MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 4088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020054	CCGGC	2	10	5793518	5793527	0 %	0 %	40 %	60 %	436838069
3502	NC_020054	TTTTC	2	10	5794205	5794214	0 %	80 %	0 %	20 %	436838069
3503	NC_020054	CCGGG	2	10	5802653	5802662	0 %	0 %	60 %	40 %	436838075
3504	NC_020054	GCCGG	2	10	5802932	5802941	0 %	0 %	60 %	40 %	436838075
3505	NC_020054	CCCCA	2	10	5805801	5805810	20 %	0 %	0 %	80 %	436838076
3506	NC_020054	GCTCG	2	10	5808203	5808212	0 %	20 %	40 %	40 %	436838079
3507	NC_020054	CGTTC	2	10	5809774	5809783	0 %	40 %	20 %	40 %	436838080
3508	NC_020054	GTCCG	2	10	5810700	5810709	0 %	20 %	40 %	40 %	436838082
3509	NC_020054	GCCTG	2	10	5812752	5812761	0 %	20 %	40 %	40 %	436838082
3510	NC_020054	CCGGT	2	10	5813777	5813786	0 %	20 %	40 %	40 %	436838083
3511	NC_020054	AGCCC	2	10	5814015	5814024	20 %	0 %	20 %	60 %	436838083
3512	NC_020054	GACGT	2	10	5814583	5814592	20 %	20 %	40 %	20 %	436838083
3513	NC_020054	ATTAC	2	10	5818344	5818353	40 %	40 %	0 %	20 %	436838085
3514	NC_020054	GCCCG	2	10	5820667	5820676	0 %	0 %	40 %	60 %	436838086
3515	NC_020054	GAATG	2	10	5821202	5821211	40 %	20 %	40 %	0 %	436838086
3516	NC_020054	CAACC	2	10	5821759	5821768	40 %	0 %	0 %	60 %	436838086
3517	NC_020054	GTCAT	2	10	5822448	5822457	20 %	40 %	20 %	20 %	436838086
3518	NC_020054	GCGTA	2	10	5825581	5825590	20 %	20 %	40 %	20 %	436838088
3519	NC_020054	GGTCA	2	10	5826854	5826863	20 %	20 %	40 %	20 %	436838089
3520	NC_020054	CAAAC	2	10	5829607	5829616	60 %	0 %	0 %	40 %	436838092
3521	NC_020054	CGGCG	2	10	5831196	5831205	0 %	0 %	60 %	40 %	436838095
3522	NC_020054	TGCCT	2	10	5831539	5831548	0 %	40 %	20 %	40 %	436838096
3523	NC_020054	TGAAC	2	10	5832262	5832271	40 %	20 %	20 %	20 %	436838097
3524	NC_020054	GTGGG	2	10	5833460	5833469	0 %	20 %	80 %	0 %	436838098
3525	NC_020054	ACCCG	2	10	5835849	5835858	20 %	0 %	20 %	60 %	436838099
3526	NC_020054	CCGAC	2	10	5836277	5836286	20 %	0 %	20 %	60 %	436838099
3527	NC_020054	TACCG	2	10	5836335	5836344	20 %	20 %	20 %	40 %	436838099
3528	NC_020054	CCAAC	2	10	5839386	5839395	40 %	0 %	0 %	60 %	436838103
3529	NC_020054	CTGGG	2	10	5839572	5839581	0 %	20 %	60 %	20 %	436838103
3530	NC_020054	AACCG	2	10	5839909	5839918	40 %	0 %	20 %	40 %	436838104
3531	NC_020054	CGCTG	2	10	5841130	5841139	0 %	20 %	40 %	40 %	436838106
3532	NC_020054	GAATC	2	10	5841436	5841445	40 %	20 %	20 %	20 %	436838106
3533	NC_020054	CGAAT	2	10	5846148	5846157	40 %	20 %	20 %	20 %	436838112
3534	NC_020054	TTTCG	2	10	5847668	5847677	0 %	60 %	20 %	20 %	436838114
3535	NC_020054	CCCGG	2	10	5849035	5849044	0 %	0 %	40 %	60 %	436838115
3536	NC_020054	ACCCC	2	10	5849461	5849470	20 %	0 %	0 %	80 %	436838116
3537	NC_020054	AACTC	2	10	5850061	5850070	40 %	20 %	0 %	40 %	436838117
3538	NC_020054	CCGAC	2	10	5854678	5854687	20 %	0 %	20 %	60 %	436838120
3539	NC_020054	GGCCG	2	10	5858108	5858117	0 %	0 %	60 %	40 %	436838123
3540	NC_020054	GGGCA	2	10	5858568	5858577	20 %	0 %	60 %	20 %	436838123
3541	NC_020054	ATGAA	2	10	5860950	5860959	60 %	20 %	20 %	0 %	436838124
3542	NC_020054	GGCTG	2	10	5861301	5861310	0 %	20 %	60 %	20 %	436838124
3543	NC_020054	CCGTT	2	10	5865032	5865041	0 %	40 %	20 %	40 %	436838127
3544	NC_020054	GACGT	2	10	5865268	5865277	20 %	20 %	40 %	20 %	436838127
3545	NC_020054	CGCCC	2	10	5865869	5865878	0 %	0 %	20 %	80 %	436838128
3546	NC_020054	CGGGC	2	10	5866077	5866086	0 %	0 %	60 %	40 %	436838128
3547	NC_020054	CGGCC	2	10	5866236	5866245	0 %	0 %	40 %	60 %	436838128
3548	NC_020054	CTGCC	2	10	5869559	5869568	0 %	20 %	20 %	60 %	436838131
3549	NC_020054	CGCTC	2	10	5871210	5871219	0 %	20 %	20 %	60 %	436838131
3550	NC_020054	CCGGC	2	10	5872531	5872540	0 %	0 %	40 %	60 %	436838132
3551	NC_020054	GCGCC	2	10	5873185	5873194	0 %	0 %	40 %	60 %	436838133
3552	NC_020054	ATCGT	2	10	5873914	5873923	20 %	40 %	20 %	20 %	436838133
3553	NC_020054	ATTCA	2	10	5874555	5874564	40 %	40 %	0 %	20 %	436838134
3554	NC_020054	TGCGC	2	10	5876973	5876982	0 %	20 %	40 %	40 %	436838135
3555	NC_020054	CAGCC	2	10	5877600	5877609	20 %	0 %	20 %	60 %	436838135
3556	NC_020054	TTACT	2	10	5881503	5881512	20 %	60 %	0 %	20 %	436838138
3557	NC_020054	TCACC	2	10	5883579	5883588	20 %	20 %	0 %	60 %	436838139
3558	NC_020054	GCATC	2	10	5886540	5886549	20 %	20 %	20 %	40 %	436838140
3559	NC_020054	AACCA	2	10	5889338	5889347	60 %	0 %	0 %	40 %	436838143
3560	NC_020054	AAGGC	2	10	5889858	5889867	40 %	0 %	40 %	20 %	436838143
3561	NC_020054	GGCTT	2	10	5890014	5890023	0 %	40 %	40 %	20 %	436838143
3562	NC_020054	CCAAT	2	10	5891712	5891721	40 %	20 %	0 %	40 %	436838144
3563	NC_020054	AACTA	2	10	5891728	5891737	60 %	20 %	0 %	20 %	436838144
3564	NC_020054	CAACT	2	10	5893803	5893812	40 %	20 %	0 %	40 %	436838146
3565	NC_020054	CTGGG	2	10	5894741	5894750	0 %	20 %	60 %	20 %	436838146
3566	NC_020054	CGACT	2	10	5895401	5895410	20 %	20 %	20 %	40 %	436838146
3567	NC_020054	TGCCC	2	10	5899471	5899480	0 %	20 %	20 %	60 %	436838148
3568	NC_020054	TGCCC	2	10	5901650	5901659	0 %	20 %	20 %	60 %	436838150
3569	NC_020054	GCTGT	2	10	5902047	5902056	0 %	40 %	40 %	20 %	436838150
3570	NC_020054	TCATC	2	10	5904196	5904205	20 %	40 %	0 %	40 %	436838151
3571	NC_020054	ACCGT	2	10	5904821	5904830	20 %	20 %	20 %	40 %	436838152
3572	NC_020054	CGGGC	2	10	5907897	5907906	0 %	0 %	60 %	40 %	436838156
3573	NC_020054	CTTCG	2	10	5909453	5909462	0 %	40 %	20 %	40 %	436838158
3574	NC_020054	GAAGG	2	10	5910275	5910284	40 %	0 %	60 %	0 %	436838158
3575	NC_020054	TTTTC	2	10	5911478	5911487	0 %	80 %	0 %	20 %	436838160
3576	NC_020054	GCCCG	2	10	5912096	5912105	0 %	0 %	40 %	60 %	436838160
3577	NC_020054	GCCGC	2	10	5912120	5912129	0 %	0 %	40 %	60 %	436838160
3578	NC_020054	GCCCA	2	10	5914334	5914343	20 %	0 %	20 %	60 %	436838162
3579	NC_020054	GCGGG	2	10	5914344	5914353	0 %	0 %	80 %	20 %	436838162
3580	NC_020054	CATCG	2	10	5915558	5915567	20 %	20 %	20 %	40 %	436838163
3581	NC_020054	CGCCC	2	10	5915875	5915884	0 %	0 %	20 %	80 %	436838164
3582	NC_020054	ACCAA	3	15	5917281	5917295	60 %	0 %	0 %	40 %	436838165
3583	NC_020054	CCAAA	2	10	5917684	5917693	60 %	0 %	0 %	40 %	436838166
3584	NC_020054	TGGGC	2	10	5922118	5922127	0 %	20 %	60 %	20 %	436838170
3585	NC_020054	TGGGC	2	10	5923699	5923708	0 %	20 %	60 %	20 %	436838170
3586	NC_020054	GGAGT	2	10	5928479	5928488	20 %	20 %	60 %	0 %	436838174
3587	NC_020054	ACGTC	2	10	5929005	5929014	20 %	20 %	20 %	40 %	436838175
3588	NC_020054	GTCGG	2	10	5929861	5929870	0 %	20 %	60 %	20 %	436838175
3589	NC_020054	CTGGC	2	10	5933305	5933314	0 %	20 %	40 %	40 %	436838178
3590	NC_020054	CCGCC	2	10	5933821	5933830	0 %	0 %	20 %	80 %	436838179
3591	NC_020054	CCCAG	2	10	5934373	5934382	20 %	0 %	20 %	60 %	436838179
3592	NC_020054	TTATC	2	10	5934672	5934681	20 %	60 %	0 %	20 %	436838180
3593	NC_020054	CGGGC	2	10	5935119	5935128	0 %	0 %	60 %	40 %	436838180
3594	NC_020054	GCCTT	2	10	5935320	5935329	0 %	40 %	20 %	40 %	436838180
3595	NC_020054	CCTGG	2	10	5937153	5937162	0 %	20 %	40 %	40 %	436838181
3596	NC_020054	ACGTA	2	10	5937305	5937314	40 %	20 %	20 %	20 %	436838181
3597	NC_020054	CAACC	2	10	5937319	5937328	40 %	0 %	0 %	60 %	436838181
3598	NC_020054	CCCGC	2	10	5937350	5937359	0 %	0 %	20 %	80 %	436838181
3599	NC_020054	CGGCC	2	10	5940189	5940198	0 %	0 %	40 %	60 %	436838184
3600	NC_020054	GACCC	2	10	5941449	5941458	20 %	0 %	20 %	60 %	436838185
3601	NC_020054	GTCAG	2	10	5943294	5943303	20 %	20 %	40 %	20 %	436838186
3602	NC_020054	CAATT	2	10	5943666	5943675	40 %	40 %	0 %	20 %	436838186
3603	NC_020054	CATCC	2	10	5944850	5944859	20 %	20 %	0 %	60 %	436838186
3604	NC_020054	AGGCG	2	10	5945513	5945522	20 %	0 %	60 %	20 %	436838186
3605	NC_020054	CAGTT	2	10	5945882	5945891	20 %	40 %	20 %	20 %	436838186
3606	NC_020054	TAGCC	2	10	5947238	5947247	20 %	20 %	20 %	40 %	436838186
3607	NC_020054	GGGCT	2	10	5949569	5949578	0 %	20 %	60 %	20 %	436838189
3608	NC_020054	CCACG	2	10	5950569	5950578	20 %	0 %	20 %	60 %	436838190
3609	NC_020054	TGGAA	2	10	5955806	5955815	40 %	20 %	40 %	0 %	436838196
3610	NC_020054	GAGCG	2	10	5956236	5956245	20 %	0 %	60 %	20 %	436838196
3611	NC_020054	CCGCT	2	10	5956840	5956849	0 %	20 %	20 %	60 %	436838196
3612	NC_020054	TGGAC	2	10	5959171	5959180	20 %	20 %	40 %	20 %	436838198
3613	NC_020054	CCGGC	2	10	5960180	5960189	0 %	0 %	40 %	60 %	436838199
3614	NC_020054	TGCGC	2	10	5961031	5961040	0 %	20 %	40 %	40 %	436838199
3615	NC_020054	ACGGC	2	10	5962813	5962822	20 %	0 %	40 %	40 %	436838200
3616	NC_020054	GCTGG	2	10	5965486	5965495	0 %	20 %	60 %	20 %	436838203
3617	NC_020054	GCTCT	2	10	5965657	5965666	0 %	40 %	20 %	40 %	436838203
3618	NC_020054	CAACG	2	10	5965732	5965741	40 %	0 %	20 %	40 %	436838203
3619	NC_020054	CTTCT	2	10	5967544	5967553	0 %	60 %	0 %	40 %	436838205
3620	NC_020054	CCGAG	2	10	5968212	5968221	20 %	0 %	40 %	40 %	436838205
3621	NC_020054	TGTAC	2	10	5969142	5969151	20 %	40 %	20 %	20 %	436838205
3622	NC_020054	CAACC	2	10	5969889	5969898	40 %	0 %	0 %	60 %	436838206
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3995	NC_020054	ATACA	2	10	6608019	6608028	60 %	20 %	0 %	20 %	436838751
3996	NC_020054	GGGCA	2	10	6608568	6608577	20 %	0 %	60 %	20 %	436838752
3997	NC_020054	CCCCG	2	10	6611977	6611986	0 %	0 %	20 %	80 %	436838756
3998	NC_020054	CAACG	2	10	6612163	6612172	40 %	0 %	20 %	40 %	436838756
3999	NC_020054	CATCA	2	10	6613538	6613547	40 %	20 %	0 %	40 %	436838757
4000	NC_020054	ATCAC	2	10	6613633	6613642	40 %	20 %	0 %	40 %	436838758

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