MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 83600

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009525	GTC	2	6	29241	29246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659783
502	NC_009525	CGA	2	6	29335	29340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659783
503	NC_009525	GCC	2	6	29406	29411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659783
504	NC_009525	GTC	2	6	29558	29563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659783
505	NC_009525	CGA	2	6	29606	29611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659783
506	NC_009525	TCG	2	6	29674	29679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659783
507	NC_009525	ACG	2	6	29698	29703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659783
508	NC_009525	GCA	2	6	29714	29719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659783
509	NC_009525	TCA	2	6	29755	29760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659784
510	NC_009525	CAC	2	6	29803	29808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659784
511	NC_009525	CTG	2	6	29822	29827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659784
512	NC_009525	GGC	2	6	29896	29901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659784
513	NC_009525	CTG	2	6	29910	29915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659784
514	NC_009525	TCA	2	6	29943	29948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659784
515	NC_009525	CGG	2	6	29978	29983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659784
516	NC_009525	CGA	2	6	30001	30006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659784
517	NC_009525	ACC	2	6	30020	30025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659784
518	NC_009525	CGT	2	6	30068	30073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659784
519	NC_009525	CGA	2	6	30116	30121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659784
520	NC_009525	ACG	2	6	30127	30132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659784
521	NC_009525	GGC	2	6	30139	30144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659784
522	NC_009525	CGC	2	6	30244	30249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659784
523	NC_009525	CAC	2	6	30361	30366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659784
524	NC_009525	CAA	2	6	30466	30471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659784
525	NC_009525	GTC	2	6	30476	30481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659784
526	NC_009525	CAA	2	6	30526	30531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659784
527	NC_009525	ACG	2	6	30670	30675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659785
528	NC_009525	AGC	2	6	30859	30864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659785
529	NC_009525	GTC	2	6	30879	30884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659785
530	NC_009525	GCC	3	9	30885	30893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659785
531	NC_009525	GGT	2	6	31202	31207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659786
532	NC_009525	CGC	2	6	31313	31318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659786
533	NC_009525	AGC	2	6	31340	31345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659786
534	NC_009525	GTC	2	6	31389	31394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659786
535	NC_009525	GGT	2	6	31562	31567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659786
536	NC_009525	GCC	2	6	31611	31616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659786
537	NC_009525	GCG	2	6	31693	31698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659786
538	NC_009525	CAG	2	6	31719	31724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659786
539	NC_009525	CCT	2	6	31757	31762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659786
540	NC_009525	GCT	3	9	31769	31777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659786
541	NC_009525	CGT	2	6	31846	31851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659786
542	NC_009525	CTG	2	6	31959	31964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659786
543	NC_009525	CGA	2	6	32000	32005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659786
544	NC_009525	AAG	2	6	32014	32019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659786
545	NC_009525	CGA	2	6	32072	32077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659786
546	NC_009525	CGA	2	6	32090	32095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659786
547	NC_009525	CGA	2	6	32137	32142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659786
548	NC_009525	CGC	2	6	32192	32197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659786
549	NC_009525	GGC	3	9	32207	32215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659786
550	NC_009525	CAA	2	6	32244	32249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659786
551	NC_009525	GCG	2	6	32441	32446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_009525	CGG	2	6	32493	32498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_009525	CAA	2	6	32528	32533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_009525	GAG	2	6	32534	32539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_009525	CAG	2	6	32604	32609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659787
556	NC_009525	CCG	2	6	32611	32616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659787
557	NC_009525	CGT	2	6	32635	32640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659787
558	NC_009525	ACG	2	6	32644	32649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659787
559	NC_009525	GCT	2	6	32714	32719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659787
560	NC_009525	CAG	2	6	32742	32747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659787
561	NC_009525	AGC	2	6	32806	32811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659787
562	NC_009525	CAT	2	6	32843	32848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659787
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565	NC_009525	GGC	2	6	33075	33080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659788
566	NC_009525	GCT	2	6	33141	33146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659788
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568	NC_009525	GGC	2	6	33231	33236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_009525	TCG	2	6	33291	33296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_009525	TGC	3	9	33300	33308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_009525	CAC	2	6	33363	33368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_009525	GAT	2	6	33392	33397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_009525	CTC	2	6	33495	33500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659789
574	NC_009525	CAC	2	6	33510	33515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659789
575	NC_009525	CCG	2	6	33560	33565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659789
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580	NC_009525	GCC	3	9	33892	33900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659789
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591	NC_009525	TGG	2	6	34557	34562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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593	NC_009525	TTC	2	6	34649	34654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659790
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598	NC_009525	CGG	2	6	35272	35277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_009525	GCG	2	6	35293	35298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_009525	TGG	2	6	35354	35359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_009525	CGG	2	6	35425	35430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_009525	GGT	2	6	35487	35492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_009525	CCA	2	6	35509	35514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_009525	CCA	2	6	35798	35803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659792
605	NC_009525	GGT	2	6	35846	35851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659792
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608	NC_009525	CGA	2	6	36225	36230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659792
609	NC_009525	TTC	2	6	36322	36327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659792
610	NC_009525	GCG	2	6	36328	36333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659792
611	NC_009525	GTT	2	6	36369	36374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659792
612	NC_009525	CTT	2	6	36399	36404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659792
613	NC_009525	GCG	2	6	36499	36504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659792
614	NC_009525	ATG	3	9	36670	36678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659792
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619	NC_009525	CGG	2	6	36968	36973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659792
620	NC_009525	GCT	2	6	36998	37003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659792
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623	NC_009525	ATC	2	6	37159	37164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659792
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999	NC_009525	CGA	2	6	57796	57801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659811
1000	NC_009525	GCT	2	6	57806	57811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659811

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