_020834	AAAAT	2	10	11480	11489	80 %	20 %	0 %	0 %	472335247
14	NC_020834	TTCAA	2	10	14181	14190	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_020834	AGCGT	2	10	14615	14624	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_020834	TGCGT	2	10	17660	17669	0 %	40 %	40 %	20 %	472335254
17	NC_020834	ATGAT	2	10	17770	17779	40 %	40 %	20 %	0 %	472335254
18	NC_020834	AAATG	2	10	21784	21793	60 %	20 %	20 %	0 %	472335259
19	NC_020834	AGGCC	2	10	25577	25586	20 %	0 %	40 %	40 %	472335262
20	NC_020834	ATTTT	2	10	26096	26105	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020834	CCAAG	2	10	26895	26904	40 %	0 %	20 %	40 %	472335263
22	NC_020834	TTTAA	2	10	29018	29027	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020834	TAAAT	2	10	29048	29057	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020834	TAAGT	2	10	31846	31855	40 %	40 %	20 %	0 %	472335269
25	NC_020834	CACAA	2	10	33545	33554	60 %	0 %	0 %	40 %	472335270
26	NC_020834	TTGAT	2	10	33807	33816	20 %	60 %	20 %	0 %	472335270
27	NC_020834	CCTGC	2	10	34652	34661	0 %	20 %	20 %	60 %	472335271
28	NC_020834	CAGTG	2	10	36028	36037	20 %	20 %	40 %	20 %	472335272
29	NC_020834	TTAAA	2	10	36606	36615	60 %	40 %	0 %	0 %	472335272
30	NC_020834	TAATT	2	10	37499	37508	40 %	60 %	0 %	0 %	472335273
31	NC_020834	TAAAT	2	10	37667	37676	60 %	40 %	0 %	0 %	472335273
32	NC_020834	AAATG	2	10	38426	38435	60 %	20 %	20 %	0 %	472335274
33	NC_020834	GGGTT	2	10	40519	40528	0 %	40 %	60 %	0 %	472335278
34	NC_020834	GTGAA	2	10	41578	41587	40 %	20 %	40 %	0 %	472335279
35	NC_020834	TTTAG	2	10	41985	41994	20 %	60 %	20 %	0 %	472335279
36	NC_020834	ATTTT	2	10	47951	47960	20 %	80 %	0 %	0 %	472335283
37	NC_020834	AAACT	2	10	50917	50926	60 %	20 %	0 %	20 %	472335287
38	NC_020834	ATGGT	2	10	51800	51809	20 %	40 %	40 %	0 %	472335288
39	NC_020834	CTAAA	2	10	53608	53617	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020834	GTTTT	2	10	54073	54082	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020834	TAAAA	2	10	55143	55152	80 %	20 %	0 %	0 %	472335291
42	NC_020834	GTTTT	2	10	55886	55895	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020834	CTTTT	2	10	58351	58360	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020834	ATTTG	2	10	59031	59040	20 %	60 %	20 %	0 %	472335297
45	NC_020834	GGCTC	2	10	62200	62209	0 %	20 %	40 %	40 %	472335299
46	NC_020834	GTTGA	2	10	63105	63114	20 %	40 %	40 %	0 %	472335302
47	NC_020834	GCACG	2	10	64160	64169	20 %	0 %	40 %	40 %	472335304
48	NC_020834	GCCCA	2	10	64849	64858	20 %	0 %	20 %	60 %	472335305
49	NC_020834	AAAAG	2	10	66712	66721	80 %	0 %	20 %	0 %	472335307
50	NC_020834	AATTA	2	10	68197	68206	60 %	40 %	0 %	0 %	472335310
51	NC_020834	TCCGT	2	10	70186	70195	0 %	40 %	20 %	40 %	472335312
52	NC_020834	CGGAG	2	10	70373	70382	20 %	0 %	60 %	20 %	472335312
53	NC_020834	CAAGG	2	10	70443	70452	40 %	0 %	40 %	20 %	472335312
54	NC_020834	ACCTT	2	10	71154	71163	20 %	40 %	0 %	40 %	472335312
55	NC_020834	AAGTG	2	10	72393	72402	40 %	20 %	40 %	0 %	472335315
56	NC_020834	CCGTT	2	10	73081	73090	0 %	40 %	20 %	40 %	472335316
57	NC_020834	CGGAG	2	10	73578	73587	20 %	0 %	60 %	20 %	472335316
58	NC_020834	ATCGA	2	10	74024	74033	40 %	20 %	20 %	20 %	472335316
59	NC_020834	GATTG	2	10	76309	76318	20 %	40 %	40 %	0 %	472335318
60	NC_020834	CGGTG	2	10	76650	76659	0 %	20 %	60 %	20 %	472335318
61	NC_020834	AACGG	2	10	81826	81835	40 %	0 %	40 %	20 %	472335322
62	NC_020834	AATTT	2	10	82056	82065	40 %	60 %	0 %	0 %	472335322
63	NC_020834	TTGTG	2	10	82498	82507	0 %	60 %	40 %	0 %	472335323
64	NC_020834	ACCCC	2	10	86002	86011	20 %	0 %	0 %	80 %	472335326
65	NC_020834	GGTTT	2	10	86362	86371	0 %	60 %	40 %	0 %	472335327
66	NC_020834	TTGCT	2	10	89789	89798	0 %	60 %	20 %	20 %	472335330
67	NC_020834	AAGCG	2	10	90394	90403	40 %	0 %	40 %	20 %	472335331
68	NC_020834	AGATG	2	10	91747	91756	40 %	20 %	40 %	0 %	472335332
69	NC_020834	ATTTC	2	10	95292	95301	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_020834	AAGCC	2	10	98803	98812	40 %	0 %	20 %	40 %	472335339
71	NC_020834	TTGCT	2	10	100479	100488	0 %	60 %	20 %	20 %	472335339
72	NC_020834	CTCGC	2	10	100506	100515	0 %	20 %	20 %	60 %	472335339
73	NC_020834	CAACC	2	10	102055	102064	40 %	0 %	0 %	60 %	472335339
74	NC_020834	TATAA	2	10	105387	105396	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020834	AATTT	2	10	105684	105693	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020834	TGTAA	2	10	106080	106089	40 %	40 %	20 %	0 %	472335345
77	NC_020834	ATCGG	2	10	108147	108156	20 %	20 %	40 %	20 %	472335348
78	NC_020834	TGGCG	2	10	112531	112540	0 %	20 %	60 %	20 %	472335353
79	NC_020834	TGGTT	2	10	113253	113262	0 %	60 %	40 %	0 %	472335355
80	NC_020834	GAAAC	2	10	113299	113308	60 %	0 %	20 %	20 %	472335355
81	NC_020834	TTTTG	2	10	113606	113615	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020834	TAAAA	2	10	113682	113691	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020834	ATTTT	2	10	113737	113746	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020834	GTGAT	2	10	114980	114989	20 %	40 %	40 %	0 %	472335357
85	NC_020834	ATTTT	2	10	120334	120343	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020834	GCCGA	2	10	123025	123034	20 %	0 %	40 %	40 %	472335367
87	NC_020834	GGAAT	2	10	123127	123136	40 %	20 %	40 %	0 %	472335367
88	NC_020834	GTGCT	2	10	123302	123311	0 %	40 %	40 %	20 %	472335367
89	NC_020834	TTGGG	2	10	123889	123898	0 %	40 %	60 %	0 %	472335368
90	NC_020834	AGCAA	2	10	124982	124991	60 %	0 %	20 %	20 %	472335369
91	NC_020834	AAGCC	2	10	125616	125625	40 %	0 %	20 %	40 %	472335369
92	NC_020834	GATTC	2	10	125758	125767	20 %	40 %	20 %	20 %	472335369
93	NC_020834	ATGCA	2	10	125864	125873	40 %	20 %	20 %	20 %	472335369
94	NC_020834	TACTG	2	10	126147	126156	20 %	40 %	20 %	20 %	472335369
95	NC_020834	GTTGC	2	10	126521	126530	0 %	40 %	40 %	20 %	472335371
96	NC_020834	AGGTT	2	10	126574	126583	20 %	40 %	40 %	0 %	472335371
97	NC_020834	CTTGG	2	10	126676	126685	0 %	40 %	40 %	20 %	472335371
98	NC_020834	AAGCC	2	10	127931	127940	40 %	0 %	20 %	40 %	472335374
99	NC_020834	AGCAA	2	10	128360	128369	60 %	0 %	20 %	20 %	472335375
100	NC_020834	TCATT	2	10	128922	128931	20 %	60 %	0 %	20 %	472335375
101	NC_020834	ATACC	2	10	129204	129213	40 %	20 %	0 %	40 %	472335375
102	NC_020834	CAAAA	2	10	129780	129789	80 %	0 %	0 %	20 %	472335376
103	NC_020834	AATCA	2	10	134290	134299	60 %	20 %	0 %	20 %	472335379
104	NC_020834	GGTAA	2	10	137090	137099	40 %	20 %	40 %	0 %	472335382
105	NC_020834	TTCTT	2	10	139313	139322	0 %	80 %	0 %	20 %	472335386
106	NC_020834	AAGTG	2	10	140465	140474	40 %	20 %	40 %	0 %	472335387
107	NC_020834	AAATA	2	10	143495	143504	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020834	TAAAA	2	10	143703	143712	80 %	20 %	0 %	0 %	472335390
109	NC_020834	CAACC	2	10	144399	144408	40 %	0 %	0 %	60 %	472335391
110	NC_020834	TGAAT	2	10	145067	145076	40 %	40 %	20 %	0 %	472335391
111	NC_020834	AATGA	2	10	145416	145425	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020834	AAAAG	2	10	145446	145455	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020834	CTTGC	2	10	147099	147108	0 %	40 %	20 %	40 %	472335393
114	NC_020834	TAAAA	2	10	149174	149183	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020834	GAAGA	2	10	149254	149263	60 %	0 %	40 %	0 %	472335394
116	NC_020834	AAATT	2	10	152124	152133	60 %	40 %	0 %	0 %	472335395
117	NC_020834	CTTTT	2	10	152852	152861	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_020834	TCAAT	2	10	153666	153675	40 %	40 %	0 %	20 %	472335396
119	NC_020834	TTCGG	2	10	155060	155069	0 %	40 %	40 %	20 %	472335398
120	NC_020834	ACCAT	2	10	155213	155222	40 %	20 %	0 %	40 %	472335398
121	NC_020834	ATTTT	2	10	155735	155744	20 %	80 %	0 %	0 %	472335398
122	NC_020834	CCCAA	2	10	157739	157748	40 %	0 %	0 %	60 %	472335401
123	NC_020834	AATGC	2	10	159676	159685	40 %	20 %	20 %	20 %	472335403
124	NC_020834	GGCAG	2	10	160582	160591	20 %	0 %	60 %	20 %	472335405
125	NC_020834	TTTTC	2	10	162273	162282	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_020834	TCACT	2	10	162360	162369	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_020834	ATTTT	2	10	164300	164309	20 %	80 %	0 %	0 %	472335407
128	NC_020834	TACCT	2	10	164719	164728	20 %	40 %	0 %	40 %	472335407
129	NC_020834	AAAAT	2	10	167810	167819	80 %	20 %	0 %	0 %	472335410
130	NC_020834	AAATG	2	10	168652	168661	60 %	20 %	20 %	0 %	472335412
131	NC_020834	CCAAA	2	10	172907	172916	60 %	0 %	0 %	40 %	472335415
132	NC_020834	AATTT	2	10	175234	175243	40 %	60 %	0 %	0 %	472335417
133	NC_020834	CAAAA	2	10	175334	175343	80 %	0 %	0 %	20 %	472335417
134	NC_020834	AAAAT	2	10	175584	175593	80 %	20 %	0 %	0 %	472335418
135	NC_020834	ACCCA	2	10	175917	175926	40 %	0 %	0 %	60 %	472335418
136	NC_020834	AATAT	2	10	178419	178428	60 %	40 %	0 %	0 %	472335421
137	NC_020834	TCCCA	2	10	182049	182058	20 %	20 %	0 %	60 %	472335423
138	NC_020834	TGGCT	2	10	187576	187585	0 %	40 %	40 %	20 %	472335429
139	NC_020834	GTTTT	2	10	187824	187833	0 %	80 %	20 %	0 %	472335430
140	NC_020834	AAAAT	2	10	188120	188129	80 %	20 %	0 %	0 %	472335430
141	NC_020834	GAGCA	2	10	188634	188643	40 %	0 %	40 %	20 %	472335431
142	NC_020834	TATTG	2	10	189944	189953	20 %	60 %	20 %	0 %	472335433
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145	NC_020834	TTGAG	2	10	192192	192201	20 %	40 %	40 %	0 %	472335437
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149	NC_020834	CATAT	2	10	197928	197937	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_020834	CATTT	2	10	197938	197947	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_020834	TTCCC	2	10	198169	198178	0 %	40 %	0 %	60 %	472335443
152	NC_020834	AGCAG	2	10	199704	199713	40 %	0 %	40 %	20 %	472335444
153	NC_020834	CTTGG	2	10	200745	200754	0 %	40 %	40 %	20 %	472335444
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155	NC_020834	CCATA	2	10	202101	202110	40 %	20 %	0 %	40 %	472335445
156	NC_020834	CAAAT	2	10	202762	202771	60 %	20 %	0 %	20 %	472335446
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159	NC_020834	GGTAA	2	10	206245	206254	40 %	20 %	40 %	0 %	472335450
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162	NC_020834	ATTTT	2	10	214383	214392	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_020834	AAATT	2	10	215653	215662	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_020834	TTATC	2	10	216051	216060	20 %	60 %	0 %	20 %	472335467
165	NC_020834	TAAAA	2	10	217354	217363	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_020834	GTTTG	2	10	223433	223442	0 %	60 %	40 %	0 %	472335473
169	NC_020834	AAATA	2	10	223621	223630	80 %	20 %	0 %	0 %	472335473
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176	NC_020834	TACGG	2	10	236706	236715	20 %	20 %	40 %	20 %	472335488
177	NC_020834	GTTTT	2	10	238522	238531	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
178	NC_020834	TGATT	2	10	243420	243429	20 %	60 %	20 %	0 %	472335494
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201	NC_020834	TAAAA	2	10	291633	291642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_020834	ATCAA	2	10	294387	294396	60 %	20 %	0 %	20 %	472335543
203	NC_020834	TTAAC	2	10	295366	295375	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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233	NC_020834	ATCGA	2	10	335753	335762	40 %	20 %	20 %	20 %	472335581
234	NC_020834	TTATC	2	10	340126	340135	20 %	60 %	0 %	20 %	472335584
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237	NC_020834	CGGCA	2	10	344441	344450	20 %	0 %	40 %	40 %	472335591
238	NC_020834	TTTAA	2	10	347948	347957	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_020834	TATCG	2	10	349693	349702	20 %	40 %	20 %	20 %	472335595
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241	NC_020834	TATTT	2	10	355143	355152	20 %	80 %	0 %	0 %	472335602
242	NC_020834	TGCAT	2	10	355933	355942	20 %	40 %	20 %	20 %	472335602
243	NC_020834	GGAAA	2	10	360525	360534	60 %	0 %	40 %	0 %	472335607
244	NC_020834	CATTT	2	10	361666	361675	20 %	60 %	0 %	20 %	472335608
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247	NC_020834	TAAGT	2	10	367536	367545	40 %	40 %	20 %	0 %	472335612
248	NC_020834	TAACT	2	10	368283	368292	40 %	40 %	0 %	20 %	472335612
249	NC_020834	GGTGA	2	10	368605	368614	20 %	20 %	60 %	0 %	472335612
250	NC_020834	CAAAA	2	10	374855	374864	80 %	0 %	0 %	20 %	472335619
251	NC_020834	AGAAA	2	10	375066	375075	80 %	0 %	20 %	0 %	472335619
252	NC_020834	TGTTT	2	10	377603	377612	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
253	NC_020834	GAAAG	2	10	379257	379266	60 %	0 %	40 %	0 %	472335622
254	NC_020834	GTAGT	2	10	380014	380023	20 %	40 %	40 %	0 %	472335623
255	NC_020834	ACCTG	2	10	380204	380213	20 %	20 %	20 %	40 %	472335623
256	NC_020834	CAGTT	2	10	380215	380224	20 %	40 %	20 %	20 %	472335623
257	NC_020834	TTTTA	2	10	380626	380635	20 %	80 %	0 %	0 %	472335623
258	NC_020834	AATCA	2	10	381191	381200	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
259	NC_020834	TTAAC	2	10	381571	381580	40 %	40 %	0 %	20 %	472335624
260	NC_020834	ATGAA	2	10	382486	382495	60 %	20 %	20 %	0 %	472335624
261	NC_020834	CGGTT	2	10	384557	384566	0 %	40 %	40 %	20 %	472335626
262	NC_020834	GGTTT	2	10	387656	387665	0 %	60 %	40 %	0 %	472335630
263	NC_020834	GGTTT	2	10	388639	388648	0 %	60 %	40 %	0 %	472335631
264	NC_020834	CTTTA	2	10	388903	388912	20 %	60 %	0 %	20 %	472335631
265	NC_020834	GCTTG	2	10	389021	389030	0 %	40 %	40 %	20 %	472335631
266	NC_020834	GAATT	2	10	389272	389281	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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