MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 22523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013156	GAA	2	6	33426	33431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810007
502	NC_013156	AAT	2	6	33452	33457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810007
503	NC_013156	AAT	2	6	33467	33472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810007
504	NC_013156	CCA	2	6	33533	33538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810008
505	NC_013156	AGA	2	6	33584	33589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810008
506	NC_013156	TGA	2	6	33597	33602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810008
507	NC_013156	ATC	2	6	33638	33643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810008
508	NC_013156	ATT	2	6	33686	33691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_013156	ATG	2	6	33804	33809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_013156	ATA	2	6	33904	33909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_013156	AGG	2	6	33911	33916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_013156	TAG	2	6	33917	33922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_013156	ACA	2	6	33988	33993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810009
514	NC_013156	AGG	2	6	34073	34078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810009
515	NC_013156	TTA	2	6	34140	34145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810009
516	NC_013156	CCA	2	6	34152	34157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810009
517	NC_013156	AGA	3	9	34185	34193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810009
518	NC_013156	GTT	2	6	34248	34253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810009
519	NC_013156	AGG	2	6	34295	34300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810009
520	NC_013156	GAG	2	6	34612	34617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810010
521	NC_013156	AAG	2	6	34665	34670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810010
522	NC_013156	ACA	2	6	34693	34698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810010
523	NC_013156	CTT	2	6	34805	34810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810010
524	NC_013156	TGC	2	6	34836	34841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810010
525	NC_013156	TAG	2	6	34940	34945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810010
526	NC_013156	AAT	2	6	35019	35024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810010
527	NC_013156	TCA	2	6	35037	35042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810010
528	NC_013156	AAG	2	6	35136	35141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810010
529	NC_013156	AGG	2	6	35184	35189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810010
530	NC_013156	ATT	2	6	35206	35211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810010
531	NC_013156	GGA	2	6	35356	35361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810010
532	NC_013156	AAC	2	6	35376	35381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810010
533	NC_013156	AGG	2	6	35510	35515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810010
534	NC_013156	AGA	2	6	35674	35679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810010
535	NC_013156	ATT	2	6	35792	35797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810011
536	NC_013156	TGG	2	6	35890	35895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810011
537	NC_013156	ATT	2	6	36114	36119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810011
538	NC_013156	ATA	2	6	36122	36127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810011
539	NC_013156	ATT	2	6	36145	36150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810011
540	NC_013156	TGA	2	6	36241	36246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810011
541	NC_013156	AGA	2	6	36301	36306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810011
542	NC_013156	GTT	2	6	36310	36315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810011
543	NC_013156	AAG	2	6	36465	36470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810011
544	NC_013156	AGT	2	6	36539	36544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810011
545	NC_013156	AGT	2	6	36634	36639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810011
546	NC_013156	TAA	2	6	36655	36660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810011
547	NC_013156	ATC	2	6	36679	36684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810011
548	NC_013156	GAT	2	6	36794	36799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810011
549	NC_013156	AGG	2	6	36846	36851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013156	TAA	2	6	36868	36873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810012
551	NC_013156	AAG	2	6	36920	36925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810012
552	NC_013156	CAG	2	6	36937	36942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810012
553	NC_013156	GAG	2	6	36970	36975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810012
554	NC_013156	TGG	2	6	36992	36997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810012
555	NC_013156	CTG	2	6	37030	37035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810012
556	NC_013156	AAG	2	6	37039	37044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810012
557	NC_013156	AGA	2	6	37055	37060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810012
558	NC_013156	TTG	2	6	37063	37068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810012
559	NC_013156	TGG	2	6	37292	37297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810012
560	NC_013156	AGA	2	6	37439	37444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810012
561	NC_013156	GAA	2	6	37470	37475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810012
562	NC_013156	TCA	2	6	37715	37720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810012
563	NC_013156	TCT	2	6	37726	37731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810012
564	NC_013156	AGT	2	6	37778	37783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810012
565	NC_013156	ATT	2	6	37879	37884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810012
566	NC_013156	CTC	2	6	37909	37914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810012
567	NC_013156	TGA	2	6	37940	37945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810012
568	NC_013156	GAA	2	6	38097	38102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810012
569	NC_013156	AAG	2	6	38129	38134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810012
570	NC_013156	TAC	2	6	38164	38169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810012
571	NC_013156	AGA	2	6	38200	38205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810012
572	NC_013156	TGA	3	9	38222	38230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810012
573	NC_013156	GGA	2	6	38240	38245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810012
574	NC_013156	CTG	2	6	38258	38263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810012
575	NC_013156	TGA	2	6	38335	38340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810012
576	NC_013156	GAA	2	6	38378	38383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810012
577	NC_013156	GAA	2	6	38432	38437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810012
578	NC_013156	AGA	2	6	38459	38464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810012
579	NC_013156	AGG	2	6	38468	38473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810012
580	NC_013156	GTT	2	6	38535	38540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810012
581	NC_013156	TTA	2	6	38571	38576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810012
582	NC_013156	TAC	2	6	38634	38639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810012
583	NC_013156	GTT	2	6	38673	38678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810012
584	NC_013156	GAT	2	6	38723	38728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810012
585	NC_013156	TTA	2	6	38763	38768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810012
586	NC_013156	GTA	2	6	38794	38799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810012
587	NC_013156	TAT	2	6	38839	38844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_013156	TGA	2	6	38912	38917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810013
589	NC_013156	GAA	2	6	38970	38975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810013
590	NC_013156	TGT	2	6	39239	39244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810013
591	NC_013156	AAG	2	6	39296	39301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810013
592	NC_013156	GAA	2	6	39305	39310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810013
593	NC_013156	AGA	2	6	39496	39501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810013
594	NC_013156	TTG	2	6	39682	39687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810013
595	NC_013156	TTG	2	6	39844	39849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810013
596	NC_013156	GTT	2	6	39860	39865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810013
597	NC_013156	TTG	2	6	39886	39891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810013
598	NC_013156	AAC	2	6	39977	39982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810013
599	NC_013156	ATT	2	6	40093	40098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_013156	TAA	2	6	40155	40160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810014
601	NC_013156	ATA	2	6	40310	40315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810014
602	NC_013156	ACT	2	6	40541	40546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810014
603	NC_013156	TAA	2	6	40564	40569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810014
604	NC_013156	ATG	2	6	40583	40588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810014
605	NC_013156	GGA	2	6	40604	40609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810014
606	NC_013156	ATT	2	6	40661	40666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_013156	ATA	2	6	40692	40697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810015
608	NC_013156	TTA	2	6	40748	40753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810015
609	NC_013156	GTT	2	6	40802	40807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810015
610	NC_013156	AGT	2	6	40822	40827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810015
611	NC_013156	GGA	2	6	40889	40894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810015
612	NC_013156	ATT	2	6	40982	40987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810015
613	NC_013156	GTT	2	6	41111	41116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810015
614	NC_013156	GCA	2	6	41198	41203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810015
615	NC_013156	GAA	2	6	41216	41221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810015
616	NC_013156	CAA	2	6	41352	41357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810015
617	NC_013156	CTG	2	6	41358	41363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810015
618	NC_013156	ATA	2	6	41418	41423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810015
619	NC_013156	AAG	2	6	41448	41453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810015
620	NC_013156	AGG	2	6	41488	41493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810015
621	NC_013156	CAA	2	6	41496	41501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810015
622	NC_013156	TGA	2	6	41581	41586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810015
623	NC_013156	CTT	2	6	41601	41606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810015
624	NC_013156	GGA	2	6	41615	41620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810015
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754	NC_013156	AAT	2	6	49435	49440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810022
755	NC_013156	TGT	2	6	49446	49451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810022
756	NC_013156	TGG	2	6	49455	49460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810022
757	NC_013156	GAG	2	6	49463	49468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810022
758	NC_013156	TTA	2	6	49513	49518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810022
759	NC_013156	TTA	2	6	49663	49668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810022
760	NC_013156	TCT	2	6	49714	49719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810022
761	NC_013156	TCC	2	6	49721	49726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810022
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766	NC_013156	CTT	2	6	50132	50137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810022
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784	NC_013156	TCA	2	6	51343	51348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810022
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786	NC_013156	GTT	2	6	51426	51431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810022
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788	NC_013156	TCT	2	6	51455	51460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810022
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792	NC_013156	TCA	2	6	51614	51619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810022
793	NC_013156	CAA	2	6	51656	51661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810022
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797	NC_013156	ATT	3	9	51991	51999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
798	NC_013156	TGA	2	6	52139	52144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810023
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