MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 5071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002679	CGA	2	6	103980	103985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488223
1502	NC_002679	TCG	2	6	104049	104054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488223
1503	NC_002679	ATT	2	6	104218	104223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13488223
1504	NC_002679	ACG	2	6	104301	104306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488223
1505	NC_002679	CTT	2	6	104348	104353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488223
1506	NC_002679	GCA	2	6	104462	104467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488223
1507	NC_002679	GGC	2	6	104574	104579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488223
1508	NC_002679	GGC	2	6	104599	104604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488223
1509	NC_002679	CGC	2	6	105001	105006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_002679	CGC	2	6	105182	105187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_002679	TCC	2	6	105231	105236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_002679	CGA	2	6	105259	105264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_002679	TCT	2	6	105267	105272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_002679	CAT	2	6	105405	105410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_002679	CGA	2	6	105434	105439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_002679	CTT	2	6	105447	105452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_002679	CGG	2	6	105617	105622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_002679	CAC	2	6	105963	105968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_002679	CGA	2	6	106051	106056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488224
1520	NC_002679	GGA	2	6	106079	106084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488224
1521	NC_002679	GCG	2	6	106092	106097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488224
1522	NC_002679	CTG	2	6	106263	106268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488224
1523	NC_002679	GAG	3	9	106314	106322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488224
1524	NC_002679	CGA	2	6	106354	106359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488224
1525	NC_002679	AAG	2	6	106404	106409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488224
1526	NC_002679	CGG	2	6	106431	106436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488224
1527	NC_002679	GCA	2	6	106483	106488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488224
1528	NC_002679	CAA	2	6	106700	106705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488224
1529	NC_002679	GGC	3	9	106847	106855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488224
1530	NC_002679	CTT	2	6	106901	106906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488224
1531	NC_002679	ATC	2	6	106966	106971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488224
1532	NC_002679	CGC	2	6	106972	106977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488224
1533	NC_002679	GCT	2	6	107072	107077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488224
1534	NC_002679	GGA	2	6	107078	107083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488224
1535	NC_002679	GGC	2	6	107108	107113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488224
1536	NC_002679	CTC	2	6	107329	107334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488224
1537	NC_002679	GGA	2	6	107444	107449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488224
1538	NC_002679	GAG	2	6	107481	107486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488224
1539	NC_002679	TCG	2	6	107606	107611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488224
1540	NC_002679	TCG	2	6	107719	107724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488224
1541	NC_002679	ACA	2	6	107801	107806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488224
1542	NC_002679	GCC	2	6	107836	107841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488224
1543	NC_002679	CAG	2	6	107992	107997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_002679	CGG	2	6	108127	108132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_002679	CGG	2	6	108134	108139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_002679	CAT	2	6	108177	108182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_002679	GCG	2	6	108257	108262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_002679	CGA	2	6	108318	108323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_002679	CCT	2	6	108343	108348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_002679	CCG	2	6	108349	108354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_002679	TGC	2	6	108451	108456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_002679	GCG	2	6	108511	108516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_002679	TAT	2	6	108526	108531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_002679	ACT	2	6	108534	108539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_002679	TAA	2	6	108605	108610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_002679	TCC	2	6	108655	108660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_002679	TTG	2	6	108685	108690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_002679	GCC	2	6	108747	108752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_002679	CGA	2	6	108822	108827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488077
1560	NC_002679	CCA	2	6	108879	108884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488077
1561	NC_002679	TGT	2	6	108910	108915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488077
1562	NC_002679	GTG	2	6	108962	108967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488077
1563	NC_002679	TTC	2	6	109042	109047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488077
1564	NC_002679	ACC	2	6	109081	109086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488077
1565	NC_002679	CGA	2	6	109149	109154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488077
1566	NC_002679	CAC	2	6	109237	109242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488077
1567	NC_002679	AGC	2	6	109283	109288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488077
1568	NC_002679	GCC	2	6	109294	109299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488077
1569	NC_002679	GTC	2	6	109378	109383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488077
1570	NC_002679	AGC	2	6	109475	109480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488077
1571	NC_002679	TCG	2	6	109515	109520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488077
1572	NC_002679	TCA	2	6	109599	109604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488077
1573	NC_002679	TCA	2	6	109632	109637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488077
1574	NC_002679	CAT	2	6	109651	109656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488077
1575	NC_002679	GAT	2	6	109702	109707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488077
1576	NC_002679	CTG	2	6	109735	109740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488077
1577	NC_002679	CGC	2	6	109767	109772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488077
1578	NC_002679	CCG	2	6	109775	109780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488077
1579	NC_002679	CGC	2	6	109794	109799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488077
1580	NC_002679	GTC	2	6	109810	109815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488077
1581	NC_002679	CGA	2	6	109912	109917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_002679	CGG	2	6	109931	109936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_002679	CAT	2	6	109937	109942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_002679	GGC	2	6	109969	109974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_002679	GCA	2	6	110050	110055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_002679	CGT	2	6	110092	110097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_002679	GAG	2	6	110105	110110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_002679	CGA	2	6	110248	110253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488078
1589	NC_002679	CGG	2	6	110287	110292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488078
1590	NC_002679	TCG	2	6	110316	110321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488078
1591	NC_002679	TGA	2	6	110431	110436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488078
1592	NC_002679	GCC	2	6	110444	110449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488078
1593	NC_002679	CCG	3	9	110475	110483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488078
1594	NC_002679	ACG	2	6	110484	110489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488078
1595	NC_002679	TCC	2	6	110535	110540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488078
1596	NC_002679	GCA	2	6	110631	110636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488078
1597	NC_002679	CGC	2	6	110665	110670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488078
1598	NC_002679	CCA	3	9	110743	110751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488078
1599	NC_002679	GCC	3	9	110756	110764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488078
1600	NC_002679	CGT	2	6	110876	110881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488078
1601	NC_002679	GCC	2	6	110882	110887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488078
1602	NC_002679	GCG	2	6	110928	110933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488078
1603	NC_002679	GAA	2	6	111029	111034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488078
1604	NC_002679	GGA	2	6	111164	111169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488078
1605	NC_002679	CGG	2	6	111211	111216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488078
1606	NC_002679	CTT	2	6	111316	111321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488078
1607	NC_002679	GCC	2	6	111359	111364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488078
1608	NC_002679	CGG	2	6	111425	111430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488078
1609	NC_002679	CGC	2	6	111486	111491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488078
1610	NC_002679	ACG	2	6	111495	111500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488078
1611	NC_002679	GTG	2	6	111516	111521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488078
1612	NC_002679	ATC	2	6	111525	111530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488078
1613	NC_002679	TGC	2	6	111548	111553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488078
1614	NC_002679	GAC	2	6	111590	111595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488078
1615	NC_002679	CCA	2	6	111637	111642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488078
1616	NC_002679	ACG	2	6	111660	111665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488078
1617	NC_002679	ATC	2	6	111705	111710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488078
1618	NC_002679	GTT	2	6	111714	111719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488079
1619	NC_002679	GCG	3	9	111754	111762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488079
1620	NC_002679	CCT	2	6	111842	111847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488079
1621	NC_002679	AGA	2	6	111908	111913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488079
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1623	NC_002679	CGA	2	6	111935	111940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488079
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1985	NC_002679	TGC	2	6	136821	136826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488225
1986	NC_002679	CGT	2	6	137168	137173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488225
1987	NC_002679	GAA	2	6	137210	137215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488225
1988	NC_002679	ACT	2	6	137355	137360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1989	NC_002679	GCT	2	6	137418	137423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1990	NC_002679	TGG	2	6	137437	137442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1991	NC_002679	AGC	2	6	137468	137473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1992	NC_002679	GAA	2	6	137519	137524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1993	NC_002679	GCA	2	6	137577	137582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1994	NC_002679	CAC	2	6	137612	137617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1995	NC_002679	ATG	2	6	137646	137651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1996	NC_002679	CGC	2	6	137656	137661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1997	NC_002679	CTG	2	6	137703	137708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1998	NC_002679	CGG	2	6	137754	137759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1999	NC_002679	CGA	2	6	137795	137800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2000	NC_002679	CCG	2	6	138016	138021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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