MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 83600

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009525	GCG	2	6	57821	57826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659811
1002	NC_009525	TGT	2	6	57886	57891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659811
1003	NC_009525	GTT	2	6	57902	57907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659811
1004	NC_009525	GCT	2	6	57908	57913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659811
1005	NC_009525	GGC	2	6	57956	57961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659811
1006	NC_009525	CGG	2	6	57964	57969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659811
1007	NC_009525	GTT	2	6	57977	57982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659811
1008	NC_009525	TGC	2	6	58000	58005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659811
1009	NC_009525	TTC	2	6	58029	58034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659811
1010	NC_009525	CGT	2	6	58079	58084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659811
1011	NC_009525	GCC	2	6	58136	58141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659811
1012	NC_009525	TGT	2	6	58182	58187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659811
1013	NC_009525	CAA	2	6	58277	58282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659811
1014	NC_009525	CCG	2	6	58343	58348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659811
1015	NC_009525	TAC	2	6	58401	58406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659811
1016	NC_009525	CAC	2	6	58448	58453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659811
1017	NC_009525	TGC	2	6	58462	58467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659811
1018	NC_009525	TGG	2	6	58498	58503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659811
1019	NC_009525	CGG	2	6	58544	58549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659811
1020	NC_009525	CGA	2	6	58580	58585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659811
1021	NC_009525	CGC	2	6	58610	58615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659811
1022	NC_009525	CGT	2	6	58639	58644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659811
1023	NC_009525	CGA	2	6	58664	58669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659811
1024	NC_009525	TGC	2	6	58757	58762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_009525	CGT	2	6	58772	58777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659812
1026	NC_009525	CGT	2	6	58782	58787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659812
1027	NC_009525	TCG	2	6	58790	58795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659812
1028	NC_009525	CCG	2	6	58800	58805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659812
1029	NC_009525	CTG	2	6	58840	58845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659812
1030	NC_009525	CGA	2	6	58860	58865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659812
1031	NC_009525	GGC	2	6	58897	58902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659812
1032	NC_009525	CAC	2	6	58977	58982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659812
1033	NC_009525	CGG	2	6	58995	59000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659812
1034	NC_009525	GGC	2	6	59010	59015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659812
1035	NC_009525	GTC	2	6	59107	59112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659812
1036	NC_009525	TCA	2	6	59132	59137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659812
1037	NC_009525	CCG	3	9	59138	59146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659812
1038	NC_009525	TGG	2	6	59180	59185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659812
1039	NC_009525	GCC	2	6	59206	59211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659812
1040	NC_009525	TGA	2	6	59225	59230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659812
1041	NC_009525	CGC	2	6	59384	59389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_009525	TCG	2	6	59393	59398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_009525	GGT	2	6	59421	59426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_009525	CCT	2	6	59493	59498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_009525	AGG	2	6	59531	59536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_009525	TGA	2	6	59537	59542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_009525	CGA	2	6	59591	59596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659813
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1049	NC_009525	CGG	2	6	59648	59653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659813
1050	NC_009525	GTG	2	6	59730	59735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659813
1051	NC_009525	GCC	2	6	59748	59753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659813
1052	NC_009525	GAA	3	9	59894	59902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_009525	GCC	2	6	59911	59916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_009525	AGG	2	6	59933	59938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_009525	ACC	2	6	59956	59961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659814
1056	NC_009525	TCG	2	6	59969	59974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659814
1057	NC_009525	TCC	2	6	60104	60109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659814
1058	NC_009525	GGC	2	6	60129	60134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659814
1059	NC_009525	AGC	2	6	60194	60199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659814
1060	NC_009525	CAA	2	6	60294	60299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659814
1061	NC_009525	GCG	2	6	60311	60316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659814
1062	NC_009525	CAG	2	6	60354	60359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659814
1063	NC_009525	GGC	3	9	60409	60417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659814
1064	NC_009525	GCG	2	6	60497	60502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659815
1065	NC_009525	GAA	2	6	60551	60556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659815
1066	NC_009525	GCA	2	6	60653	60658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659815
1067	NC_009525	GAA	2	6	60683	60688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659815
1068	NC_009525	GCT	2	6	60704	60709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659815
1069	NC_009525	TCG	2	6	60876	60881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659816
1070	NC_009525	CCG	2	6	60916	60921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659816
1071	NC_009525	GGC	2	6	60973	60978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659816
1072	NC_009525	GTT	2	6	61036	61041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659816
1073	NC_009525	CCG	2	6	61053	61058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659816
1074	NC_009525	TGC	2	6	61069	61074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659816
1075	NC_009525	AAG	2	6	61079	61084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659816
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1078	NC_009525	GCC	3	9	61276	61284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659817
1079	NC_009525	CAG	2	6	61496	61501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659817
1080	NC_009525	GGT	2	6	61671	61676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659817
1081	NC_009525	GCG	2	6	61683	61688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659817
1082	NC_009525	GGA	2	6	61737	61742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659817
1083	NC_009525	TGA	2	6	61765	61770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659817
1084	NC_009525	CTC	2	6	61789	61794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659818
1085	NC_009525	ACC	2	6	61822	61827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659818
1086	NC_009525	CGC	2	6	61837	61842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659818
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1088	NC_009525	GCC	2	6	62006	62011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659818
1089	NC_009525	GCT	2	6	62029	62034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1090	NC_009525	CGG	2	6	62044	62049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659818
1091	NC_009525	GCC	2	6	62090	62095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659818
1092	NC_009525	CTA	2	6	62104	62109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659818
1093	NC_009525	GCT	2	6	62134	62139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1094	NC_009525	GTG	2	6	62168	62173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659818
1095	NC_009525	GGT	2	6	62215	62220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659818
1096	NC_009525	ACG	2	6	62244	62249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1097	NC_009525	CGG	2	6	62258	62263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659818
1098	NC_009525	CTG	2	6	62294	62299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1099	NC_009525	CGA	2	6	62304	62309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1100	NC_009525	GGC	2	6	62339	62344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659818
1101	NC_009525	CGA	2	6	62380	62385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1102	NC_009525	GGC	2	6	62425	62430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659818
1103	NC_009525	TCT	2	6	62511	62516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659818
1104	NC_009525	CTG	2	6	62552	62557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1105	NC_009525	CGG	2	6	62559	62564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659818
1106	NC_009525	GAC	2	6	62612	62617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1107	NC_009525	GCG	2	6	62632	62637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659818
1108	NC_009525	CGA	2	6	62671	62676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1109	NC_009525	ATG	2	6	62693	62698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659818
1110	NC_009525	TGA	2	6	62772	62777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659818
1111	NC_009525	AAG	2	6	62786	62791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659818
1112	NC_009525	AGC	2	6	62901	62906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1113	NC_009525	CCA	2	6	62964	62969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659818
1114	NC_009525	TGG	2	6	63069	63074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659818
1115	NC_009525	GAT	2	6	63082	63087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659818
1116	NC_009525	GCA	2	6	63230	63235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1117	NC_009525	GAA	2	6	63328	63333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659818
1118	NC_009525	CGG	2	6	63390	63395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659818
1119	NC_009525	CGA	2	6	63421	63426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1120	NC_009525	CGT	2	6	63447	63452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1121	NC_009525	GCG	2	6	63500	63505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659818
1122	NC_009525	GTT	2	6	63595	63600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659818
1123	NC_009525	TGG	2	6	63622	63627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659818
1124	NC_009525	CTA	2	6	63667	63672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659818
1125	NC_009525	CGA	2	6	63697	63702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1126	NC_009525	TGC	2	6	63714	63719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1127	NC_009525	GGC	2	6	63764	63769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659818
1128	NC_009525	GGC	2	6	63780	63785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659818
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1130	NC_009525	TGC	2	6	63870	63875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659818
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1132	NC_009525	CGA	2	6	63993	63998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659818
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1139	NC_009525	CGG	2	6	64462	64467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1140	NC_009525	CGT	2	6	64491	64496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1159	NC_009525	GCC	2	6	65098	65103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659819
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1243	NC_009525	CAC	2	6	71066	71071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659824
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1491	NC_009525	CGC	2	6	86184	86189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659835
1492	NC_009525	CAT	2	6	86194	86199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659835
1493	NC_009525	GCT	2	6	86220	86225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659835
1494	NC_009525	ATC	2	6	86249	86254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659835
1495	NC_009525	CGG	2	6	86360	86365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659835
1496	NC_009525	CCA	2	6	86456	86461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659835
1497	NC_009525	GCC	2	6	86500	86505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659835
1498	NC_009525	CAT	2	6	86514	86519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659835
1499	NC_009525	GCG	2	6	86551	86556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659836
1500	NC_009525	GAA	2	6	86571	86576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659836

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