MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 22523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013156	TTA	2	6	265358	265363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810239
4002	NC_013156	ATA	2	6	265389	265394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810239
4003	NC_013156	TAA	2	6	265415	265420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810239
4004	NC_013156	TCA	2	6	265459	265464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810239
4005	NC_013156	CTT	2	6	265481	265486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810239
4006	NC_013156	ATC	2	6	265566	265571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810239
4007	NC_013156	CTC	2	6	265575	265580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810239
4008	NC_013156	CAT	2	6	265583	265588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810239
4009	NC_013156	TTA	2	6	265594	265599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810239
4010	NC_013156	TCA	2	6	265672	265677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810239
4011	NC_013156	TAA	2	6	265682	265687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810239
4012	NC_013156	AAT	2	6	265748	265753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810239
4013	NC_013156	CAA	2	6	265769	265774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810239
4014	NC_013156	GGA	2	6	265831	265836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810239
4015	NC_013156	TAA	2	6	265854	265859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810239
4016	NC_013156	CAA	2	6	265910	265915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810239
4017	NC_013156	GTA	2	6	265987	265992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810239
4018	NC_013156	ATC	2	6	266252	266257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810240
4019	NC_013156	GGT	2	6	266266	266271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810240
4020	NC_013156	CTC	2	6	266308	266313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810240
4021	NC_013156	CTC	2	6	266327	266332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810240
4022	NC_013156	TCC	2	6	266345	266350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810240
4023	NC_013156	TCT	2	6	266368	266373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810240
4024	NC_013156	CAT	2	6	266389	266394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810240
4025	NC_013156	TCC	2	6	266438	266443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810240
4026	NC_013156	TAA	2	6	266444	266449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810240
4027	NC_013156	AAC	2	6	266564	266569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810240
4028	NC_013156	CTC	2	6	266834	266839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810240
4029	NC_013156	TAT	2	6	266902	266907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810240
4030	NC_013156	CAA	2	6	266938	266943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810240
4031	NC_013156	CAT	2	6	266978	266983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810240
4032	NC_013156	AAC	2	6	266990	266995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810240
4033	NC_013156	TTA	2	6	267006	267011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810240
4034	NC_013156	TCC	2	6	267064	267069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810240
4035	NC_013156	ATG	2	6	267077	267082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810240
4036	NC_013156	TAA	2	6	267205	267210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_013156	TAA	2	6	267247	267252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_013156	TAT	2	6	267260	267265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_013156	ATT	2	6	267417	267422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810241
4040	NC_013156	AAC	2	6	267447	267452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810241
4041	NC_013156	ATA	2	6	267636	267641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810241
4042	NC_013156	TAT	2	6	267730	267735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810241
4043	NC_013156	TAA	2	6	267769	267774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810241
4044	NC_013156	TGA	2	6	267805	267810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810241
4045	NC_013156	TGT	3	9	267910	267918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810241
4046	NC_013156	TTA	2	6	267921	267926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810241
4047	NC_013156	TAA	2	6	268024	268029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810242
4048	NC_013156	ATT	2	6	268240	268245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810242
4049	NC_013156	GAG	2	6	268269	268274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810242
4050	NC_013156	TTA	2	6	268311	268316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810242
4051	NC_013156	AGT	2	6	268319	268324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810242
4052	NC_013156	TAT	2	6	268427	268432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810242
4053	NC_013156	ATA	2	6	268604	268609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_013156	ATT	2	6	268611	268616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_013156	GCT	2	6	268729	268734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810243
4056	NC_013156	TTG	2	6	268880	268885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810243
4057	NC_013156	GAG	2	6	268936	268941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810243
4058	NC_013156	ACA	2	6	269041	269046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810243
4059	NC_013156	ATA	2	6	269078	269083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810243
4060	NC_013156	TTG	2	6	269111	269116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810243
4061	NC_013156	TGC	2	6	269211	269216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810243
4062	NC_013156	AAG	2	6	269320	269325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810243
4063	NC_013156	GAA	3	9	269329	269337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810243
4064	NC_013156	ACC	2	6	269361	269366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810243
4065	NC_013156	AAT	2	6	269482	269487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_013156	ATT	2	6	269635	269640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810244
4067	NC_013156	GAA	2	6	269819	269824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810244
4068	NC_013156	AGA	2	6	269850	269855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810244
4069	NC_013156	ATG	3	9	269912	269920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810244
4070	NC_013156	ATA	2	6	269929	269934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810244
4071	NC_013156	ATT	2	6	269954	269959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810244
4072	NC_013156	TTA	2	6	269966	269971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810244
4073	NC_013156	AAT	2	6	269995	270000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810244
4074	NC_013156	TGA	2	6	270075	270080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810244
4075	NC_013156	TAA	2	6	270083	270088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810244
4076	NC_013156	GAT	2	6	270091	270096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810244
4077	NC_013156	TTG	2	6	270109	270114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810244
4078	NC_013156	TGA	2	6	270123	270128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810244
4079	NC_013156	GTT	2	6	270134	270139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810244
4080	NC_013156	GGA	2	6	270142	270147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810244
4081	NC_013156	AAT	2	6	270205	270210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810244
4082	NC_013156	AAG	2	6	270215	270220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810244
4083	NC_013156	AAT	2	6	270334	270339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810244
4084	NC_013156	TAA	2	6	270354	270359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810244
4085	NC_013156	AAT	2	6	270385	270390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810244
4086	NC_013156	ATT	2	6	270415	270420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810244
4087	NC_013156	TAA	2	6	270428	270433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810244
4088	NC_013156	ATG	2	6	270470	270475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810244
4089	NC_013156	AGG	2	6	270579	270584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810244
4090	NC_013156	GGT	2	6	270619	270624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810244
4091	NC_013156	TAT	2	6	270653	270658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810245
4092	NC_013156	AAC	2	6	270701	270706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810245
4093	NC_013156	ATT	2	6	270845	270850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810245
4094	NC_013156	GAT	2	6	270959	270964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810245
4095	NC_013156	AGG	2	6	271028	271033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810245
4096	NC_013156	TAA	2	6	271167	271172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810245
4097	NC_013156	GAA	2	6	271204	271209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810245
4098	NC_013156	TGT	2	6	271243	271248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810245
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4100	NC_013156	ATT	2	6	271286	271291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810245
4101	NC_013156	GAA	2	6	271292	271297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810245
4102	NC_013156	TAG	2	6	271432	271437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810245
4103	NC_013156	AGT	2	6	271474	271479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810245
4104	NC_013156	GAA	2	6	271537	271542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810245
4105	NC_013156	ATG	2	6	271545	271550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810245
4106	NC_013156	TTA	2	6	271753	271758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810246
4107	NC_013156	TGG	2	6	271831	271836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810246
4108	NC_013156	TTA	2	6	271909	271914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810246
4109	NC_013156	TTA	2	6	272012	272017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810246
4110	NC_013156	GAT	2	6	272222	272227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810247
4111	NC_013156	TGA	2	6	272314	272319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810247
4112	NC_013156	AGA	2	6	272387	272392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810247
4113	NC_013156	CAT	2	6	272508	272513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810247
4114	NC_013156	CAA	2	6	272667	272672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810247
4115	NC_013156	TGA	3	9	272872	272880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810247
4116	NC_013156	CAA	2	6	272889	272894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810247
4117	NC_013156	CTT	2	6	272962	272967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810247
4118	NC_013156	TAC	2	6	273127	273132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810247
4119	NC_013156	TGA	2	6	273169	273174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810247
4120	NC_013156	TTG	2	6	273248	273253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810247
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4241	NC_013156	AGA	4	12	281014	281025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810253
4242	NC_013156	ATA	2	6	281036	281041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810253
4243	NC_013156	GTT	2	6	281047	281052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810253
4244	NC_013156	TAT	2	6	281074	281079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810253
4245	NC_013156	ATG	2	6	281151	281156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810253
4246	NC_013156	GAA	2	6	281317	281322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_013156	TTA	2	6	281356	281361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_013156	TTG	2	6	281415	281420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4249	NC_013156	AGA	2	6	281469	281474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_013156	TGA	2	6	281545	281550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_013156	AAC	2	6	281745	281750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4252	NC_013156	CCT	2	6	281883	281888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4253	NC_013156	GGA	2	6	281951	281956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4255	NC_013156	GTA	2	6	282081	282086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_013156	TAA	2	6	282366	282371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4259	NC_013156	AAT	2	6	282781	282786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_013156	ACA	2	6	282818	282823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4261	NC_013156	AAC	2	6	282824	282829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4262	NC_013156	TGA	2	6	282843	282848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_013156	AAT	2	6	282890	282895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_013156	ATA	2	6	282922	282927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_013156	TCT	2	6	282985	282990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4266	NC_013156	AAT	2	6	283087	283092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_013156	AAT	2	6	283145	283150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4268	NC_013156	ATT	2	6	283278	283283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810254
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4270	NC_013156	AGA	2	6	283396	283401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810254
4271	NC_013156	CAT	2	6	283470	283475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810254
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4274	NC_013156	CAA	3	9	283610	283618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810254
4275	NC_013156	CCT	2	6	283619	283624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810254
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4280	NC_013156	TAA	2	6	283897	283902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810254
4281	NC_013156	TCA	2	6	283964	283969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810254
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4288	NC_013156	CAT	2	6	284454	284459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810254
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4291	NC_013156	ACC	2	6	284548	284553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4292	NC_013156	TCA	2	6	284651	284656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810255
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4323	NC_013156	ATT	2	6	286008	286013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4343	NC_013156	ATG	2	6	287364	287369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810257
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4345	NC_013156	TCA	2	6	287512	287517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810257
4346	NC_013156	TCT	2	6	287664	287669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4347	NC_013156	TTG	2	6	287761	287766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810258
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4363	NC_013156	CTA	2	6	288595	288600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810259
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4401	NC_013156	ATT	2	6	291115	291120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4402	NC_013156	TAT	2	6	291215	291220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4403	NC_013156	TAA	2	6	291321	291326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4482	NC_013156	CTC	2	6	295975	295980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810266
4483	NC_013156	TAA	2	6	295990	295995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810266
4484	NC_013156	CAA	2	6	296131	296136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810266
4485	NC_013156	AAC	2	6	296165	296170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810266
4486	NC_013156	TCA	2	6	296229	296234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810266
4487	NC_013156	CAA	2	6	296251	296256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810266
4488	NC_013156	CAT	2	6	296485	296490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810266
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4491	NC_013156	TAA	2	6	296617	296622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810266
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