MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 1723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015942	TCTGG	2	10	932880	932889	0 %	40 %	40 %	20 %	344199082
502	NC_015942	TATTT	2	10	934904	934913	20 %	80 %	0 %	0 %	344199084
503	NC_015942	TGCGA	2	10	935839	935848	20 %	20 %	40 %	20 %	344199086
504	NC_015942	TCATC	2	10	936618	936627	20 %	40 %	0 %	40 %	344199087
505	NC_015942	GTCCA	2	10	938869	938878	20 %	20 %	20 %	40 %	344199090
506	NC_015942	ATAGA	2	10	941490	941499	60 %	20 %	20 %	0 %	344199090
507	NC_015942	GCTCC	2	10	944069	944078	0 %	20 %	20 %	60 %	344199091
508	NC_015942	TGCCC	2	10	944306	944315	0 %	20 %	20 %	60 %	344199092
509	NC_015942	TTCCA	2	10	952668	952677	20 %	40 %	0 %	40 %	344199096
510	NC_015942	GCGGG	2	10	954451	954460	0 %	0 %	80 %	20 %	344199097
511	NC_015942	CGCGG	2	10	955016	955025	0 %	0 %	60 %	40 %	344199098
512	NC_015942	GCGGT	2	10	956661	956670	0 %	20 %	60 %	20 %	344199099
513	NC_015942	GGGCA	2	10	957705	957714	20 %	0 %	60 %	20 %	344199100
514	NC_015942	CTGGG	2	10	959358	959367	0 %	20 %	60 %	20 %	344199102
515	NC_015942	GGTGG	2	10	959371	959380	0 %	20 %	80 %	0 %	344199102
516	NC_015942	AGCTG	2	10	961311	961320	20 %	20 %	40 %	20 %	344199103
517	NC_015942	CGGTG	2	10	962462	962471	0 %	20 %	60 %	20 %	344199105
518	NC_015942	CGGCT	2	10	963152	963161	0 %	20 %	40 %	40 %	344199106
519	NC_015942	CAGGG	2	10	964129	964138	20 %	0 %	60 %	20 %	344199107
520	NC_015942	TTTTC	2	10	964647	964656	0 %	80 %	0 %	20 %	344199107
521	NC_015942	GCCCC	2	10	964863	964872	0 %	0 %	20 %	80 %	344199107
522	NC_015942	ATTTC	2	10	967672	967681	20 %	60 %	0 %	20 %	344199112
523	NC_015942	TGCAC	2	10	967770	967779	20 %	20 %	20 %	40 %	344199112
524	NC_015942	GGCTC	2	10	968738	968747	0 %	20 %	40 %	40 %	344199113
525	NC_015942	CGACT	2	10	969293	969302	20 %	20 %	20 %	40 %	344199113
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529	NC_015942	CCGTT	2	10	985894	985903	0 %	40 %	20 %	40 %	344199133
530	NC_015942	CAGAT	2	10	993770	993779	40 %	20 %	20 %	20 %	344199140
531	NC_015942	GCGGA	2	10	997091	997100	20 %	0 %	60 %	20 %	344199142
532	NC_015942	GAAAA	2	10	998569	998578	80 %	0 %	20 %	0 %	344199144
533	NC_015942	CGCGC	2	10	1000893	1000902	0 %	0 %	40 %	60 %	344199145
534	NC_015942	GGGAG	2	10	1001298	1001307	20 %	0 %	80 %	0 %	344199145
535	NC_015942	CCAGC	2	10	1005431	1005440	20 %	0 %	20 %	60 %	344199149
536	NC_015942	TGGCC	2	10	1007885	1007894	0 %	20 %	40 %	40 %	344199152
537	NC_015942	TCCCA	2	10	1007952	1007961	20 %	20 %	0 %	60 %	344199152
538	NC_015942	GCACC	2	10	1008012	1008021	20 %	0 %	20 %	60 %	344199152
539	NC_015942	GCAAG	2	10	1009780	1009789	40 %	0 %	40 %	20 %	344199154
540	NC_015942	TGATC	2	10	1011707	1011716	20 %	40 %	20 %	20 %	344199156
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543	NC_015942	GCTGG	2	10	1014146	1014155	0 %	20 %	60 %	20 %	344199158
544	NC_015942	ATAAA	2	10	1014798	1014807	80 %	20 %	0 %	0 %	344199158
545	NC_015942	TCGGA	2	10	1018704	1018713	20 %	20 %	40 %	20 %	344199162
546	NC_015942	TCGGA	2	10	1022318	1022327	20 %	20 %	40 %	20 %	344199166
547	NC_015942	GGGGC	2	10	1024047	1024056	0 %	0 %	80 %	20 %	344199169
548	NC_015942	CGGCG	2	10	1027716	1027725	0 %	0 %	60 %	40 %	344199171
549	NC_015942	CGCAG	2	10	1029212	1029221	20 %	0 %	40 %	40 %	344199172
550	NC_015942	GCGTG	2	10	1032657	1032666	0 %	20 %	60 %	20 %	344199176
551	NC_015942	TGCTC	2	10	1033472	1033481	0 %	40 %	20 %	40 %	344199177
552	NC_015942	TGCGG	2	10	1034480	1034489	0 %	20 %	60 %	20 %	344199178
553	NC_015942	CGCTG	3	15	1039708	1039722	0 %	20 %	40 %	40 %	344199183
554	NC_015942	CGCTG	2	10	1040403	1040412	0 %	20 %	40 %	40 %	344199184
555	NC_015942	AAGTG	2	10	1040627	1040636	40 %	20 %	40 %	0 %	344199185
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558	NC_015942	TCACC	2	10	1049660	1049669	20 %	20 %	0 %	60 %	344199193
559	NC_015942	GGGCC	2	10	1050875	1050884	0 %	0 %	60 %	40 %	344199194
560	NC_015942	GAAAA	2	10	1050903	1050912	80 %	0 %	20 %	0 %	344199194
561	NC_015942	CATGA	2	10	1057141	1057150	40 %	20 %	20 %	20 %	344199199
562	NC_015942	TTATT	2	10	1058820	1058829	20 %	80 %	0 %	0 %	344199202
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564	NC_015942	CACAG	2	10	1066424	1066433	40 %	0 %	20 %	40 %	344199211
565	NC_015942	CGCGG	2	10	1066610	1066619	0 %	0 %	60 %	40 %	344199211
566	NC_015942	GCAAT	2	10	1066834	1066843	40 %	20 %	20 %	20 %	344199211
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572	NC_015942	CGCGG	2	10	1077473	1077482	0 %	0 %	60 %	40 %	344199224
573	NC_015942	ATGGC	2	10	1078560	1078569	20 %	20 %	40 %	20 %	344199225
574	NC_015942	CAGCG	2	10	1088744	1088753	20 %	0 %	40 %	40 %	344199235
575	NC_015942	GCCGG	2	10	1089778	1089787	0 %	0 %	60 %	40 %	344199237
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577	NC_015942	GCCGC	2	10	1091782	1091791	0 %	0 %	40 %	60 %	344199239
578	NC_015942	CTCGC	2	10	1097055	1097064	0 %	20 %	20 %	60 %	344199243
579	NC_015942	GATCA	2	10	1097237	1097246	40 %	20 %	20 %	20 %	344199243
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587	NC_015942	TTTTG	2	10	1106053	1106062	0 %	80 %	20 %	0 %	344199252
588	NC_015942	TCTTT	2	10	1106250	1106259	0 %	80 %	0 %	20 %	344199252
589	NC_015942	TCGGT	2	10	1106334	1106343	0 %	40 %	40 %	20 %	344199252
590	NC_015942	CCGCT	2	10	1108707	1108716	0 %	20 %	20 %	60 %	344199254
591	NC_015942	GCGCG	2	10	1110044	1110053	0 %	0 %	60 %	40 %	344199254
592	NC_015942	CTGCG	2	10	1111303	1111312	0 %	20 %	40 %	40 %	344199255
593	NC_015942	GACCT	2	10	1111432	1111441	20 %	20 %	20 %	40 %	344199255
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596	NC_015942	GCCGT	2	10	1118179	1118188	0 %	20 %	40 %	40 %	344199258
597	NC_015942	CGTGC	2	10	1119132	1119141	0 %	20 %	40 %	40 %	344199259
598	NC_015942	GGCGC	2	10	1121253	1121262	0 %	0 %	60 %	40 %	344199260
599	NC_015942	CGGCG	2	10	1121576	1121585	0 %	0 %	60 %	40 %	344199261
600	NC_015942	AGAAA	2	10	1123033	1123042	80 %	0 %	20 %	0 %	344199262
601	NC_015942	CGGGC	2	10	1123289	1123298	0 %	0 %	60 %	40 %	344199263
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605	NC_015942	TCCTG	2	10	1130028	1130037	0 %	40 %	20 %	40 %	344199272
606	NC_015942	GCGGG	2	10	1133052	1133061	0 %	0 %	80 %	20 %	344199278
607	NC_015942	CTCCG	2	10	1134661	1134670	0 %	20 %	20 %	60 %	344199280
608	NC_015942	CGCGG	2	10	1135921	1135930	0 %	0 %	60 %	40 %	344199281
609	NC_015942	CGCGA	2	10	1136592	1136601	20 %	0 %	40 %	40 %	344199282
610	NC_015942	CGTGC	2	10	1139100	1139109	0 %	20 %	40 %	40 %	344199285
611	NC_015942	CGGCG	2	10	1141564	1141573	0 %	0 %	60 %	40 %	344199289
612	NC_015942	GGGTT	2	10	1141823	1141832	0 %	40 %	60 %	0 %	344199289
613	NC_015942	GCGCC	2	10	1143281	1143290	0 %	0 %	40 %	60 %	344199290
614	NC_015942	CAGGG	2	10	1145220	1145229	20 %	0 %	60 %	20 %	344199291
615	NC_015942	GGCCG	2	10	1146659	1146668	0 %	0 %	60 %	40 %	344199293
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622	NC_015942	GTGCC	2	10	1154545	1154554	0 %	20 %	40 %	40 %	344199300
623	NC_015942	ATATC	2	10	1157527	1157536	40 %	40 %	0 %	20 %	344199306
624	NC_015942	AAAGG	2	10	1157930	1157939	60 %	0 %	40 %	0 %	344199307
625	NC_015942	ACCGG	2	10	1159653	1159662	20 %	0 %	40 %	40 %	344199311
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