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Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4c

Total Repeats: 2451

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011984	CCG	2	6	211	216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083146
2	NC_011984	TCG	2	6	244	249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083146
3	NC_011984	GCC	2	6	256	261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083146
4	NC_011984	ACA	2	6	338	343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083146
5	NC_011984	CGC	2	6	346	351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083146
6	NC_011984	TCA	2	6	458	463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083146
7	NC_011984	CGT	2	6	465	470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083146
8	NC_011984	GGT	2	6	481	486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083146
9	NC_011984	ACG	2	6	653	658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083146
10	NC_011984	CGT	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083146
11	NC_011984	TCA	2	6	683	688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083146
12	NC_011984	AGA	2	6	689	694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083146
13	NC_011984	TCT	2	6	794	799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083146
14	NC_011984	ATG	2	6	842	847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083146
15	NC_011984	TCT	2	6	969	974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083146
16	NC_011984	GCT	2	6	987	992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083146
17	NC_011984	CGT	2	6	996	1001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083146
18	NC_011984	TGG	2	6	1011	1016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083146
19	NC_011984	ATC	2	6	1130	1135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083146
20	NC_011984	GTG	2	6	1497	1502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083147
21	NC_011984	GCC	2	6	1725	1730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083147
22	NC_011984	GCC	2	6	1748	1753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083147
23	NC_011984	GGC	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083147
24	NC_011984	GAG	2	6	1793	1798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083147
25	NC_011984	GGC	2	6	1912	1917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083147
26	NC_011984	GCT	2	6	1934	1939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083147
27	NC_011984	ATT	2	6	1982	1987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222083147
28	NC_011984	GAT	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083147
29	NC_011984	TCT	2	6	2111	2116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083147
30	NC_011984	CGG	2	6	2190	2195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083147
31	NC_011984	GAC	3	9	2225	2233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083147
32	NC_011984	GCG	2	6	2264	2269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083147
33	NC_011984	TGA	2	6	2289	2294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083147
34	NC_011984	GAA	2	6	2351	2356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083147
35	NC_011984	ACG	2	6	2805	2810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083148
36	NC_011984	TCG	2	6	2833	2838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083148
37	NC_011984	AGG	2	6	2900	2905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083148
38	NC_011984	TCG	2	6	2944	2949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083148
39	NC_011984	CTG	2	6	3033	3038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083148
40	NC_011984	GAT	2	6	3056	3061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083148
41	NC_011984	TAG	2	6	3163	3168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083148
42	NC_011984	AGG	2	6	3449	3454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083148
43	NC_011984	GCA	2	6	3483	3488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083148
44	NC_011984	AGC	2	6	3559	3564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083148
45	NC_011984	CCA	2	6	3568	3573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083148
46	NC_011984	GGC	2	6	3581	3586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083148
47	NC_011984	CAA	2	6	3611	3616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083148
48	NC_011984	GTG	2	6	3827	3832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083148
49	NC_011984	TTC	2	6	3903	3908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083149
50	NC_011984	GGA	2	6	3911	3916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083149
51	NC_011984	GCC	2	6	3932	3937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083149
52	NC_011984	GGA	2	6	4004	4009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083149
53	NC_011984	TCA	2	6	4030	4035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083149
54	NC_011984	CCA	2	6	4099	4104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083149
55	NC_011984	GCT	2	6	4153	4158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083149
56	NC_011984	CGC	2	6	4346	4351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083149
57	NC_011984	CTC	2	6	4483	4488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083149
58	NC_011984	TGG	2	6	4742	4747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083149
59	NC_011984	GTC	2	6	6179	6184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083150
60	NC_011984	GCT	2	6	6224	6229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083150
61	NC_011984	ATC	2	6	6230	6235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083150
62	NC_011984	ATC	2	6	6278	6283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083150
63	NC_011984	ACC	2	6	6284	6289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083150
64	NC_011984	GGA	2	6	6367	6372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083150
65	NC_011984	GAG	2	6	6383	6388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083150
66	NC_011984	TCT	2	6	6583	6588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083150
67	NC_011984	CAT	2	6	6602	6607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083150
68	NC_011984	GCA	2	6	6636	6641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083150
69	NC_011984	TCA	2	6	6642	6647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083150
70	NC_011984	GGC	2	6	6652	6657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083150
71	NC_011984	CGA	2	6	6757	6762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083150
72	NC_011984	GAG	2	6	6992	6997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083150
73	NC_011984	CAA	2	6	7053	7058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083150
74	NC_011984	GAT	2	6	7087	7092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083150
75	NC_011984	CCT	2	6	7141	7146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083150
76	NC_011984	CGC	2	6	7168	7173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083150
77	NC_011984	CGC	2	6	7177	7182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083150
78	NC_011984	CGC	3	9	7543	7551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083151
79	NC_011984	CGG	2	6	7792	7797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083151
80	NC_011984	CAG	2	6	8037	8042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083151
81	NC_011984	GAT	2	6	8100	8105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083151
82	NC_011984	CCT	2	6	8123	8128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083151
83	NC_011984	AAT	2	6	8222	8227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222083151
84	NC_011984	GAG	2	6	8239	8244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083151
85	NC_011984	CAC	2	6	8374	8379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083151
86	NC_011984	GGC	2	6	8433	8438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083151
87	NC_011984	TGG	2	6	8484	8489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083151
88	NC_011984	TCG	2	6	8494	8499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083151
89	NC_011984	CCG	2	6	8525	8530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083151
90	NC_011984	GCG	2	6	8537	8542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083151
91	NC_011984	GAT	2	6	8619	8624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083151
92	NC_011984	CCT	2	6	8858	8863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083152
93	NC_011984	CGC	2	6	8865	8870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083152
94	NC_011984	CGA	2	6	8892	8897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083152
95	NC_011984	GCC	2	6	8913	8918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083152
96	NC_011984	GCT	2	6	8927	8932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083152
97	NC_011984	GAA	2	6	8995	9000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083152
98	NC_011984	TTG	2	6	9022	9027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083152
99	NC_011984	TGA	2	6	9039	9044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083152
100	NC_011984	CAC	2	6	9108	9113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083152
101	NC_011984	GCT	2	6	9138	9143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083152
102	NC_011984	GAC	2	6	9157	9162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083152
103	NC_011984	TCG	2	6	9185	9190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083152
104	NC_011984	AGC	2	6	9213	9218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083152
105	NC_011984	GCT	2	6	9342	9347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083152
106	NC_011984	GGT	2	6	9385	9390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083152
107	NC_011984	TGG	2	6	9446	9451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083152
108	NC_011984	CCG	2	6	9492	9497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083152
109	NC_011984	GTT	2	6	9507	9512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083152
110	NC_011984	CCG	2	6	9558	9563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083152
111	NC_011984	CGA	2	6	9573	9578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083152
112	NC_011984	GTT	2	6	9633	9638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083152
113	NC_011984	CTC	2	6	9684	9689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083152
114	NC_011984	CGG	2	6	9984	9989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083153
115	NC_011984	GCA	2	6	9993	9998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083153
116	NC_011984	CCG	2	6	10061	10066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083153
117	NC_011984	AAG	2	6	10154	10159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083153
118	NC_011984	GAC	2	6	10251	10256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083153
119	NC_011984	CTG	2	6	10333	10338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083153
120	NC_011984	CGC	2	6	10365	10370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083153
121	NC_011984	GGC	2	6	10378	10383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083153
122	NC_011984	GTC	2	6	10428	10433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083154
123	NC_011984	GAA	2	6	10513	10518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083154
124	NC_011984	GCA	2	6	10519	10524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083154
125	NC_011984	GAC	2	6	10592	10597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083154
126	NC_011984	GGC	2	6	10604	10609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083154
127	NC_011984	TGC	2	6	10721	10726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083154
128	NC_011984	GCA	2	6	10745	10750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083154
129	NC_011984	CGC	2	6	10938	10943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083155
130	NC_011984	GTC	2	6	10951	10956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083155
131	NC_011984	AGC	2	6	11209	11214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083156
132	NC_011984	CCG	2	6	11268	11273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083156
133	NC_011984	GCC	2	6	11457	11462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083156
134	NC_011984	GAT	2	6	11521	11526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083156
135	NC_011984	CTG	2	6	11584	11589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083156
136	NC_011984	CTA	2	6	11697	11702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083156
137	NC_011984	CGA	3	9	11715	11723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083156
138	NC_011984	CTG	2	6	11743	11748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083156
139	NC_011984	TCG	2	6	13904	13909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083157
140	NC_011984	CCT	2	6	13974	13979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083157
141	NC_011984	CTT	2	6	14056	14061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083157
142	NC_011984	CGA	2	6	14188	14193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083157
143	NC_011984	GCG	2	6	14212	14217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083157
144	NC_011984	TCT	2	6	14232	14237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083157
145	NC_011984	GTC	2	6	14240	14245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083157
146	NC_011984	ATC	2	6	14494	14499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083158
147	NC_011984	TAA	2	6	14553	14558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222083158
148	NC_011984	CGG	2	6	14622	14627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083158
149	NC_011984	CCG	2	6	14670	14675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083158
150	NC_011984	CAA	2	6	14793	14798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083158
151	NC_011984	GAA	2	6	17072	17077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083159
152	NC_011984	CGA	2	6	17123	17128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083159
153	NC_011984	GAC	2	6	17201	17206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083159
154	NC_011984	TCA	2	6	17293	17298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083159
155	NC_011984	ATC	2	6	17475	17480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083159
156	NC_011984	TGC	2	6	17502	17507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083159
157	NC_011984	AGA	2	6	17517	17522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083159
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159	NC_011984	TCG	2	6	17619	17624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083159
160	NC_011984	GGT	2	6	17914	17919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083159
161	NC_011984	TGA	2	6	18121	18126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083160
162	NC_011984	TGA	3	9	18217	18225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083160
163	NC_011984	CGG	2	6	18233	18238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083160
164	NC_011984	CAC	2	6	18251	18256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083160
165	NC_011984	GCC	2	6	18363	18368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083160
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169	NC_011984	GGC	2	6	18917	18922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083161
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171	NC_011984	TCA	2	6	18966	18971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083161
172	NC_011984	CGG	2	6	19018	19023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083161
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175	NC_011984	GGT	2	6	19396	19401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083161
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184	NC_011984	GCG	2	6	22424	22429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083163
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188	NC_011984	CGC	2	6	22656	22661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083163
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200	NC_011984	TCC	2	6	24323	24328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083164
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