MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 3523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018078	CGGCC	2	10	3082325	3082334	0 %	0 %	40 %	60 %	392433219
2502	NC_018078	GCAAC	2	10	3083718	3083727	40 %	0 %	20 %	40 %	392433220
2503	NC_018078	GGCCT	2	10	3084766	3084775	0 %	20 %	40 %	40 %	392433221
2504	NC_018078	TCGTG	2	10	3085187	3085196	0 %	40 %	40 %	20 %	392433221
2505	NC_018078	TGGTC	2	10	3088484	3088493	0 %	40 %	40 %	20 %	392433223
2506	NC_018078	CGTGG	2	10	3092386	3092395	0 %	20 %	60 %	20 %	392433225
2507	NC_018078	CCGAG	2	10	3093398	3093407	20 %	0 %	40 %	40 %	392433225
2508	NC_018078	GCATC	2	10	3093839	3093848	20 %	20 %	20 %	40 %	392433225
2509	NC_018078	CCGAT	2	10	3093899	3093908	20 %	20 %	20 %	40 %	392433225
2510	NC_018078	GTGCG	2	10	3095708	3095717	0 %	20 %	60 %	20 %	392433225
2511	NC_018078	ACCAC	2	10	3097724	3097733	40 %	0 %	0 %	60 %	392433225
2512	NC_018078	GCGCG	2	10	3100242	3100251	0 %	0 %	60 %	40 %	392433226
2513	NC_018078	GTCCG	2	10	3100898	3100907	0 %	20 %	40 %	40 %	392433226
2514	NC_018078	GCCCG	2	10	3101323	3101332	0 %	0 %	40 %	60 %	392433226
2515	NC_018078	GGCCG	2	10	3103496	3103505	0 %	0 %	60 %	40 %	392433229
2516	NC_018078	GCCGC	2	10	3104450	3104459	0 %	0 %	40 %	60 %	392433230
2517	NC_018078	GTGTC	2	10	3104899	3104908	0 %	40 %	40 %	20 %	392433230
2518	NC_018078	CGGCA	2	10	3105760	3105769	20 %	0 %	40 %	40 %	392433230
2519	NC_018078	GAGCC	2	10	3110532	3110541	20 %	0 %	40 %	40 %	392433234
2520	NC_018078	CGATT	2	10	3111903	3111912	20 %	40 %	20 %	20 %	392433236
2521	NC_018078	GAGCT	2	10	3112302	3112311	20 %	20 %	40 %	20 %	392433237
2522	NC_018078	GGCGA	2	10	3112632	3112641	20 %	0 %	60 %	20 %	392433237
2523	NC_018078	TCGGT	2	10	3112747	3112756	0 %	40 %	40 %	20 %	392433237
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2527	NC_018078	GGGCA	2	10	3116883	3116892	20 %	0 %	60 %	20 %	392433240
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2529	NC_018078	CTGCC	2	10	3119438	3119447	0 %	20 %	20 %	60 %	392433243
2530	NC_018078	CGGAC	2	10	3119452	3119461	20 %	0 %	40 %	40 %	392433243
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2532	NC_018078	CGCGG	2	10	3122655	3122664	0 %	0 %	60 %	40 %	392433244
2533	NC_018078	CGCAC	2	10	3123752	3123761	20 %	0 %	20 %	60 %	392433244
2534	NC_018078	GCGCG	2	10	3125265	3125274	0 %	0 %	60 %	40 %	392433245
2535	NC_018078	AGACC	2	10	3125803	3125812	40 %	0 %	20 %	40 %	392433247
2536	NC_018078	GCCAG	2	10	3126082	3126091	20 %	0 %	40 %	40 %	392433247
2537	NC_018078	CGCGC	2	10	3126173	3126182	0 %	0 %	40 %	60 %	392433247
2538	NC_018078	AGCCT	2	10	3129981	3129990	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2539	NC_018078	GACCC	2	10	3131016	3131025	20 %	0 %	20 %	60 %	392433252
2540	NC_018078	GTCGA	2	10	3131296	3131305	20 %	20 %	40 %	20 %	392433253
2541	NC_018078	GCATC	2	10	3132013	3132022	20 %	20 %	20 %	40 %	392433254
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2544	NC_018078	GGCCT	2	10	3133592	3133601	0 %	20 %	40 %	40 %	392433256
2545	NC_018078	GCGCC	2	10	3134643	3134652	0 %	0 %	40 %	60 %	392433257
2546	NC_018078	TGGCC	2	10	3134850	3134859	0 %	20 %	40 %	40 %	392433257
2547	NC_018078	CGATC	2	10	3136270	3136279	20 %	20 %	20 %	40 %	392433258
2548	NC_018078	AGCAC	2	10	3136751	3136760	40 %	0 %	20 %	40 %	392433259
2549	NC_018078	CGGCG	2	10	3139539	3139548	0 %	0 %	60 %	40 %	392433261
2550	NC_018078	CGAGC	2	10	3139558	3139567	20 %	0 %	40 %	40 %	392433261
2551	NC_018078	TCGGT	2	10	3140459	3140468	0 %	40 %	40 %	20 %	392433263
2552	NC_018078	GGCCC	2	10	3141886	3141895	0 %	0 %	40 %	60 %	392433264
2553	NC_018078	GGGCT	2	10	3144874	3144883	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2554	NC_018078	TGGCC	2	10	3145614	3145623	0 %	20 %	40 %	40 %	392433269
2555	NC_018078	CCGGG	2	10	3145718	3145727	0 %	0 %	60 %	40 %	392433269
2556	NC_018078	TTGGC	2	10	3147416	3147425	0 %	40 %	40 %	20 %	392433272
2557	NC_018078	GGCCA	2	10	3148512	3148521	20 %	0 %	40 %	40 %	392433273
2558	NC_018078	CGCGC	2	10	3150463	3150472	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2559	NC_018078	ATCGG	2	10	3150544	3150553	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2560	NC_018078	GCGCC	2	10	3151855	3151864	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2561	NC_018078	CTGCG	2	10	3152421	3152430	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2562	NC_018078	ACGTC	2	10	3152598	3152607	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2563	NC_018078	CAGCC	2	10	3154322	3154331	20 %	0 %	20 %	60 %	392433274
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2566	NC_018078	ACGCC	2	10	3162152	3162161	20 %	0 %	20 %	60 %	392433280
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2570	NC_018078	CGGGC	2	10	3170332	3170341	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2571	NC_018078	AGGCG	2	10	3173709	3173718	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2572	NC_018078	CAGCG	2	10	3173760	3173769	20 %	0 %	40 %	40 %	392433296
2573	NC_018078	AGCTC	2	10	3174210	3174219	20 %	20 %	20 %	40 %	392433296
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2583	NC_018078	GCACC	2	10	3187488	3187497	20 %	0 %	20 %	60 %	392433312
2584	NC_018078	GCCGG	2	10	3187603	3187612	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2585	NC_018078	GCAGG	2	10	3189137	3189146	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2586	NC_018078	TCGTC	2	10	3189356	3189365	0 %	40 %	20 %	40 %	392433314
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2590	NC_018078	CGAGC	2	10	3191776	3191785	20 %	0 %	40 %	40 %	392433316
2591	NC_018078	TGGGG	2	10	3198166	3198175	0 %	20 %	80 %	0 %	392433324
2592	NC_018078	CCGCC	2	10	3199455	3199464	0 %	0 %	20 %	80 %	392433324
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2595	NC_018078	GCGAC	2	10	3202005	3202014	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2596	NC_018078	CGCCC	2	10	3202223	3202232	0 %	0 %	20 %	80 %	392433326
2597	NC_018078	CGCGG	2	10	3202925	3202934	0 %	0 %	60 %	40 %	392433326
2598	NC_018078	CCACC	2	10	3206637	3206646	20 %	0 %	0 %	80 %	392433331
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2600	NC_018078	CGATC	2	10	3209866	3209875	20 %	20 %	20 %	40 %	392433333
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2603	NC_018078	TGCGC	2	10	3212140	3212149	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2604	NC_018078	ACCAG	2	10	3214656	3214665	40 %	0 %	20 %	40 %	392433336
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2608	NC_018078	GCAGT	2	10	3217835	3217844	20 %	20 %	40 %	20 %	392433339
2609	NC_018078	GCGCC	2	10	3218398	3218407	0 %	0 %	40 %	60 %	392433339
2610	NC_018078	TTCCG	2	10	3219490	3219499	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2611	NC_018078	CCGCG	3	15	3223630	3223644	0 %	0 %	40 %	60 %	392433342
2612	NC_018078	ACCCA	2	10	3223910	3223919	40 %	0 %	0 %	60 %	392433343
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2615	NC_018078	CGGCC	2	10	3228286	3228295	0 %	0 %	40 %	60 %	392433349
2616	NC_018078	CGGTC	2	10	3228773	3228782	0 %	20 %	40 %	40 %	392433349
2617	NC_018078	GACCC	2	10	3230382	3230391	20 %	0 %	20 %	60 %	392433350
2618	NC_018078	CGGTG	2	10	3232251	3232260	0 %	20 %	60 %	20 %	392433351
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2620	NC_018078	TCAAA	2	10	3232731	3232740	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2621	NC_018078	TGCGC	2	10	3233167	3233176	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2622	NC_018078	CCAGG	2	10	3233452	3233461	20 %	0 %	40 %	40 %	392433353
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2624	NC_018078	GGTTG	2	10	3234179	3234188	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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