MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 22523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013156	ATA	3	9	198385	198393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810172
3002	NC_013156	CAA	2	6	198402	198407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810172
3003	NC_013156	TCT	2	6	198536	198541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810172
3004	NC_013156	ATC	2	6	198584	198589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810172
3005	NC_013156	AAC	2	6	198795	198800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_013156	ATT	3	9	198826	198834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810173
3007	NC_013156	TCT	2	6	198889	198894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810173
3008	NC_013156	ATT	2	6	198904	198909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810173
3009	NC_013156	TCA	2	6	198917	198922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810173
3010	NC_013156	TTC	2	6	198974	198979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810173
3011	NC_013156	CAG	2	6	199097	199102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810173
3012	NC_013156	GCT	2	6	199396	199401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810173
3013	NC_013156	CCT	2	6	199447	199452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810173
3014	NC_013156	AGC	2	6	199524	199529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810173
3015	NC_013156	CAA	2	6	199631	199636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810173
3016	NC_013156	CTT	2	6	199880	199885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810173
3017	NC_013156	GCC	2	6	200062	200067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256810173
3018	NC_013156	TAA	2	6	200076	200081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810173
3019	NC_013156	TCT	2	6	200119	200124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810173
3020	NC_013156	TTG	2	6	200147	200152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810173
3021	NC_013156	CAA	2	6	200276	200281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810173
3022	NC_013156	CAG	2	6	200323	200328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810173
3023	NC_013156	TCA	2	6	200542	200547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810173
3024	NC_013156	AAT	2	6	200585	200590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810173
3025	NC_013156	CTT	2	6	200594	200599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810173
3026	NC_013156	ATA	2	6	200618	200623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810173
3027	NC_013156	AAT	2	6	200645	200650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810173
3028	NC_013156	GGT	2	6	200777	200782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810173
3029	NC_013156	CTA	2	6	200794	200799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810173
3030	NC_013156	CAG	2	6	200827	200832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810173
3031	NC_013156	ACT	2	6	200842	200847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810173
3032	NC_013156	TTC	2	6	200887	200892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810173
3033	NC_013156	GGA	2	6	200959	200964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810173
3034	NC_013156	CTT	2	6	201050	201055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810173
3035	NC_013156	AAT	2	6	201301	201306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_013156	TAT	2	6	201326	201331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_013156	ACT	2	6	201340	201345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_013156	ATA	2	6	201439	201444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810174
3039	NC_013156	TAT	2	6	201466	201471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810174
3040	NC_013156	ATT	2	6	201497	201502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810174
3041	NC_013156	GAG	2	6	201559	201564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810174
3042	NC_013156	GAA	2	6	201577	201582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810175
3043	NC_013156	TAA	2	6	201638	201643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810175
3044	NC_013156	ATC	2	6	201696	201701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810175
3045	NC_013156	CCT	2	6	201826	201831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810175
3046	NC_013156	GAA	2	6	201874	201879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810175
3047	NC_013156	GAA	2	6	201911	201916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810175
3048	NC_013156	AGA	2	6	201952	201957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810175
3049	NC_013156	ATT	2	6	201987	201992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810175
3050	NC_013156	AAG	2	6	202110	202115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810175
3051	NC_013156	AGA	2	6	202191	202196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810175
3052	NC_013156	GAA	2	6	202204	202209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810175
3053	NC_013156	GTT	3	9	202264	202272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810175
3054	NC_013156	CTG	2	6	202280	202285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810175
3055	NC_013156	GAA	4	12	202509	202520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810175
3056	NC_013156	ATA	2	6	202521	202526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810175
3057	NC_013156	GAT	2	6	202636	202641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_013156	TAG	2	6	202725	202730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810176
3059	NC_013156	TGG	2	6	202738	202743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810176
3060	NC_013156	GCT	2	6	202922	202927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810176
3061	NC_013156	AGA	2	6	202948	202953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810176
3062	NC_013156	GTG	2	6	202998	203003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810176
3063	NC_013156	GAA	2	6	203110	203115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810176
3064	NC_013156	ATT	2	6	203162	203167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810176
3065	NC_013156	AAC	2	6	203174	203179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810176
3066	NC_013156	TGA	2	6	203233	203238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810176
3067	NC_013156	TAA	2	6	203292	203297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810176
3068	NC_013156	GTG	2	6	203331	203336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810176
3069	NC_013156	GAG	2	6	203337	203342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810176
3070	NC_013156	GAT	2	6	203347	203352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810176
3071	NC_013156	TAG	2	6	203371	203376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810176
3072	NC_013156	ATT	2	6	203428	203433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810176
3073	NC_013156	AGG	2	6	203479	203484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810176
3074	NC_013156	AAG	2	6	203502	203507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810176
3075	NC_013156	AAT	2	6	203614	203619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810176
3076	NC_013156	AAG	2	6	203665	203670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810176
3077	NC_013156	AAT	2	6	203671	203676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810176
3078	NC_013156	AGA	2	6	203705	203710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810176
3079	NC_013156	TAA	2	6	203767	203772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_013156	ATT	2	6	203782	203787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_013156	GTT	2	6	203800	203805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_013156	GAA	2	6	203861	203866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810177
3083	NC_013156	GAA	2	6	204017	204022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810177
3084	NC_013156	CTG	2	6	204132	204137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810177
3085	NC_013156	GGA	2	6	204145	204150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810177
3086	NC_013156	TTG	2	6	204156	204161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810177
3087	NC_013156	AAT	2	6	204298	204303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810177
3088	NC_013156	AAT	2	6	204321	204326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810177
3089	NC_013156	ATT	2	6	204351	204356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810178
3090	NC_013156	ATT	2	6	204371	204376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810178
3091	NC_013156	AAG	2	6	204432	204437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810178
3092	NC_013156	ATT	2	6	204592	204597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810178
3093	NC_013156	TGC	2	6	204628	204633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810178
3094	NC_013156	AAC	2	6	204634	204639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810178
3095	NC_013156	TCA	3	9	204641	204649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810178
3096	NC_013156	TTC	2	6	204725	204730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810178
3097	NC_013156	CTT	2	6	204831	204836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810178
3098	NC_013156	AAC	2	6	204880	204885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810178
3099	NC_013156	AGG	2	6	204964	204969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810178
3100	NC_013156	ATT	2	6	205290	205295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_013156	TTA	2	6	205305	205310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_013156	ATT	2	6	205335	205340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_013156	TGA	2	6	205345	205350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_013156	CAA	2	6	205404	205409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810179
3105	NC_013156	AGA	3	9	205414	205422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810179
3106	NC_013156	ATT	2	6	205433	205438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810179
3107	NC_013156	TTG	2	6	205524	205529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810179
3108	NC_013156	AAG	2	6	205559	205564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810179
3109	NC_013156	ATG	2	6	205727	205732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810179
3110	NC_013156	TCC	2	6	205753	205758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810179
3111	NC_013156	TAA	2	6	205818	205823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810179
3112	NC_013156	CAA	2	6	205863	205868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810179
3113	NC_013156	GTT	2	6	206048	206053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810179
3114	NC_013156	GGA	2	6	206096	206101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810179
3115	NC_013156	TGC	2	6	206113	206118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810179
3116	NC_013156	TGT	2	6	206131	206136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810179
3117	NC_013156	TGA	2	6	206179	206184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810179
3118	NC_013156	TTG	2	6	206192	206197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810179
3119	NC_013156	TCA	2	6	206353	206358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810179
3120	NC_013156	TGA	2	6	206389	206394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810179
3121	NC_013156	AAG	2	6	206608	206613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810179
3122	NC_013156	TGA	2	6	206652	206657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810179
3123	NC_013156	GAT	2	6	206738	206743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810179
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3130	NC_013156	CTT	2	6	207299	207304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810181
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3220	NC_013156	CCT	2	6	214391	214396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3242	NC_013156	ATA	2	6	216363	216368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810191
3243	NC_013156	CTA	2	6	216395	216400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810191
3244	NC_013156	TCA	2	6	216453	216458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810191
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3246	NC_013156	GTT	2	6	216650	216655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810191
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3291	NC_013156	TAT	2	6	219087	219092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3292	NC_013156	TTA	2	6	219099	219104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3293	NC_013156	GTT	2	6	219106	219111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3351	NC_013156	TAT	2	6	221922	221927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3352	NC_013156	TAC	2	6	221955	221960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3357	NC_013156	TAT	2	6	222085	222090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3362	NC_013156	TAC	2	6	222660	222665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810199
3363	NC_013156	CTC	2	6	222671	222676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810199
3364	NC_013156	AGA	2	6	222677	222682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810199
3365	NC_013156	TAA	2	6	222686	222691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810199
3366	NC_013156	TGA	2	6	222701	222706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810199
3367	NC_013156	GTA	2	6	223089	223094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810199
3368	NC_013156	TTA	2	6	223146	223151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810199
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3370	NC_013156	AGA	2	6	223263	223268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810200
3371	NC_013156	ATT	2	6	223409	223414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810200
3372	NC_013156	TTA	2	6	223454	223459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810200
3373	NC_013156	GTT	2	6	223513	223518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810200
3374	NC_013156	TAA	2	6	223577	223582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810200
3375	NC_013156	ATT	2	6	223667	223672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810200
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3382	NC_013156	AAT	2	6	224200	224205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810201
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3386	NC_013156	CAA	2	6	224454	224459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810202
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3391	NC_013156	TCT	2	6	224887	224892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810202
3392	NC_013156	CTT	2	6	224931	224936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810202
3393	NC_013156	TGC	2	6	225096	225101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810202
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3395	NC_013156	TCT	2	6	225233	225238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810202
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3412	NC_013156	CAT	2	6	225947	225952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810202
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3417	NC_013156	TGA	2	6	226146	226151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3418	NC_013156	ATA	2	6	226154	226159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3419	NC_013156	ATA	2	6	226227	226232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810203
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3436	NC_013156	TGG	2	6	228112	228117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3437	NC_013156	GAT	2	6	228242	228247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810205
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3463	NC_013156	TTA	2	6	229660	229665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810206
3464	NC_013156	TAC	2	6	229894	229899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3466	NC_013156	TAC	2	6	230113	230118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3467	NC_013156	TAA	2	6	230202	230207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3468	NC_013156	TCC	2	6	230248	230253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3469	NC_013156	GTT	2	6	230348	230353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810207
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3474	NC_013156	AGA	2	6	230686	230691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810207
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3478	NC_013156	ACC	2	6	230913	230918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810207
3479	NC_013156	TGA	2	6	231013	231018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810207
3480	NC_013156	GAA	2	6	231233	231238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810207
3481	NC_013156	ATC	2	6	231260	231265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810207
3482	NC_013156	ACG	2	6	231279	231284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810207
3483	NC_013156	AGA	2	6	231304	231309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810207
3484	NC_013156	CAG	2	6	231372	231377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810207
3485	NC_013156	AGG	2	6	231385	231390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810207
3486	NC_013156	CTG	2	6	231496	231501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810207
3487	NC_013156	GAA	2	6	231514	231519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810207
3488	NC_013156	GCA	2	6	231535	231540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810207
3489	NC_013156	GAG	2	6	231602	231607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810207
3490	NC_013156	AGA	2	6	231614	231619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810207
3491	NC_013156	AGA	2	6	231709	231714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810207
3492	NC_013156	TTC	2	6	231839	231844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810207
3493	NC_013156	TGT	2	6	232021	232026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810207
3494	NC_013156	TGA	2	6	232027	232032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810207
3495	NC_013156	GGA	2	6	232043	232048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810207
3496	NC_013156	TAG	2	6	232113	232118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810207
3497	NC_013156	ATC	2	6	232214	232219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810207
3498	NC_013156	GTG	2	6	232438	232443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3499	NC_013156	TAA	2	6	232551	232556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810208
3500	NC_013156	CTG	2	6	232564	232569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810208

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