MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 5071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002679	TCC	2	6	277572	277577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488143
4002	NC_002679	CGG	2	6	277603	277608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488143
4003	NC_002679	CCT	2	6	277735	277740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488143
4004	NC_002679	AGC	2	6	277848	277853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488143
4005	NC_002679	GTC	2	6	277865	277870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488143
4006	NC_002679	ATC	2	6	277926	277931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488143
4007	NC_002679	ACG	2	6	277974	277979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488143
4008	NC_002679	ATC	2	6	277982	277987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488143
4009	NC_002679	GCC	2	6	278034	278039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488143
4010	NC_002679	CTG	2	6	278216	278221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488143
4011	NC_002679	TCG	2	6	278265	278270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488143
4012	NC_002679	GCG	2	6	278354	278359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488143
4013	NC_002679	CCA	2	6	278384	278389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488143
4014	NC_002679	CTT	2	6	278423	278428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488143
4015	NC_002679	TCA	2	6	278445	278450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488143
4016	NC_002679	CTG	2	6	278477	278482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488143
4017	NC_002679	AGC	2	6	278541	278546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488143
4018	NC_002679	GCT	2	6	278659	278664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488143
4019	NC_002679	GCC	2	6	278699	278704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488143
4020	NC_002679	GCC	2	6	278804	278809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488143
4021	NC_002679	CAG	3	9	278867	278875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488143
4022	NC_002679	CTT	2	6	279018	279023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_002679	GAC	2	6	279124	279129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_002679	GCG	2	6	279146	279151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_002679	TTC	2	6	279201	279206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_002679	CGT	2	6	279242	279247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_002679	AGG	2	6	279375	279380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488363
4028	NC_002679	CCA	2	6	279455	279460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_002679	CGC	2	6	279658	279663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4030	NC_002679	GCT	2	6	279794	279799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_002679	GTG	2	6	279862	279867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_002679	GGT	2	6	279901	279906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_002679	TTC	2	6	279913	279918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_002679	CCG	2	6	280008	280013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_002679	GGT	2	6	280043	280048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488144
4036	NC_002679	GCG	2	6	280152	280157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488144
4037	NC_002679	CTT	2	6	280265	280270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488144
4038	NC_002679	CTT	2	6	280310	280315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488144
4039	NC_002679	CGG	2	6	280480	280485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488144
4040	NC_002679	GGT	2	6	280489	280494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488144
4041	NC_002679	TTC	2	6	280499	280504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488144
4042	NC_002679	ATG	2	6	280594	280599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_002679	GCG	2	6	280612	280617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_002679	GGC	2	6	280687	280692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_002679	GAA	2	6	280835	280840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_002679	GGC	2	6	280901	280906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_002679	TTC	2	6	281024	281029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_002679	CAA	2	6	281038	281043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_002679	GTC	2	6	281111	281116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_002679	CCG	2	6	281249	281254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4051	NC_002679	GCC	2	6	281401	281406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_002679	CTA	2	6	281445	281450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_002679	CGC	2	6	281555	281560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488145
4054	NC_002679	AGG	2	6	281576	281581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488145
4055	NC_002679	CCT	2	6	281597	281602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488145
4056	NC_002679	GCG	2	6	281678	281683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488145
4057	NC_002679	GGT	2	6	281685	281690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488145
4058	NC_002679	TGG	2	6	281735	281740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488145
4059	NC_002679	CCG	2	6	281794	281799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488145
4060	NC_002679	TCA	2	6	281858	281863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488145
4061	NC_002679	ACC	2	6	281908	281913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488145
4062	NC_002679	TCA	3	9	282037	282045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488145
4063	NC_002679	TCC	2	6	282175	282180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488145
4064	NC_002679	CCG	2	6	282183	282188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488145
4065	NC_002679	AAC	2	6	282232	282237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488298
4066	NC_002679	GCC	2	6	282262	282267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488298
4067	NC_002679	GAC	3	9	282297	282305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488298
4068	NC_002679	ACA	2	6	282316	282321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488298
4069	NC_002679	AGC	2	6	282375	282380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488298
4070	NC_002679	GAT	2	6	282428	282433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488298
4071	NC_002679	CGA	2	6	282500	282505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488298
4072	NC_002679	AAG	2	6	282558	282563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488298
4073	NC_002679	AGC	2	6	282583	282588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488298
4074	NC_002679	GTC	2	6	282622	282627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488146
4075	NC_002679	TGA	2	6	282723	282728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488146
4076	NC_002679	CAC	2	6	282790	282795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488146
4077	NC_002679	AGC	2	6	282956	282961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488146
4078	NC_002679	TTC	2	6	283055	283060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488146
4079	NC_002679	TGG	2	6	283143	283148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_002679	CTG	2	6	283309	283314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_002679	TGA	2	6	283354	283359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488299
4082	NC_002679	GAG	2	6	283393	283398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488299
4083	NC_002679	CGC	2	6	283508	283513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488299
4084	NC_002679	TGA	2	6	283538	283543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488299
4085	NC_002679	TCC	2	6	283545	283550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488299
4086	NC_002679	GCC	2	6	283552	283557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488299
4087	NC_002679	AGA	2	6	283565	283570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488299
4088	NC_002679	GCA	2	6	283629	283634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488299
4089	NC_002679	ACT	2	6	283640	283645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488299
4090	NC_002679	TTA	2	6	283654	283659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13488299
4091	NC_002679	CGC	2	6	283665	283670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488299
4092	NC_002679	GGA	2	6	283706	283711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488299
4093	NC_002679	GAT	2	6	283712	283717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488299
4094	NC_002679	GTA	2	6	283827	283832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488299
4095	NC_002679	GTT	2	6	283976	283981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488299
4096	NC_002679	GAC	2	6	284011	284016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488299
4097	NC_002679	TCT	2	6	284060	284065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488299
4098	NC_002679	GTG	3	9	284361	284369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488299
4099	NC_002679	ATA	2	6	284371	284376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488299
4100	NC_002679	CGC	2	6	284394	284399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488299
4101	NC_002679	CTT	2	6	284454	284459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488299
4102	NC_002679	GAA	2	6	284624	284629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488300
4103	NC_002679	CGA	2	6	284635	284640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488300
4104	NC_002679	CGT	2	6	284645	284650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488300
4105	NC_002679	ACC	2	6	284666	284671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488300
4106	NC_002679	CTG	2	6	284684	284689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488300
4107	NC_002679	CAT	2	6	284743	284748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488300
4108	NC_002679	AAG	2	6	284777	284782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488300
4109	NC_002679	TCG	2	6	284815	284820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488300
4110	NC_002679	CTG	2	6	284939	284944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488300
4111	NC_002679	TCT	2	6	285004	285009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488300
4112	NC_002679	GTT	2	6	285051	285056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488300
4113	NC_002679	CTT	2	6	285205	285210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488300
4114	NC_002679	TCT	2	6	285229	285234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488300
4115	NC_002679	TCA	2	6	285261	285266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488300
4116	NC_002679	GTT	2	6	285482	285487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488300
4117	NC_002679	TGC	2	6	285661	285666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488301
4118	NC_002679	TTC	2	6	285820	285825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488301
4119	NC_002679	CAT	2	6	285837	285842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488301
4120	NC_002679	GGA	2	6	285929	285934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488301
4121	NC_002679	TTC	2	6	285996	286001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488301
4122	NC_002679	GCG	2	6	286275	286280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488301
4123	NC_002679	CTT	2	6	286296	286301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488301
4124	NC_002679	CTC	2	6	286315	286320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488301
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4142	NC_002679	GGC	2	6	287065	287070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4144	NC_002679	TGC	2	6	287159	287164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4239	NC_002679	TCT	2	6	294111	294116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488153
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4242	NC_002679	GCC	2	6	294278	294283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488153
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4487	NC_002679	CGA	2	6	308729	308734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488160
4488	NC_002679	GCC	3	9	308843	308851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488160
4489	NC_002679	CGT	2	6	308859	308864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488160
4490	NC_002679	ACA	2	6	308979	308984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4491	NC_002679	ATC	2	6	309082	309087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488161
4492	NC_002679	CGG	2	6	309229	309234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488161
4493	NC_002679	CTT	2	6	309235	309240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488161
4494	NC_002679	CAT	2	6	309259	309264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488161
4495	NC_002679	ACA	2	6	309441	309446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488161
4496	NC_002679	TCT	2	6	309462	309467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488161
4497	NC_002679	CGA	3	9	309588	309596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488161
4498	NC_002679	GAG	2	6	309643	309648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488161
4499	NC_002679	CCT	2	6	309664	309669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488161
4500	NC_002679	TGC	2	6	309710	309715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488161

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