MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 1891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020834	ATTTA	2	10	1332468	1332477	40 %	60 %	0 %	0 %	472336579
1002	NC_020834	AATTA	2	10	1333268	1333277	60 %	40 %	0 %	0 %	472336579
1003	NC_020834	CCTTA	2	10	1335127	1335136	20 %	40 %	0 %	40 %	472336580
1004	NC_020834	TGCTC	2	10	1335633	1335642	0 %	40 %	20 %	40 %	472336580
1005	NC_020834	AATTC	2	10	1336201	1336210	40 %	40 %	0 %	20 %	472336581
1006	NC_020834	AATCA	2	10	1337307	1337316	60 %	20 %	0 %	20 %	472336582
1007	NC_020834	TAAAT	2	10	1338683	1338692	60 %	40 %	0 %	0 %	472336583
1008	NC_020834	CTTGT	2	10	1340424	1340433	0 %	60 %	20 %	20 %	472336584
1009	NC_020834	GAATG	2	10	1344140	1344149	40 %	20 %	40 %	0 %	472336586
1010	NC_020834	TAAAC	2	10	1344154	1344163	60 %	20 %	0 %	20 %	472336586
1011	NC_020834	GCTTC	2	10	1346425	1346434	0 %	40 %	20 %	40 %	472336588
1012	NC_020834	ATCTA	2	10	1347351	1347360	40 %	40 %	0 %	20 %	472336590
1013	NC_020834	GCTTC	2	10	1349874	1349883	0 %	40 %	20 %	40 %	472336591
1014	NC_020834	TGCCG	2	10	1351154	1351163	0 %	20 %	40 %	40 %	472336591
1015	NC_020834	CGTGC	2	10	1351394	1351403	0 %	20 %	40 %	40 %	472336591
1016	NC_020834	TTTTG	2	10	1351732	1351741	0 %	80 %	20 %	0 %	472336591
1017	NC_020834	CAAAC	2	10	1352508	1352517	60 %	0 %	0 %	40 %	472336591
1018	NC_020834	TTAAA	2	10	1353801	1353810	60 %	40 %	0 %	0 %	472336591
1019	NC_020834	AAAAT	2	10	1354094	1354103	80 %	20 %	0 %	0 %	472336591
1020	NC_020834	CTTCG	2	10	1356940	1356949	0 %	40 %	20 %	40 %	472336591
1021	NC_020834	AGAAT	2	10	1359363	1359372	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020834	TTTCA	2	10	1359392	1359401	20 %	60 %	0 %	20 %	472336593
1023	NC_020834	CAATG	2	10	1359949	1359958	40 %	20 %	20 %	20 %	472336593
1024	NC_020834	GCGAT	2	10	1360410	1360419	20 %	20 %	40 %	20 %	472336593
1025	NC_020834	CGGCA	2	10	1362483	1362492	20 %	0 %	40 %	40 %	472336595
1026	NC_020834	TTTTG	2	10	1365282	1365291	0 %	80 %	20 %	0 %	472336597
1027	NC_020834	TAAAT	2	10	1367273	1367282	60 %	40 %	0 %	0 %	472336599
1028	NC_020834	ACATT	2	10	1368375	1368384	40 %	40 %	0 %	20 %	472336600
1029	NC_020834	AAATC	2	10	1369088	1369097	60 %	20 %	0 %	20 %	472336601
1030	NC_020834	GCCTC	2	10	1369914	1369923	0 %	20 %	20 %	60 %	472336601
1031	NC_020834	TTTCC	2	10	1371411	1371420	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1032	NC_020834	CAATA	2	10	1371684	1371693	60 %	20 %	0 %	20 %	472336603
1033	NC_020834	AAGCA	2	10	1372310	1372319	60 %	0 %	20 %	20 %	472336603
1034	NC_020834	AGTCA	2	10	1373644	1373653	40 %	20 %	20 %	20 %	472336604
1035	NC_020834	CTTTG	2	10	1376523	1376532	0 %	60 %	20 %	20 %	472336606
1036	NC_020834	GCATT	2	10	1376696	1376705	20 %	40 %	20 %	20 %	472336606
1037	NC_020834	TTACT	2	10	1377517	1377526	20 %	60 %	0 %	20 %	472336607
1038	NC_020834	ACCGC	2	10	1378038	1378047	20 %	0 %	20 %	60 %	472336607
1039	NC_020834	CAAAA	2	10	1378238	1378247	80 %	0 %	0 %	20 %	472336607
1040	NC_020834	TGGAT	2	10	1379262	1379271	20 %	40 %	40 %	0 %	472336609
1041	NC_020834	ATTGA	2	10	1380322	1380331	40 %	40 %	20 %	0 %	472336610
1042	NC_020834	ATTTA	2	10	1380764	1380773	40 %	60 %	0 %	0 %	472336610
1043	NC_020834	TATCG	2	10	1382113	1382122	20 %	40 %	20 %	20 %	472336611
1044	NC_020834	AATTT	2	10	1383621	1383630	40 %	60 %	0 %	0 %	472336612
1045	NC_020834	ATTTC	2	10	1384598	1384607	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1046	NC_020834	AAATG	2	10	1384763	1384772	60 %	20 %	20 %	0 %	472336613
1047	NC_020834	AACCA	2	10	1386759	1386768	60 %	0 %	0 %	40 %	472336614
1048	NC_020834	ATAAA	2	10	1387107	1387116	80 %	20 %	0 %	0 %	472336614
1049	NC_020834	AGGTA	2	10	1388207	1388216	40 %	20 %	40 %	0 %	472336616
1050	NC_020834	GTTAA	2	10	1388243	1388252	40 %	40 %	20 %	0 %	472336617
1051	NC_020834	TTTGC	2	10	1391848	1391857	0 %	60 %	20 %	20 %	472336619
1052	NC_020834	CTTCT	2	10	1392389	1392398	0 %	60 %	0 %	40 %	472336620
1053	NC_020834	AAAAC	2	10	1394341	1394350	80 %	0 %	0 %	20 %	472336622
1054	NC_020834	CGCTT	2	10	1395392	1395401	0 %	40 %	20 %	40 %	472336623
1055	NC_020834	ACCTC	2	10	1398803	1398812	20 %	20 %	0 %	60 %	472336626
1056	NC_020834	TTGAT	2	10	1400366	1400375	20 %	60 %	20 %	0 %	472336629
1057	NC_020834	TTTGC	2	10	1400431	1400440	0 %	60 %	20 %	20 %	472336629
1058	NC_020834	AGTTA	2	10	1400622	1400631	40 %	40 %	20 %	0 %	472336629
1059	NC_020834	CACTT	2	10	1400784	1400793	20 %	40 %	0 %	40 %	472336629
1060	NC_020834	TTTAC	2	10	1401136	1401145	20 %	60 %	0 %	20 %	472336629
1061	NC_020834	TTTCA	2	10	1402347	1402356	20 %	60 %	0 %	20 %	472336631
1062	NC_020834	ACTTT	2	10	1403728	1403737	20 %	60 %	0 %	20 %	472336632
1063	NC_020834	ATAAA	2	10	1404205	1404214	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_020834	AACAT	2	10	1406260	1406269	60 %	20 %	0 %	20 %	472336634
1065	NC_020834	TTGCT	2	10	1407457	1407466	0 %	60 %	20 %	20 %	472336635
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1067	NC_020834	TCGCT	2	10	1410354	1410363	0 %	40 %	20 %	40 %	472336639
1068	NC_020834	AAAAT	2	10	1412041	1412050	80 %	20 %	0 %	0 %	472336641
1069	NC_020834	TGCTT	2	10	1412737	1412746	0 %	60 %	20 %	20 %	472336642
1070	NC_020834	GAAAA	2	10	1413123	1413132	80 %	0 %	20 %	0 %	472336643
1071	NC_020834	TGATA	2	10	1414064	1414073	40 %	40 %	20 %	0 %	472336645
1072	NC_020834	AGCAT	2	10	1415340	1415349	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1073	NC_020834	CCGGG	2	10	1418746	1418755	0 %	0 %	60 %	40 %	472336650
1074	NC_020834	AATTG	2	10	1423459	1423468	40 %	40 %	20 %	0 %	472336653
1075	NC_020834	TAAAG	2	10	1427727	1427736	60 %	20 %	20 %	0 %	472336655
1076	NC_020834	TAAAA	2	10	1427961	1427970	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_020834	CAAAC	2	10	1430180	1430189	60 %	0 %	0 %	40 %	472336658
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1079	NC_020834	GCAAT	2	10	1431004	1431013	40 %	20 %	20 %	20 %	472336659
1080	NC_020834	TCCGC	2	10	1432514	1432523	0 %	20 %	20 %	60 %	472336660
1081	NC_020834	CCGAT	2	10	1434904	1434913	20 %	20 %	20 %	40 %	472336660
1082	NC_020834	TAGGT	2	10	1435766	1435775	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_020834	TCAAC	2	10	1436425	1436434	40 %	20 %	0 %	40 %	472336661
1084	NC_020834	GAAAT	2	10	1436589	1436598	60 %	20 %	20 %	0 %	472336661
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1086	NC_020834	AAGCC	2	10	1441835	1441844	40 %	0 %	20 %	40 %	472336665
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1088	NC_020834	AATGT	2	10	1444435	1444444	40 %	40 %	20 %	0 %	472336668
1089	NC_020834	TACCT	2	10	1445222	1445231	20 %	40 %	0 %	40 %	472336670
1090	NC_020834	CTTTA	2	10	1446152	1446161	20 %	60 %	0 %	20 %	472336671
1091	NC_020834	GCCCT	2	10	1446417	1446426	0 %	20 %	20 %	60 %	472336671
1092	NC_020834	TAAAA	2	10	1448431	1448440	80 %	20 %	0 %	0 %	472336672
1093	NC_020834	AATGG	2	10	1449201	1449210	40 %	20 %	40 %	0 %	472336673
1094	NC_020834	GAAAT	2	10	1450095	1450104	60 %	20 %	20 %	0 %	472336674
1095	NC_020834	ATTTT	2	10	1451055	1451064	20 %	80 %	0 %	0 %	472336677
1096	NC_020834	GAACC	2	10	1452002	1452011	40 %	0 %	20 %	40 %	472336680
1097	NC_020834	ATCAA	2	10	1453798	1453807	60 %	20 %	0 %	20 %	472336684
1098	NC_020834	GGTTC	2	10	1456829	1456838	0 %	40 %	40 %	20 %	472336687
1099	NC_020834	GCATT	2	10	1459383	1459392	20 %	40 %	20 %	20 %	472336693
1100	NC_020834	GTAAG	2	10	1459546	1459555	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_020834	CGCCT	2	10	1461863	1461872	0 %	20 %	20 %	60 %	472336696
1102	NC_020834	AGGGG	2	10	1462236	1462245	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_020834	TGGGT	2	10	1463626	1463635	0 %	40 %	60 %	0 %	472336697
1104	NC_020834	CGAAT	2	10	1464549	1464558	40 %	20 %	20 %	20 %	472336698
1105	NC_020834	GATTA	2	10	1465292	1465301	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_020834	TACCT	2	10	1466344	1466353	20 %	40 %	0 %	40 %	472336699
1107	NC_020834	CGGTA	2	10	1467781	1467790	20 %	20 %	40 %	20 %	472336701
1108	NC_020834	TAAAA	2	10	1468886	1468895	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_020834	CATTG	2	10	1470686	1470695	20 %	40 %	20 %	20 %	472336704
1110	NC_020834	AAATC	2	10	1472467	1472476	60 %	20 %	0 %	20 %	472336706
1111	NC_020834	CACAT	2	10	1473008	1473017	40 %	20 %	0 %	40 %	472336706
1112	NC_020834	GTAAT	2	10	1473583	1473592	40 %	40 %	20 %	0 %	472336706
1113	NC_020834	ATTAA	2	10	1475216	1475225	60 %	40 %	0 %	0 %	472336708
1114	NC_020834	GATGC	2	10	1475309	1475318	20 %	20 %	40 %	20 %	472336708
1115	NC_020834	AGTGA	2	10	1479891	1479900	40 %	20 %	40 %	0 %	472336714
1116	NC_020834	AAAAG	2	10	1480282	1480291	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_020834	TACAA	2	10	1481272	1481281	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1118	NC_020834	TCATT	2	10	1483518	1483527	20 %	60 %	0 %	20 %	472336717
1119	NC_020834	AATTC	2	10	1483536	1483545	40 %	40 %	0 %	20 %	472336717
1120	NC_020834	GAAAA	2	10	1484622	1484631	80 %	0 %	20 %	0 %	472336718
1121	NC_020834	TTTTC	2	10	1484639	1484648	0 %	80 %	0 %	20 %	472336718
1122	NC_020834	AAAGG	2	10	1485735	1485744	60 %	0 %	40 %	0 %	472336719
1123	NC_020834	CAGGT	2	10	1486470	1486479	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1124	NC_020834	GACTG	2	10	1488110	1488119	20 %	20 %	40 %	20 %	472336720
1125	NC_020834	CGCTC	2	10	1491267	1491276	0 %	20 %	20 %	60 %	472336723
1126	NC_020834	AAACC	2	10	1492426	1492435	60 %	0 %	0 %	40 %	472336724
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1129	NC_020834	TTAAA	2	10	1495171	1495180	60 %	40 %	0 %	0 %	472336726
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1131	NC_020834	TAAAA	2	10	1496211	1496220	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1139	NC_020834	TTTTC	2	10	1507913	1507922	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1167	NC_020834	TTTCT	2	10	1547783	1547792	0 %	80 %	0 %	20 %	472336777
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1219	NC_020834	GATTG	2	10	1624569	1624578	20 %	40 %	40 %	0 %	472336838
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1232	NC_020834	TAATG	2	10	1639642	1639651	40 %	40 %	20 %	0 %	472336855
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1237	NC_020834	TTAAA	2	10	1650117	1650126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1247	NC_020834	TAATT	2	10	1658683	1658692	40 %	60 %	0 %	0 %	472336878
1248	NC_020834	TTAAC	2	10	1659206	1659215	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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