MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 5071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_002679	TCG	2	6	346715	346720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488177
5002	NC_002679	GCG	2	6	346724	346729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488177
5003	NC_002679	ACC	2	6	346781	346786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488177
5004	NC_002679	CAT	2	6	346828	346833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488177
5005	NC_002679	TCC	2	6	346948	346953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488177
5006	NC_002679	GCC	2	6	346957	346962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488177
5007	NC_002679	GAT	2	6	346969	346974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488177
5008	NC_002679	CCA	2	6	347007	347012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488177
5009	NC_002679	GCG	2	6	347027	347032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488177
5010	NC_002679	CTC	2	6	347056	347061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488177
5011	NC_002679	CCG	2	6	347097	347102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488177
5012	NC_002679	ACG	2	6	347162	347167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488177
5013	NC_002679	TTG	2	6	347256	347261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488177
5014	NC_002679	TCC	2	6	347262	347267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488177
5015	NC_002679	GCA	2	6	347322	347327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_002679	CGC	2	6	347433	347438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488318
5017	NC_002679	CGA	2	6	347445	347450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488318
5018	NC_002679	TCT	2	6	347553	347558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488318
5019	NC_002679	CGC	2	6	347629	347634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488318
5020	NC_002679	GTC	2	6	347680	347685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488318
5021	NC_002679	GAC	2	6	347754	347759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488318
5022	NC_002679	CTG	2	6	347770	347775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488318
5023	NC_002679	AAG	2	6	347837	347842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488318
5024	NC_002679	GAC	2	6	347928	347933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488318
5025	NC_002679	CAT	2	6	348034	348039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_002679	CGG	2	6	348112	348117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_002679	CAC	2	6	348128	348133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_002679	CTC	2	6	348156	348161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_002679	GGC	2	6	348207	348212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_002679	GCC	2	6	348263	348268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5031	NC_002679	AAC	2	6	348317	348322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_002679	GCC	2	6	348494	348499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_002679	GTT	2	6	348532	348537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_002679	CGT	2	6	348577	348582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_002679	CGT	2	6	348688	348693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_002679	GCC	2	6	348769	348774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488178
5037	NC_002679	GGC	2	6	348838	348843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488178
5038	NC_002679	GGC	2	6	348946	348951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488178
5039	NC_002679	ATA	2	6	349313	349318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_002679	TGA	2	6	349329	349334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_002679	CTT	2	6	349473	349478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161621456
5042	NC_002679	CTT	2	6	349485	349490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161621456
5043	NC_002679	GGC	2	6	349711	349716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161621456
5044	NC_002679	CAA	2	6	349764	349769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161621456
5045	NC_002679	GCC	2	6	349825	349830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161621456
5046	NC_002679	GGC	2	6	349848	349853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161621456
5047	NC_002679	TTG	2	6	350078	350083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161621456
5048	NC_002679	ATC	2	6	350113	350118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161621456
5049	NC_002679	TGC	2	6	350178	350183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161621456
5050	NC_002679	GTT	2	6	350367	350372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161621456
5051	NC_002679	TTC	3	9	350449	350457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161621456
5052	NC_002679	TCA	2	6	350600	350605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161621456
5053	NC_002679	TGC	2	6	350606	350611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161621456
5054	NC_002679	CGG	2	6	350678	350683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161621456
5055	NC_002679	ACG	2	6	350738	350743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161621456
5056	NC_002679	TTG	2	6	350779	350784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161621456
5057	NC_002679	CAT	2	6	350793	350798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161621456
5058	NC_002679	GAC	2	6	350853	350858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_002679	CGG	2	6	350927	350932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_002679	GAC	2	6	350937	350942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_002679	CGG	2	6	350973	350978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_002679	CAT	2	6	351132	351137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_002679	GTC	2	6	351232	351237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_002679	GGA	2	6	351291	351296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_002679	TGC	2	6	351369	351374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_002679	GTC	2	6	351391	351396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_002679	TTG	2	6	351485	351490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_002679	CCG	2	6	351504	351509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_002679	TTC	2	6	351545	351550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_002679	CAA	2	6	351681	351686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_002679	GAA	2	6	351894	351899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.