MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 3530

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019965	CGTGC	2	10	4380292	4380301	0 %	20 %	40 %	40 %	433644079
3502	NC_019965	TGAAA	2	10	4383048	4383057	60 %	20 %	20 %	0 %	433644081
3503	NC_019965	CACAC	2	10	4383327	4383336	40 %	0 %	0 %	60 %	433644082
3504	NC_019965	GTCGC	2	10	4383929	4383938	0 %	20 %	40 %	40 %	433644082
3505	NC_019965	GCTGA	2	10	4385505	4385514	20 %	20 %	40 %	20 %	433644085
3506	NC_019965	GGCGA	2	10	4389116	4389125	20 %	0 %	60 %	20 %	433644087
3507	NC_019965	GCCGC	2	10	4389530	4389539	0 %	0 %	40 %	60 %	433644087
3508	NC_019965	CACGC	2	10	4391424	4391433	20 %	0 %	20 %	60 %	433644088
3509	NC_019965	CGTCG	2	10	4393568	4393577	0 %	20 %	40 %	40 %	433644090
3510	NC_019965	AGTCC	2	10	4394004	4394013	20 %	20 %	20 %	40 %	433644090
3511	NC_019965	GCCGG	2	10	4394483	4394492	0 %	0 %	60 %	40 %	433644090
3512	NC_019965	CCGGC	2	10	4395650	4395659	0 %	0 %	40 %	60 %	433644091
3513	NC_019965	CAGCG	2	10	4397227	4397236	20 %	0 %	40 %	40 %	433644092
3514	NC_019965	TTAAT	2	10	4398260	4398269	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_019965	AGCCC	2	10	4402986	4402995	20 %	0 %	20 %	60 %	433644099
3516	NC_019965	CTGGC	2	10	4404447	4404456	0 %	20 %	40 %	40 %	433644099
3517	NC_019965	GCCGT	2	10	4405230	4405239	0 %	20 %	40 %	40 %	433644099
3518	NC_019965	CCCTC	2	10	4405276	4405285	0 %	20 %	0 %	80 %	433644100
3519	NC_019965	CCCGT	2	10	4408501	4408510	0 %	20 %	20 %	60 %	433644100
3520	NC_019965	CGGCC	2	10	4408687	4408696	0 %	0 %	40 %	60 %	433644100
3521	NC_019965	CCGGG	2	10	4408825	4408834	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3522	NC_019965	CGGAC	2	10	4409214	4409223	20 %	0 %	40 %	40 %	433644101
3523	NC_019965	CCGCC	2	10	4410410	4410419	0 %	0 %	20 %	80 %	433644103
3524	NC_019965	CCGCG	2	10	4411879	4411888	0 %	0 %	40 %	60 %	433644105
3525	NC_019965	TGCGC	2	10	4411899	4411908	0 %	20 %	40 %	40 %	433644105
3526	NC_019965	CTGCG	2	10	4412674	4412683	0 %	20 %	40 %	40 %	433644105
3527	NC_019965	GTCGC	2	10	4414343	4414352	0 %	20 %	40 %	40 %	433644107
3528	NC_019965	TCCGG	2	10	4414463	4414472	0 %	20 %	40 %	40 %	433644107
3529	NC_019965	CGCGC	2	10	4415226	4415235	0 %	0 %	40 %	60 %	433644108
3530	NC_019965	CCGAG	2	10	4419139	4419148	20 %	0 %	40 %	40 %	433644113

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.