MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 1891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020834	CAATC	2	10	1998608	1998617	40 %	20 %	0 %	40 %	472337221
1502	NC_020834	TGCAT	2	10	1999324	1999333	20 %	40 %	20 %	20 %	472337221
1503	NC_020834	CAATT	2	10	2000135	2000144	40 %	40 %	0 %	20 %	472337222
1504	NC_020834	TAACA	2	10	2000366	2000375	60 %	20 %	0 %	20 %	472337222
1505	NC_020834	TTATG	2	10	2000404	2000413	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020834	CCTGC	2	10	2003656	2003665	0 %	20 %	20 %	60 %	472337227
1507	NC_020834	TTGGG	2	10	2005028	2005037	0 %	40 %	60 %	0 %	472337228
1508	NC_020834	TTAAT	2	10	2007529	2007538	40 %	60 %	0 %	0 %	472337230
1509	NC_020834	CCCTT	2	10	2007883	2007892	0 %	40 %	0 %	60 %	472337231
1510	NC_020834	TGCAT	2	10	2008071	2008080	20 %	40 %	20 %	20 %	472337231
1511	NC_020834	TGCTT	2	10	2009103	2009112	0 %	60 %	20 %	20 %	472337231
1512	NC_020834	TACTT	2	10	2009658	2009667	20 %	60 %	0 %	20 %	472337232
1513	NC_020834	GGTAT	2	10	2010312	2010321	20 %	40 %	40 %	0 %	472337232
1514	NC_020834	GTTAT	2	10	2010954	2010963	20 %	60 %	20 %	0 %	472337232
1515	NC_020834	ATTCA	2	10	2012519	2012528	40 %	40 %	0 %	20 %	472337234
1516	NC_020834	TATCT	2	10	2014135	2014144	20 %	60 %	0 %	20 %	472337236
1517	NC_020834	TGGCG	2	10	2015793	2015802	0 %	20 %	60 %	20 %	472337237
1518	NC_020834	AAAAT	2	10	2015809	2015818	80 %	20 %	0 %	0 %	472337237
1519	NC_020834	CCCAA	2	10	2016791	2016800	40 %	0 %	0 %	60 %	472337237
1520	NC_020834	CCATA	2	10	2017461	2017470	40 %	20 %	0 %	40 %	472337238
1521	NC_020834	GGGCT	2	10	2017886	2017895	0 %	20 %	60 %	20 %	472337238
1522	NC_020834	GAAAC	2	10	2018242	2018251	60 %	0 %	20 %	20 %	472337238
1523	NC_020834	CTTGC	2	10	2020608	2020617	0 %	40 %	20 %	40 %	472337241
1524	NC_020834	AGCGA	2	10	2021449	2021458	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1525	NC_020834	TTTAC	2	10	2024552	2024561	20 %	60 %	0 %	20 %	472337245
1526	NC_020834	CAGAT	2	10	2025400	2025409	40 %	20 %	20 %	20 %	472337246
1527	NC_020834	AGCAA	2	10	2028868	2028877	60 %	0 %	20 %	20 %	472337249
1528	NC_020834	AAAGC	2	10	2031736	2031745	60 %	0 %	20 %	20 %	472337252
1529	NC_020834	AACCA	2	10	2031933	2031942	60 %	0 %	0 %	40 %	472337253
1530	NC_020834	TTTAA	2	10	2033784	2033793	40 %	60 %	0 %	0 %	472337256
1531	NC_020834	TTGCA	2	10	2038966	2038975	20 %	40 %	20 %	20 %	472337260
1532	NC_020834	AAGCA	2	10	2042679	2042688	60 %	0 %	20 %	20 %	472337265
1533	NC_020834	ATAAA	2	10	2042889	2042898	80 %	20 %	0 %	0 %	472337266
1534	NC_020834	GCCGG	2	10	2043267	2043276	0 %	0 %	60 %	40 %	472337266
1535	NC_020834	TTTGC	2	10	2044170	2044179	0 %	60 %	20 %	20 %	472337267
1536	NC_020834	ACGCA	2	10	2044264	2044273	40 %	0 %	20 %	40 %	472337267
1537	NC_020834	GGAAT	2	10	2048287	2048296	40 %	20 %	40 %	0 %	472337272
1538	NC_020834	CGATT	2	10	2048598	2048607	20 %	40 %	20 %	20 %	472337273
1539	NC_020834	ATTAC	2	10	2050629	2050638	40 %	40 %	0 %	20 %	472337273
1540	NC_020834	AAATG	2	10	2051759	2051768	60 %	20 %	20 %	0 %	472337275
1541	NC_020834	TTTAT	2	10	2052279	2052288	20 %	80 %	0 %	0 %	472337275
1542	NC_020834	GGTAC	2	10	2052705	2052714	20 %	20 %	40 %	20 %	472337275
1543	NC_020834	AAATT	2	10	2052796	2052805	60 %	40 %	0 %	0 %	472337275
1544	NC_020834	TTTAG	2	10	2055429	2055438	20 %	60 %	20 %	0 %	472337278
1545	NC_020834	TCTGC	2	10	2057131	2057140	0 %	40 %	20 %	40 %	472337280
1546	NC_020834	TCGGA	2	10	2058898	2058907	20 %	20 %	40 %	20 %	472337281
1547	NC_020834	CCACC	2	10	2063108	2063117	20 %	0 %	0 %	80 %	472337284
1548	NC_020834	TGCTT	2	10	2065080	2065089	0 %	60 %	20 %	20 %	472337288
1549	NC_020834	TAAAT	2	10	2066155	2066164	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_020834	ACGAA	2	10	2067242	2067251	60 %	0 %	20 %	20 %	472337291
1551	NC_020834	AAAAT	2	10	2067427	2067436	80 %	20 %	0 %	0 %	472337291
1552	NC_020834	GTTTT	2	10	2071681	2071690	0 %	80 %	20 %	0 %	472337296
1553	NC_020834	CCACG	2	10	2073817	2073826	20 %	0 %	20 %	60 %	472337298
1554	NC_020834	AACCG	2	10	2075895	2075904	40 %	0 %	20 %	40 %	472337299
1555	NC_020834	ATATT	2	10	2076771	2076780	40 %	60 %	0 %	0 %	472337300
1556	NC_020834	TTTAC	2	10	2078252	2078261	20 %	60 %	0 %	20 %	472337302
1557	NC_020834	ACTAG	2	10	2079746	2079755	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1558	NC_020834	GCCGA	2	10	2081254	2081263	20 %	0 %	40 %	40 %	472337306
1559	NC_020834	GCACA	2	10	2081515	2081524	40 %	0 %	20 %	40 %	472337306
1560	NC_020834	CTGCT	2	10	2082398	2082407	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1561	NC_020834	AGCTC	2	10	2082675	2082684	20 %	20 %	20 %	40 %	472337309
1562	NC_020834	TACGC	2	10	2084223	2084232	20 %	20 %	20 %	40 %	472337311
1563	NC_020834	GCCAA	2	10	2088787	2088796	40 %	0 %	20 %	40 %	472337315
1564	NC_020834	TGGTT	2	10	2090689	2090698	0 %	60 %	40 %	0 %	472337317
1565	NC_020834	TATTT	2	10	2092422	2092431	20 %	80 %	0 %	0 %	472337319
1566	NC_020834	GAAAT	2	10	2094110	2094119	60 %	20 %	20 %	0 %	472337320
1567	NC_020834	TTTTG	2	10	2098837	2098846	0 %	80 %	20 %	0 %	472337326
1568	NC_020834	GCCGA	2	10	2101120	2101129	20 %	0 %	40 %	40 %	472337328
1569	NC_020834	AACCA	2	10	2101231	2101240	60 %	0 %	0 %	40 %	472337328
1570	NC_020834	CAGCT	2	10	2102469	2102478	20 %	20 %	20 %	40 %	472337329
1571	NC_020834	AATTA	2	10	2103912	2103921	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_020834	AAGCA	2	10	2105621	2105630	60 %	0 %	20 %	20 %	472337333
1573	NC_020834	GTTGC	2	10	2105997	2106006	0 %	40 %	40 %	20 %	472337333
1574	NC_020834	CGATT	2	10	2110357	2110366	20 %	40 %	20 %	20 %	472337338
1575	NC_020834	TGTCT	2	10	2111316	2111325	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1576	NC_020834	TTTTA	2	10	2112744	2112753	20 %	80 %	0 %	0 %	472337341
1577	NC_020834	AGTGA	2	10	2112985	2112994	40 %	20 %	40 %	0 %	472337341
1578	NC_020834	GTTTT	2	10	2119249	2119258	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_020834	TTAAA	2	10	2121224	2121233	60 %	40 %	0 %	0 %	472337350
1580	NC_020834	GAAAA	2	10	2121643	2121652	80 %	0 %	20 %	0 %	472337350
1581	NC_020834	ATGTT	2	10	2122208	2122217	20 %	60 %	20 %	0 %	472337350
1582	NC_020834	AAATT	2	10	2123243	2123252	60 %	40 %	0 %	0 %	472337350
1583	NC_020834	GAATG	2	10	2124322	2124331	40 %	20 %	40 %	0 %	472337351
1584	NC_020834	AAGCT	2	10	2125144	2125153	40 %	20 %	20 %	20 %	472337352
1585	NC_020834	TTTAT	2	10	2126791	2126800	20 %	80 %	0 %	0 %	472337353
1586	NC_020834	AAAAC	2	10	2127435	2127444	80 %	0 %	0 %	20 %	472337354
1587	NC_020834	CGATT	2	10	2127985	2127994	20 %	40 %	20 %	20 %	472337354
1588	NC_020834	ATTTT	2	10	2128887	2128896	20 %	80 %	0 %	0 %	472337355
1589	NC_020834	GTCCG	2	10	2130325	2130334	0 %	20 %	40 %	40 %	472337356
1590	NC_020834	ACCGC	2	10	2132269	2132278	20 %	0 %	20 %	60 %	472337357
1591	NC_020834	TGGCT	2	10	2132548	2132557	0 %	40 %	40 %	20 %	472337357
1592	NC_020834	TGATG	2	10	2133423	2133432	20 %	40 %	40 %	0 %	472337358
1593	NC_020834	AATTA	2	10	2134743	2134752	60 %	40 %	0 %	0 %	472337360
1594	NC_020834	AATTC	2	10	2136906	2136915	40 %	40 %	0 %	20 %	472337361
1595	NC_020834	AACAA	2	10	2139208	2139217	80 %	0 %	0 %	20 %	472337363
1596	NC_020834	CATGC	2	10	2139832	2139841	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1597	NC_020834	AACGG	2	10	2140069	2140078	40 %	0 %	40 %	20 %	472337364
1598	NC_020834	CACCG	2	10	2140622	2140631	20 %	0 %	20 %	60 %	472337364
1599	NC_020834	TGCCG	2	10	2141069	2141078	0 %	20 %	40 %	40 %	472337364
1600	NC_020834	TTTGC	2	10	2143534	2143543	0 %	60 %	20 %	20 %	472337366
1601	NC_020834	ATATA	2	10	2143778	2143787	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_020834	CATCG	2	10	2144474	2144483	20 %	20 %	20 %	40 %	472337367
1603	NC_020834	TTGTG	2	10	2144900	2144909	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_020834	ACTTA	2	10	2145077	2145086	40 %	40 %	0 %	20 %	472337368
1605	NC_020834	ATTTT	2	10	2145922	2145931	20 %	80 %	0 %	0 %	472337369
1606	NC_020834	GCAAC	2	10	2146437	2146446	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1607	NC_020834	AAGCC	2	10	2146590	2146599	40 %	0 %	20 %	40 %	472337370
1608	NC_020834	AAAAC	2	10	2149980	2149989	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1609	NC_020834	ATCAA	2	10	2151073	2151082	60 %	20 %	0 %	20 %	472337377
1610	NC_020834	CCGCA	2	10	2152064	2152073	20 %	0 %	20 %	60 %	472337377
1611	NC_020834	AAATT	2	10	2155049	2155058	60 %	40 %	0 %	0 %	472337379
1612	NC_020834	AGGGG	2	10	2157688	2157697	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_020834	ATGCA	2	10	2161370	2161379	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1614	NC_020834	TTTAG	2	10	2162492	2162501	20 %	60 %	20 %	0 %	472337389
1615	NC_020834	ATCAG	2	10	2162558	2162567	40 %	20 %	20 %	20 %	472337389
1616	NC_020834	TATTT	2	10	2163067	2163076	20 %	80 %	0 %	0 %	472337389
1617	NC_020834	CGGCT	2	10	2165709	2165718	0 %	20 %	40 %	40 %	472337393
1618	NC_020834	CAGTT	2	10	2168478	2168487	20 %	40 %	20 %	20 %	472337397
1619	NC_020834	GCAGG	2	10	2168818	2168827	20 %	0 %	60 %	20 %	472337397
1620	NC_020834	TCAGC	2	10	2169503	2169512	20 %	20 %	20 %	40 %	472337398
1621	NC_020834	CAAAA	2	10	2173044	2173053	80 %	0 %	0 %	20 %	472337403
1622	NC_020834	AGTAA	2	10	2173829	2173838	60 %	20 %	20 %	0 %	472337404
1623	NC_020834	AACAG	2	10	2174938	2174947	60 %	0 %	20 %	20 %	472337404
1624	NC_020834	TAAGT	2	10	2175254	2175263	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1626	NC_020834	ATTTT	2	10	2176737	2176746	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1753	NC_020834	TCGGT	2	10	2357017	2357026	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1754	NC_020834	TCGCT	2	10	2358166	2358175	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1755	NC_020834	TTCAA	2	10	2359878	2359887	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1756	NC_020834	TTTTA	2	10	2360483	2360492	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1833	NC_020834	TCGGT	2	10	2464396	2464405	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1876	NC_020834	CGACT	2	10	2521836	2521845	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1877	NC_020834	TCGGT	2	10	2522211	2522220	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1878	NC_020834	TCGCT	2	10	2523373	2523382	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1879	NC_020834	TTCAA	2	10	2525085	2525094	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1880	NC_020834	TTGTT	2	10	2525429	2525438	0 %	80 %	20 %	0 %	472337759
1881	NC_020834	GATTT	2	10	2528138	2528147	20 %	60 %	20 %	0 %	472337762
1882	NC_020834	TAACC	2	10	2529034	2529043	40 %	20 %	0 %	40 %	472337763
1883	NC_020834	ATTAA	2	10	2529721	2529730	60 %	40 %	0 %	0 %	472337764
1884	NC_020834	TGTTC	2	10	2530216	2530225	0 %	60 %	20 %	20 %	472337765
1885	NC_020834	TTTGA	2	10	2531769	2531778	20 %	60 %	20 %	0 %	472337766
1886	NC_020834	ACATC	2	10	2532449	2532458	40 %	20 %	0 %	40 %	472337766
1887	NC_020834	CAATC	2	10	2533471	2533480	40 %	20 %	0 %	40 %	472337768
1888	NC_020834	AAGGC	2	10	2537211	2537220	40 %	0 %	40 %	20 %	472337771
1889	NC_020834	ATCAA	2	10	2538846	2538855	60 %	20 %	0 %	20 %	472337772
1890	NC_020834	AATTT	2	10	2539348	2539357	40 %	60 %	0 %	0 %	472337773
1891	NC_020834	GTTTC	2	10	2543533	2543542	0 %	60 %	20 %	20 %	472337776

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