MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 5071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002679	TTC	2	6	37202	37207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488197
502	NC_002679	CGG	2	6	37270	37275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488197
503	NC_002679	CGG	2	6	37278	37283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488197
504	NC_002679	TCA	2	6	37325	37330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488197
505	NC_002679	GTC	2	6	37450	37455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488197
506	NC_002679	TGG	2	6	37528	37533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488197
507	NC_002679	CAT	2	6	37555	37560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488197
508	NC_002679	TGG	2	6	37618	37623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488197
509	NC_002679	CAC	2	6	37624	37629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488197
510	NC_002679	GCT	2	6	37645	37650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488197
511	NC_002679	GAT	2	6	37711	37716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488197
512	NC_002679	CGC	2	6	37735	37740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488197
513	NC_002679	CGG	2	6	37762	37767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488197
514	NC_002679	GAA	2	6	37868	37873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488198
515	NC_002679	CGA	3	9	37915	37923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488198
516	NC_002679	AGC	2	6	37999	38004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488198
517	NC_002679	GCC	2	6	38100	38105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488198
518	NC_002679	CTG	2	6	38391	38396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488198
519	NC_002679	AGA	2	6	38530	38535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488198
520	NC_002679	GGC	2	6	38578	38583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488199
521	NC_002679	TGT	2	6	38637	38642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488199
522	NC_002679	GCA	2	6	38645	38650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488199
523	NC_002679	ACG	2	6	38878	38883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488199
524	NC_002679	GGC	2	6	38953	38958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488199
525	NC_002679	AGC	2	6	38960	38965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488199
526	NC_002679	AGC	2	6	39056	39061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488199
527	NC_002679	ACT	2	6	39080	39085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488199
528	NC_002679	GTC	2	6	39264	39269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_002679	CAC	2	6	39300	39305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_002679	CCG	2	6	39334	39339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_002679	CTT	2	6	39401	39406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488200
532	NC_002679	CAG	2	6	39450	39455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488200
533	NC_002679	GAT	2	6	39458	39463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488200
534	NC_002679	TGG	2	6	39601	39606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488200
535	NC_002679	AGA	2	6	39610	39615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488200
536	NC_002679	TCG	2	6	39655	39660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488200
537	NC_002679	TCG	2	6	39675	39680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488200
538	NC_002679	AGG	2	6	39727	39732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488200
539	NC_002679	AGC	2	6	39761	39766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_002679	GAA	2	6	39773	39778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_002679	GAA	2	6	39787	39792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_002679	CCG	2	6	39910	39915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_002679	GCT	2	6	39956	39961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_002679	CGT	2	6	40290	40295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_002679	GAT	2	6	40306	40311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_002679	GCA	2	6	40402	40407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_002679	GTC	2	6	40440	40445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_002679	CGA	2	6	40495	40500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488201
549	NC_002679	TGA	2	6	40562	40567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488201
550	NC_002679	CCA	2	6	40579	40584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488201
551	NC_002679	CAA	2	6	40658	40663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488201
552	NC_002679	CAG	2	6	40738	40743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488201
553	NC_002679	CAA	2	6	40746	40751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488201
554	NC_002679	TGC	2	6	40762	40767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488201
555	NC_002679	GCA	2	6	40950	40955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488201
556	NC_002679	GTC	2	6	41032	41037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488201
557	NC_002679	CGC	2	6	41132	41137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488201
558	NC_002679	TTG	2	6	41233	41238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488201
559	NC_002679	CGG	2	6	41248	41253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488201
560	NC_002679	CAA	2	6	41351	41356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488201
561	NC_002679	TGA	2	6	41380	41385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488201
562	NC_002679	TCA	2	6	41566	41571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_002679	AGG	2	6	41659	41664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_002679	TTG	2	6	41745	41750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_002679	GAT	2	6	41759	41764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_002679	TTC	2	6	41897	41902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488343
567	NC_002679	CCG	2	6	41947	41952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488343
568	NC_002679	CGC	2	6	41978	41983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488343
569	NC_002679	TCG	2	6	42042	42047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488343
570	NC_002679	GCA	2	6	42134	42139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488344
571	NC_002679	ACA	2	6	42149	42154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488344
572	NC_002679	CCT	2	6	42156	42161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488344
573	NC_002679	CCG	2	6	42209	42214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488344
574	NC_002679	AGC	2	6	42278	42283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_002679	CGA	2	6	42342	42347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_002679	CTG	2	6	42349	42354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_002679	CGT	2	6	42417	42422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_002679	GTT	2	6	42464	42469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_002679	AGC	2	6	42477	42482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_002679	GTT	2	6	42500	42505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_002679	CAT	2	6	42565	42570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_002679	TAA	2	6	42627	42632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_002679	GCT	2	6	42725	42730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_002679	GCT	2	6	42989	42994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_002679	ACC	2	6	43169	43174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_002679	GCT	2	6	43421	43426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_002679	GGC	2	6	43533	43538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_002679	CCG	3	9	43545	43553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_002679	GGT	2	6	43595	43600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_002679	TTG	2	6	43683	43688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488058
591	NC_002679	TTG	2	6	43851	43856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488058
592	NC_002679	CGG	2	6	43924	43929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488058
593	NC_002679	GCG	2	6	43989	43994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488058
594	NC_002679	CAG	2	6	44195	44200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488058
595	NC_002679	GGC	2	6	44269	44274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488058
596	NC_002679	GGC	2	6	44333	44338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488058
597	NC_002679	CCA	2	6	44413	44418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488058
598	NC_002679	GTC	2	6	44420	44425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488058
599	NC_002679	CGG	2	6	44554	44559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488058
600	NC_002679	GAC	2	6	44585	44590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488058
601	NC_002679	CGA	2	6	44638	44643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488058
602	NC_002679	GCC	2	6	44685	44690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488058
603	NC_002679	CGC	2	6	44800	44805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488058
604	NC_002679	CTG	2	6	44904	44909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_002679	CTG	2	6	45070	45075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_002679	CCG	2	6	45147	45152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_002679	ACC	2	6	45267	45272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488202
608	NC_002679	GAA	2	6	45321	45326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488202
609	NC_002679	AAT	2	6	45486	45491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488202
610	NC_002679	TCT	2	6	45513	45518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488202
611	NC_002679	CAT	2	6	45549	45554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488202
612	NC_002679	GAA	2	6	45636	45641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488202
613	NC_002679	TGA	2	6	45719	45724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488202
614	NC_002679	CCA	2	6	45801	45806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488202
615	NC_002679	ATC	2	6	45809	45814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488202
616	NC_002679	ATC	2	6	45820	45825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488202
617	NC_002679	GCC	2	6	45856	45861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488202
618	NC_002679	CAT	2	6	45879	45884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488202
619	NC_002679	TCG	2	6	46019	46024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_002679	GCC	2	6	46095	46100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_002679	CGC	2	6	46127	46132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_002679	ACC	2	6	46133	46138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_002679	GGC	2	6	46190	46195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_002679	TTG	2	6	46358	46363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_002679	TCG	2	6	46523	46528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488203
626	NC_002679	CTG	2	6	46531	46536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488203
627	NC_002679	CTG	2	6	46685	46690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488203
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