MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 32182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_020833	TCA	2	6	504760	504765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472333017
6002	NC_020833	TCC	2	6	504880	504885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_020833	TTA	2	6	504995	505000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_020833	GAA	2	6	505112	505117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333018
6005	NC_020833	GAT	3	9	505127	505135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472333018
6006	NC_020833	TAT	2	6	505167	505172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472333018
6007	NC_020833	TAT	2	6	505188	505193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472333018
6008	NC_020833	GTA	2	6	505706	505711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472333019
6009	NC_020833	CTG	2	6	505852	505857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472333019
6010	NC_020833	TGA	2	6	505917	505922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472333019
6011	NC_020833	ATC	2	6	506006	506011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472333019
6012	NC_020833	TCT	2	6	506019	506024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472333019
6013	NC_020833	ATC	2	6	506048	506053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472333019
6014	NC_020833	TAA	2	6	506225	506230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472333019
6015	NC_020833	AAG	2	6	506725	506730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333020
6016	NC_020833	ACC	2	6	506786	506791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472333020
6017	NC_020833	GCC	2	6	506849	506854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472333020
6018	NC_020833	GTG	2	6	506886	506891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472333020
6019	NC_020833	TGA	2	6	506900	506905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472333020
6020	NC_020833	GAA	2	6	507327	507332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333020
6021	NC_020833	CTA	2	6	507368	507373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472333020
6022	NC_020833	ACC	2	6	507461	507466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472333020
6023	NC_020833	TGA	2	6	507467	507472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472333020
6024	NC_020833	TGA	2	6	507631	507636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472333020
6025	NC_020833	CAC	2	6	507740	507745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472333020
6026	NC_020833	CCA	2	6	507853	507858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472333020
6027	NC_020833	ACC	2	6	507876	507881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472333020
6028	NC_020833	TGA	2	6	507932	507937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472333020
6029	NC_020833	TCA	2	6	508039	508044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_020833	AGC	2	6	508119	508124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472333021
6031	NC_020833	CCA	2	6	508151	508156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472333021
6032	NC_020833	TAA	2	6	508179	508184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472333021
6033	NC_020833	AGC	2	6	508257	508262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472333021
6034	NC_020833	CTC	2	6	508299	508304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472333021
6035	NC_020833	ATG	2	6	508452	508457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472333021
6036	NC_020833	ATC	2	6	508638	508643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472333021
6037	NC_020833	ATG	2	6	508998	509003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472333022
6038	NC_020833	GAA	2	6	509019	509024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333022
6039	NC_020833	ACA	2	6	509299	509304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472333022
6040	NC_020833	AGC	2	6	509333	509338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472333022
6041	NC_020833	ACT	2	6	509374	509379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472333022
6042	NC_020833	GTG	2	6	509706	509711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472333022
6043	NC_020833	GCA	2	6	509760	509765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472333022
6044	NC_020833	TAT	2	6	509780	509785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472333022
6045	NC_020833	GAA	2	6	509808	509813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333022
6046	NC_020833	ATA	2	6	509840	509845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472333022
6047	NC_020833	ATT	2	6	509936	509941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_020833	CAA	2	6	509983	509988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_020833	ACA	2	6	510003	510008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472333023
6050	NC_020833	TTA	2	6	510244	510249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_020833	AGA	2	6	510332	510337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333024
6052	NC_020833	ATT	2	6	510576	510581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472333024
6053	NC_020833	AAG	2	6	510583	510588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333024
6054	NC_020833	AAG	2	6	510592	510597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333024
6055	NC_020833	AGA	2	6	510617	510622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333024
6056	NC_020833	AGC	2	6	510638	510643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472333024
6057	NC_020833	ACC	2	6	510648	510653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472333024
6058	NC_020833	AAC	2	6	510693	510698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472333024
6059	NC_020833	GGT	2	6	510708	510713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472333024
6060	NC_020833	CCG	2	6	510719	510724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472333024
6061	NC_020833	TGA	2	6	510734	510739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472333024
6062	NC_020833	CCG	2	6	510808	510813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472333024
6063	NC_020833	GCG	2	6	510888	510893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472333024
6064	NC_020833	ACA	2	6	510994	510999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472333024
6065	NC_020833	TCA	2	6	511051	511056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472333024
6066	NC_020833	CTC	2	6	511211	511216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472333024
6067	NC_020833	GGC	2	6	511230	511235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472333024
6068	NC_020833	GAA	2	6	511242	511247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333024
6069	NC_020833	GGT	2	6	511314	511319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472333024
6070	NC_020833	CCA	2	6	511358	511363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472333024
6071	NC_020833	CAT	2	6	511477	511482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472333024
6072	NC_020833	AGA	3	9	511577	511585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333024
6073	NC_020833	TTG	2	6	511705	511710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472333024
6074	NC_020833	CGC	2	6	511735	511740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472333024
6075	NC_020833	GAA	3	9	511824	511832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333024
6076	NC_020833	CAT	2	6	511839	511844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472333024
6077	NC_020833	AAG	2	6	511852	511857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333024
6078	NC_020833	ACC	2	6	511952	511957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472333024
6079	NC_020833	GAA	2	6	512010	512015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333024
6080	NC_020833	GAA	2	6	512022	512027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333024
6081	NC_020833	ACT	2	6	512136	512141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472333024
6082	NC_020833	GAA	2	6	512148	512153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333024
6083	NC_020833	GAA	2	6	512196	512201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333024
6084	NC_020833	AAG	2	6	512305	512310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333024
6085	NC_020833	CTG	2	6	512332	512337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472333024
6086	NC_020833	CAA	2	6	512382	512387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472333024
6087	NC_020833	AAG	2	6	512407	512412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333024
6088	NC_020833	CGT	3	9	512511	512519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472333024
6089	NC_020833	CAT	2	6	512641	512646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472333024
6090	NC_020833	TTG	2	6	512689	512694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472333024
6091	NC_020833	AGA	2	6	512711	512716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333024
6092	NC_020833	GAA	2	6	512717	512722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333024
6093	NC_020833	AGA	2	6	512816	512821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333024
6094	NC_020833	GTT	2	6	512886	512891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472333024
6095	NC_020833	AGT	2	6	513125	513130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472333024
6096	NC_020833	TTA	2	6	513344	513349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_020833	ATT	2	6	513408	513413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472333025
6098	NC_020833	TGC	2	6	513438	513443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472333025
6099	NC_020833	AAG	2	6	513458	513463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333025
6100	NC_020833	AAG	2	6	513500	513505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333025
6101	NC_020833	GCA	2	6	513571	513576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472333025
6102	NC_020833	ATG	2	6	513578	513583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472333025
6103	NC_020833	CAG	2	6	513596	513601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472333025
6104	NC_020833	AGA	2	6	513609	513614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333025
6105	NC_020833	GAA	2	6	513676	513681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333025
6106	NC_020833	AGC	3	9	513687	513695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472333025
6107	NC_020833	ATG	2	6	513698	513703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472333025
6108	NC_020833	CAA	2	6	513713	513718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472333025
6109	NC_020833	AGA	2	6	513729	513734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333025
6110	NC_020833	GCT	2	6	513760	513765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472333025
6111	NC_020833	GAA	2	6	513796	513801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333025
6112	NC_020833	AGC	3	9	513807	513815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472333025
6113	NC_020833	CAG	2	6	513836	513841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472333025
6114	NC_020833	AGA	2	6	513849	513854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333025
6115	NC_020833	GCA	2	6	513880	513885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472333025
6116	NC_020833	GAA	2	6	513916	513921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333025
6117	NC_020833	ATT	2	6	514036	514041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472333026
6118	NC_020833	GCT	2	6	514089	514094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472333026
6119	NC_020833	TGC	2	6	514238	514243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472333026
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6123	NC_020833	GCT	2	6	514481	514486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472333027
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