MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 1891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020834	TCAAA	2	10	679881	679890	60 %	20 %	0 %	20 %	472335907
502	NC_020834	AACCC	2	10	682009	682018	40 %	0 %	0 %	60 %	472335910
503	NC_020834	CCAAT	2	10	683381	683390	40 %	20 %	0 %	40 %	472335911
504	NC_020834	AACAC	2	10	685333	685342	60 %	0 %	0 %	40 %	472335914
505	NC_020834	AAATG	2	10	686732	686741	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020834	ATTTA	2	10	688521	688530	40 %	60 %	0 %	0 %	472335918
507	NC_020834	ATCAC	2	10	689643	689652	40 %	20 %	0 %	40 %	472335919
508	NC_020834	CATCG	2	10	689972	689981	20 %	20 %	20 %	40 %	472335919
509	NC_020834	CATCG	2	10	690014	690023	20 %	20 %	20 %	40 %	472335919
510	NC_020834	GGCTA	2	10	690617	690626	20 %	20 %	40 %	20 %	472335920
511	NC_020834	CAGTG	2	10	691687	691696	20 %	20 %	40 %	20 %	472335920
512	NC_020834	CTTCA	2	10	692005	692014	20 %	40 %	0 %	40 %	472335920
513	NC_020834	GGTTC	2	10	692520	692529	0 %	40 %	40 %	20 %	472335920
514	NC_020834	GGCGT	2	10	695260	695269	0 %	20 %	60 %	20 %	472335922
515	NC_020834	GTTTA	2	10	695639	695648	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020834	CCAAT	2	10	695884	695893	40 %	20 %	0 %	40 %	472335923
517	NC_020834	GTATG	2	10	696652	696661	20 %	40 %	40 %	0 %	472335923
518	NC_020834	AATTC	2	10	696812	696821	40 %	40 %	0 %	20 %	472335923
519	NC_020834	CATAT	2	10	697147	697156	40 %	40 %	0 %	20 %	472335923
520	NC_020834	TTTCC	2	10	697191	697200	0 %	60 %	0 %	40 %	472335923
521	NC_020834	TTTTG	2	10	697280	697289	0 %	80 %	20 %	0 %	472335923
522	NC_020834	ATTTA	2	10	697624	697633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020834	AAATC	2	10	698250	698259	60 %	20 %	0 %	20 %	472335925
524	NC_020834	TTGCC	2	10	699250	699259	0 %	40 %	20 %	40 %	472335926
525	NC_020834	GCGGT	2	10	701507	701516	0 %	20 %	60 %	20 %	472335928
526	NC_020834	TGCCT	2	10	703332	703341	0 %	40 %	20 %	40 %	472335931
527	NC_020834	GTGAT	2	10	703448	703457	20 %	40 %	40 %	0 %	472335931
528	NC_020834	CCGCC	2	10	706250	706259	0 %	0 %	20 %	80 %	472335932
529	NC_020834	TGCCG	2	10	709373	709382	0 %	20 %	40 %	40 %	472335935
530	NC_020834	GGTTG	2	10	716861	716870	0 %	40 %	60 %	0 %	472335942
531	NC_020834	GTAGC	2	10	717162	717171	20 %	20 %	40 %	20 %	472335942
532	NC_020834	TATTT	2	10	717802	717811	20 %	80 %	0 %	0 %	472335943
533	NC_020834	TTTTG	2	10	718415	718424	0 %	80 %	20 %	0 %	472335943
534	NC_020834	GGCAA	2	10	719397	719406	40 %	0 %	40 %	20 %	472335945
535	NC_020834	AACTC	2	10	720214	720223	40 %	20 %	0 %	40 %	472335946
536	NC_020834	TAATT	2	10	721725	721734	40 %	60 %	0 %	0 %	472335948
537	NC_020834	ATAAA	2	10	722769	722778	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020834	GCTCG	2	10	723701	723710	0 %	20 %	40 %	40 %	472335950
539	NC_020834	AGCGT	2	10	723933	723942	20 %	20 %	40 %	20 %	472335950
540	NC_020834	CGGTG	2	10	724365	724374	0 %	20 %	60 %	20 %	472335951
541	NC_020834	TGAAG	2	10	724905	724914	40 %	20 %	40 %	0 %	472335951
542	NC_020834	GTCAA	2	10	725923	725932	40 %	20 %	20 %	20 %	472335952
543	NC_020834	TAGCA	2	10	726045	726054	40 %	20 %	20 %	20 %	472335952
544	NC_020834	TACGA	2	10	727599	727608	40 %	20 %	20 %	20 %	472335953
545	NC_020834	CTTTT	2	10	728806	728815	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
546	NC_020834	TTTAG	2	10	728844	728853	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
547	NC_020834	TTTCA	2	10	731750	731759	20 %	60 %	0 %	20 %	472335957
548	NC_020834	CAATC	2	10	732151	732160	40 %	20 %	0 %	40 %	472335958
549	NC_020834	GTAAT	2	10	734087	734096	40 %	40 %	20 %	0 %	472335960
550	NC_020834	TAAAT	2	10	734948	734957	60 %	40 %	0 %	0 %	472335960
551	NC_020834	GAAAT	2	10	736142	736151	60 %	20 %	20 %	0 %	472335962
552	NC_020834	AAGCC	2	10	737990	737999	40 %	0 %	20 %	40 %	472335963
553	NC_020834	TGAAA	2	10	739148	739157	60 %	20 %	20 %	0 %	472335964
554	NC_020834	ATTGT	2	10	739216	739225	20 %	60 %	20 %	0 %	472335964
555	NC_020834	AAATG	2	10	740990	740999	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020834	CCGAT	2	10	741810	741819	20 %	20 %	20 %	40 %	472335969
557	NC_020834	TGGTG	2	10	743592	743601	0 %	40 %	60 %	0 %	472335971
558	NC_020834	TCCAA	2	10	744566	744575	40 %	20 %	0 %	40 %	472335972
559	NC_020834	ATTGC	2	10	750583	750592	20 %	40 %	20 %	20 %	472335977
560	NC_020834	ATTGC	2	10	750625	750634	20 %	40 %	20 %	20 %	472335977
561	NC_020834	GGTTG	2	10	751165	751174	0 %	40 %	60 %	0 %	472335978
562	NC_020834	ATTGC	2	10	752485	752494	20 %	40 %	20 %	20 %	472335979
563	NC_020834	TGGTT	2	10	753842	753851	0 %	60 %	40 %	0 %	472335981
564	NC_020834	TATCT	2	10	754313	754322	20 %	60 %	0 %	20 %	472335981
565	NC_020834	CATTG	2	10	759978	759987	20 %	40 %	20 %	20 %	472335987
566	NC_020834	ACCGC	2	10	761397	761406	20 %	0 %	20 %	60 %	472335988
567	NC_020834	GGTGG	2	10	762424	762433	0 %	20 %	80 %	0 %	472335990
568	NC_020834	AAACT	2	10	762677	762686	60 %	20 %	0 %	20 %	472335990
569	NC_020834	CGTGC	2	10	763143	763152	0 %	20 %	40 %	40 %	472335990
570	NC_020834	TTTTG	2	10	764179	764188	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
571	NC_020834	AAGGT	2	10	766897	766906	40 %	20 %	40 %	0 %	472335994
572	NC_020834	GCACC	2	10	767006	767015	20 %	0 %	20 %	60 %	472335994
573	NC_020834	GCTGG	2	10	767592	767601	0 %	20 %	60 %	20 %	472335994
574	NC_020834	CTTGC	2	10	767655	767664	0 %	40 %	20 %	40 %	472335994
575	NC_020834	TAAAA	2	10	772362	772371	80 %	20 %	0 %	0 %	472336002
576	NC_020834	TTTAA	2	10	772543	772552	40 %	60 %	0 %	0 %	472336002
577	NC_020834	ATTGA	2	10	775982	775991	40 %	40 %	20 %	0 %	472336005
578	NC_020834	ATTTT	2	10	778470	778479	20 %	80 %	0 %	0 %	472336009
579	NC_020834	CAAAT	2	10	778821	778830	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
580	NC_020834	GTTAA	2	10	778840	778849	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
581	NC_020834	AATTT	2	10	778925	778934	40 %	60 %	0 %	0 %	472336010
582	NC_020834	ATAGC	2	10	779040	779049	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
583	NC_020834	CTTGT	2	10	779537	779546	0 %	60 %	20 %	20 %	472336011
584	NC_020834	AGTAG	2	10	780972	780981	40 %	20 %	40 %	0 %	472336012
585	NC_020834	AGATA	2	10	785306	785315	60 %	20 %	20 %	0 %	472336016
586	NC_020834	TTTGG	2	10	786807	786816	0 %	60 %	40 %	0 %	472336019
587	NC_020834	CTGAA	2	10	788981	788990	40 %	20 %	20 %	20 %	472336020
588	NC_020834	GGGCA	2	10	790780	790789	20 %	0 %	60 %	20 %	472336022
589	NC_020834	TCGGC	2	10	790852	790861	0 %	20 %	40 %	40 %	472336022
590	NC_020834	GGTGT	2	10	791754	791763	0 %	40 %	60 %	0 %	472336022
591	NC_020834	TTGGT	2	10	792203	792212	0 %	60 %	40 %	0 %	472336023
592	NC_020834	GCCTT	2	10	792797	792806	0 %	40 %	20 %	40 %	472336023
593	NC_020834	GCAGA	2	10	795825	795834	40 %	0 %	40 %	20 %	472336027
594	NC_020834	AGGAC	2	10	797293	797302	40 %	0 %	40 %	20 %	472336027
595	NC_020834	GAGCA	2	10	797447	797456	40 %	0 %	40 %	20 %	472336027
596	NC_020834	TTCCG	2	10	799537	799546	0 %	40 %	20 %	40 %	472336031
597	NC_020834	GTGGA	2	10	800912	800921	20 %	20 %	60 %	0 %	472336032
598	NC_020834	TAAAT	2	10	800933	800942	60 %	40 %	0 %	0 %	472336032
599	NC_020834	ACCGG	2	10	804427	804436	20 %	0 %	40 %	40 %	472336038
600	NC_020834	AAATA	2	10	804648	804657	80 %	20 %	0 %	0 %	472336038
601	NC_020834	ATCCC	2	10	804704	804713	20 %	20 %	0 %	60 %	472336038
602	NC_020834	GCTTT	2	10	809491	809500	0 %	60 %	20 %	20 %	472336042
603	NC_020834	ATTTG	2	10	809843	809852	20 %	60 %	20 %	0 %	472336042
604	NC_020834	GATTT	2	10	810667	810676	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020834	GTTTT	2	10	811124	811133	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020834	CTGAT	2	10	812321	812330	20 %	40 %	20 %	20 %	472336045
607	NC_020834	AGCCA	2	10	813806	813815	40 %	0 %	20 %	40 %	472336046
608	NC_020834	AGCAG	2	10	815383	815392	40 %	0 %	40 %	20 %	472336047
609	NC_020834	CAGGG	2	10	816923	816932	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
610	NC_020834	CGAGC	2	10	816961	816970	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
611	NC_020834	CAAAC	2	10	817634	817643	60 %	0 %	0 %	40 %	472336048
612	NC_020834	ATCCA	2	10	821569	821578	40 %	20 %	0 %	40 %	472336052
613	NC_020834	TGATT	2	10	821789	821798	20 %	60 %	20 %	0 %	472336052
614	NC_020834	ACCAA	2	10	822476	822485	60 %	0 %	0 %	40 %	472336052
615	NC_020834	TGAAA	2	10	823703	823712	60 %	20 %	20 %	0 %	472336054
616	NC_020834	ATAAA	2	10	824307	824316	80 %	20 %	0 %	0 %	472336054
617	NC_020834	GGTGG	2	10	825470	825479	0 %	20 %	80 %	0 %	472336057
618	NC_020834	CGAGA	2	10	826392	826401	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
619	NC_020834	CAAAT	2	10	826528	826537	60 %	20 %	0 %	20 %	472336058
620	NC_020834	AAAAT	2	10	827183	827192	80 %	20 %	0 %	0 %	472336059
621	NC_020834	ATTGG	2	10	829900	829909	20 %	40 %	40 %	0 %	472336063
622	NC_020834	ATGCT	2	10	830152	830161	20 %	40 %	20 %	20 %	472336063
623	NC_020834	AAATT	2	10	832381	832390	60 %	40 %	0 %	0 %	472336064
624	NC_020834	AGCTC	2	10	832830	832839	20 %	20 %	20 %	40 %	472336064
625	NC_020834	TTTAT	2	10	833253	833262	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020834	CGGCT	2	10	834614	834623	0 %	20 %	40 %	40 %	472336065
627	NC_020834	AAAAT	2	10	836867	836876	80 %	20 %	0 %	0 %	472336066
628	NC_020834	ACGCC	2	10	837676	837685	20 %	0 %	20 %	60 %	472336067
629	NC_020834	GATTG	2	10	841774	841783	20 %	40 %	40 %	0 %	472336071
630	NC_020834	CCAAA	2	10	842453	842462	60 %	0 %	0 %	40 %	472336072
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