MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 3523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_018078	CCGGC	2	10	2401927	2401936	0 %	0 %	40 %	60 %	392432636
2002	NC_018078	GGGTT	2	10	2402399	2402408	0 %	40 %	60 %	0 %	392432636
2003	NC_018078	TGGGC	2	10	2402554	2402563	0 %	20 %	60 %	20 %	392432636
2004	NC_018078	TCGGC	2	10	2402883	2402892	0 %	20 %	40 %	40 %	392432636
2005	NC_018078	TCGAG	2	10	2402953	2402962	20 %	20 %	40 %	20 %	392432636
2006	NC_018078	TCCGC	2	10	2406506	2406515	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2007	NC_018078	GTGCT	2	10	2406562	2406571	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2008	NC_018078	GGACT	2	10	2406698	2406707	20 %	20 %	40 %	20 %	392432638
2009	NC_018078	CCGGG	2	10	2408177	2408186	0 %	0 %	60 %	40 %	392432638
2010	NC_018078	CGCTG	2	10	2409995	2410004	0 %	20 %	40 %	40 %	392432640
2011	NC_018078	CGACG	2	10	2410061	2410070	20 %	0 %	40 %	40 %	392432640
2012	NC_018078	GGGCT	2	10	2411648	2411657	0 %	20 %	60 %	20 %	392432641
2013	NC_018078	ATCCG	2	10	2413857	2413866	20 %	20 %	20 %	40 %	392432643
2014	NC_018078	GGACT	2	10	2417074	2417083	20 %	20 %	40 %	20 %	392432646
2015	NC_018078	GCCGC	2	10	2419143	2419152	0 %	0 %	40 %	60 %	392432649
2016	NC_018078	GCCGC	2	10	2424152	2424161	0 %	0 %	40 %	60 %	392432653
2017	NC_018078	GTGCG	2	10	2425337	2425346	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2018	NC_018078	CAGTT	2	10	2426080	2426089	20 %	40 %	20 %	20 %	392432655
2019	NC_018078	ACCGG	2	10	2426665	2426674	20 %	0 %	40 %	40 %	392432655
2020	NC_018078	GCTCG	2	10	2427031	2427040	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2021	NC_018078	CGCGA	2	10	2429887	2429896	20 %	0 %	40 %	40 %	392432659
2022	NC_018078	GGGCG	2	10	2431996	2432005	0 %	0 %	80 %	20 %	392432660
2023	NC_018078	GCTGA	2	10	2434898	2434907	20 %	20 %	40 %	20 %	392432662
2024	NC_018078	GTCGA	2	10	2435071	2435080	20 %	20 %	40 %	20 %	392432663
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2026	NC_018078	GCCGC	2	10	2436421	2436430	0 %	0 %	40 %	60 %	392432664
2027	NC_018078	GACCG	2	10	2436627	2436636	20 %	0 %	40 %	40 %	392432664
2028	NC_018078	CCGGA	2	10	2437112	2437121	20 %	0 %	40 %	40 %	392432664
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2030	NC_018078	GGGCA	2	10	2439180	2439189	20 %	0 %	60 %	20 %	392432665
2031	NC_018078	GGCCG	2	10	2442718	2442727	0 %	0 %	60 %	40 %	392432667
2032	NC_018078	CCAGG	2	10	2445867	2445876	20 %	0 %	40 %	40 %	392432670
2033	NC_018078	GTCGC	2	10	2446209	2446218	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2034	NC_018078	GCTGC	2	10	2449372	2449381	0 %	20 %	40 %	40 %	392432672
2035	NC_018078	GCGAC	2	10	2450597	2450606	20 %	0 %	40 %	40 %	392432673
2036	NC_018078	GCCGA	2	10	2453147	2453156	20 %	0 %	40 %	40 %	392432675
2037	NC_018078	GGCGA	2	10	2453847	2453856	20 %	0 %	60 %	20 %	392432676
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2039	NC_018078	CGGCG	2	10	2457536	2457545	0 %	0 %	60 %	40 %	392432681
2040	NC_018078	CACGA	2	10	2460514	2460523	40 %	0 %	20 %	40 %	392432683
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2042	NC_018078	CCGCA	2	10	2463912	2463921	20 %	0 %	20 %	60 %	392432688
2043	NC_018078	CGCAT	2	10	2466043	2466052	20 %	20 %	20 %	40 %	392432689
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2045	NC_018078	GTCCG	2	10	2469129	2469138	0 %	20 %	40 %	40 %	392432692
2046	NC_018078	TCGCG	2	10	2469529	2469538	0 %	20 %	40 %	40 %	392432693
2047	NC_018078	GACCG	2	10	2470100	2470109	20 %	0 %	40 %	40 %	392432693
2048	NC_018078	CCCGC	2	10	2470160	2470169	0 %	0 %	20 %	80 %	392432693
2049	NC_018078	CGTGG	2	10	2470370	2470379	0 %	20 %	60 %	20 %	392432693
2050	NC_018078	CGCGG	2	10	2472166	2472175	0 %	0 %	60 %	40 %	392432696
2051	NC_018078	GCGCG	2	10	2473880	2473889	0 %	0 %	60 %	40 %	392432697
2052	NC_018078	TCGCT	2	10	2477794	2477803	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2053	NC_018078	GGCCC	2	10	2480068	2480077	0 %	0 %	40 %	60 %	392432706
2054	NC_018078	GCCCG	2	10	2481226	2481235	0 %	0 %	40 %	60 %	392432707
2055	NC_018078	CTGGC	2	10	2481502	2481511	0 %	20 %	40 %	40 %	392432707
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2057	NC_018078	CGCAC	2	10	2484031	2484040	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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2059	NC_018078	GCGCG	2	10	2486051	2486060	0 %	0 %	60 %	40 %	392432711
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2062	NC_018078	CGGCG	2	10	2490511	2490520	0 %	0 %	60 %	40 %	392432715
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2092	NC_018078	ACAGC	2	10	2525993	2526002	40 %	0 %	20 %	40 %	392432747
2093	NC_018078	GCCAC	2	10	2526128	2526137	20 %	0 %	20 %	60 %	392432748
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2097	NC_018078	GCTCG	2	10	2528079	2528088	0 %	20 %	40 %	40 %	392432750
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2500	NC_018078	GCTGG	2	10	3079448	3079457	0 %	20 %	60 %	20 %	392433217

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