MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 4341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017167	ACG	2	6	323564	323569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017167	AGG	2	6	323572	323577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017167	TTG	2	6	325635	325640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017167	GTT	2	6	325651	325656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017167	CAC	2	6	325689	325694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_017167	CGC	2	6	326563	326568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_017167	CGA	2	6	326601	326606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017167	GGT	2	6	326646	326651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017167	ACC	2	6	326721	326726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_017167	AGA	2	6	326776	326781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017167	GTC	2	6	326960	326965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017167	AGG	2	6	326988	326993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017167	GTA	2	6	327026	327031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017167	CGT	2	6	327058	327063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017167	CTG	2	6	327065	327070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017167	TCT	2	6	328341	328346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_017167	TGT	2	6	328429	328434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017167	AGT	2	6	328478	328483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017167	GTG	2	6	328516	328521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017167	GGC	2	6	328573	328578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_017167	AGG	2	6	330477	330482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017167	ATT	2	6	330508	330513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017167	CCT	2	6	331167	331172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_017167	GAT	2	6	331191	331196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017167	ACC	2	6	331210	331215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_017167	CAG	2	6	331579	331584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017167	GCT	2	6	331598	331603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017167	ACC	2	6	331633	331638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_017167	AAC	2	6	331811	331816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_017167	GTG	2	6	331874	331879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017167	CCG	2	6	331907	331912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_017167	GCG	2	6	331920	331925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_017167	GTG	2	6	331957	331962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017167	GAG	2	6	332108	332113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017167	TCC	2	6	332118	332123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_017167	TAT	2	6	332215	332220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017167	ACC	2	6	332285	332290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_017167	GTG	2	6	332299	332304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017167	GTG	2	6	332491	332496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017167	CGA	2	6	332516	332521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_017167	AGC	2	6	332581	332586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_017167	CCT	2	6	332604	332609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_017167	CGA	2	6	332828	332833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_017167	GCT	2	6	332852	332857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_017167	GGC	2	6	333168	333173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017167	TAG	2	6	333277	333282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017167	TAA	2	6	333297	333302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017167	GGC	2	6	333317	333322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_017167	ACC	2	6	333376	333381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_017167	GGC	2	6	333463	333468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017167	GCG	2	6	333511	333516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_017167	GAG	2	6	333599	333604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017167	TCT	2	6	333608	333613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_017167	CCA	2	6	333686	333691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_017167	CGA	2	6	333695	333700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_017167	GCA	2	6	333769	333774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_017167	CGC	2	6	333816	333821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_017167	GAA	2	6	333828	333833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017167	CAG	2	6	333939	333944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_017167	GGA	2	6	334131	334136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017167	GAA	2	6	334394	334399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017167	GGT	2	6	334469	334474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017167	GTC	2	6	334483	334488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017167	GGA	2	6	334597	334602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017167	ATC	2	6	334621	334626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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567	NC_017167	GAT	2	6	334906	334911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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569	NC_017167	GGA	2	6	335043	335048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017167	GAA	2	6	335125	335130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017167	CAG	2	6	335222	335227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017167	AGT	2	6	335315	335320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017167	GGA	2	6	335334	335339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_017167	GGT	2	6	337520	337525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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600	NC_017167	GGC	2	6	339894	339899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_017167	ACG	2	6	339909	339914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_017167	GCG	2	6	339917	339922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017167	AGC	2	6	340085	340090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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609	NC_017167	AGG	2	6	340416	340421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017167	GAC	2	6	342130	342135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017167	AGC	3	9	342189	342197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_017167	GAC	2	6	342203	342208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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618	NC_017167	TCC	2	6	351032	351037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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621	NC_017167	GAG	2	6	352770	352775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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623	NC_017167	GTA	2	6	353046	353051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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