MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 3523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018078	GTCGG	2	10	1218081	1218090	0 %	20 %	60 %	20 %	392431502
1002	NC_018078	TGCCG	2	10	1218740	1218749	0 %	20 %	40 %	40 %	392431503
1003	NC_018078	GACGC	2	10	1218798	1218807	20 %	0 %	40 %	40 %	392431503
1004	NC_018078	CACCT	2	10	1218860	1218869	20 %	20 %	0 %	60 %	392431503
1005	NC_018078	CAAGT	2	10	1219763	1219772	40 %	20 %	20 %	20 %	392431503
1006	NC_018078	CAGAA	2	10	1220589	1220598	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1007	NC_018078	GCAGC	2	10	1221286	1221295	20 %	0 %	40 %	40 %	392431505
1008	NC_018078	GCAAG	2	10	1224718	1224727	40 %	0 %	40 %	20 %	392431509
1009	NC_018078	GCCGA	2	10	1228509	1228518	20 %	0 %	40 %	40 %	392431513
1010	NC_018078	GCTGG	2	10	1231749	1231758	0 %	20 %	60 %	20 %	392431517
1011	NC_018078	CGGCG	2	10	1232327	1232336	0 %	0 %	60 %	40 %	392431518
1012	NC_018078	CTCGG	2	10	1235141	1235150	0 %	20 %	40 %	40 %	392431520
1013	NC_018078	CCACG	2	10	1235616	1235625	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1014	NC_018078	CGGCA	2	10	1237219	1237228	20 %	0 %	40 %	40 %	392431523
1015	NC_018078	CGGTC	2	10	1237720	1237729	0 %	20 %	40 %	40 %	392431523
1016	NC_018078	CGTGC	2	10	1242991	1243000	0 %	20 %	40 %	40 %	392431529
1017	NC_018078	GCAGC	2	10	1244028	1244037	20 %	0 %	40 %	40 %	392431530
1018	NC_018078	CCAAC	2	10	1246296	1246305	40 %	0 %	0 %	60 %	392431534
1019	NC_018078	GCAGA	2	10	1247748	1247757	40 %	0 %	40 %	20 %	392431535
1020	NC_018078	CGATG	2	10	1248063	1248072	20 %	20 %	40 %	20 %	392431535
1021	NC_018078	GATCG	2	10	1248462	1248471	20 %	20 %	40 %	20 %	392431535
1022	NC_018078	ACGCG	2	10	1248540	1248549	20 %	0 %	40 %	40 %	392431535
1023	NC_018078	GTGTG	2	10	1249630	1249639	0 %	40 %	60 %	0 %	392431536
1024	NC_018078	CGAAC	2	10	1251961	1251970	40 %	0 %	20 %	40 %	392431538
1025	NC_018078	TGCGC	2	10	1252996	1253005	0 %	20 %	40 %	40 %	392431538
1026	NC_018078	CGGCC	2	10	1256583	1256592	0 %	0 %	40 %	60 %	392431542
1027	NC_018078	CGGTG	2	10	1257737	1257746	0 %	20 %	60 %	20 %	392431542
1028	NC_018078	GCCGG	2	10	1257806	1257815	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1029	NC_018078	CGCCC	2	10	1258649	1258658	0 %	0 %	20 %	80 %	392431543
1030	NC_018078	GAGCT	2	10	1259551	1259560	20 %	20 %	40 %	20 %	392431544
1031	NC_018078	CCTGC	2	10	1261208	1261217	0 %	20 %	20 %	60 %	392431545
1032	NC_018078	GCTGC	2	10	1264996	1265005	0 %	20 %	40 %	40 %	392431549
1033	NC_018078	CGGGG	2	10	1265799	1265808	0 %	0 %	80 %	20 %	392431550
1034	NC_018078	AACAG	2	10	1265954	1265963	60 %	0 %	20 %	20 %	392431550
1035	NC_018078	CACCC	2	10	1266448	1266457	20 %	0 %	0 %	80 %	392431551
1036	NC_018078	CCCCG	2	10	1266582	1266591	0 %	0 %	20 %	80 %	392431551
1037	NC_018078	GCCCG	2	10	1266597	1266606	0 %	0 %	40 %	60 %	392431551
1038	NC_018078	AAGGC	2	10	1268353	1268362	40 %	0 %	40 %	20 %	392431551
1039	NC_018078	TCGCT	2	10	1268629	1268638	0 %	40 %	20 %	40 %	392431551
1040	NC_018078	CGCTG	2	10	1269371	1269380	0 %	20 %	40 %	40 %	392431553
1041	NC_018078	CGCTG	2	10	1272770	1272779	0 %	20 %	40 %	40 %	392431556
1042	NC_018078	TGGCT	2	10	1277060	1277069	0 %	40 %	40 %	20 %	392431561
1043	NC_018078	CCGAC	2	10	1277570	1277579	20 %	0 %	20 %	60 %	392431562
1044	NC_018078	ATAGT	2	10	1278424	1278433	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_018078	TCGGT	2	10	1281108	1281117	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1046	NC_018078	GCGCG	2	10	1281976	1281985	0 %	0 %	60 %	40 %	392431567
1047	NC_018078	CTGCG	2	10	1282404	1282413	0 %	20 %	40 %	40 %	392431568
1048	NC_018078	AACTC	2	10	1283424	1283433	40 %	20 %	0 %	40 %	392431568
1049	NC_018078	AGCCG	2	10	1283651	1283660	20 %	0 %	40 %	40 %	392431568
1050	NC_018078	CGCGG	2	10	1286023	1286032	0 %	0 %	60 %	40 %	392431571
1051	NC_018078	CACCG	2	10	1289238	1289247	20 %	0 %	20 %	60 %	392431574
1052	NC_018078	AATCG	2	10	1289817	1289826	40 %	20 %	20 %	20 %	392431574
1053	NC_018078	TAAGA	2	10	1290245	1290254	60 %	20 %	20 %	0 %	392431575
1054	NC_018078	GTCGT	2	10	1290518	1290527	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1055	NC_018078	GCTGA	2	10	1292232	1292241	20 %	20 %	40 %	20 %	392431576
1056	NC_018078	GTCGA	2	10	1292405	1292414	20 %	20 %	40 %	20 %	392431577
1057	NC_018078	TCAGA	2	10	1293282	1293291	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1058	NC_018078	CTCAG	2	10	1293436	1293445	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1059	NC_018078	CACGA	2	10	1293648	1293657	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1060	NC_018078	GGTGT	2	10	1294723	1294732	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_018078	CTGGT	2	10	1294860	1294869	0 %	40 %	40 %	20 %	392431578
1062	NC_018078	GGCAT	2	10	1294971	1294980	20 %	20 %	40 %	20 %	392431578
1063	NC_018078	GCGGT	2	10	1295697	1295706	0 %	20 %	60 %	20 %	392431579
1064	NC_018078	GTTGC	2	10	1296547	1296556	0 %	40 %	40 %	20 %	392431579
1065	NC_018078	GCCCA	2	10	1296575	1296584	20 %	0 %	20 %	60 %	392431579
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1067	NC_018078	CGGCG	2	10	1297405	1297414	0 %	0 %	60 %	40 %	392431580
1068	NC_018078	CAGCT	2	10	1297566	1297575	20 %	20 %	20 %	40 %	392431580
1069	NC_018078	TCCAC	2	10	1298058	1298067	20 %	20 %	0 %	60 %	392431582
1070	NC_018078	CGGAT	2	10	1301130	1301139	20 %	20 %	40 %	20 %	392431587
1071	NC_018078	TCGGG	3	15	1301226	1301240	0 %	20 %	60 %	20 %	392431587
1072	NC_018078	CGGCC	2	10	1301248	1301257	0 %	0 %	40 %	60 %	392431587
1073	NC_018078	AGCGA	2	10	1303297	1303306	40 %	0 %	40 %	20 %	392431591
1074	NC_018078	AGCAC	2	10	1304081	1304090	40 %	0 %	20 %	40 %	392431592
1075	NC_018078	GTCGG	2	10	1304167	1304176	0 %	20 %	60 %	20 %	392431592
1076	NC_018078	CGCGG	2	10	1304710	1304719	0 %	0 %	60 %	40 %	392431592
1077	NC_018078	GCCAC	2	10	1304972	1304981	20 %	0 %	20 %	60 %	392431592
1078	NC_018078	GCGCG	2	10	1305563	1305572	0 %	0 %	60 %	40 %	392431593
1079	NC_018078	GCAGC	2	10	1305678	1305687	20 %	0 %	40 %	40 %	392431593
1080	NC_018078	GCGTC	2	10	1306558	1306567	0 %	20 %	40 %	40 %	392431595
1081	NC_018078	GCCGA	2	10	1308894	1308903	20 %	0 %	40 %	40 %	392431597
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1087	NC_018078	ACCAG	2	10	1317274	1317283	40 %	0 %	20 %	40 %	392431605
1088	NC_018078	ACCGC	2	10	1319459	1319468	20 %	0 %	20 %	60 %	392431606
1089	NC_018078	GGGGC	2	10	1319495	1319504	0 %	0 %	80 %	20 %	392431606
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1096	NC_018078	GCCGC	2	10	1333645	1333654	0 %	0 %	40 %	60 %	392431621
1097	NC_018078	TGCGG	2	10	1334091	1334100	0 %	20 %	60 %	20 %	392431622
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1101	NC_018078	TCGGC	2	10	1336204	1336213	0 %	20 %	40 %	40 %	392431624
1102	NC_018078	TTCGC	2	10	1337689	1337698	0 %	40 %	20 %	40 %	392431625
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1107	NC_018078	CGCGG	2	10	1348102	1348111	0 %	0 %	60 %	40 %	392431641
1108	NC_018078	CGGTG	2	10	1350253	1350262	0 %	20 %	60 %	20 %	392431642
1109	NC_018078	CCGAT	2	10	1350507	1350516	20 %	20 %	20 %	40 %	392431642
1110	NC_018078	CGGCC	2	10	1350708	1350717	0 %	0 %	40 %	60 %	392431643
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1115	NC_018078	CGATC	2	10	1356175	1356184	20 %	20 %	20 %	40 %	392431648
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1117	NC_018078	CGGCG	2	10	1359440	1359449	0 %	0 %	60 %	40 %	392431652
1118	NC_018078	CGCGT	2	10	1359539	1359548	0 %	20 %	40 %	40 %	392431652
1119	NC_018078	GCCGG	2	10	1361957	1361966	0 %	0 %	60 %	40 %	392431656
1120	NC_018078	CGCAT	2	10	1364503	1364512	20 %	20 %	20 %	40 %	392431658
1121	NC_018078	CTCTT	2	10	1366743	1366752	0 %	60 %	0 %	40 %	392431660
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1123	NC_018078	CCGGA	2	10	1368133	1368142	20 %	0 %	40 %	40 %	392431661
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1499	NC_018078	GTTGG	2	10	1818537	1818546	0 %	40 %	60 %	0 %	392432070
1500	NC_018078	CGAAC	2	10	1826565	1826574	40 %	0 %	20 %	40 %	392432079

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