MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 5071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002679	GAA	2	6	17	22	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002679	CTT	2	6	50	55	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002679	GTT	2	6	255	260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002679	GCA	2	6	387	392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_002679	TAT	2	6	447	452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002679	TAC	3	9	529	537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_002679	CGC	2	6	552	557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_002679	TCA	2	6	562	567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_002679	TCA	2	6	569	574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_002679	CGG	2	6	576	581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_002679	TGG	2	6	688	693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002679	ATT	2	6	799	804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002679	CAT	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_002679	GGC	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_002679	GCT	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_002679	ATC	2	6	1225	1230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_002679	GCA	2	6	1294	1299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_002679	CAT	2	6	1412	1417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_002679	CAA	2	6	1674	1679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_002679	TCG	2	6	1832	1837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_002679	AAC	2	6	1951	1956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_002679	AAG	2	6	1985	1990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002679	ATA	2	6	2010	2015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002679	GGT	2	6	2062	2067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002679	AGG	2	6	2125	2130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002679	GCG	2	6	2220	2225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488180
27	NC_002679	TCC	2	6	2249	2254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488180
28	NC_002679	CGC	2	6	2270	2275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488180
29	NC_002679	CCA	2	6	2334	2339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488180
30	NC_002679	CCG	2	6	2440	2445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488180
31	NC_002679	GCT	2	6	2510	2515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488180
32	NC_002679	AGT	2	6	2746	2751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488180
33	NC_002679	CGC	2	6	2882	2887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488180
34	NC_002679	GGT	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488180
35	NC_002679	GCC	2	6	3072	3077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488180
36	NC_002679	GCA	2	6	3165	3170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488180
37	NC_002679	GCT	2	6	3203	3208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488180
38	NC_002679	AGC	2	6	3237	3242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488180
39	NC_002679	CGA	2	6	3267	3272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_002679	ATC	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_002679	CGG	2	6	3290	3295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_002679	GCA	2	6	3545	3550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_002679	GCG	2	6	3601	3606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_002679	GTC	2	6	3609	3614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_002679	ACC	2	6	3654	3659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_002679	TGC	2	6	3712	3717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_002679	CAA	2	6	3783	3788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_002679	ACC	2	6	3900	3905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488323
49	NC_002679	TGC	2	6	3954	3959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488323
50	NC_002679	CCA	2	6	4034	4039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488323
51	NC_002679	CGT	3	9	4057	4065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488323
52	NC_002679	GAT	2	6	4070	4075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488323
53	NC_002679	CCG	3	9	4161	4169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_002679	CGT	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_002679	CAT	2	6	4179	4184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_002679	TGG	2	6	4198	4203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002679	CGC	2	6	4307	4312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_002679	CGG	2	6	4414	4419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_002679	TGA	2	6	4467	4472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488342
60	NC_002679	TTC	2	6	4499	4504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488342
61	NC_002679	CGG	2	6	4513	4518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488342
62	NC_002679	CCG	2	6	4541	4546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488342
63	NC_002679	TGC	2	6	4679	4684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488051
64	NC_002679	ATG	2	6	4710	4715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488051
65	NC_002679	GTC	2	6	5030	5035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488051
66	NC_002679	CAA	2	6	5053	5058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488051
67	NC_002679	CGC	2	6	5158	5163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488051
68	NC_002679	TCA	2	6	5295	5300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488051
69	NC_002679	TGT	2	6	5509	5514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488051
70	NC_002679	CAG	2	6	5531	5536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488051
71	NC_002679	CCG	2	6	5746	5751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488051
72	NC_002679	TCC	2	6	5876	5881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488051
73	NC_002679	CGG	2	6	5929	5934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488051
74	NC_002679	TCC	2	6	5939	5944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488051
75	NC_002679	GCT	2	6	5955	5960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488051
76	NC_002679	TGA	3	9	5990	5998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488051
77	NC_002679	CTT	2	6	6013	6018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488051
78	NC_002679	CAG	2	6	6040	6045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488051
79	NC_002679	CAC	2	6	6070	6075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488051
80	NC_002679	GCC	2	6	6192	6197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_002679	AGC	2	6	6222	6227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_002679	ACG	2	6	6249	6254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_002679	AGA	2	6	6282	6287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002679	AAG	2	6	6348	6353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002679	TAC	2	6	6452	6457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_002679	TCT	2	6	6468	6473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_002679	AGT	2	6	6480	6485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002679	AGA	2	6	6550	6555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488179
89	NC_002679	ATA	2	6	6556	6561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488179
90	NC_002679	GTA	2	6	6621	6626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488179
91	NC_002679	CAC	2	6	6717	6722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488179
92	NC_002679	GCA	2	6	6853	6858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488179
93	NC_002679	TGC	2	6	6930	6935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488052
94	NC_002679	GAT	2	6	7013	7018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488052
95	NC_002679	GCC	2	6	7257	7262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488052
96	NC_002679	TGC	2	6	7298	7303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488052
97	NC_002679	ATC	2	6	7322	7327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488052
98	NC_002679	GGC	2	6	7423	7428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488052
99	NC_002679	CCT	2	6	7489	7494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488052
100	NC_002679	CAG	2	6	7537	7542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488052
101	NC_002679	GAA	2	6	7602	7607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488052
102	NC_002679	TCG	2	6	7644	7649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488052
103	NC_002679	TTG	2	6	7671	7676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488052
104	NC_002679	CAA	2	6	7880	7885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488052
105	NC_002679	CCG	2	6	7905	7910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488052
106	NC_002679	CTG	2	6	7972	7977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_002679	TGC	2	6	8059	8064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_002679	CAG	2	6	8251	8256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_002679	GCG	2	6	8360	8365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_002679	TTC	2	6	8493	8498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_002679	GCC	2	6	8518	8523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_002679	GAC	2	6	8547	8552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_002679	CGT	2	6	8634	8639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_002679	CGG	2	6	8683	8688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_002679	CGG	2	6	8777	8782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_002679	GCG	2	6	8923	8928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_002679	GAA	2	6	8956	8961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002679	TAC	2	6	9033	9038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_002679	CGC	2	6	9197	9202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_002679	CAG	2	6	9388	9393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_002679	GCC	2	6	9495	9500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_002679	TCG	2	6	9655	9660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488053
123	NC_002679	GAT	2	6	9765	9770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488053
124	NC_002679	GCA	2	6	9938	9943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488053
125	NC_002679	GCC	2	6	10026	10031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488053
126	NC_002679	CGT	2	6	10146	10151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488053
127	NC_002679	GTC	2	6	10212	10217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488053
128	NC_002679	TGA	2	6	10250	10255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488053
129	NC_002679	CCG	2	6	10315	10320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488053
130	NC_002679	GAT	2	6	10337	10342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488053
131	NC_002679	CCA	2	6	10618	10623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488054
132	NC_002679	TGC	2	6	10638	10643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488054
133	NC_002679	CCT	2	6	10735	10740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488054
134	NC_002679	GTT	2	6	10979	10984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488054
135	NC_002679	CAA	2	6	11100	11105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488054
136	NC_002679	GAG	2	6	11159	11164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488054
137	NC_002679	CAG	2	6	11195	11200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488054
138	NC_002679	GTC	2	6	11201	11206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488054
139	NC_002679	GCC	2	6	11397	11402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488054
140	NC_002679	GTC	2	6	11442	11447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488054
141	NC_002679	GTA	2	6	11512	11517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488054
142	NC_002679	GCT	2	6	11544	11549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488054
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188	NC_002679	GAC	2	6	14809	14814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488183
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254	NC_002679	CCG	2	6	19006	19011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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262	NC_002679	GGC	2	6	19373	19378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488187
263	NC_002679	ATC	2	6	19511	19516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488187
264	NC_002679	GAA	2	6	19673	19678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488187
265	NC_002679	TTG	2	6	19778	19783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488187
266	NC_002679	GAA	2	6	19853	19858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488187
267	NC_002679	CGA	2	6	19987	19992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488187
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269	NC_002679	TGC	2	6	20142	20147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_002679	CGA	2	6	20205	20210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_002679	CAA	2	6	20512	20517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_002679	CGA	2	6	20604	20609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_002679	AGT	2	6	20670	20675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
274	NC_002679	CAA	2	6	20685	20690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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296	NC_002679	ATC	2	6	22188	22193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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