MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 4341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017167	TGT	2	6	2192874	2192879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017167	GAC	2	6	2195769	2195774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_017167	CGG	2	6	2195849	2195854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_017167	GTG	2	6	2195892	2195897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017167	ACG	2	6	2195950	2195955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_017167	CCG	2	6	2196011	2196016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_017167	ACA	2	6	2197045	2197050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_017167	ATG	2	6	2199957	2199962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017167	CTT	2	6	2200000	2200005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_017167	GAC	2	6	2200051	2200056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_017167	CAA	2	6	2203024	2203029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_017167	GAA	2	6	2203114	2203119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017167	CTC	2	6	2204580	2204585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_017167	CAA	2	6	2205563	2205568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_017167	GCC	2	6	2205597	2205602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_017167	CGG	2	6	2205615	2205620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_017167	TGC	2	6	2205804	2205809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_017167	AGG	2	6	2205844	2205849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017167	AAG	2	6	2206595	2206600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017167	TCC	2	6	2207097	2207102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3021	NC_017167	TCT	2	6	2207632	2207637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_017167	CCG	2	6	2209996	2210001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_017167	CGG	2	6	2210010	2210015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_017167	GAA	2	6	2210236	2210241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017167	ACA	2	6	2210330	2210335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_017167	TCC	2	6	2210362	2210367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_017167	CGT	2	6	2210511	2210516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_017167	ACG	2	6	2212432	2212437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_017167	TAG	2	6	2212538	2212543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017167	AAG	2	6	2214947	2214952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017167	CAG	2	6	2215067	2215072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_017167	CTG	2	6	2215082	2215087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_017167	TCC	2	6	2217735	2217740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_017167	TCC	2	6	2217924	2217929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_017167	ATG	2	6	2217934	2217939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017167	CGC	2	6	2217943	2217948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3037	NC_017167	ATG	2	6	2217966	2217971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_017167	CCT	2	6	2218055	2218060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_017167	CAT	2	6	2218102	2218107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_017167	AAG	2	6	2218135	2218140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017167	TAA	2	6	2218219	2218224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017167	CAT	2	6	2218628	2218633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_017167	GGC	2	6	2219025	2219030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_017167	GCC	2	6	2219039	2219044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_017167	GCC	2	6	2220118	2220123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_017167	CGG	2	6	2220252	2220257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_017167	AAG	2	6	2220294	2220299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_017167	TTG	2	6	2220314	2220319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_017167	TGA	2	6	2220329	2220334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_017167	TTC	2	6	2223487	2223492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_017167	CGG	2	6	2225412	2225417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_017167	GCG	3	9	2225461	2225469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_017167	TCG	2	6	2226651	2226656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3055	NC_017167	GCA	2	6	2227483	2227488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_017167	CTC	2	6	2227509	2227514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3057	NC_017167	CAA	2	6	2228851	2228856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_017167	TGG	2	6	2229080	2229085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_017167	CCG	2	6	2229103	2229108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3060	NC_017167	GCC	2	6	2229153	2229158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_017167	TGG	2	6	2229169	2229174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017167	ATA	2	6	2229353	2229358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_017167	CGG	2	6	2229450	2229455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_017167	TGG	2	6	2229476	2229481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017167	GCT	2	6	2229503	2229508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_017167	TTG	2	6	2229961	2229966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017167	CAT	2	6	2230538	2230543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_017167	AGT	2	6	2230573	2230578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017167	AAG	2	6	2231285	2231290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017167	CGC	2	6	2231306	2231311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_017167	CAT	2	6	2231320	2231325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_017167	TCC	2	6	2232492	2232497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3073	NC_017167	TAC	2	6	2236398	2236403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3075	NC_017167	CGG	2	6	2236909	2236914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_017167	GTT	2	6	2236918	2236923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_017167	GCC	2	6	2237366	2237371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3078	NC_017167	CCG	2	6	2237374	2237379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3079	NC_017167	CCT	2	6	2238540	2238545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3080	NC_017167	TAC	2	6	2238622	2238627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_017167	CGA	2	6	2239319	2239324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_017167	GGA	2	6	2239325	2239330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_017167	GCC	2	6	2240678	2240683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3084	NC_017167	GCG	2	6	2240686	2240691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_017167	CGG	2	6	2240697	2240702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3087	NC_017167	CGG	2	6	2245007	2245012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_017167	CGC	2	6	2245030	2245035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3089	NC_017167	TCC	2	6	2247313	2247318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3090	NC_017167	CTC	2	6	2249018	2249023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3091	NC_017167	TCG	2	6	2250093	2250098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_017167	GTA	2	6	2250204	2250209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_017167	GGA	2	6	2250306	2250311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_017167	TCC	2	6	2251636	2251641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3095	NC_017167	GAC	2	6	2251720	2251725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_017167	CCT	2	6	2257064	2257069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3097	NC_017167	TCA	2	6	2257113	2257118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_017167	GCC	2	6	2260226	2260231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_017167	CGC	2	6	2260979	2260984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3100	NC_017167	GCG	2	6	2260986	2260991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_017167	CCT	2	6	2261475	2261480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3102	NC_017167	AGG	2	6	2262449	2262454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017167	CTT	2	6	2262836	2262841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_017167	TCC	2	6	2263418	2263423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_017167	CGG	3	9	2264096	2264104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3107	NC_017167	TCG	2	6	2264223	2264228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_017167	CCG	2	6	2264290	2264295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_017167	CCG	2	6	2264847	2264852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3110	NC_017167	CCT	2	6	2264907	2264912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3111	NC_017167	CTG	2	6	2266619	2266624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_017167	GGT	2	6	2266636	2266641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017167	CCT	2	6	2266654	2266659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3114	NC_017167	AAC	2	6	2267056	2267061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_017167	CAT	2	6	2267091	2267096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3119	NC_017167	TTC	2	6	2267365	2267370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_017167	TGT	2	6	2267410	2267415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017167	CAC	2	6	2267417	2267422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3122	NC_017167	ATG	2	6	2267500	2267505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_017167	GAA	2	6	2267550	2267555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017167	CCA	2	6	2267865	2267870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_017167	AGG	2	6	2268058	2268063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3127	NC_017167	CTT	2	6	2269024	2269029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_017167	GCT	2	6	2269081	2269086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3131	NC_017167	GAT	2	6	2269163	2269168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_017167	CCT	2	6	2270549	2270554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3153	NC_017167	TCC	2	6	2291567	2291572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3186	NC_017167	CTT	2	6	2312393	2312398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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