MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 3523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018078	GTTCG	2	10	618328	618337	0 %	40 %	40 %	20 %	392430948
502	NC_018078	TCGTG	2	10	618456	618465	0 %	40 %	40 %	20 %	392430948
503	NC_018078	ACCTG	2	10	620470	620479	20 %	20 %	20 %	40 %	392430950
504	NC_018078	GTGCG	2	10	622197	622206	0 %	20 %	60 %	20 %	392430951
505	NC_018078	CAGCG	2	10	622654	622663	20 %	0 %	40 %	40 %	392430952
506	NC_018078	GGTCG	2	10	625050	625059	0 %	20 %	60 %	20 %	392430954
507	NC_018078	GCCGT	2	10	626972	626981	0 %	20 %	40 %	40 %	392430956
508	NC_018078	GAAGC	2	10	628996	629005	40 %	0 %	40 %	20 %	392430958
509	NC_018078	GGCCG	2	10	630116	630125	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
510	NC_018078	CACCG	2	10	631595	631604	20 %	0 %	20 %	60 %	392430959
511	NC_018078	CCAAC	2	10	631884	631893	40 %	0 %	0 %	60 %	392430959
512	NC_018078	GCCGG	2	10	632739	632748	0 %	0 %	60 %	40 %	392430961
513	NC_018078	CGATC	2	10	634202	634211	20 %	20 %	20 %	40 %	392430962
514	NC_018078	CGGCG	2	10	634575	634584	0 %	0 %	60 %	40 %	392430962
515	NC_018078	GCAGG	2	10	635830	635839	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
516	NC_018078	GCCGA	2	10	637242	637251	20 %	0 %	40 %	40 %	392430966
517	NC_018078	CAGCG	2	10	639214	639223	20 %	0 %	40 %	40 %	392430968
518	NC_018078	CAGAT	2	10	641373	641382	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
519	NC_018078	CGTCT	2	10	641854	641863	0 %	40 %	20 %	40 %	392430972
520	NC_018078	CGGCC	2	10	643526	643535	0 %	0 %	40 %	60 %	392430973
521	NC_018078	CGCGG	2	10	645484	645493	0 %	0 %	60 %	40 %	392430974
522	NC_018078	CGGCC	2	10	646579	646588	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
523	NC_018078	GCCGG	2	10	647208	647217	0 %	0 %	60 %	40 %	392430976
524	NC_018078	CCCCG	2	10	647906	647915	0 %	0 %	20 %	80 %	392430976
525	NC_018078	CGGAT	2	10	648535	648544	20 %	20 %	40 %	20 %	392430977
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530	NC_018078	CGTGC	2	10	654586	654595	0 %	20 %	40 %	40 %	392430984
531	NC_018078	CGGAT	2	10	654982	654991	20 %	20 %	40 %	20 %	392430984
532	NC_018078	CGATG	2	10	655433	655442	20 %	20 %	40 %	20 %	392430985
533	NC_018078	CGGAT	2	10	658654	658663	20 %	20 %	40 %	20 %	392430988
534	NC_018078	GGCCG	2	10	660123	660132	0 %	0 %	60 %	40 %	392430989
535	NC_018078	TCCGG	2	10	660255	660264	0 %	20 %	40 %	40 %	392430989
536	NC_018078	GCGGT	2	10	662860	662869	0 %	20 %	60 %	20 %	392430991
537	NC_018078	CTGAC	2	10	670979	670988	20 %	20 %	20 %	40 %	392430998
538	NC_018078	AGGCA	2	10	671507	671516	40 %	0 %	40 %	20 %	392430999
539	NC_018078	GCCCC	2	10	673178	673187	0 %	0 %	20 %	80 %	392431000
540	NC_018078	CCGGC	2	10	673770	673779	0 %	0 %	40 %	60 %	392431000
541	NC_018078	CAGGT	2	10	676237	676246	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
542	NC_018078	TCGTC	2	10	678756	678765	0 %	40 %	20 %	40 %	392431006
543	NC_018078	GTTGA	2	10	678781	678790	20 %	40 %	40 %	0 %	392431006
544	NC_018078	GCTCG	2	10	679899	679908	0 %	20 %	40 %	40 %	392431007
545	NC_018078	GACCT	2	10	681769	681778	20 %	20 %	20 %	40 %	392431007
546	NC_018078	GCCGC	2	10	681826	681835	0 %	0 %	40 %	60 %	392431007
547	NC_018078	CGAGG	2	10	682382	682391	20 %	0 %	60 %	20 %	392431008
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549	NC_018078	GAACG	2	10	685081	685090	40 %	0 %	40 %	20 %	392431009
550	NC_018078	CGATG	2	10	685832	685841	20 %	20 %	40 %	20 %	392431010
551	NC_018078	CGGGA	2	10	686222	686231	20 %	0 %	60 %	20 %	392431010
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553	NC_018078	TGGGC	2	10	687668	687677	0 %	20 %	60 %	20 %	392431012
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555	NC_018078	GACGG	2	10	690789	690798	20 %	0 %	60 %	20 %	392431015
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557	NC_018078	CCTAC	2	10	692819	692828	20 %	20 %	0 %	60 %	392431017
558	NC_018078	GCACC	2	10	694563	694572	20 %	0 %	20 %	60 %	392431018
559	NC_018078	GCCAG	2	10	694798	694807	20 %	0 %	40 %	40 %	392431018
560	NC_018078	GGTGT	2	10	695021	695030	0 %	40 %	60 %	0 %	392431018
561	NC_018078	CGGCG	2	10	696042	696051	0 %	0 %	60 %	40 %	392431021
562	NC_018078	CGGCG	2	10	696722	696731	0 %	0 %	60 %	40 %	392431021
563	NC_018078	GCGCA	2	10	698860	698869	20 %	0 %	40 %	40 %	392431024
564	NC_018078	GCGCG	2	10	699107	699116	0 %	0 %	60 %	40 %	392431024
565	NC_018078	CCGCG	2	10	699795	699804	0 %	0 %	40 %	60 %	392431025
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600	NC_018078	CTGGT	2	10	733807	733816	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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611	NC_018078	GCGAC	2	10	748807	748816	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
612	NC_018078	GACCG	2	10	748873	748882	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
613	NC_018078	CGCAG	2	10	749158	749167	20 %	0 %	40 %	40 %	392431078
614	NC_018078	CGGCC	2	10	751145	751154	0 %	0 %	40 %	60 %	392431081
615	NC_018078	CGGTG	2	10	751935	751944	0 %	20 %	60 %	20 %	392431081
616	NC_018078	GGGGA	2	10	759361	759370	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
617	NC_018078	GCTGG	2	10	761352	761361	0 %	20 %	60 %	20 %	392431095
618	NC_018078	CCGGG	2	10	765388	765397	0 %	0 %	60 %	40 %	392431096
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621	NC_018078	GTTTA	2	10	768401	768410	20 %	60 %	20 %	0 %	392431097
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623	NC_018078	CGCTC	2	10	769560	769569	0 %	20 %	20 %	60 %	392431098
624	NC_018078	CGCCA	2	10	771247	771256	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
625	NC_018078	CGCAG	2	10	773680	773689	20 %	0 %	40 %	40 %	392431100
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627	NC_018078	TGCGG	2	10	774844	774853	0 %	20 %	60 %	20 %	392431101
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629	NC_018078	CCGAT	2	10	775499	775508	20 %	20 %	20 %	40 %	392431102
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