MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Megasphaera elsdenii DSM 20460

Total Repeats: 39966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015873	CTT	2	6	89807	89812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025316
1502	NC_015873	CAA	3	9	89834	89842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348025316
1503	NC_015873	GCC	2	6	89930	89935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025317
1504	NC_015873	CTT	2	6	90007	90012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025317
1505	NC_015873	CTT	2	6	90064	90069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025317
1506	NC_015873	GCG	2	6	90192	90197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025317
1507	NC_015873	CGA	2	6	90229	90234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025317
1508	NC_015873	TGA	2	6	90247	90252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025317
1509	NC_015873	TCA	3	9	90271	90279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025317
1510	NC_015873	TCT	3	9	90345	90353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025317
1511	NC_015873	ATT	2	6	90392	90397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348025317
1512	NC_015873	TCA	2	6	90462	90467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025317
1513	NC_015873	TTC	2	6	90506	90511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025317
1514	NC_015873	CAG	2	6	90532	90537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025317
1515	NC_015873	GAT	2	6	90557	90562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025317
1516	NC_015873	GCC	2	6	90623	90628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025317
1517	NC_015873	CCT	2	6	90671	90676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	348025318
1518	NC_015873	TCT	2	6	90712	90717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025318
1519	NC_015873	CGA	2	6	90788	90793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025318
1520	NC_015873	GGA	3	9	91025	91033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025318
1521	NC_015873	TTC	2	6	91074	91079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025318
1522	NC_015873	TGC	2	6	91091	91096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025318
1523	NC_015873	GCC	2	6	91146	91151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025318
1524	NC_015873	GCC	2	6	91218	91223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025318
1525	NC_015873	CGA	2	6	91310	91315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025318
1526	NC_015873	GCA	2	6	91386	91391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025318
1527	NC_015873	TAT	2	6	91424	91429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348025318
1528	NC_015873	TTC	2	6	91443	91448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025318
1529	NC_015873	CGT	2	6	91493	91498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025318
1530	NC_015873	CTT	2	6	91502	91507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025318
1531	NC_015873	TCA	3	9	91601	91609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025318
1532	NC_015873	CGC	2	6	91699	91704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025319
1533	NC_015873	GAT	2	6	91835	91840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025319
1534	NC_015873	CTT	2	6	91954	91959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025319
1535	NC_015873	CCG	2	6	92079	92084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025319
1536	NC_015873	CAG	2	6	92119	92124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025319
1537	NC_015873	ACG	2	6	92152	92157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025319
1538	NC_015873	GAC	2	6	92174	92179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025319
1539	NC_015873	GAT	2	6	92249	92254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025319
1540	NC_015873	GCT	2	6	92280	92285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025319
1541	NC_015873	GAT	2	6	92381	92386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025319
1542	NC_015873	TTC	2	6	92418	92423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025319
1543	NC_015873	CTT	2	6	92428	92433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025319
1544	NC_015873	TAG	2	6	92443	92448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025319
1545	NC_015873	CAT	2	6	92534	92539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025319
1546	NC_015873	CTT	2	6	92639	92644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025320
1547	NC_015873	CGA	2	6	92669	92674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025320
1548	NC_015873	GAT	2	6	92748	92753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025320
1549	NC_015873	AGC	2	6	92773	92778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025320
1550	NC_015873	CCG	2	6	92785	92790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025320
1551	NC_015873	TTC	2	6	92812	92817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025320
1552	NC_015873	GAT	2	6	92901	92906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025320
1553	NC_015873	CGA	2	6	92948	92953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025320
1554	NC_015873	GAC	3	9	92964	92972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025320
1555	NC_015873	TCT	2	6	93056	93061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025320
1556	NC_015873	CTT	2	6	93086	93091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025320
1557	NC_015873	CGA	2	6	93173	93178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025320
1558	NC_015873	GAG	2	6	93216	93221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025320
1559	NC_015873	CTT	2	6	93234	93239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025320
1560	NC_015873	CCG	2	6	93305	93310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025320
1561	NC_015873	GCG	2	6	93316	93321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025320
1562	NC_015873	TGC	2	6	93326	93331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025320
1563	NC_015873	GCG	2	6	93334	93339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025320
1564	NC_015873	ACG	2	6	93382	93387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025320
1565	NC_015873	GCG	2	6	93405	93410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025320
1566	NC_015873	CGC	2	6	93506	93511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025320
1567	NC_015873	GAC	2	6	93537	93542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025320
1568	NC_015873	CTA	2	6	93637	93642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_015873	ATT	2	6	93650	93655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348025321
1570	NC_015873	TAA	2	6	93668	93673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348025321
1571	NC_015873	CTT	2	6	93689	93694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025321
1572	NC_015873	GTA	2	6	93723	93728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025321
1573	NC_015873	TCG	2	6	93904	93909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025321
1574	NC_015873	GAT	2	6	93954	93959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025321
1575	NC_015873	CGA	2	6	93965	93970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025321
1576	NC_015873	CGA	2	6	93977	93982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025321
1577	NC_015873	TTC	2	6	94101	94106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025321
1578	NC_015873	TTC	2	6	94113	94118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025321
1579	NC_015873	TTC	2	6	94137	94142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025321
1580	NC_015873	TAA	2	6	94155	94160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348025321
1581	NC_015873	ATT	2	6	94210	94215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_015873	TCA	2	6	94334	94339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_015873	TTC	2	6	94395	94400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025322
1584	NC_015873	TGT	2	6	94607	94612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_015873	ATT	2	6	94639	94644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_015873	CAG	2	6	94679	94684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_015873	GCC	2	6	94748	94753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025323
1588	NC_015873	ACG	2	6	94845	94850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025323
1589	NC_015873	ATC	2	6	94860	94865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025323
1590	NC_015873	TGA	2	6	94897	94902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025323
1591	NC_015873	TCG	2	6	94986	94991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025323
1592	NC_015873	GAC	2	6	95003	95008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025323
1593	NC_015873	ATC	2	6	95013	95018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025323
1594	NC_015873	CCA	2	6	95038	95043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	348025323
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1596	NC_015873	GAT	2	6	95153	95158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025323
1597	NC_015873	GCC	2	6	95186	95191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025323
1598	NC_015873	GAT	2	6	95198	95203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025323
1599	NC_015873	ATG	3	9	95223	95231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025323
1600	NC_015873	CCG	2	6	95232	95237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025323
1601	NC_015873	AAG	2	6	95250	95255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025323
1602	NC_015873	TCT	2	6	95350	95355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025323
1603	NC_015873	GAA	2	6	95369	95374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025323
1604	NC_015873	GAT	3	9	95387	95395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025323
1605	NC_015873	CGA	2	6	95446	95451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025323
1606	NC_015873	CGC	2	6	95452	95457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025323
1607	NC_015873	TCC	2	6	95560	95565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	348025324
1608	NC_015873	GTT	2	6	95568	95573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348025324
1609	NC_015873	CGG	2	6	95585	95590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025324
1610	NC_015873	CGA	2	6	95604	95609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025324
1611	NC_015873	ATC	2	6	95611	95616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025324
1612	NC_015873	CGG	2	6	95626	95631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025324
1613	NC_015873	GCG	2	6	95656	95661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025324
1614	NC_015873	GCG	2	6	95673	95678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025324
1615	NC_015873	GTG	2	6	95711	95716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348025324
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1617	NC_015873	TGA	2	6	95750	95755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025324
1618	NC_015873	CTT	2	6	95791	95796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025324
1619	NC_015873	AAT	2	6	95859	95864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348025324
1620	NC_015873	TCT	2	6	95912	95917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025324
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1743	NC_015873	TCA	2	6	102297	102302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025332
1744	NC_015873	GGA	2	6	102321	102326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025332
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1747	NC_015873	CGA	2	6	102399	102404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025332
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1754	NC_015873	TCG	3	9	102642	102650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025332
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1763	NC_015873	CTT	2	6	103116	103121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1764	NC_015873	GGA	2	6	103186	103191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025333
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1771	NC_015873	CGA	2	6	103516	103521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025333
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1976	NC_015873	GCA	2	6	114417	114422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025343
1977	NC_015873	GAT	2	6	114437	114442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025343
1978	NC_015873	CGA	2	6	114508	114513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025343
1979	NC_015873	CGT	2	6	114533	114538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025343
1980	NC_015873	CAT	2	6	114566	114571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025343
1981	NC_015873	GGT	2	6	114640	114645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348025343
1982	NC_015873	ATG	2	6	114693	114698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025343
1983	NC_015873	CGG	2	6	114763	114768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025343
1984	NC_015873	CGG	2	6	114777	114782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025343
1985	NC_015873	CTG	2	6	114938	114943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025343
1986	NC_015873	ATG	2	6	114993	114998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025343
1987	NC_015873	TCG	2	6	115015	115020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025343
1988	NC_015873	TGC	2	6	115030	115035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025343
1989	NC_015873	TTC	2	6	115088	115093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025343
1990	NC_015873	GCC	2	6	115124	115129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025343
1991	NC_015873	TGA	2	6	115222	115227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025344
1992	NC_015873	CGT	2	6	115255	115260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025344
1993	NC_015873	TTC	2	6	115280	115285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025344
1994	NC_015873	TGA	2	6	115321	115326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025344
1995	NC_015873	TCT	2	6	115369	115374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025344
1996	NC_015873	CGA	2	6	115384	115389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025344
1997	NC_015873	GCG	2	6	115411	115416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025344
1998	NC_015873	ATG	3	9	115527	115535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025344
1999	NC_015873	CGA	2	6	115591	115596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025344
2000	NC_015873	CGA	2	6	115600	115605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025344

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