MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Megasphaera elsdenii DSM 20460

Total Repeats: 39966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015873	GCA	2	6	412	417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025248
2	NC_015873	AGA	2	6	439	444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025248
3	NC_015873	CTG	2	6	482	487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025248
4	NC_015873	CTG	2	6	512	517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025248
5	NC_015873	GGC	2	6	523	528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025248
6	NC_015873	GCT	2	6	615	620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025248
7	NC_015873	CTT	2	6	772	777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025248
8	NC_015873	CGA	2	6	809	814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025248
9	NC_015873	TTC	2	6	863	868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025248
10	NC_015873	AAG	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025248
11	NC_015873	GAC	2	6	888	893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025248
12	NC_015873	AAG	2	6	894	899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025248
13	NC_015873	AAC	2	6	942	947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348025248
14	NC_015873	GCC	2	6	954	959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025248
15	NC_015873	GCC	2	6	1044	1049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025248
16	NC_015873	CGA	2	6	1060	1065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025248
17	NC_015873	CGT	2	6	1106	1111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025248
18	NC_015873	CTT	2	6	1287	1292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015873	TGC	2	6	1294	1299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015873	CGC	2	6	1534	1539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025249
21	NC_015873	TCA	2	6	1583	1588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025249
22	NC_015873	GTC	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025249
23	NC_015873	TTC	2	6	1825	1830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025249
24	NC_015873	CGA	2	6	1851	1856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025249
25	NC_015873	ATC	2	6	1900	1905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025249
26	NC_015873	TCT	2	6	1907	1912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025249
27	NC_015873	TCG	3	9	2135	2143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025249
28	NC_015873	GGC	2	6	2161	2166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025249
29	NC_015873	CGA	2	6	2214	2219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025249
30	NC_015873	CGA	2	6	2241	2246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025249
31	NC_015873	AAG	2	6	2300	2305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025249
32	NC_015873	CAT	2	6	2322	2327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025249
33	NC_015873	CGG	3	9	2346	2354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025249
34	NC_015873	CGT	2	6	2370	2375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025249
35	NC_015873	GAA	2	6	2383	2388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025249
36	NC_015873	CGG	2	6	2418	2423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025249
37	NC_015873	CGG	2	6	2430	2435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025249
38	NC_015873	ACG	2	6	2561	2566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025249
39	NC_015873	TCA	2	6	2663	2668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025249
40	NC_015873	TCG	2	6	2744	2749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025249
41	NC_015873	AAT	2	6	2813	2818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348025249
42	NC_015873	TCG	3	9	3023	3031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025250
43	NC_015873	TTC	2	6	3043	3048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025250
44	NC_015873	GCA	2	6	3192	3197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025250
45	NC_015873	TGA	2	6	3291	3296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025250
46	NC_015873	GAT	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025250
47	NC_015873	GGC	2	6	3345	3350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025250
48	NC_015873	CGA	2	6	3360	3365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025250
49	NC_015873	GCC	2	6	3463	3468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025250
50	NC_015873	CCG	2	6	3504	3509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025250
51	NC_015873	TGC	2	6	3552	3557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025250
52	NC_015873	TTC	2	6	3565	3570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025250
53	NC_015873	CGT	2	6	3823	3828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025250
54	NC_015873	GGT	2	6	3861	3866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348025250
55	NC_015873	CTT	2	6	4121	4126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025251
56	NC_015873	TTC	2	6	4152	4157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025251
57	NC_015873	CTT	2	6	4268	4273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025251
58	NC_015873	CAT	2	6	4341	4346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025251
59	NC_015873	CGG	2	6	4407	4412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025251
60	NC_015873	TGC	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025251
61	NC_015873	GGA	2	6	4541	4546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025251
62	NC_015873	CGA	2	6	4580	4585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025251
63	NC_015873	GCC	2	6	4650	4655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025251
64	NC_015873	GTC	2	6	4683	4688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025251
65	NC_015873	CGT	2	6	4697	4702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025251
66	NC_015873	CGG	2	6	4709	4714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025251
67	NC_015873	CGA	2	6	4850	4855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025251
68	NC_015873	GCG	2	6	4962	4967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025252
69	NC_015873	CGT	2	6	5011	5016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025252
70	NC_015873	GAT	2	6	5029	5034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025252
71	NC_015873	TCG	2	6	5093	5098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025252
72	NC_015873	GTC	2	6	5401	5406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025252
73	NC_015873	CTT	2	6	5415	5420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025252
74	NC_015873	TGA	2	6	5454	5459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025252
75	NC_015873	TTC	2	6	5501	5506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025252
76	NC_015873	CGG	2	6	5512	5517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025252
77	NC_015873	CGC	2	6	5544	5549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025252
78	NC_015873	TCA	2	6	5562	5567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025252
79	NC_015873	GTC	2	6	5614	5619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025252
80	NC_015873	TAA	2	6	5648	5653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348025252
81	NC_015873	CGG	3	9	5716	5724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025252
82	NC_015873	CGA	2	6	5949	5954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025252
83	NC_015873	ATA	2	6	5971	5976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348025252
84	NC_015873	GAC	2	6	6028	6033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025252
85	NC_015873	TTG	2	6	6086	6091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348025252
86	NC_015873	CGA	2	6	6156	6161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025252
87	NC_015873	TCA	2	6	6305	6310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025252
88	NC_015873	CGA	2	6	6357	6362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025252
89	NC_015873	CGT	2	6	6367	6372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025252
90	NC_015873	GAC	2	6	6457	6462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025252
91	NC_015873	CAG	2	6	6466	6471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025252
92	NC_015873	CCT	2	6	6508	6513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	348025253
93	NC_015873	CGA	2	6	6530	6535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025253
94	NC_015873	GTC	2	6	6540	6545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025253
95	NC_015873	GGC	2	6	6575	6580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025253
96	NC_015873	CGC	2	6	6653	6658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025253
97	NC_015873	CGA	2	6	6770	6775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025253
98	NC_015873	GCG	2	6	6801	6806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025253
99	NC_015873	CTG	2	6	6867	6872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025253
100	NC_015873	CAT	2	6	6882	6887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025253
101	NC_015873	TCA	2	6	6934	6939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025253
102	NC_015873	GCC	2	6	6999	7004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025253
103	NC_015873	TGA	2	6	7130	7135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025253
104	NC_015873	ATC	2	6	7186	7191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025253
105	NC_015873	GGC	2	6	7199	7204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025253
106	NC_015873	CGG	2	6	7220	7225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025253
107	NC_015873	GCC	2	6	7260	7265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025253
108	NC_015873	CGA	2	6	7328	7333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025253
109	NC_015873	CGG	2	6	7379	7384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025253
110	NC_015873	GAC	2	6	7422	7427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025253
111	NC_015873	CCT	2	6	7474	7479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	348025254
112	NC_015873	GTA	2	6	7511	7516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025254
113	NC_015873	CTT	2	6	7531	7536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025254
114	NC_015873	CGG	2	6	7541	7546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025254
115	NC_015873	CGA	3	9	7750	7758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025254
116	NC_015873	GCG	2	6	7781	7786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025254
117	NC_015873	GAC	2	6	7826	7831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025254
118	NC_015873	GTC	2	6	7887	7892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025254
119	NC_015873	CGT	2	6	7904	7909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025254
120	NC_015873	GCC	2	6	7979	7984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025254
121	NC_015873	TGG	2	6	8004	8009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348025254
122	NC_015873	GGT	2	6	8194	8199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348025254
123	NC_015873	TCT	2	6	8203	8208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025254
124	NC_015873	GCA	2	6	8281	8286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025254
125	NC_015873	GCC	2	6	8295	8300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025254
126	NC_015873	CGA	2	6	8335	8340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025254
127	NC_015873	CAG	2	6	8393	8398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025254
128	NC_015873	CCT	2	6	8463	8468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	348025255
129	NC_015873	GAT	2	6	8707	8712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025255
130	NC_015873	GGC	2	6	8739	8744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025255
131	NC_015873	GGC	2	6	8779	8784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025255
132	NC_015873	CTG	2	6	8797	8802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025255
133	NC_015873	GAC	2	6	8899	8904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025255
134	NC_015873	AGC	2	6	8924	8929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025255
135	NC_015873	CAT	2	6	8962	8967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025255
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142	NC_015873	CAT	3	9	9355	9363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025255
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150	NC_015873	ATG	2	6	9730	9735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025256
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152	NC_015873	GCC	2	6	9850	9855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025256
153	NC_015873	ATC	2	6	9895	9900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025256
154	NC_015873	GCC	3	9	9934	9942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025256
155	NC_015873	TCG	2	6	10123	10128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025256
156	NC_015873	GAC	2	6	10248	10253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025256
157	NC_015873	GAG	2	6	10263	10268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025256
158	NC_015873	GGC	2	6	10374	10379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_015873	TAA	2	6	10383	10388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015873	CGT	2	6	10574	10579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025257
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162	NC_015873	CGG	2	6	10703	10708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025257
163	NC_015873	CGC	2	6	10720	10725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025257
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237	NC_015873	CAT	2	6	14055	14060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
238	NC_015873	ATT	2	6	14070	14075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348025260
239	NC_015873	TGA	2	6	14103	14108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025260
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246	NC_015873	CTT	2	6	14469	14474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025260
247	NC_015873	TTC	2	6	14480	14485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025260
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253	NC_015873	CGA	2	6	14865	14870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025260
254	NC_015873	CGA	2	6	14875	14880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025260
255	NC_015873	TGA	2	6	14892	14897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025260
256	NC_015873	CAT	2	6	14908	14913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025260
257	NC_015873	TCT	2	6	14931	14936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025260
258	NC_015873	CTG	2	6	14977	14982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025260
259	NC_015873	GCC	2	6	15001	15006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025260
260	NC_015873	GTA	2	6	15067	15072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025260
261	NC_015873	TTC	2	6	15103	15108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025260
262	NC_015873	GTA	2	6	15157	15162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025260
263	NC_015873	GCC	2	6	15190	15195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025260
264	NC_015873	CGA	2	6	15219	15224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025260
265	NC_015873	GAT	2	6	15385	15390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025260
266	NC_015873	GTA	2	6	15430	15435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025260
267	NC_015873	TGT	2	6	15507	15512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348025260
268	NC_015873	TGT	2	6	15543	15548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348025260
269	NC_015873	GAC	2	6	15622	15627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025260
270	NC_015873	GCC	2	6	15772	15777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025260
271	NC_015873	GAA	2	6	15904	15909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025260
272	NC_015873	GAG	2	6	16093	16098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025260
273	NC_015873	GAC	2	6	16117	16122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025260
274	NC_015873	AAG	2	6	16211	16216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025260
275	NC_015873	CGC	2	6	16233	16238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025260
276	NC_015873	GCT	2	6	16277	16282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025260
277	NC_015873	GTC	3	9	16304	16312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025260
278	NC_015873	CAG	2	6	16318	16323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025260
279	NC_015873	GTA	2	6	16330	16335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025260
280	NC_015873	TGA	2	6	16341	16346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025260
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282	NC_015873	GTT	2	6	16438	16443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348025260
283	NC_015873	TCT	2	6	16451	16456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025260
284	NC_015873	CGT	2	6	16497	16502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025260
285	NC_015873	TTC	2	6	16703	16708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025260
286	NC_015873	TCT	2	6	16734	16739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025260
287	NC_015873	CGA	2	6	16779	16784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025260
288	NC_015873	TCG	2	6	16847	16852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025260
289	NC_015873	CCG	3	9	17006	17014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025260
290	NC_015873	CTT	2	6	17122	17127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025260
291	NC_015873	ATG	2	6	17162	17167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025260
292	NC_015873	CTT	3	9	17202	17210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025260
293	NC_015873	AAG	2	6	17243	17248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025260
294	NC_015873	ATA	2	6	17297	17302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348025260
295	NC_015873	CGA	2	6	17346	17351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025260
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297	NC_015873	CCT	2	6	17514	17519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
298	NC_015873	TTC	2	6	17583	17588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_015873	GCT	2	6	17688	17693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025261
300	NC_015873	CGT	2	6	17781	17786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025261
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315	NC_015873	GTT	2	6	18446	18451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
316	NC_015873	ATG	2	6	18554	18559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
317	NC_015873	TAC	2	6	18609	18614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
318	NC_015873	CGG	2	6	18746	18751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025262
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324	NC_015873	AAG	2	6	19190	19195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
325	NC_015873	AAG	2	6	19387	19392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
326	NC_015873	TTC	2	6	19466	19471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025263
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328	NC_015873	TTC	2	6	19521	19526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025263
329	NC_015873	ACG	3	9	19536	19544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025263
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358	NC_015873	TTA	2	6	21131	21136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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374	NC_015873	CGT	2	6	22049	22054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025265
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378	NC_015873	GGC	2	6	22256	22261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025265
379	NC_015873	TCA	2	6	22318	22323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025265
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382	NC_015873	CGG	2	6	22523	22528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025266
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410	NC_015873	TGA	2	6	23697	23702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025267
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