MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 3523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018078	GACCA	2	10	4370701	4370710	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3502	NC_018078	CGTCG	2	10	4370856	4370865	0 %	20 %	40 %	40 %	392434383
3503	NC_018078	GCCGG	2	10	4371771	4371780	0 %	0 %	60 %	40 %	392434384
3504	NC_018078	CCAGG	2	10	4372015	4372024	20 %	0 %	40 %	40 %	392434385
3505	NC_018078	CCGGC	2	10	4372938	4372947	0 %	0 %	40 %	60 %	392434385
3506	NC_018078	CAGCG	2	10	4374497	4374506	20 %	0 %	40 %	40 %	392434387
3507	NC_018078	TATCT	2	10	4375121	4375130	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3508	NC_018078	GCCAC	2	10	4377778	4377787	20 %	0 %	20 %	60 %	392434389
3509	NC_018078	AGCCC	2	10	4382133	4382142	20 %	0 %	20 %	60 %	392434395
3510	NC_018078	CTGGC	2	10	4383594	4383603	0 %	20 %	40 %	40 %	392434395
3511	NC_018078	GCCGT	2	10	4384377	4384386	0 %	20 %	40 %	40 %	392434395
3512	NC_018078	CCCGT	2	10	4387648	4387657	0 %	20 %	20 %	60 %	392434396
3513	NC_018078	CGGCC	2	10	4387834	4387843	0 %	0 %	40 %	60 %	392434396
3514	NC_018078	CCGGG	2	10	4387972	4387981	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3515	NC_018078	CGGAC	2	10	4388361	4388370	20 %	0 %	40 %	40 %	392434397
3516	NC_018078	CCGCC	2	10	4389551	4389560	0 %	0 %	20 %	80 %	392434399
3517	NC_018078	CCGCG	2	10	4391020	4391029	0 %	0 %	40 %	60 %	392434401
3518	NC_018078	TGCGC	2	10	4391040	4391049	0 %	20 %	40 %	40 %	392434401
3519	NC_018078	CTGCG	2	10	4391815	4391824	0 %	20 %	40 %	40 %	392434401
3520	NC_018078	GTCGC	2	10	4393496	4393505	0 %	20 %	40 %	40 %	392434403
3521	NC_018078	TCCGG	2	10	4393616	4393625	0 %	20 %	40 %	40 %	392434403
3522	NC_018078	CGCGC	2	10	4394379	4394388	0 %	0 %	40 %	60 %	392434404
3523	NC_018078	CCGAG	2	10	4398164	4398173	20 %	0 %	40 %	40 %	392434409

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.