MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 3523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018078	TCATC	2	10	1003	1012	20 %	40 %	0 %	40 %	392430410
2	NC_018078	CGTTT	2	10	2193	2202	0 %	60 %	20 %	20 %	392430411
3	NC_018078	CGGTT	2	10	3342	3351	0 %	40 %	40 %	20 %	392430411
4	NC_018078	GTCGG	2	10	4690	4699	0 %	20 %	60 %	20 %	392430413
5	NC_018078	GCAGC	2	10	7474	7483	20 %	0 %	40 %	40 %	392430415
6	NC_018078	CGGTG	2	10	9382	9391	0 %	20 %	60 %	20 %	392430415
7	NC_018078	CAGAC	2	10	9900	9909	40 %	0 %	20 %	40 %	392430415
8	NC_018078	CGCAA	2	10	10424	10433	40 %	0 %	20 %	40 %	392430416
9	NC_018078	CGGCG	2	10	10550	10559	0 %	0 %	60 %	40 %	392430416
10	NC_018078	ACCCG	2	10	11380	11389	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_018078	CGACC	2	10	13773	13782	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_018078	GGCGT	2	10	14255	14264	0 %	20 %	60 %	20 %	392430421
13	NC_018078	GGGCC	2	10	14538	14547	0 %	0 %	60 %	40 %	392430421
14	NC_018078	GCGTT	2	10	15283	15292	0 %	40 %	40 %	20 %	392430422
15	NC_018078	CCAGC	2	10	15823	15832	20 %	0 %	20 %	60 %	392430423
16	NC_018078	ACCGA	2	10	16586	16595	40 %	0 %	20 %	40 %	392430423
17	NC_018078	ATCGG	2	10	16978	16987	20 %	20 %	40 %	20 %	392430423
18	NC_018078	CGGCC	2	10	17987	17996	0 %	0 %	40 %	60 %	392430424
19	NC_018078	TTAGC	2	10	19138	19147	20 %	40 %	20 %	20 %	392430425
20	NC_018078	GGTCC	2	10	19210	19219	0 %	20 %	40 %	40 %	392430425
21	NC_018078	GTCGT	2	10	21729	21738	0 %	40 %	40 %	20 %	392430426
22	NC_018078	ATCAC	2	10	24002	24011	40 %	20 %	0 %	40 %	392430429
23	NC_018078	GCCGG	2	10	24689	24698	0 %	0 %	60 %	40 %	392430429
24	NC_018078	CGAGC	2	10	27069	27078	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_018078	GGCAA	2	10	29402	29411	40 %	0 %	40 %	20 %	392430434
26	NC_018078	CGATC	2	10	30228	30237	20 %	20 %	20 %	40 %	392430435
27	NC_018078	CGACG	2	10	32411	32420	20 %	0 %	40 %	40 %	392430439
28	NC_018078	GCGTC	2	10	32466	32475	0 %	20 %	40 %	40 %	392430439
29	NC_018078	GACAC	2	10	32563	32572	40 %	0 %	20 %	40 %	392430439
30	NC_018078	CCGCC	2	10	33909	33918	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
31	NC_018078	TCCTG	2	10	37569	37578	0 %	40 %	20 %	40 %	392430444
32	NC_018078	CTCGG	2	10	37662	37671	0 %	20 %	40 %	40 %	392430444
33	NC_018078	GGCGC	2	10	38205	38214	0 %	0 %	60 %	40 %	392430444
34	NC_018078	TGGCC	2	10	38353	38362	0 %	20 %	40 %	40 %	392430444
35	NC_018078	CGGCG	2	10	38885	38894	0 %	0 %	60 %	40 %	392430444
36	NC_018078	GTCCA	2	10	39497	39506	20 %	20 %	20 %	40 %	392430445
37	NC_018078	GCCAA	2	10	41631	41640	40 %	0 %	20 %	40 %	392430447
38	NC_018078	GCGTC	2	10	42046	42055	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_018078	GCACA	2	10	42430	42439	40 %	0 %	20 %	40 %	392430448
40	NC_018078	GGTAC	2	10	44964	44973	20 %	20 %	40 %	20 %	392430450
41	NC_018078	TCGAA	2	10	45196	45205	40 %	20 %	20 %	20 %	392430450
42	NC_018078	GCACC	2	10	46126	46135	20 %	0 %	20 %	60 %	392430450
43	NC_018078	CGGTG	2	10	47160	47169	0 %	20 %	60 %	20 %	392430451
44	NC_018078	TCATG	2	10	47306	47315	20 %	40 %	20 %	20 %	392430451
45	NC_018078	ATCGG	2	10	47453	47462	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018078	GCAGC	2	10	48700	48709	20 %	0 %	40 %	40 %	392430453
47	NC_018078	CCCGA	2	10	48783	48792	20 %	0 %	20 %	60 %	392430453
48	NC_018078	CAGCG	2	10	49908	49917	20 %	0 %	40 %	40 %	392430454
49	NC_018078	CTCCC	2	10	56342	56351	0 %	20 %	0 %	80 %	392430460
50	NC_018078	CGGCG	2	10	56791	56800	0 %	0 %	60 %	40 %	392430460
51	NC_018078	CGACC	2	10	58323	58332	20 %	0 %	20 %	60 %	392430462
52	NC_018078	CTTCG	2	10	59010	59019	0 %	40 %	20 %	40 %	392430463
53	NC_018078	CGGTG	2	10	60066	60075	0 %	20 %	60 %	20 %	392430466
54	NC_018078	TCAGG	2	10	62551	62560	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018078	TGCCG	2	10	65582	65591	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_018078	GGCGA	2	10	66514	66523	20 %	0 %	60 %	20 %	392430470
57	NC_018078	GGTGT	2	10	69090	69099	0 %	40 %	60 %	0 %	392430473
58	NC_018078	ATCGG	2	10	69727	69736	20 %	20 %	40 %	20 %	392430473
59	NC_018078	CCGCG	2	10	70264	70273	0 %	0 %	40 %	60 %	392430473
60	NC_018078	GGCAA	2	10	70615	70624	40 %	0 %	40 %	20 %	392430473
61	NC_018078	CGACC	2	10	70904	70913	20 %	0 %	20 %	60 %	392430473
62	NC_018078	CGGGT	2	10	71358	71367	0 %	20 %	60 %	20 %	392430473
63	NC_018078	GGTCG	2	10	71418	71427	0 %	20 %	60 %	20 %	392430473
64	NC_018078	TGCCT	2	10	72159	72168	0 %	40 %	20 %	40 %	392430475
65	NC_018078	GTCCA	2	10	73030	73039	20 %	20 %	20 %	40 %	392430476
66	NC_018078	TGACC	2	10	75654	75663	20 %	20 %	20 %	40 %	392430478
67	NC_018078	GCCAA	2	10	75968	75977	40 %	0 %	20 %	40 %	392430478
68	NC_018078	GTCGC	2	10	76045	76054	0 %	20 %	40 %	40 %	392430478
69	NC_018078	GCGCG	2	10	77133	77142	0 %	0 %	60 %	40 %	392430479
70	NC_018078	CACGA	2	10	79981	79990	40 %	0 %	20 %	40 %	392430481
71	NC_018078	GCACC	2	10	80421	80430	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_018078	CCACC	2	10	80614	80623	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
73	NC_018078	GAGCA	2	10	82519	82528	40 %	0 %	40 %	20 %	392430483
74	NC_018078	GCCGG	2	10	82618	82627	0 %	0 %	60 %	40 %	392430483
75	NC_018078	GCGAC	2	10	82694	82703	20 %	0 %	40 %	40 %	392430483
76	NC_018078	ATCCG	2	10	83464	83473	20 %	20 %	20 %	40 %	392430484
77	NC_018078	CACCG	2	10	84244	84253	20 %	0 %	20 %	60 %	392430485
78	NC_018078	TGGTC	2	10	86379	86388	0 %	40 %	40 %	20 %	392430487
79	NC_018078	GCTGG	2	10	87016	87025	0 %	20 %	60 %	20 %	392430488
80	NC_018078	TGGGT	2	10	90054	90063	0 %	40 %	60 %	0 %	392430493
81	NC_018078	TCGCC	2	10	90261	90270	0 %	20 %	20 %	60 %	392430493
82	NC_018078	GGGCC	2	10	91234	91243	0 %	0 %	60 %	40 %	392430494
83	NC_018078	GGCCG	2	10	92553	92562	0 %	0 %	60 %	40 %	392430495
84	NC_018078	GCGCC	2	10	93205	93214	0 %	0 %	40 %	60 %	392430495
85	NC_018078	GCTTG	2	10	95237	95246	0 %	40 %	40 %	20 %	392430497
86	NC_018078	CGTGT	2	10	95669	95678	0 %	40 %	40 %	20 %	392430498
87	NC_018078	AGATC	2	10	95748	95757	40 %	20 %	20 %	20 %	392430498
88	NC_018078	CGGCG	2	10	99329	99338	0 %	0 %	60 %	40 %	392430501
89	NC_018078	CGGCG	2	10	99456	99465	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_018078	GCGGT	2	10	100405	100414	0 %	20 %	60 %	20 %	392430502
91	NC_018078	GGTGA	2	10	100623	100632	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018078	GCGCC	2	10	103237	103246	0 %	0 %	40 %	60 %	392430504
93	NC_018078	GGTGG	2	10	103925	103934	0 %	20 %	80 %	0 %	392430505
94	NC_018078	GGCTT	2	10	104938	104947	0 %	40 %	40 %	20 %	392430506
95	NC_018078	CTGGC	2	10	105660	105669	0 %	20 %	40 %	40 %	392430507
96	NC_018078	GCACA	2	10	106781	106790	40 %	0 %	20 %	40 %	392430507
97	NC_018078	CTGAA	2	10	109111	109120	40 %	20 %	20 %	20 %	392430510
98	NC_018078	ATCGC	2	10	109606	109615	20 %	20 %	20 %	40 %	392430510
99	NC_018078	TCTGA	2	10	110940	110949	20 %	40 %	20 %	20 %	392430512
100	NC_018078	CGGTC	2	10	111215	111224	0 %	20 %	40 %	40 %	392430512
101	NC_018078	GACCA	2	10	112353	112362	40 %	0 %	20 %	40 %	392430512
102	NC_018078	GGCTG	2	10	114917	114926	0 %	20 %	60 %	20 %	392430512
103	NC_018078	CCGCG	2	10	118837	118846	0 %	0 %	40 %	60 %	392430513
104	NC_018078	TCGTG	2	10	122790	122799	0 %	40 %	40 %	20 %	392430515
105	NC_018078	GCACG	2	10	124445	124454	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_018078	CCGGA	2	10	124571	124580	20 %	0 %	40 %	40 %	392430517
107	NC_018078	TGCGC	2	10	127044	127053	0 %	20 %	40 %	40 %	392430518
108	NC_018078	GCGAG	2	10	127555	127564	20 %	0 %	60 %	20 %	392430518
109	NC_018078	GGGGT	2	10	128564	128573	0 %	20 %	80 %	0 %	392430518
110	NC_018078	CCCAC	2	10	129126	129135	20 %	0 %	0 %	80 %	392430518
111	NC_018078	CCGGC	2	10	129636	129645	0 %	0 %	40 %	60 %	392430518
112	NC_018078	TGCGG	2	10	130046	130055	0 %	20 %	60 %	20 %	392430518
113	NC_018078	ATCAC	2	10	131525	131534	40 %	20 %	0 %	40 %	392430520
114	NC_018078	ATCGG	2	10	131573	131582	20 %	20 %	40 %	20 %	392430520
115	NC_018078	CGGGC	2	10	132664	132673	0 %	0 %	60 %	40 %	392430520
116	NC_018078	GCGAT	2	10	134469	134478	20 %	20 %	40 %	20 %	392430522
117	NC_018078	GTTCG	2	10	134690	134699	0 %	40 %	40 %	20 %	392430522
118	NC_018078	CCTGG	2	10	135082	135091	0 %	20 %	40 %	40 %	392430522
119	NC_018078	GGCCC	2	10	135188	135197	0 %	0 %	40 %	60 %	392430522
120	NC_018078	CGTTG	2	10	135700	135709	0 %	40 %	40 %	20 %	392430522
121	NC_018078	CGACC	2	10	135772	135781	20 %	0 %	20 %	60 %	392430522
122	NC_018078	GAGAT	2	10	138792	138801	40 %	20 %	40 %	0 %	392430526
123	NC_018078	CGGCG	2	10	140946	140955	0 %	0 %	60 %	40 %	392430527
124	NC_018078	TGCGG	2	10	141579	141588	0 %	20 %	60 %	20 %	392430528
125	NC_018078	CGCTG	2	10	142286	142295	0 %	20 %	40 %	40 %	392430529
126	NC_018078	GTTGC	2	10	142832	142841	0 %	40 %	40 %	20 %	392430529
127	NC_018078	CCGAT	2	10	143580	143589	20 %	20 %	20 %	40 %	392430529
128	NC_018078	ATCGC	2	10	144271	144280	20 %	20 %	20 %	40 %	392430530
129	NC_018078	AACCG	2	10	145010	145019	40 %	0 %	20 %	40 %	392430530
130	NC_018078	CCGCC	2	10	145597	145606	0 %	0 %	20 %	80 %	392430530
131	NC_018078	CCGCC	2	10	146240	146249	0 %	0 %	20 %	80 %	392430531
132	NC_018078	GGGTC	2	10	147994	148003	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_018078	ATCGG	2	10	149724	149733	20 %	20 %	40 %	20 %	392430535
134	NC_018078	ATTGG	2	10	152560	152569	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018078	AGCGA	2	10	154463	154472	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018078	TCGTC	2	10	154810	154819	0 %	40 %	20 %	40 %	392430539
137	NC_018078	CACGC	2	10	155274	155283	20 %	0 %	20 %	60 %	392430539
138	NC_018078	ATTCT	2	10	156118	156127	20 %	60 %	0 %	20 %	392430540
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145	NC_018078	CGGTT	2	10	161650	161659	0 %	40 %	40 %	20 %	392430545
146	NC_018078	GTCGC	2	10	161812	161821	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
147	NC_018078	GCCGG	2	10	162111	162120	0 %	0 %	60 %	40 %	392430546
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171	NC_018078	GGCTG	2	10	190900	190909	0 %	20 %	60 %	20 %	392430576
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175	NC_018078	GGCCG	2	10	196316	196325	0 %	0 %	60 %	40 %	392430581
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236	NC_018078	GCAGT	2	10	275943	275952	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
237	NC_018078	GATCC	2	10	278385	278394	20 %	20 %	20 %	40 %	392430648
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246	NC_018078	ACGCC	2	10	294165	294174	20 %	0 %	20 %	60 %	392430661
247	NC_018078	CGGCC	2	10	302082	302091	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
248	NC_018078	TGCGC	2	10	302129	302138	0 %	20 %	40 %	40 %	392430668
249	NC_018078	TGCGC	2	10	303338	303347	0 %	20 %	40 %	40 %	392430669
250	NC_018078	TCGAC	2	10	305287	305296	20 %	20 %	20 %	40 %	392430669
251	NC_018078	TGGGG	2	10	308329	308338	0 %	20 %	80 %	0 %	392430673
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253	NC_018078	TGCCA	2	10	310742	310751	20 %	20 %	20 %	40 %	392430676
254	NC_018078	CGCAG	2	10	311898	311907	20 %	0 %	40 %	40 %	392430677
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256	NC_018078	CGGCC	2	10	313106	313115	0 %	0 %	40 %	60 %	392430678
257	NC_018078	CAGAT	2	10	314013	314022	40 %	20 %	20 %	20 %	392430678
258	NC_018078	AGCGG	2	10	314237	314246	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
259	NC_018078	CGCAG	2	10	314559	314568	20 %	0 %	40 %	40 %	392430679
260	NC_018078	GGCCG	2	10	314874	314883	0 %	0 %	60 %	40 %	392430680
261	NC_018078	GCCCG	2	10	315372	315381	0 %	0 %	40 %	60 %	392430680
262	NC_018078	TCGGC	2	10	316400	316409	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
263	NC_018078	CCTGG	2	10	316948	316957	0 %	20 %	40 %	40 %	392430682
264	NC_018078	GGCCG	2	10	320053	320062	0 %	0 %	60 %	40 %	392430683
265	NC_018078	TGCGC	2	10	320550	320559	0 %	20 %	40 %	40 %	392430683
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