MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 1723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015942	CGGCG	2	10	510	519	0 %	0 %	60 %	40 %	344198244
2	NC_015942	CAACA	2	10	835	844	60 %	0 %	0 %	40 %	344198244
3	NC_015942	CTGTG	2	10	2077	2086	0 %	40 %	40 %	20 %	344198245
4	NC_015942	ACTGG	2	10	3365	3374	20 %	20 %	40 %	20 %	344198246
5	NC_015942	GCAGC	2	10	7714	7723	20 %	0 %	40 %	40 %	344198249
6	NC_015942	GCCAG	2	10	8892	8901	20 %	0 %	40 %	40 %	344198249
7	NC_015942	CAGTC	2	10	8942	8951	20 %	20 %	20 %	40 %	344198249
8	NC_015942	TCATG	2	10	10798	10807	20 %	40 %	20 %	20 %	344198249
9	NC_015942	CAGAT	2	10	14730	14739	40 %	20 %	20 %	20 %	344198254
10	NC_015942	GCGCG	2	10	15453	15462	0 %	0 %	60 %	40 %	344198254
11	NC_015942	CCGGG	2	10	15946	15955	0 %	0 %	60 %	40 %	344198255
12	NC_015942	GCCCA	2	10	18656	18665	20 %	0 %	20 %	60 %	344198258
13	NC_015942	GCAGG	2	10	18946	18955	20 %	0 %	60 %	20 %	344198258
14	NC_015942	GCGCG	2	10	19454	19463	0 %	0 %	60 %	40 %	344198259
15	NC_015942	TCCGG	2	10	19542	19551	0 %	20 %	40 %	40 %	344198259
16	NC_015942	GGCGT	2	10	20660	20669	0 %	20 %	60 %	20 %	344198260
17	NC_015942	CGGCG	2	10	21594	21603	0 %	0 %	60 %	40 %	344198261
18	NC_015942	TCAGC	2	10	22604	22613	20 %	20 %	20 %	40 %	344198262
19	NC_015942	CAGCG	2	10	23217	23226	20 %	0 %	40 %	40 %	344198262
20	NC_015942	GGCGC	2	10	23243	23252	0 %	0 %	60 %	40 %	344198262
21	NC_015942	TGCCC	2	10	24836	24845	0 %	20 %	20 %	60 %	344198263
22	NC_015942	GTGCC	2	10	25752	25761	0 %	20 %	40 %	40 %	344198264
23	NC_015942	GGCTT	2	10	27080	27089	0 %	40 %	40 %	20 %	344198265
24	NC_015942	AAAAT	2	10	27245	27254	80 %	20 %	0 %	0 %	344198265
25	NC_015942	GTGCG	2	10	29258	29267	0 %	20 %	60 %	20 %	344198267
26	NC_015942	GTGCA	2	10	34016	34025	20 %	20 %	40 %	20 %	344198267
27	NC_015942	TCTGC	2	10	35962	35971	0 %	40 %	20 %	40 %	344198267
28	NC_015942	AATCG	2	10	38893	38902	40 %	20 %	20 %	20 %	344198270
29	NC_015942	GGCCA	2	10	43472	43481	20 %	0 %	40 %	40 %	344198272
30	NC_015942	GGCAT	2	10	43938	43947	20 %	20 %	40 %	20 %	344198272
31	NC_015942	CTTGC	2	10	44403	44412	0 %	40 %	20 %	40 %	344198272
32	NC_015942	ACCGC	2	10	46213	46222	20 %	0 %	20 %	60 %	344198275
33	NC_015942	TGTCT	2	10	47854	47863	0 %	60 %	20 %	20 %	344198277
34	NC_015942	GCCGG	2	10	50209	50218	0 %	0 %	60 %	40 %	344198280
35	NC_015942	TCCCA	2	10	50621	50630	20 %	20 %	0 %	60 %	344198280
36	NC_015942	GCCGC	2	10	62616	62625	0 %	0 %	40 %	60 %	344198292
37	NC_015942	ATGGG	2	10	63075	63084	20 %	20 %	60 %	0 %	344198292
38	NC_015942	GCGCA	2	10	64708	64717	20 %	0 %	40 %	40 %	344198294
39	NC_015942	TCTGA	2	10	73010	73019	20 %	40 %	20 %	20 %	344198303
40	NC_015942	CATTT	2	10	74937	74946	20 %	60 %	0 %	20 %	344198305
41	NC_015942	GACTG	2	10	77009	77018	20 %	20 %	40 %	20 %	344198306
42	NC_015942	CTGGC	2	10	77059	77068	0 %	20 %	40 %	40 %	344198306
43	NC_015942	GCTGC	2	10	78237	78246	0 %	20 %	40 %	40 %	344198306
44	NC_015942	ATTCA	2	10	78770	78779	40 %	40 %	0 %	20 %	344198307
45	NC_015942	TCTGT	2	10	80411	80420	0 %	60 %	20 %	20 %	344198310
46	NC_015942	TTCCC	2	10	89821	89830	0 %	40 %	0 %	60 %	344198317
47	NC_015942	GGTCA	2	10	90156	90165	20 %	20 %	40 %	20 %	344198317
48	NC_015942	CAGTG	2	10	93463	93472	20 %	20 %	40 %	20 %	344198320
49	NC_015942	TCTGG	2	10	99305	99314	0 %	40 %	40 %	20 %	344198324
50	NC_015942	GCCCC	2	10	101766	101775	0 %	0 %	20 %	80 %	344198327
51	NC_015942	CCTAT	2	10	102341	102350	20 %	40 %	0 %	40 %	344198327
52	NC_015942	GCTAT	2	10	104618	104627	20 %	40 %	20 %	20 %	344198327
53	NC_015942	ACATC	2	10	105865	105874	40 %	20 %	0 %	40 %	344198328
54	NC_015942	CGCTG	2	10	107915	107924	0 %	20 %	40 %	40 %	344198330
55	NC_015942	TGCGC	2	10	108692	108701	0 %	20 %	40 %	40 %	344198332
56	NC_015942	GCGGT	2	10	109850	109859	0 %	20 %	60 %	20 %	344198334
57	NC_015942	AATGC	2	10	110939	110948	40 %	20 %	20 %	20 %	344198335
58	NC_015942	GCGCT	2	10	112160	112169	0 %	20 %	40 %	40 %	344198337
59	NC_015942	CGCAA	2	10	113077	113086	40 %	0 %	20 %	40 %	344198338
60	NC_015942	GCTGC	2	10	113203	113212	0 %	20 %	40 %	40 %	344198339
61	NC_015942	AGCAG	2	10	115519	115528	40 %	0 %	40 %	20 %	344198341
62	NC_015942	TTTCA	2	10	119249	119258	20 %	60 %	0 %	20 %	344198345
63	NC_015942	GTGAA	2	10	120537	120546	40 %	20 %	40 %	0 %	344198346
64	NC_015942	CCCAG	2	10	121177	121186	20 %	0 %	20 %	60 %	344198346
65	NC_015942	CCAAA	2	10	122221	122230	60 %	0 %	0 %	40 %	344198346
66	NC_015942	GGGCG	2	10	127858	127867	0 %	0 %	80 %	20 %	344198351
67	NC_015942	CAGCG	2	10	133376	133385	20 %	0 %	40 %	40 %	344198353
68	NC_015942	CGCTG	2	10	133700	133709	0 %	20 %	40 %	40 %	344198353
69	NC_015942	GGGCT	2	10	136650	136659	0 %	20 %	60 %	20 %	344198354
70	NC_015942	CGCCA	2	10	136980	136989	20 %	0 %	20 %	60 %	344198354
71	NC_015942	AATTC	2	10	138766	138775	40 %	40 %	0 %	20 %	344198357
72	NC_015942	GACGC	2	10	140517	140526	20 %	0 %	40 %	40 %	344198358
73	NC_015942	TCGTA	2	10	144081	144090	20 %	40 %	20 %	20 %	344198363
74	NC_015942	GGGGA	2	10	147562	147571	20 %	0 %	80 %	0 %	344198366
75	NC_015942	ATTTT	2	10	148289	148298	20 %	80 %	0 %	0 %	344198366
76	NC_015942	CGGCG	2	10	149571	149580	0 %	0 %	60 %	40 %	344198368
77	NC_015942	GGAGA	2	10	150318	150327	40 %	0 %	60 %	0 %	344198368
78	NC_015942	GCGCG	2	10	151307	151316	0 %	0 %	60 %	40 %	344198370
79	NC_015942	TCCTT	2	10	151477	151486	0 %	60 %	0 %	40 %	344198371
80	NC_015942	CTTGC	2	10	152795	152804	0 %	40 %	20 %	40 %	344198372
81	NC_015942	GCGGT	2	10	153833	153842	0 %	20 %	60 %	20 %	344198374
82	NC_015942	GACCG	2	10	153877	153886	20 %	0 %	40 %	40 %	344198374
83	NC_015942	TCTGC	2	10	155524	155533	0 %	40 %	20 %	40 %	344198375
84	NC_015942	TGGCT	2	10	155669	155678	0 %	40 %	40 %	20 %	344198375
85	NC_015942	AGCCA	2	10	160664	160673	40 %	0 %	20 %	40 %	344198383
86	NC_015942	ATCAC	2	10	162404	162413	40 %	20 %	0 %	40 %	344198385
87	NC_015942	GCCGC	2	10	162899	162908	0 %	0 %	40 %	60 %	344198385
88	NC_015942	GTACT	2	10	170011	170020	20 %	40 %	20 %	20 %	344198393
89	NC_015942	GCCCC	2	10	171146	171155	0 %	0 %	20 %	80 %	344198394
90	NC_015942	AGCGC	2	10	176093	176102	20 %	0 %	40 %	40 %	344198398
91	NC_015942	GGTCG	2	10	178146	178155	0 %	20 %	60 %	20 %	344198399
92	NC_015942	CCCGA	2	10	184789	184798	20 %	0 %	20 %	60 %	344198405
93	NC_015942	CCGCG	2	10	185974	185983	0 %	0 %	40 %	60 %	344198406
94	NC_015942	CCCTG	2	10	186726	186735	0 %	20 %	20 %	60 %	344198408
95	NC_015942	CGGGG	2	10	188807	188816	0 %	0 %	80 %	20 %	344198411
96	NC_015942	CTGCG	2	10	190218	190227	0 %	20 %	40 %	40 %	344198413
97	NC_015942	TTCAA	2	10	190861	190870	40 %	40 %	0 %	20 %	344198414
98	NC_015942	CGAGG	2	10	190871	190880	20 %	0 %	60 %	20 %	344198414
99	NC_015942	TTGGG	2	10	194096	194105	0 %	40 %	60 %	0 %	344198416
100	NC_015942	GATCA	2	10	197430	197439	40 %	20 %	20 %	20 %	344198420
101	NC_015942	GCGCG	2	10	199837	199846	0 %	0 %	60 %	40 %	344198421
102	NC_015942	ATGCC	2	10	202661	202670	20 %	20 %	20 %	40 %	344198423
103	NC_015942	CGGGG	2	10	203623	203632	0 %	0 %	80 %	20 %	344198424
104	NC_015942	AGTGA	2	10	210198	210207	40 %	20 %	40 %	0 %	344198431
105	NC_015942	TCAAA	2	10	210715	210724	60 %	20 %	0 %	20 %	344198432
106	NC_015942	TGCCC	2	10	211237	211246	0 %	20 %	20 %	60 %	344198433
107	NC_015942	CCCCG	2	10	211369	211378	0 %	0 %	20 %	80 %	344198433
108	NC_015942	GGGCA	2	10	211636	211645	20 %	0 %	60 %	20 %	344198433
109	NC_015942	GCACC	2	10	213612	213621	20 %	0 %	20 %	60 %	344198433
110	NC_015942	CCGCG	2	10	214749	214758	0 %	0 %	40 %	60 %	344198434
111	NC_015942	CCGGT	2	10	218661	218670	0 %	20 %	40 %	40 %	344198437
112	NC_015942	TCGAC	2	10	219006	219015	20 %	20 %	20 %	40 %	344198438
113	NC_015942	GCATA	2	10	222522	222531	40 %	20 %	20 %	20 %	344198443
114	NC_015942	GACAC	2	10	223647	223656	40 %	0 %	20 %	40 %	344198444
115	NC_015942	CGGTG	2	10	228162	228171	0 %	20 %	60 %	20 %	344198449
116	NC_015942	GCCCG	2	10	228289	228298	0 %	0 %	40 %	60 %	344198449
117	NC_015942	CGCAG	2	10	235248	235257	20 %	0 %	40 %	40 %	344198455
118	NC_015942	TATAA	2	10	236349	236358	60 %	40 %	0 %	0 %	344198456
119	NC_015942	GGCGC	2	10	237421	237430	0 %	0 %	60 %	40 %	344198458
120	NC_015942	CGCAA	2	10	247660	247669	40 %	0 %	20 %	40 %	344198470
121	NC_015942	CAGAA	2	10	248758	248767	60 %	0 %	20 %	20 %	344198470
122	NC_015942	AGCCA	2	10	249640	249649	40 %	0 %	20 %	40 %	344198471
123	NC_015942	TTGGC	2	10	250029	250038	0 %	40 %	40 %	20 %	344198471
124	NC_015942	GGGCA	2	10	256987	256996	20 %	0 %	60 %	20 %	344198476
125	NC_015942	AGTAG	2	10	258319	258328	40 %	20 %	40 %	0 %	344198477
126	NC_015942	TGGGG	2	10	259565	259574	0 %	20 %	80 %	0 %	344198478
127	NC_015942	CAGAG	2	10	261015	261024	40 %	0 %	40 %	20 %	344198479
128	NC_015942	GCGGG	2	10	265531	265540	0 %	0 %	80 %	20 %	344198483
129	NC_015942	GATCA	2	10	265821	265830	40 %	20 %	20 %	20 %	344198483
130	NC_015942	GTGAA	2	10	268027	268036	40 %	20 %	40 %	0 %	344198483
131	NC_015942	GGCGC	2	10	275736	275745	0 %	0 %	60 %	40 %	344198489
132	NC_015942	CCATG	2	10	277096	277105	20 %	20 %	20 %	40 %	344198490
133	NC_015942	CCGGG	2	10	277778	277787	0 %	0 %	60 %	40 %	344198491
134	NC_015942	TGATC	2	10	278555	278564	20 %	40 %	20 %	20 %	344198491
135	NC_015942	CAGTA	2	10	278600	278609	40 %	20 %	20 %	20 %	344198491
136	NC_015942	GCCGC	2	10	289127	289136	0 %	0 %	40 %	60 %	344198501
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142	NC_015942	GCCGG	2	10	294144	294153	0 %	0 %	60 %	40 %	344198506
143	NC_015942	CTCAG	2	10	294276	294285	20 %	20 %	20 %	40 %	344198507
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147	NC_015942	GGGGT	2	10	299935	299944	0 %	20 %	80 %	0 %	344198512
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149	NC_015942	CGCAC	2	10	300219	300228	20 %	0 %	20 %	60 %	344198512
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155	NC_015942	GCGCC	2	10	307151	307160	0 %	0 %	40 %	60 %	344198522
156	NC_015942	CGCTG	2	10	307562	307571	0 %	20 %	40 %	40 %	344198523
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248	NC_015942	GGACT	2	10	455128	455137	20 %	20 %	40 %	20 %	344198663
249	NC_015942	GCCGA	2	10	460866	460875	20 %	0 %	40 %	40 %	344198669
250	NC_015942	GCCGG	2	10	461469	461478	0 %	0 %	60 %	40 %	344198670
251	NC_015942	GAACA	2	10	463942	463951	60 %	0 %	20 %	20 %	344198674
252	NC_015942	GCTTG	2	10	471441	471450	0 %	40 %	40 %	20 %	344198677
253	NC_015942	TCTGG	2	10	475543	475552	0 %	40 %	40 %	20 %	344198679
254	NC_015942	CAAGG	2	10	476385	476394	40 %	0 %	40 %	20 %	344198680
255	NC_015942	GGGCA	2	10	477194	477203	20 %	0 %	60 %	20 %	344198682
256	NC_015942	TTTCC	2	10	477881	477890	0 %	60 %	0 %	40 %	344198683
257	NC_015942	GCCCC	2	10	480050	480059	0 %	0 %	20 %	80 %	344198687
258	NC_015942	GTCAT	2	10	485566	485575	20 %	40 %	20 %	20 %	344198690
259	NC_015942	ACCGC	2	10	486360	486369	20 %	0 %	20 %	60 %	344198691
260	NC_015942	TTGGG	2	10	490045	490054	0 %	40 %	60 %	0 %	344198693
261	NC_015942	CGATA	2	10	498032	498041	40 %	20 %	20 %	20 %	344198702
262	NC_015942	CCGCT	2	10	503829	503838	0 %	20 %	20 %	60 %	344198706
263	NC_015942	CCGTG	2	10	505028	505037	0 %	20 %	40 %	40 %	344198707
264	NC_015942	CGGCA	2	10	505224	505233	20 %	0 %	40 %	40 %	344198707
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377	NC_015942	CCATC	2	10	701477	701486	20 %	20 %	0 %	60 %	344198884
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379	NC_015942	CGGCG	2	10	707034	707043	0 %	0 %	60 %	40 %	344198889
380	NC_015942	CAGTG	2	10	707200	707209	20 %	20 %	40 %	20 %	344198889
381	NC_015942	CAGGC	2	10	708143	708152	20 %	0 %	40 %	40 %	344198890
382	NC_015942	GTGGA	2	10	710869	710878	20 %	20 %	60 %	0 %	344198893
383	NC_015942	TGGTG	2	10	711259	711268	0 %	40 %	60 %	0 %	344198893
384	NC_015942	CAACC	2	10	713034	713043	40 %	0 %	0 %	60 %	344198893
385	NC_015942	CAGGC	2	10	715878	715887	20 %	0 %	40 %	40 %	344198895
386	NC_015942	ACGTG	2	10	718522	718531	20 %	20 %	40 %	20 %	344198898
387	NC_015942	GTCAA	2	10	719397	719406	40 %	20 %	20 %	20 %	344198899
388	NC_015942	GATCT	2	10	720745	720754	20 %	40 %	20 %	20 %	344198900
389	NC_015942	TAAAA	2	10	721884	721893	80 %	20 %	0 %	0 %	344198901
390	NC_015942	GGCAT	2	10	726451	726460	20 %	20 %	40 %	20 %	344198904
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