MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 4341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017167	GTT	2	6	2861342	2861347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_017167	CCG	2	6	2862397	2862402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_017167	CTC	2	6	2862540	2862545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4004	NC_017167	CCT	2	6	2863804	2863809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_017167	ACG	2	6	2863817	2863822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_017167	CCT	2	6	2865787	2865792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_017167	TCC	2	6	2866297	2866302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4008	NC_017167	GCC	2	6	2866699	2866704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_017167	CGT	2	6	2867262	2867267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_017167	CCT	2	6	2867679	2867684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4011	NC_017167	CAA	2	6	2868427	2868432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_017167	CCT	2	6	2868450	2868455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4013	NC_017167	CCT	2	6	2868800	2868805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_017167	TCC	2	6	2869195	2869200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_017167	CAG	2	6	2869204	2869209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_017167	CCT	2	6	2871195	2871200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4017	NC_017167	GCC	2	6	2871224	2871229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4018	NC_017167	CTT	2	6	2871510	2871515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_017167	GAC	2	6	2872404	2872409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_017167	GTC	2	6	2873339	2873344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_017167	TCC	2	6	2873346	2873351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_017167	CCT	2	6	2874372	2874377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_017167	CGA	2	6	2874546	2874551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_017167	TTC	2	6	2874565	2874570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_017167	GGC	2	6	2874583	2874588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_017167	TGC	2	6	2874627	2874632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_017167	CGC	2	6	2877921	2877926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_017167	CCT	2	6	2878424	2878429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_017167	CAT	2	6	2878439	2878444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_017167	TCA	2	6	2878462	2878467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_017167	AGC	2	6	2878496	2878501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_017167	CCT	2	6	2878933	2878938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_017167	TGG	2	6	2878989	2878994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017167	ATC	2	6	2879348	2879353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_017167	TCG	2	6	2883074	2883079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_017167	AGG	2	6	2886677	2886682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017167	TCT	2	6	2886697	2886702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_017167	GAC	2	6	2886762	2886767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_017167	GCA	2	6	2886804	2886809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_017167	GAT	2	6	2886837	2886842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017167	AGG	2	6	2886898	2886903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017167	AAC	2	6	2886914	2886919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_017167	TGA	2	6	2886935	2886940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017167	CCG	2	6	2887006	2887011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4045	NC_017167	CTC	2	6	2888060	2888065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4046	NC_017167	CTG	2	6	2888785	2888790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_017167	GCC	2	6	2890140	2890145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4048	NC_017167	AGC	2	6	2890755	2890760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_017167	AGA	2	6	2891259	2891264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017167	CGG	2	6	2891927	2891932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_017167	ATG	2	6	2892011	2892016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017167	CGA	2	6	2898749	2898754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_017167	CGA	2	6	2898814	2898819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_017167	GCC	2	6	2898845	2898850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_017167	CTC	2	6	2898884	2898889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4056	NC_017167	CCA	2	6	2898937	2898942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4057	NC_017167	CGG	2	6	2898961	2898966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_017167	GTC	2	6	2898981	2898986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_017167	CTT	2	6	2899085	2899090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_017167	CAT	2	6	2899091	2899096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_017167	CCT	2	6	2899106	2899111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_017167	CGC	2	6	2902479	2902484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_017167	TCA	2	6	2902496	2902501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_017167	GCA	2	6	2907211	2907216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_017167	TTA	2	6	2907272	2907277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017167	CAC	2	6	2907358	2907363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4067	NC_017167	CCG	2	6	2907403	2907408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_017167	ATC	2	6	2907659	2907664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_017167	AGC	2	6	2908940	2908945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_017167	GCG	2	6	2914560	2914565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_017167	TCC	2	6	2914568	2914573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4072	NC_017167	TTG	2	6	2915202	2915207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017167	AGT	2	6	2915904	2915909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017167	GCG	2	6	2917096	2917101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_017167	GCG	3	9	2918555	2918563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_017167	GCC	2	6	2919869	2919874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4077	NC_017167	CAT	2	6	2919915	2919920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_017167	CCT	2	6	2921815	2921820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NC_017167	CAC	2	6	2922712	2922717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4080	NC_017167	GAG	2	6	2925394	2925399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017167	TCC	2	6	2925672	2925677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4082	NC_017167	TTG	2	6	2925680	2925685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017167	CTT	2	6	2926504	2926509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_017167	CCA	2	6	2927238	2927243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_017167	GCC	2	6	2929432	2929437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4086	NC_017167	GCG	2	6	2929445	2929450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_017167	CGC	2	6	2930763	2930768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4088	NC_017167	GCG	2	6	2930798	2930803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_017167	TCC	2	6	2931987	2931992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4090	NC_017167	AGG	2	6	2932035	2932040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017167	ACG	2	6	2932064	2932069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_017167	CCT	2	6	2932650	2932655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4093	NC_017167	TCC	2	6	2934352	2934357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_017167	TTC	2	6	2934364	2934369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_017167	CGC	2	6	2934418	2934423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4096	NC_017167	TGT	2	6	2934463	2934468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017167	CGG	2	6	2934525	2934530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_017167	CGG	2	6	2935393	2935398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_017167	GCA	2	6	2935416	2935421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_017167	CTC	2	6	2936944	2936949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4101	NC_017167	CCT	2	6	2937661	2937666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_017167	GCG	2	6	2937716	2937721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_017167	GAT	2	6	2940138	2940143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017167	CAT	2	6	2940601	2940606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_017167	CGG	2	6	2942010	2942015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_017167	CGC	2	6	2942020	2942025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4107	NC_017167	CGT	2	6	2942079	2942084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_017167	CAC	2	6	2942100	2942105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4109	NC_017167	GTT	2	6	2942248	2942253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017167	GTA	2	6	2942264	2942269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017167	GCC	2	6	2942361	2942366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_017167	TCC	2	6	2945263	2945268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4113	NC_017167	TCG	2	6	2946101	2946106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_017167	TAT	2	6	2952551	2952556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017167	ACC	2	6	2952709	2952714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4116	NC_017167	CTC	3	9	2955519	2955527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_017167	CTC	2	6	2959382	2959387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_017167	CAA	2	6	2959397	2959402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_017167	TCC	2	6	2959411	2959416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_017167	GCC	2	6	2959420	2959425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4121	NC_017167	GCC	2	6	2960281	2960286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4122	NC_017167	CTT	2	6	2960306	2960311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_017167	ATC	2	6	2960343	2960348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_017167	GCC	2	6	2960653	2960658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4125	NC_017167	CGC	2	6	2960718	2960723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4127	NC_017167	CTC	3	9	2961202	2961210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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