MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 4341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017167	GTT	2	6	680943	680948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017167	CCT	2	6	680964	680969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_017167	AGT	2	6	681019	681024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017167	AGC	2	6	681180	681185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_017167	GTT	2	6	681230	681235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017167	TTG	2	6	681343	681348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017167	GCA	2	6	681482	681487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_017167	AGC	2	6	681631	681636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_017167	GTG	2	6	681643	681648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017167	ATT	2	6	682122	682127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017167	AGC	2	6	682255	682260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_017167	TCT	2	6	682285	682290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_017167	TGC	2	6	682297	682302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_017167	GTT	2	6	682325	682330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017167	ATG	2	6	682347	682352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017167	GAA	2	6	682383	682388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017167	TGG	2	6	682416	682421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017167	CTC	2	6	682480	682485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_017167	AGA	2	6	682612	682617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017167	GAG	2	6	684775	684780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017167	GAT	2	6	684842	684847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017167	TTG	2	6	684855	684860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017167	GAC	2	6	685119	685124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1031	NC_017167	GCG	2	6	687548	687553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1037	NC_017167	TGA	2	6	692584	692589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1061	NC_017167	GGC	2	6	709156	709161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1112	NC_017167	GAG	2	6	772087	772092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1129	NC_017167	GCT	2	6	805780	805785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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