MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 4341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017167	GGC	2	6	2447669	2447674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_017167	CGG	2	6	2447790	2447795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_017167	GGA	3	9	2447813	2447821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_017167	CAT	2	6	2451542	2451547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_017167	CCT	2	6	2451580	2451585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3506	NC_017167	TCG	2	6	2455265	2455270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_017167	CGC	2	6	2455299	2455304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_017167	GCC	2	6	2461552	2461557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_017167	GGC	2	6	2463346	2463351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_017167	GCC	2	6	2463361	2463366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_017167	ATG	2	6	2464157	2464162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_017167	GAA	2	6	2467206	2467211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_017167	CGC	2	6	2467222	2467227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_017167	AGG	2	6	2467233	2467238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_017167	CTT	2	6	2468539	2468544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_017167	TCC	2	6	2469607	2469612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_017167	GGT	2	6	2469645	2469650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_017167	ATG	2	6	2469696	2469701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_017167	GGC	2	6	2469730	2469735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_017167	AGA	3	9	2471648	2471656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_017167	CCG	2	6	2472466	2472471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3522	NC_017167	CGG	2	6	2472477	2472482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_017167	CGG	2	6	2472488	2472493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_017167	GCA	2	6	2477555	2477560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_017167	CGA	2	6	2477594	2477599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_017167	AGG	2	6	2478660	2478665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_017167	GCG	2	6	2479022	2479027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_017167	CGC	2	6	2479035	2479040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3529	NC_017167	CTC	2	6	2482144	2482149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_017167	ATC	2	6	2482199	2482204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_017167	GTC	2	6	2482330	2482335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_017167	ATC	3	9	2482402	2482410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_017167	CGA	2	6	2489505	2489510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_017167	GGT	2	6	2489607	2489612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_017167	GGT	2	6	2489727	2489732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_017167	GCG	2	6	2492489	2492494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_017167	CGC	2	6	2492503	2492508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3538	NC_017167	CAT	2	6	2492537	2492542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_017167	CGG	2	6	2494581	2494586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_017167	CAT	2	6	2495683	2495688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_017167	GAA	2	6	2497246	2497251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_017167	CGG	2	6	2497262	2497267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_017167	GCG	2	6	2506093	2506098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_017167	CGG	2	6	2506112	2506117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_017167	CTC	2	6	2506336	2506341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3548	NC_017167	TGG	2	6	2509382	2509387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_017167	CAG	2	6	2509395	2509400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_017167	GCC	2	6	2509414	2509419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3551	NC_017167	CAT	2	6	2509426	2509431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_017167	TCC	3	9	2509728	2509736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_017167	GGA	3	9	2509842	2509850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_017167	GGC	2	6	2510140	2510145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_017167	GTT	3	9	2510963	2510971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_017167	CGA	2	6	2510998	2511003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_017167	CAA	2	6	2511005	2511010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_017167	AGG	2	6	2511033	2511038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_017167	GAG	2	6	2511072	2511077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_017167	GCC	2	6	2511098	2511103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_017167	TAT	2	6	2512220	2512225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_017167	GAA	2	6	2512233	2512238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017167	GCT	2	6	2512281	2512286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_017167	AGG	2	6	2512328	2512333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_017167	CAC	2	6	2513901	2513906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3566	NC_017167	CGG	2	6	2514383	2514388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_017167	TTG	2	6	2514399	2514404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_017167	CAA	2	6	2514550	2514555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_017167	ATA	2	6	2519771	2519776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_017167	CCG	2	6	2519798	2519803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3571	NC_017167	CGC	2	6	2521307	2521312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_017167	GCC	2	6	2521322	2521327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_017167	CCG	2	6	2522161	2522166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3574	NC_017167	GCG	2	6	2522203	2522208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_017167	CTG	2	6	2522770	2522775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_017167	TCC	2	6	2522861	2522866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3577	NC_017167	CCG	2	6	2522887	2522892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3578	NC_017167	GCC	2	6	2522928	2522933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3579	NC_017167	TAT	2	6	2523502	2523507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3581	NC_017167	GTC	2	6	2523580	2523585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_017167	CCG	2	6	2523603	2523608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_017167	TCG	2	6	2523671	2523676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_017167	GCC	2	6	2523687	2523692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3589	NC_017167	CGC	2	6	2526082	2526087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_017167	CGC	2	6	2527893	2527898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3591	NC_017167	CGA	2	6	2527904	2527909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_017167	CTT	2	6	2532413	2532418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_017167	CAT	2	6	2532493	2532498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3595	NC_017167	AGG	2	6	2532591	2532596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_017167	CTC	2	6	2534082	2534087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_017167	GCT	2	6	2534396	2534401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_017167	CCT	2	6	2534417	2534422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3599	NC_017167	GCG	2	6	2534431	2534436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_017167	TCC	2	6	2537588	2537593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_017167	GCC	2	6	2539346	2539351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3602	NC_017167	GCG	2	6	2542620	2542625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_017167	GGA	2	6	2544235	2544240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3606	NC_017167	GTG	2	6	2548310	2548315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_017167	CAA	2	6	2548505	2548510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_017167	ATA	2	6	2548551	2548556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_017167	CAT	2	6	2548596	2548601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_017167	AGG	2	6	2548713	2548718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3612	NC_017167	TGG	2	6	2550306	2550311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_017167	CAT	2	6	2550466	2550471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3617	NC_017167	CAT	2	6	2553653	2553658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3619	NC_017167	GAA	2	6	2555101	2555106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_017167	GCG	2	6	2555152	2555157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_017167	GCC	2	6	2557489	2557494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3622	NC_017167	CGG	2	6	2557507	2557512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_017167	TCT	2	6	2560607	2560612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_017167	ACG	2	6	2560655	2560660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_017167	ATA	2	6	2560712	2560717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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