MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 1723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015942	GCCCT	2	10	1859889	1859898	0 %	20 %	20 %	60 %	344199999
1002	NC_015942	AGTCC	2	10	1860327	1860336	20 %	20 %	20 %	40 %	344199999
1003	NC_015942	GAATG	2	10	1860815	1860824	40 %	20 %	40 %	0 %	344199999
1004	NC_015942	TGATT	2	10	1860989	1860998	20 %	60 %	20 %	0 %	344199999
1005	NC_015942	CGCCA	2	10	1866701	1866710	20 %	0 %	20 %	60 %	344200004
1006	NC_015942	GCCAC	2	10	1878898	1878907	20 %	0 %	20 %	60 %	344200017
1007	NC_015942	ATCAC	2	10	1879080	1879089	40 %	20 %	0 %	40 %	344200017
1008	NC_015942	CATTC	2	10	1880713	1880722	20 %	40 %	0 %	40 %	344200019
1009	NC_015942	GCCCT	2	10	1880881	1880890	0 %	20 %	20 %	60 %	344200019
1010	NC_015942	GTGGC	2	10	1880953	1880962	0 %	20 %	60 %	20 %	344200019
1011	NC_015942	AACCA	2	10	1881182	1881191	60 %	0 %	0 %	40 %	344200019
1012	NC_015942	CTGTG	2	10	1881371	1881380	0 %	40 %	40 %	20 %	344200020
1013	NC_015942	CGCGC	2	10	1881934	1881943	0 %	0 %	40 %	60 %	344200020
1014	NC_015942	TGCCC	2	10	1884326	1884335	0 %	20 %	20 %	60 %	344200022
1015	NC_015942	AAACA	2	10	1886716	1886725	80 %	0 %	0 %	20 %	344200023
1016	NC_015942	TGCTG	2	10	1887085	1887094	0 %	40 %	40 %	20 %	344200023
1017	NC_015942	GCTGG	2	10	1888917	1888926	0 %	20 %	60 %	20 %	344200025
1018	NC_015942	TCAGA	2	10	1890270	1890279	40 %	20 %	20 %	20 %	344200027
1019	NC_015942	ACCGC	2	10	1893315	1893324	20 %	0 %	20 %	60 %	344200030
1020	NC_015942	ATCTC	2	10	1893781	1893790	20 %	40 %	0 %	40 %	344200031
1021	NC_015942	TGCCC	2	10	1895088	1895097	0 %	20 %	20 %	60 %	344200032
1022	NC_015942	TCCGG	2	10	1896086	1896095	0 %	20 %	40 %	40 %	344200035
1023	NC_015942	CAGAT	2	10	1896733	1896742	40 %	20 %	20 %	20 %	344200035
1024	NC_015942	CCGGC	2	10	1897778	1897787	0 %	0 %	40 %	60 %	344200035
1025	NC_015942	TCGAT	2	10	1901891	1901900	20 %	40 %	20 %	20 %	344200039
1026	NC_015942	ATTTC	2	10	1903717	1903726	20 %	60 %	0 %	20 %	344200042
1027	NC_015942	CATCA	2	10	1906749	1906758	40 %	20 %	0 %	40 %	344200043
1028	NC_015942	CCGCA	2	10	1908237	1908246	20 %	0 %	20 %	60 %	344200043
1029	NC_015942	TTGGG	2	10	1911572	1911581	0 %	40 %	60 %	0 %	344200046
1030	NC_015942	ATCAA	2	10	1911625	1911634	60 %	20 %	0 %	20 %	344200046
1031	NC_015942	ACCCG	2	10	1914692	1914701	20 %	0 %	20 %	60 %	344200053
1032	NC_015942	GTCGG	2	10	1918019	1918028	0 %	20 %	60 %	20 %	344200056
1033	NC_015942	AAAAT	2	10	1919749	1919758	80 %	20 %	0 %	0 %	344200060
1034	NC_015942	CGCAG	2	10	1923844	1923853	20 %	0 %	40 %	40 %	344200062
1035	NC_015942	GGACC	2	10	1924141	1924150	20 %	0 %	40 %	40 %	344200062
1036	NC_015942	GGGCA	2	10	1925629	1925638	20 %	0 %	60 %	20 %	344200063
1037	NC_015942	CCCTG	2	10	1928250	1928259	0 %	20 %	20 %	60 %	344200068
1038	NC_015942	AATCC	2	10	1932097	1932106	40 %	20 %	0 %	40 %	344200071
1039	NC_015942	TTATC	2	10	1937227	1937236	20 %	60 %	0 %	20 %	344200073
1040	NC_015942	GACCA	2	10	1940678	1940687	40 %	0 %	20 %	40 %	344200076
1041	NC_015942	TGGCG	2	10	1941068	1941077	0 %	20 %	60 %	20 %	344200076
1042	NC_015942	TTTTC	2	10	1942176	1942185	0 %	80 %	0 %	20 %	344200077
1043	NC_015942	ATGGT	2	10	1949588	1949597	20 %	40 %	40 %	0 %	344200088
1044	NC_015942	GAGCA	2	10	1950071	1950080	40 %	0 %	40 %	20 %	344200089
1045	NC_015942	ACCCC	2	10	1952054	1952063	20 %	0 %	0 %	80 %	344200092
1046	NC_015942	CTGAT	2	10	1952208	1952217	20 %	40 %	20 %	20 %	344200092
1047	NC_015942	TTGAC	2	10	1953782	1953791	20 %	40 %	20 %	20 %	344200094
1048	NC_015942	GGTTC	2	10	1954135	1954144	0 %	40 %	40 %	20 %	344200095
1049	NC_015942	CATTC	2	10	1954259	1954268	20 %	40 %	0 %	40 %	344200096
1050	NC_015942	CCGTT	2	10	1954996	1955005	0 %	40 %	20 %	40 %	344200097
1051	NC_015942	GGCTT	2	10	1959306	1959315	0 %	40 %	40 %	20 %	344200101
1052	NC_015942	GTGGG	2	10	1961063	1961072	0 %	20 %	80 %	0 %	344200104
1053	NC_015942	TACTT	2	10	1962171	1962180	20 %	60 %	0 %	20 %	344200105
1054	NC_015942	AGGGA	2	10	1966767	1966776	40 %	0 %	60 %	0 %	344200110
1055	NC_015942	CGCAC	2	10	1972538	1972547	20 %	0 %	20 %	60 %	344200116
1056	NC_015942	ACAGC	2	10	1979498	1979507	40 %	0 %	20 %	40 %	344200122
1057	NC_015942	CAGCG	2	10	1979707	1979716	20 %	0 %	40 %	40 %	344200122
1058	NC_015942	CGCCA	2	10	1979932	1979941	20 %	0 %	20 %	60 %	344200123
1059	NC_015942	GGCAA	2	10	1980047	1980056	40 %	0 %	40 %	20 %	344200123
1060	NC_015942	CGCGC	2	10	1980517	1980526	0 %	0 %	40 %	60 %	344200123
1061	NC_015942	TGCCC	2	10	1981069	1981078	0 %	20 %	20 %	60 %	344200124
1062	NC_015942	GCTGG	2	10	1981387	1981396	0 %	20 %	60 %	20 %	344200124
1063	NC_015942	CGGTG	2	10	1981759	1981768	0 %	20 %	60 %	20 %	344200124
1064	NC_015942	GCGCG	2	10	1982380	1982389	0 %	0 %	60 %	40 %	344200125
1065	NC_015942	TCCGG	2	10	1987041	1987050	0 %	20 %	40 %	40 %	344200129
1066	NC_015942	GGAGA	2	10	1988314	1988323	40 %	0 %	60 %	0 %	344200129
1067	NC_015942	TCACC	2	10	1988521	1988530	20 %	20 %	0 %	60 %	344200130
1068	NC_015942	TGGAC	2	10	1991813	1991822	20 %	20 %	40 %	20 %	344200132
1069	NC_015942	TGCCC	2	10	1992259	1992268	0 %	20 %	20 %	60 %	344200133
1070	NC_015942	ACCTG	2	10	1994014	1994023	20 %	20 %	20 %	40 %	344200134
1071	NC_015942	CAGGA	2	10	1995910	1995919	40 %	0 %	40 %	20 %	344200136
1072	NC_015942	TGGCC	2	10	1997523	1997532	0 %	20 %	40 %	40 %	344200137
1073	NC_015942	TCGTC	2	10	1997974	1997983	0 %	40 %	20 %	40 %	344200138
1074	NC_015942	ACGCA	2	10	1998838	1998847	40 %	0 %	20 %	40 %	344200139
1075	NC_015942	CACAC	2	10	1998962	1998971	40 %	0 %	0 %	60 %	344200139
1076	NC_015942	GCCAC	2	10	1999236	1999245	20 %	0 %	20 %	60 %	344200140
1077	NC_015942	ATGGC	2	10	2000228	2000237	20 %	20 %	40 %	20 %	344200140
1078	NC_015942	GCGCG	2	10	2002662	2002671	0 %	0 %	60 %	40 %	344200142
1079	NC_015942	AGCGC	2	10	2004116	2004125	20 %	0 %	40 %	40 %	344200146
1080	NC_015942	CCGGC	2	10	2010150	2010159	0 %	0 %	40 %	60 %	344200152
1081	NC_015942	CACCC	2	10	2010613	2010622	20 %	0 %	0 %	80 %	344200153
1082	NC_015942	GGAAG	2	10	2015581	2015590	40 %	0 %	60 %	0 %	344200157
1083	NC_015942	GCGCC	2	10	2015855	2015864	0 %	0 %	40 %	60 %	344200158
1084	NC_015942	CATCC	2	10	2017157	2017166	20 %	20 %	0 %	60 %	344200159
1085	NC_015942	GCAAT	2	10	2017183	2017192	40 %	20 %	20 %	20 %	344200159
1086	NC_015942	CGATA	2	10	2019496	2019505	40 %	20 %	20 %	20 %	344200160
1087	NC_015942	GCGCG	2	10	2022210	2022219	0 %	0 %	60 %	40 %	344200162
1088	NC_015942	CAGTG	2	10	2023895	2023904	20 %	20 %	40 %	20 %	344200163
1089	NC_015942	CCGGA	2	10	2025936	2025945	20 %	0 %	40 %	40 %	344200166
1090	NC_015942	GCGCC	2	10	2028988	2028997	0 %	0 %	40 %	60 %	344200168
1091	NC_015942	CTGCG	2	10	2029385	2029394	0 %	20 %	40 %	40 %	344200168
1092	NC_015942	CGGCG	2	10	2029514	2029523	0 %	0 %	60 %	40 %	344200168
1093	NC_015942	TCCTG	2	10	2030235	2030244	0 %	40 %	20 %	40 %	344200168
1094	NC_015942	ATCTC	2	10	2032367	2032376	20 %	40 %	0 %	40 %	344200171
1095	NC_015942	ATCAG	2	10	2033103	2033112	40 %	20 %	20 %	20 %	344200172
1096	NC_015942	TGGCC	2	10	2034634	2034643	0 %	20 %	40 %	40 %	344200174
1097	NC_015942	CGACG	2	10	2036929	2036938	20 %	0 %	40 %	40 %	344200175
1098	NC_015942	GGGGT	2	10	2038414	2038423	0 %	20 %	80 %	0 %	344200178
1099	NC_015942	TTATT	2	10	2041321	2041330	20 %	80 %	0 %	0 %	344200183
1100	NC_015942	TGGCA	2	10	2042649	2042658	20 %	20 %	40 %	20 %	344200184
1101	NC_015942	AGCGC	2	10	2049332	2049341	20 %	0 %	40 %	40 %	344200193
1102	NC_015942	GGTGC	2	10	2051186	2051195	0 %	20 %	60 %	20 %	344200194
1103	NC_015942	CTGTA	2	10	2053272	2053281	20 %	40 %	20 %	20 %	344200195
1104	NC_015942	GCTGG	2	10	2053957	2053966	0 %	20 %	60 %	20 %	344200196
1105	NC_015942	TGCGG	2	10	2059226	2059235	0 %	20 %	60 %	20 %	344200198
1106	NC_015942	CGGCA	2	10	2059725	2059734	20 %	0 %	40 %	40 %	344200199
1107	NC_015942	CCGCG	2	10	2060582	2060591	0 %	0 %	40 %	60 %	344200200
1108	NC_015942	CTGCA	2	10	2061478	2061487	20 %	20 %	20 %	40 %	344200201
1109	NC_015942	GCATC	2	10	2068443	2068452	20 %	20 %	20 %	40 %	344200208
1110	NC_015942	TTGCG	2	10	2070356	2070365	0 %	40 %	40 %	20 %	344200211
1111	NC_015942	TGGTC	2	10	2071202	2071211	0 %	40 %	40 %	20 %	344200213
1112	NC_015942	ATTTT	2	10	2072754	2072763	20 %	80 %	0 %	0 %	344200215
1113	NC_015942	GTCCT	2	10	2073495	2073504	0 %	40 %	20 %	40 %	344200218
1114	NC_015942	GCCCC	2	10	2077714	2077723	0 %	0 %	20 %	80 %	344200226
1115	NC_015942	TGCGC	2	10	2078021	2078030	0 %	20 %	40 %	40 %	344200226
1116	NC_015942	CGCTG	2	10	2079828	2079837	0 %	20 %	40 %	40 %	344200229
1117	NC_015942	GTGAC	2	10	2082464	2082473	20 %	20 %	40 %	20 %	344200233
1118	NC_015942	AAAAG	2	10	2086658	2086667	80 %	0 %	20 %	0 %	344200236
1119	NC_015942	CGCGC	3	15	2087138	2087152	0 %	0 %	40 %	60 %	344200237
1120	NC_015942	CAGCA	2	10	2087933	2087942	40 %	0 %	20 %	40 %	344200238
1121	NC_015942	GCGCT	2	10	2088673	2088682	0 %	20 %	40 %	40 %	344200239
1122	NC_015942	CCCTC	2	10	2089636	2089645	0 %	20 %	0 %	80 %	344200239
1123	NC_015942	GCCAG	2	10	2091432	2091441	20 %	0 %	40 %	40 %	344200240
1124	NC_015942	CCCGG	2	10	2091758	2091767	0 %	0 %	40 %	60 %	344200240
1125	NC_015942	GTTGC	2	10	2094199	2094208	0 %	40 %	40 %	20 %	344200242
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1156	NC_015942	GCCCG	2	10	2142217	2142226	0 %	0 %	40 %	60 %	344200282
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1233	NC_015942	TGGAC	2	10	2268254	2268263	20 %	20 %	40 %	20 %	344200399
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1235	NC_015942	CACGG	2	10	2271970	2271979	20 %	0 %	40 %	40 %	344200403
1236	NC_015942	AAGGC	2	10	2272211	2272220	40 %	0 %	40 %	20 %	344200403
1237	NC_015942	TCAGC	2	10	2273949	2273958	20 %	20 %	20 %	40 %	344200405
1238	NC_015942	TGACA	2	10	2276256	2276265	40 %	20 %	20 %	20 %	344200407
1239	NC_015942	CACCC	2	10	2278080	2278089	20 %	0 %	0 %	80 %	344200408
1240	NC_015942	GAACG	2	10	2279723	2279732	40 %	0 %	40 %	20 %	344200410
1241	NC_015942	TGCGC	2	10	2280013	2280022	0 %	20 %	40 %	40 %	344200410
1242	NC_015942	GCGTG	2	10	2282728	2282737	0 %	20 %	60 %	20 %	344200413
1243	NC_015942	GCCAG	2	10	2284487	2284496	20 %	0 %	40 %	40 %	344200414
1244	NC_015942	GGCGC	2	10	2285342	2285351	0 %	0 %	60 %	40 %	344200414
1245	NC_015942	AGCGC	2	10	2286427	2286436	20 %	0 %	40 %	40 %	344200414
1246	NC_015942	ATCGC	2	10	2288589	2288598	20 %	20 %	20 %	40 %	344200415
1247	NC_015942	TGCCT	2	10	2289592	2289601	0 %	40 %	20 %	40 %	344200415
1248	NC_015942	GCATC	2	10	2289973	2289982	20 %	20 %	20 %	40 %	344200415
1249	NC_015942	CTGGA	2	10	2292020	2292029	20 %	20 %	40 %	20 %	344200417
1250	NC_015942	GGGCG	2	10	2293301	2293310	0 %	0 %	80 %	20 %	344200417
1251	NC_015942	GGCAA	2	10	2293394	2293403	40 %	0 %	40 %	20 %	344200417
1252	NC_015942	ACGAC	2	10	2294565	2294574	40 %	0 %	20 %	40 %	344200419
1253	NC_015942	GATTG	2	10	2301914	2301923	20 %	40 %	40 %	0 %	344200425
1254	NC_015942	CTGCC	2	10	2307143	2307152	0 %	20 %	20 %	60 %	344200429
1255	NC_015942	AATAC	2	10	2307960	2307969	60 %	20 %	0 %	20 %	344200430
1256	NC_015942	GGTAG	2	10	2309150	2309159	20 %	20 %	60 %	0 %	344200431
1257	NC_015942	CCGCC	2	10	2311346	2311355	0 %	0 %	20 %	80 %	344200432
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1259	NC_015942	TTGGC	2	10	2315627	2315636	0 %	40 %	40 %	20 %	344200434
1260	NC_015942	CTCCC	2	10	2315998	2316007	0 %	20 %	0 %	80 %	344200435
1261	NC_015942	GGCCG	2	10	2321463	2321472	0 %	0 %	60 %	40 %	344200437
1262	NC_015942	TACGC	2	10	2325866	2325875	20 %	20 %	20 %	40 %	344200441
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1264	NC_015942	GCTTG	2	10	2333258	2333267	0 %	40 %	40 %	20 %	344200447
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1272	NC_015942	ATTGC	2	10	2348676	2348685	20 %	40 %	20 %	20 %	344200458
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1280	NC_015942	TACCG	2	10	2376605	2376614	20 %	20 %	20 %	40 %	344200474
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1282	NC_015942	TGGAC	2	10	2377616	2377625	20 %	20 %	40 %	20 %	344200474
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1314	NC_015942	GCGGT	2	10	2443057	2443066	0 %	20 %	60 %	20 %	344200538
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1316	NC_015942	GCCTG	2	10	2445330	2445339	0 %	20 %	40 %	40 %	344200539
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1320	NC_015942	TGCCC	2	10	2451466	2451475	0 %	20 %	20 %	60 %	344200548
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1322	NC_015942	CGTCA	2	10	2452139	2452148	20 %	20 %	20 %	40 %	344200548
1323	NC_015942	CCGGG	3	15	2452395	2452409	0 %	0 %	60 %	40 %	344200549
1324	NC_015942	GCACC	2	10	2453514	2453523	20 %	0 %	20 %	60 %	344200549
1325	NC_015942	CGGCG	2	10	2454238	2454247	0 %	0 %	60 %	40 %	344200550
1326	NC_015942	CCCGC	2	10	2455961	2455970	0 %	0 %	20 %	80 %	344200550
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1329	NC_015942	GCCAA	2	10	2459136	2459145	40 %	0 %	20 %	40 %	344200555
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1332	NC_015942	GCCGC	2	10	2463174	2463183	0 %	0 %	40 %	60 %	344200559
1333	NC_015942	CCGCA	2	10	2465516	2465525	20 %	0 %	20 %	60 %	344200561
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1341	NC_015942	GCGCA	2	10	2480490	2480499	20 %	0 %	40 %	40 %	344200579
1342	NC_015942	ACTGA	2	10	2482677	2482686	40 %	20 %	20 %	20 %	344200581
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1345	NC_015942	CCCAA	2	10	2491226	2491235	40 %	0 %	0 %	60 %	344200588
1346	NC_015942	CTGGT	2	10	2492139	2492148	0 %	40 %	40 %	20 %	344200589
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1352	NC_015942	GAAGC	2	10	2503807	2503816	40 %	0 %	40 %	20 %	344200604
1353	NC_015942	GAATG	2	10	2504357	2504366	40 %	20 %	40 %	0 %	344200605
1354	NC_015942	GCAGC	2	10	2504637	2504646	20 %	0 %	40 %	40 %	344200605
1355	NC_015942	GCCAT	2	10	2504710	2504719	20 %	20 %	20 %	40 %	344200605
1356	NC_015942	GCGCC	2	10	2506275	2506284	0 %	0 %	40 %	60 %	344200606
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1359	NC_015942	GCCGC	2	10	2511320	2511329	0 %	0 %	40 %	60 %	344200612
1360	NC_015942	GCGTA	2	10	2511658	2511667	20 %	20 %	40 %	20 %	344200613
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1362	NC_015942	CGGCG	2	10	2515261	2515270	0 %	0 %	60 %	40 %	344200617
1363	NC_015942	GTAGC	2	10	2518997	2519006	20 %	20 %	40 %	20 %	344200620
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1365	NC_015942	ACCGG	2	10	2520854	2520863	20 %	0 %	40 %	40 %	344200622
1366	NC_015942	CAGCT	2	10	2521444	2521453	20 %	20 %	20 %	40 %	344200622
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1368	NC_015942	AGGCC	2	10	2524569	2524578	20 %	0 %	40 %	40 %	344200627
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1370	NC_015942	GCCAG	2	10	2528516	2528525	20 %	0 %	40 %	40 %	344200630
1371	NC_015942	AGGCC	2	10	2529710	2529719	20 %	0 %	40 %	40 %	344200631
1372	NC_015942	CCGGC	2	10	2531733	2531742	0 %	0 %	40 %	60 %	344200633
1373	NC_015942	AAATA	2	10	2533169	2533178	80 %	20 %	0 %	0 %	344200635
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1383	NC_015942	CCAAA	2	10	2554395	2554404	60 %	0 %	0 %	40 %	344200652
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1402	NC_015942	CGCTT	2	10	2606853	2606862	0 %	40 %	20 %	40 %	344200701
1403	NC_015942	ATATT	2	10	2617886	2617895	40 %	60 %	0 %	0 %	344200709
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1488	NC_015942	CGCAA	2	10	2775258	2775267	40 %	0 %	20 %	40 %	344200881
1489	NC_015942	CCTGG	2	10	2777407	2777416	0 %	20 %	40 %	40 %	344200883
1490	NC_015942	AGCAC	2	10	2779948	2779957	40 %	0 %	20 %	40 %	344200886
1491	NC_015942	TGCGT	2	10	2780024	2780033	0 %	40 %	40 %	20 %	344200886
1492	NC_015942	CGACC	2	10	2780118	2780127	20 %	0 %	20 %	60 %	344200886
1493	NC_015942	CAGGC	2	10	2780990	2780999	20 %	0 %	40 %	40 %	344200887
1494	NC_015942	ACACC	2	10	2783367	2783376	40 %	0 %	0 %	60 %	344200889
1495	NC_015942	CGCCT	2	10	2787721	2787730	0 %	20 %	20 %	60 %	344200892
1496	NC_015942	GAGGC	2	10	2789110	2789119	20 %	0 %	60 %	20 %	344200893
1497	NC_015942	GCTGG	2	10	2790048	2790057	0 %	20 %	60 %	20 %	344200894
1498	NC_015942	GCGCG	2	10	2790562	2790571	0 %	0 %	60 %	40 %	344200895
1499	NC_015942	ATGAA	2	10	2794432	2794441	60 %	20 %	20 %	0 %	344200899
1500	NC_015942	CACCC	2	10	2795177	2795186	20 %	0 %	0 %	80 %	344200899

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