MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4c

Total Repeats: 2451

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011984	GAT	2	6	133914	133919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083251
1502	NC_011984	CGA	2	6	133961	133966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083251
1503	NC_011984	CGG	2	6	133987	133992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083251
1504	NC_011984	CCG	2	6	134120	134125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083252
1505	NC_011984	AAG	2	6	134185	134190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083252
1506	NC_011984	TCG	2	6	134321	134326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083252
1507	NC_011984	GGC	2	6	134463	134468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083252
1508	NC_011984	CCG	2	6	134593	134598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083253
1509	NC_011984	TGC	2	6	134686	134691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083253
1510	NC_011984	CGG	2	6	134698	134703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083253
1511	NC_011984	GCG	2	6	134704	134709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083253
1512	NC_011984	CGA	2	6	134795	134800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083253
1513	NC_011984	GCT	2	6	134802	134807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083253
1514	NC_011984	GCA	2	6	134887	134892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083253
1515	NC_011984	CGT	2	6	134936	134941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083253
1516	NC_011984	CCG	2	6	134953	134958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083253
1517	NC_011984	CGG	2	6	134963	134968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083253
1518	NC_011984	TGC	2	6	135010	135015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083253
1519	NC_011984	GGC	2	6	135024	135029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083253
1520	NC_011984	GCG	2	6	135098	135103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083253
1521	NC_011984	GTG	2	6	135234	135239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083253
1522	NC_011984	ATC	3	9	135259	135267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083253
1523	NC_011984	GAT	2	6	135281	135286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083253
1524	NC_011984	CGG	2	6	135296	135301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083253
1525	NC_011984	CAT	2	6	135312	135317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083253
1526	NC_011984	CGA	2	6	135320	135325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083253
1527	NC_011984	TGC	2	6	135398	135403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083253
1528	NC_011984	GGA	2	6	135439	135444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083253
1529	NC_011984	ATG	2	6	135452	135457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083253
1530	NC_011984	TCT	3	9	135472	135480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083254
1531	NC_011984	CAT	2	6	135515	135520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083254
1532	NC_011984	TGC	2	6	135531	135536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083254
1533	NC_011984	CGA	2	6	135634	135639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083254
1534	NC_011984	CCG	2	6	135679	135684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083254
1535	NC_011984	GCG	2	6	135728	135733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083254
1536	NC_011984	CGC	2	6	135736	135741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083254
1537	NC_011984	CGA	2	6	135775	135780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083254
1538	NC_011984	CCG	2	6	135815	135820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083254
1539	NC_011984	ATC	2	6	135821	135826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083254
1540	NC_011984	CAG	2	6	135841	135846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083254
1541	NC_011984	ACG	2	6	135906	135911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083254
1542	NC_011984	CCG	2	6	135917	135922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083254
1543	NC_011984	AGG	3	9	135933	135941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083254
1544	NC_011984	GCG	2	6	135959	135964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083254
1545	NC_011984	GAC	2	6	136025	136030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083254
1546	NC_011984	TGC	2	6	136038	136043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083254
1547	NC_011984	GCC	2	6	136722	136727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083255
1548	NC_011984	CCA	2	6	136761	136766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083255
1549	NC_011984	TCG	2	6	136881	136886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083255
1550	NC_011984	TCG	2	6	136950	136955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083255
1551	NC_011984	CGA	2	6	137053	137058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083255
1552	NC_011984	GCC	2	6	137090	137095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083255
1553	NC_011984	CGC	2	6	137113	137118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083255
1554	NC_011984	CGC	2	6	137152	137157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083255
1555	NC_011984	TTG	2	6	137187	137192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083255
1556	NC_011984	GGC	2	6	137254	137259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083255
1557	NC_011984	CGT	2	6	137816	137821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083256
1558	NC_011984	GCG	2	6	137882	137887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083256
1559	NC_011984	CGT	2	6	137892	137897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083256
1560	NC_011984	TAT	2	6	138022	138027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222083256
1561	NC_011984	CTT	2	6	138081	138086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083256
1562	NC_011984	ACA	2	6	138089	138094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083256
1563	NC_011984	GTC	2	6	138103	138108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083256
1564	NC_011984	CGG	2	6	138114	138119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083256
1565	NC_011984	TAT	2	6	138130	138135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222083256
1566	NC_011984	CCG	2	6	138282	138287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083256
1567	NC_011984	GAA	2	6	138301	138306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083256
1568	NC_011984	GCC	2	6	138385	138390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083256
1569	NC_011984	GCG	3	9	138445	138453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083256
1570	NC_011984	CCG	2	6	138503	138508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083256
1571	NC_011984	AGG	2	6	138512	138517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083256
1572	NC_011984	GGA	2	6	138551	138556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083257
1573	NC_011984	TCC	2	6	138561	138566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083257
1574	NC_011984	CCA	3	9	138610	138618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083257
1575	NC_011984	TCG	2	6	138901	138906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083257
1576	NC_011984	ATG	2	6	138951	138956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083257
1577	NC_011984	TTG	2	6	139014	139019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083257
1578	NC_011984	GCC	2	6	139401	139406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083257
1579	NC_011984	CAC	2	6	140152	140157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083258
1580	NC_011984	CAT	2	6	140173	140178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083258
1581	NC_011984	CCG	2	6	140268	140273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083258
1582	NC_011984	ACG	2	6	140316	140321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083258
1583	NC_011984	CGA	2	6	140347	140352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083258
1584	NC_011984	GCC	2	6	140843	140848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083259
1585	NC_011984	CGG	2	6	140855	140860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083259
1586	NC_011984	GGC	2	6	140908	140913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083259
1587	NC_011984	CCT	2	6	140929	140934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083259
1588	NC_011984	AGG	2	6	140939	140944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083259
1589	NC_011984	CTT	2	6	141030	141035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083260
1590	NC_011984	CGC	2	6	141039	141044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083260
1591	NC_011984	TCG	2	6	141053	141058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083260
1592	NC_011984	CGA	2	6	141182	141187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083260
1593	NC_011984	TGC	2	6	141406	141411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083261
1594	NC_011984	CGT	2	6	141429	141434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083261
1595	NC_011984	GAT	2	6	141481	141486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083261
1596	NC_011984	CAT	2	6	141497	141502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083261
1597	NC_011984	GCC	2	6	141509	141514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083261
1598	NC_011984	CCG	2	6	141552	141557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083261
1599	NC_011984	TCG	2	6	141999	142004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083262
1600	NC_011984	AGA	2	6	142041	142046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083262
1601	NC_011984	GCC	2	6	142065	142070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083262
1602	NC_011984	CGA	2	6	142174	142179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083262
1603	NC_011984	GCG	2	6	142190	142195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083262
1604	NC_011984	CAC	2	6	142201	142206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083262
1605	NC_011984	CAC	2	6	142256	142261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083262
1606	NC_011984	CAT	2	6	142271	142276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083262
1607	NC_011984	CGC	2	6	142297	142302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083263
1608	NC_011984	CTG	2	6	142321	142326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083263
1609	NC_011984	TCC	2	6	142385	142390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083263
1610	NC_011984	CGG	2	6	142462	142467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083263
1611	NC_011984	GTG	2	6	142548	142553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083263
1612	NC_011984	ATC	2	6	142622	142627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083263
1613	NC_011984	TCC	2	6	142656	142661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083263
1614	NC_011984	CCG	2	6	142747	142752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083264
1615	NC_011984	GCG	2	6	142805	142810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083264
1616	NC_011984	TCG	2	6	142837	142842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083264
1617	NC_011984	CGG	2	6	142882	142887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083264
1618	NC_011984	GCT	2	6	142892	142897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083264
1619	NC_011984	CGA	2	6	142911	142916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083264
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1973	NC_011984	TCA	2	6	173450	173455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083287
1974	NC_011984	TCG	2	6	173495	173500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083287
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1978	NC_011984	TCG	2	6	173705	173710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083287
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2000	NC_011984	CGC	2	6	174722	174727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083289

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