MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Megasphaera elsdenii DSM 20460

Total Repeats: 39966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015873	ATT	2	6	174401	174406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348025403
3002	NC_015873	TGC	2	6	174486	174491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025403
3003	NC_015873	CGG	2	6	174796	174801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025403
3004	NC_015873	GAA	2	6	174958	174963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025403
3005	NC_015873	ATG	2	6	174995	175000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025403
3006	NC_015873	AGA	2	6	175074	175079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025403
3007	NC_015873	TAC	2	6	175603	175608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025403
3008	NC_015873	CCG	2	6	175728	175733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025403
3009	NC_015873	TGT	2	6	175772	175777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348025403
3010	NC_015873	ACA	3	9	175836	175844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348025403
3011	NC_015873	AGA	2	6	175857	175862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025403
3012	NC_015873	TTA	2	6	175906	175911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_015873	CAA	2	6	176000	176005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_015873	GTT	2	6	176052	176057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_015873	CGG	2	6	176088	176093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_015873	GCC	2	6	176094	176099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_015873	CCA	2	6	176156	176161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_015873	ATT	2	6	176162	176167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348025404
3019	NC_015873	CGA	2	6	176261	176266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025404
3020	NC_015873	GAT	2	6	176273	176278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025404
3021	NC_015873	CGA	2	6	176288	176293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025404
3022	NC_015873	GTC	2	6	176307	176312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025404
3023	NC_015873	TGT	2	6	176366	176371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348025404
3024	NC_015873	GCC	2	6	176481	176486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025404
3025	NC_015873	CGA	2	6	176556	176561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025404
3026	NC_015873	CGA	2	6	176579	176584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025404
3027	NC_015873	GTT	2	6	176646	176651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348025404
3028	NC_015873	GCC	2	6	176706	176711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025404
3029	NC_015873	ACG	2	6	176716	176721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025404
3030	NC_015873	CTT	2	6	176744	176749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025404
3031	NC_015873	TCT	2	6	176936	176941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025404
3032	NC_015873	CTT	2	6	177008	177013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025404
3033	NC_015873	GAT	2	6	177147	177152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025404
3034	NC_015873	TGC	2	6	177170	177175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025404
3035	NC_015873	CAG	2	6	177221	177226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025404
3036	NC_015873	GCC	2	6	177342	177347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025404
3037	NC_015873	TGA	2	6	177356	177361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025404
3038	NC_015873	GTC	3	9	177375	177383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025404
3039	NC_015873	CGC	2	6	177458	177463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025404
3040	NC_015873	CGT	2	6	177581	177586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025404
3041	NC_015873	TTC	2	6	177685	177690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025404
3042	NC_015873	TGC	2	6	177708	177713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025404
3043	NC_015873	GAA	2	6	177733	177738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025404
3044	NC_015873	ACG	2	6	177739	177744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025404
3045	NC_015873	TCC	2	6	177777	177782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_015873	TTA	2	6	177822	177827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_015873	TAT	2	6	177831	177836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_015873	GAT	2	6	177949	177954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025405
3049	NC_015873	CTT	2	6	178050	178055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025405
3050	NC_015873	TCT	2	6	178071	178076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025405
3051	NC_015873	GTA	2	6	178207	178212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025405
3052	NC_015873	ATG	2	6	178283	178288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025405
3053	NC_015873	AAG	2	6	178289	178294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025405
3054	NC_015873	CTT	2	6	178317	178322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025405
3055	NC_015873	CGT	2	6	178434	178439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025405
3056	NC_015873	GTG	2	6	178483	178488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348025405
3057	NC_015873	ATC	2	6	178508	178513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025405
3058	NC_015873	GAC	2	6	178594	178599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025405
3059	NC_015873	GTC	2	6	178609	178614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025405
3060	NC_015873	TTC	2	6	178672	178677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025405
3061	NC_015873	GAT	2	6	178867	178872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025405
3062	NC_015873	GAT	2	6	178888	178893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025405
3063	NC_015873	CCG	2	6	178926	178931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025405
3064	NC_015873	GTT	2	6	178978	178983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348025405
3065	NC_015873	AGG	2	6	179045	179050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025405
3066	NC_015873	CGT	2	6	179217	179222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025405
3067	NC_015873	AAG	2	6	179228	179233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025405
3068	NC_015873	TGA	2	6	179238	179243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025405
3069	NC_015873	CGA	2	6	179295	179300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025405
3070	NC_015873	ATG	2	6	179312	179317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025405
3071	NC_015873	GCG	2	6	179388	179393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025405
3072	NC_015873	TCC	2	6	179512	179517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	348025406
3073	NC_015873	CGT	2	6	179570	179575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025406
3074	NC_015873	CAA	2	6	179730	179735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348025406
3075	NC_015873	TGA	2	6	179762	179767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025406
3076	NC_015873	CGT	2	6	179769	179774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025406
3077	NC_015873	GTA	2	6	179838	179843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025406
3078	NC_015873	TAT	2	6	179967	179972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_015873	CTT	2	6	180009	180014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_015873	TTC	2	6	180161	180166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025407
3081	NC_015873	CGC	2	6	180202	180207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025407
3082	NC_015873	GAT	2	6	180227	180232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025407
3083	NC_015873	ACC	2	6	180242	180247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3084	NC_015873	TCG	2	6	180309	180314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025408
3085	NC_015873	GTC	2	6	180329	180334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025408
3086	NC_015873	TCG	2	6	180358	180363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025408
3087	NC_015873	GCA	2	6	180377	180382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025408
3088	NC_015873	CCA	2	6	180406	180411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	348025408
3089	NC_015873	AGC	2	6	180422	180427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025408
3090	NC_015873	GGA	2	6	180496	180501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025408
3091	NC_015873	AGC	2	6	180542	180547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025408
3092	NC_015873	ACG	2	6	180589	180594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025408
3093	NC_015873	CGT	2	6	180610	180615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025408
3094	NC_015873	GAC	2	6	180710	180715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025408
3095	NC_015873	GAT	2	6	180761	180766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025408
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3098	NC_015873	CGA	2	6	180880	180885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025408
3099	NC_015873	ATA	2	6	180893	180898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348025408
3100	NC_015873	CGG	2	6	180900	180905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025408
3101	NC_015873	TTC	2	6	180923	180928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025408
3102	NC_015873	ATG	2	6	181023	181028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025408
3103	NC_015873	CTT	2	6	181099	181104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025408
3104	NC_015873	GAA	2	6	181139	181144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025408
3105	NC_015873	GAT	2	6	181178	181183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025408
3106	NC_015873	GGA	2	6	181249	181254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025408
3107	NC_015873	AGT	2	6	181258	181263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025408
3108	NC_015873	TCG	2	6	181308	181313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025408
3109	NC_015873	CGA	2	6	181336	181341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025408
3110	NC_015873	TCA	2	6	181353	181358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025408
3111	NC_015873	TCT	2	6	181467	181472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025408
3112	NC_015873	CCT	2	6	181494	181499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3113	NC_015873	AGC	2	6	181511	181516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_015873	CTG	2	6	181521	181526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_015873	GTT	2	6	181639	181644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348025409
3116	NC_015873	GAC	2	6	181649	181654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025409
3117	NC_015873	CGA	2	6	181666	181671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025409
3118	NC_015873	TCG	2	6	181689	181694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025409
3119	NC_015873	ACG	2	6	181814	181819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025409
3120	NC_015873	CTG	2	6	181894	181899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025409
3121	NC_015873	TGC	2	6	182001	182006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025409
3122	NC_015873	CCA	2	6	182019	182024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	348025409
3123	NC_015873	CGC	2	6	182028	182033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025409
3124	NC_015873	TCT	2	6	182072	182077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025409
3125	NC_015873	CAG	2	6	182089	182094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025409
3126	NC_015873	TTC	2	6	182095	182100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025409
3127	NC_015873	CTG	3	9	182101	182109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025409
3128	NC_015873	CGC	2	6	182131	182136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025409
3129	NC_015873	GTA	2	6	182155	182160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025409
3130	NC_015873	GAT	2	6	182182	182187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025409
3131	NC_015873	CAT	2	6	182206	182211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025409
3132	NC_015873	GGC	2	6	182230	182235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025409
3133	NC_015873	TGA	2	6	182247	182252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025409
3134	NC_015873	GCG	2	6	182260	182265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025409
3135	NC_015873	ATG	2	6	182273	182278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025409
3136	NC_015873	GAT	2	6	182284	182289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025409
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3139	NC_015873	GAC	2	6	182434	182439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025409
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3142	NC_015873	CAT	2	6	182715	182720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025409
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3148	NC_015873	CGA	2	6	182948	182953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025410
3149	NC_015873	GAT	2	6	183099	183104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025410
3150	NC_015873	ACG	2	6	183208	183213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025410
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3152	NC_015873	CGA	2	6	183236	183241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025410
3153	NC_015873	CTG	2	6	183312	183317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025410
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3165	NC_015873	TTC	2	6	183896	183901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025411
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3183	NC_015873	GCC	2	6	184874	184879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025411
3184	NC_015873	GAC	2	6	184913	184918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025411
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3205	NC_015873	CTT	2	6	186144	186149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3206	NC_015873	ATA	2	6	186316	186321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3207	NC_015873	GGT	2	6	186327	186332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3208	NC_015873	ATC	2	6	186379	186384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025413
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3224	NC_015873	AAG	2	6	186974	186979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025413
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3229	NC_015873	GAC	2	6	187221	187226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025413
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3233	NC_015873	ACG	2	6	187480	187485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025413
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3235	NC_015873	CTT	2	6	187626	187631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025413
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3237	NC_015873	GTC	2	6	187687	187692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025413
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3239	NC_015873	GCG	2	6	187752	187757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3240	NC_015873	ACG	2	6	187775	187780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3241	NC_015873	GCC	2	6	187809	187814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3242	NC_015873	CCG	2	6	188155	188160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3352	NC_015873	GGC	2	6	194668	194673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3353	NC_015873	ATG	2	6	194683	194688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3355	NC_015873	TGA	2	6	195277	195282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025417
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3461	NC_015873	AAT	2	6	201024	201029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3462	NC_015873	ATA	2	6	201032	201037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3463	NC_015873	ATA	2	6	201062	201067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3464	NC_015873	ATA	2	6	201079	201084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3465	NC_015873	CAA	2	6	201233	201238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348025422
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3474	NC_015873	ACC	2	6	202189	202194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	348025422
3475	NC_015873	AAC	2	6	202293	202298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348025422
3476	NC_015873	AAC	2	6	202319	202324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348025422
3477	NC_015873	GAT	2	6	202371	202376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3478	NC_015873	TCC	2	6	202499	202504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3479	NC_015873	TCA	2	6	202622	202627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3480	NC_015873	CTT	2	6	202728	202733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025423
3481	NC_015873	GAT	2	6	202828	202833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025423
3482	NC_015873	GCT	2	6	202994	202999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025423
3483	NC_015873	GAT	2	6	203049	203054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025423
3484	NC_015873	TTC	2	6	203218	203223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025423
3485	NC_015873	TCT	3	9	203243	203251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025423
3486	NC_015873	TGG	2	6	203271	203276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348025423
3487	NC_015873	CGA	2	6	203307	203312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025423
3488	NC_015873	CGA	2	6	203325	203330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025423
3489	NC_015873	GAA	2	6	203356	203361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025423
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3491	NC_015873	ATG	2	6	203537	203542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025423
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3493	NC_015873	CAG	3	9	203676	203684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025423
3494	NC_015873	ATC	2	6	203708	203713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025423
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3498	NC_015873	AGA	2	6	204105	204110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025423
3499	NC_015873	TCA	2	6	204152	204157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025423
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