MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Megasphaera elsdenii DSM 20460

Total Repeats: 39966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015873	AGC	2	6	295046	295051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025506
5002	NC_015873	CGA	2	6	295120	295125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025506
5003	NC_015873	TTC	2	6	295139	295144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025506
5004	NC_015873	TGC	2	6	295311	295316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025506
5005	NC_015873	GAG	2	6	295409	295414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025506
5006	NC_015873	GAA	2	6	295481	295486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025506
5007	NC_015873	TGA	2	6	295489	295494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025506
5008	NC_015873	GAC	2	6	295526	295531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025506
5009	NC_015873	ATC	2	6	295719	295724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025506
5010	NC_015873	GTC	3	9	295746	295754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025506
5011	NC_015873	GGC	2	6	295859	295864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025506
5012	NC_015873	CGA	2	6	295892	295897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025506
5013	NC_015873	ATC	2	6	296082	296087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_015873	TCG	2	6	296331	296336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_015873	GAT	2	6	296405	296410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025507
5016	NC_015873	AGG	2	6	296460	296465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025507
5017	NC_015873	TCG	2	6	296496	296501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025507
5018	NC_015873	GTA	2	6	296504	296509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025507
5019	NC_015873	AGC	2	6	296544	296549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025507
5020	NC_015873	CAG	2	6	296668	296673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025507
5021	NC_015873	GAC	2	6	296684	296689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025507
5022	NC_015873	TCG	2	6	296745	296750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025507
5023	NC_015873	TAT	2	6	296825	296830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_015873	CGC	2	6	296868	296873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_015873	GCA	2	6	296877	296882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_015873	TTA	2	6	296893	296898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348025508
5027	NC_015873	GAG	2	6	296902	296907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025508
5028	NC_015873	TTC	2	6	296932	296937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025508
5029	NC_015873	TGA	2	6	296985	296990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025508
5030	NC_015873	TGC	2	6	297139	297144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025508
5031	NC_015873	GGC	2	6	297201	297206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025508
5032	NC_015873	CGT	2	6	297321	297326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025508
5033	NC_015873	GCG	2	6	297330	297335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025508
5034	NC_015873	CCT	2	6	297454	297459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5035	NC_015873	GCC	2	6	297487	297492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025509
5036	NC_015873	CTT	2	6	297531	297536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025509
5037	NC_015873	TTC	2	6	297625	297630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025509
5038	NC_015873	CGA	2	6	297669	297674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025509
5039	NC_015873	TTC	2	6	297700	297705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025509
5040	NC_015873	CGA	2	6	297804	297809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025509
5041	NC_015873	TCC	2	6	297925	297930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_015873	ATT	2	6	298055	298060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_015873	ATT	2	6	298065	298070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348025510
5044	NC_015873	TCG	2	6	298131	298136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025510
5045	NC_015873	GCC	2	6	298168	298173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025510
5046	NC_015873	CCG	2	6	298210	298215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025510
5047	NC_015873	AGA	2	6	298258	298263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025510
5048	NC_015873	GTC	2	6	298349	298354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025510
5049	NC_015873	ATG	2	6	298436	298441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025510
5050	NC_015873	GGC	2	6	298446	298451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025510
5051	NC_015873	CGC	2	6	298494	298499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025510
5052	NC_015873	AGA	2	6	298551	298556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025510
5053	NC_015873	ATA	2	6	298582	298587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348025510
5054	NC_015873	TGC	2	6	298667	298672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025510
5055	NC_015873	GCC	3	9	298738	298746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025510
5056	NC_015873	TGG	2	6	298844	298849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348025510
5057	NC_015873	TGT	2	6	298872	298877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348025510
5058	NC_015873	GCG	2	6	298878	298883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025510
5059	NC_015873	CCA	2	6	298975	298980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	348025510
5060	NC_015873	TCA	2	6	298988	298993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025510
5061	NC_015873	CAG	2	6	299002	299007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025510
5062	NC_015873	TCA	2	6	299033	299038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025510
5063	NC_015873	AGA	2	6	299051	299056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025510
5064	NC_015873	CGC	2	6	299098	299103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025510
5065	NC_015873	GCG	2	6	299273	299278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025511
5066	NC_015873	TTC	2	6	299288	299293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025511
5067	NC_015873	CAG	2	6	299295	299300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025511
5068	NC_015873	CGA	2	6	299317	299322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025511
5069	NC_015873	CGG	2	6	299372	299377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025511
5070	NC_015873	CTT	2	6	299390	299395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025511
5071	NC_015873	GGC	2	6	299482	299487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025511
5072	NC_015873	TCA	2	6	299508	299513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025511
5073	NC_015873	GCA	2	6	299711	299716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025511
5074	NC_015873	GGT	2	6	299776	299781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348025511
5075	NC_015873	GTC	2	6	299796	299801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025511
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5078	NC_015873	CGA	2	6	299932	299937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025511
5079	NC_015873	TGA	2	6	300028	300033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025511
5080	NC_015873	TGA	2	6	300151	300156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025511
5081	NC_015873	CCT	2	6	300249	300254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_015873	GCC	2	6	300272	300277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5083	NC_015873	GCT	2	6	300344	300349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_015873	TCT	3	9	300398	300406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025512
5085	NC_015873	CTG	2	6	300486	300491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025512
5086	NC_015873	TTC	2	6	300507	300512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025512
5087	NC_015873	CGA	2	6	300536	300541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025512
5088	NC_015873	GGC	2	6	300665	300670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025512
5089	NC_015873	GAT	2	6	300792	300797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025512
5090	NC_015873	CGA	2	6	300884	300889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025512
5091	NC_015873	TTC	2	6	300915	300920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025512
5092	NC_015873	CGT	2	6	301003	301008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025513
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5094	NC_015873	CGG	2	6	301082	301087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025513
5095	NC_015873	TGA	2	6	301105	301110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025513
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5098	NC_015873	ATG	2	6	301296	301301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025513
5099	NC_015873	ATG	2	6	301344	301349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025513
5100	NC_015873	ACG	3	9	301416	301424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025513
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5102	NC_015873	TTC	2	6	301449	301454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025513
5103	NC_015873	ATG	2	6	301473	301478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025513
5104	NC_015873	GAA	2	6	301511	301516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025513
5105	NC_015873	ACG	2	6	301551	301556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025513
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5107	NC_015873	ATA	2	6	301649	301654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348025513
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5110	NC_015873	TCG	2	6	301788	301793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025513
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5112	NC_015873	CAA	2	6	301828	301833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348025513
5113	NC_015873	AGT	2	6	301958	301963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_015873	ATT	2	6	301971	301976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348025514
5115	NC_015873	CGT	2	6	302181	302186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025514
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5117	NC_015873	GAT	2	6	302485	302490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025514
5118	NC_015873	CGT	2	6	302548	302553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025514
5119	NC_015873	TAT	2	6	302565	302570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348025514
5120	NC_015873	ATG	2	6	302579	302584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025514
5121	NC_015873	CTG	2	6	302650	302655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025514
5122	NC_015873	GCA	2	6	302693	302698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025514
5123	NC_015873	GAC	2	6	302707	302712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025514
5124	NC_015873	GAT	2	6	302737	302742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025514
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5128	NC_015873	GAC	2	6	302893	302898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025514
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5142	NC_015873	CCA	2	6	304113	304118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5143	NC_015873	GAT	2	6	304154	304159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_015873	ATT	2	6	304255	304260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5145	NC_015873	TCT	2	6	304289	304294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025516
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5173	NC_015873	TAT	2	6	305994	305999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5174	NC_015873	AAT	2	6	306002	306007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5238	NC_015873	CGT	2	6	309735	309740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025519
5239	NC_015873	ATC	2	6	309784	309789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025519
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5265	NC_015873	TGA	2	6	311434	311439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5266	NC_015873	TAT	2	6	311474	311479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5353	NC_015873	CCT	2	6	315927	315932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	348025527
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5356	NC_015873	CCG	2	6	316103	316108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025527
5357	NC_015873	CTT	3	9	316134	316142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025527
5358	NC_015873	CGC	2	6	316149	316154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025527
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5379	NC_015873	TTC	2	6	317631	317636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025528
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5391	NC_015873	GCT	2	6	318011	318016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025528
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5400	NC_015873	TTC	2	6	318658	318663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025529
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5422	NC_015873	CGA	2	6	320063	320068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025530
5423	NC_015873	TCC	2	6	320199	320204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5424	NC_015873	TAA	2	6	320212	320217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5425	NC_015873	GGC	2	6	320286	320291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025531
5426	NC_015873	TCT	2	6	320319	320324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025531
5427	NC_015873	CAT	2	6	320333	320338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025531
5428	NC_015873	GTC	2	6	320482	320487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5429	NC_015873	AGG	2	6	320625	320630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025532
5430	NC_015873	GAC	2	6	320647	320652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025532
5431	NC_015873	GCT	3	9	320781	320789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025532
5432	NC_015873	CTT	2	6	320802	320807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025532
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5434	NC_015873	TCT	2	6	320975	320980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025532
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5449	NC_015873	GTC	2	6	322036	322041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025533
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5453	NC_015873	GTC	2	6	322241	322246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025533
5454	NC_015873	GCC	2	6	322249	322254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025533
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5456	NC_015873	CCT	2	6	322325	322330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5457	NC_015873	CTT	2	6	322342	322347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025534
5458	NC_015873	CCG	2	6	322417	322422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025534
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5460	NC_015873	GAC	2	6	322567	322572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025534
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5462	NC_015873	GCA	2	6	322791	322796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025534
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5464	NC_015873	GCA	2	6	323096	323101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025534
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5467	NC_015873	ACA	2	6	323322	323327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348025535
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5471	NC_015873	TCA	2	6	323546	323551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025535
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5473	NC_015873	GCA	2	6	323666	323671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025535
5474	NC_015873	TTC	2	6	323704	323709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025535
5475	NC_015873	GCG	2	6	323745	323750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025535
5476	NC_015873	CTG	2	6	323809	323814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025535
5477	NC_015873	CCG	2	6	324348	324353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5478	NC_015873	GCC	2	6	324508	324513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025536
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5499	NC_015873	CGT	2	6	325510	325515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025537
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