MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4c

Total Repeats: 2451

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011984	CGA	2	6	95993	95998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083224
1002	NC_011984	CGG	2	6	96008	96013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083224
1003	NC_011984	GTG	2	6	96035	96040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083224
1004	NC_011984	TGC	2	6	96085	96090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083224
1005	NC_011984	CGA	2	6	96229	96234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083224
1006	NC_011984	GAT	2	6	96287	96292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083224
1007	NC_011984	TGA	2	6	96340	96345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083224
1008	NC_011984	GAA	2	6	96381	96386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083224
1009	NC_011984	GGC	2	6	96420	96425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083224
1010	NC_011984	CTT	2	6	96446	96451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083224
1011	NC_011984	CGG	2	6	96518	96523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083224
1012	NC_011984	GCC	2	6	96584	96589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083224
1013	NC_011984	CGA	2	6	96620	96625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083224
1014	NC_011984	CGC	2	6	96658	96663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083224
1015	NC_011984	GAT	2	6	96689	96694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083224
1016	NC_011984	GAC	2	6	96864	96869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083224
1017	NC_011984	CGA	2	6	96920	96925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083224
1018	NC_011984	CCG	2	6	96941	96946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083224
1019	NC_011984	GAC	2	6	96992	96997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083224
1020	NC_011984	GAA	2	6	97046	97051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083224
1021	NC_011984	GCT	2	6	97057	97062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083224
1022	NC_011984	GTC	2	6	97077	97082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083224
1023	NC_011984	CGC	2	6	97084	97089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083224
1024	NC_011984	GCT	2	6	97212	97217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083224
1025	NC_011984	GCC	2	6	97221	97226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083224
1026	NC_011984	CGG	2	6	97247	97252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083224
1027	NC_011984	CAT	2	6	97254	97259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083224
1028	NC_011984	CAT	2	6	97292	97297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083224
1029	NC_011984	CAA	2	6	97334	97339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083224
1030	NC_011984	CGG	2	6	97463	97468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083224
1031	NC_011984	CTG	2	6	97488	97493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083224
1032	NC_011984	GCC	2	6	97875	97880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083225
1033	NC_011984	CGA	2	6	97979	97984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083225
1034	NC_011984	ATG	2	6	98047	98052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083225
1035	NC_011984	AGC	2	6	98063	98068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083225
1036	NC_011984	CGG	2	6	98108	98113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083225
1037	NC_011984	GCC	2	6	98139	98144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083225
1038	NC_011984	CGC	2	6	98249	98254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083225
1039	NC_011984	ATC	2	6	98280	98285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083225
1040	NC_011984	CCA	2	6	98311	98316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083225
1041	NC_011984	CGT	2	6	98326	98331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083225
1042	NC_011984	AGC	2	6	98416	98421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083225
1043	NC_011984	GCC	2	6	98555	98560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083225
1044	NC_011984	ATG	2	6	98682	98687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083225
1045	NC_011984	ATG	2	6	98694	98699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083225
1046	NC_011984	GTC	2	6	98717	98722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083225
1047	NC_011984	GCC	2	6	98844	98849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083225
1048	NC_011984	TGC	2	6	98920	98925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083225
1049	NC_011984	GCG	2	6	98949	98954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083225
1050	NC_011984	TCG	2	6	99007	99012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083225
1051	NC_011984	GCT	2	6	99042	99047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083225
1052	NC_011984	GCA	2	6	99059	99064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083225
1053	NC_011984	GAT	2	6	99147	99152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083225
1054	NC_011984	GCT	2	6	99179	99184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083225
1055	NC_011984	AGG	2	6	99208	99213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083225
1056	NC_011984	GCC	2	6	99335	99340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083226
1057	NC_011984	CAA	2	6	99451	99456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083226
1058	NC_011984	TGG	2	6	99492	99497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083226
1059	NC_011984	TCA	2	6	99516	99521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083226
1060	NC_011984	TTC	2	6	99527	99532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083226
1061	NC_011984	CTG	2	6	99587	99592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083226
1062	NC_011984	GAG	3	9	99632	99640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083226
1063	NC_011984	TCA	2	6	99666	99671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083226
1064	NC_011984	TCG	2	6	99684	99689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083226
1065	NC_011984	GCC	2	6	99690	99695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083226
1066	NC_011984	GGT	2	6	99721	99726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083226
1067	NC_011984	TCG	2	6	99863	99868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083226
1068	NC_011984	GCC	2	6	99908	99913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083226
1069	NC_011984	GTC	3	9	99944	99952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083226
1070	NC_011984	CAT	2	6	100057	100062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083226
1071	NC_011984	GCA	2	6	100108	100113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083226
1072	NC_011984	GAC	2	6	100154	100159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083226
1073	NC_011984	GGC	2	6	100228	100233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083226
1074	NC_011984	CGC	2	6	100938	100943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083227
1075	NC_011984	ATC	2	6	101334	101339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083228
1076	NC_011984	TCG	2	6	101355	101360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083228
1077	NC_011984	GCC	2	6	101380	101385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083228
1078	NC_011984	CTC	2	6	101472	101477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083228
1079	NC_011984	CGA	2	6	101544	101549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083228
1080	NC_011984	TTG	2	6	101567	101572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083228
1081	NC_011984	TGA	2	6	101580	101585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083228
1082	NC_011984	GCC	2	6	101605	101610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083228
1083	NC_011984	GGA	2	6	101611	101616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083228
1084	NC_011984	GGC	2	6	101644	101649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083228
1085	NC_011984	CTT	2	6	101653	101658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083228
1086	NC_011984	GTC	2	6	101680	101685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083228
1087	NC_011984	GAA	2	6	101710	101715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083228
1088	NC_011984	AGC	2	6	101741	101746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083228
1089	NC_011984	CTT	2	6	101920	101925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083228
1090	NC_011984	TTC	2	6	101975	101980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083228
1091	NC_011984	CAT	2	6	102177	102182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083228
1092	NC_011984	CAC	2	6	102340	102345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083228
1093	NC_011984	ATC	2	6	102482	102487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083228
1094	NC_011984	TCG	2	6	102544	102549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083229
1095	NC_011984	ATT	2	6	102580	102585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222083229
1096	NC_011984	ATC	2	6	102665	102670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083229
1097	NC_011984	GGC	2	6	102721	102726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083229
1098	NC_011984	CGG	2	6	102737	102742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083229
1099	NC_011984	CTT	2	6	102802	102807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083229
1100	NC_011984	AAC	2	6	102820	102825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083229
1101	NC_011984	GAT	2	6	102863	102868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083229
1102	NC_011984	GAC	2	6	102870	102875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083229
1103	NC_011984	ACC	2	6	104261	104266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083230
1104	NC_011984	GGA	2	6	104349	104354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083230
1105	NC_011984	TCC	2	6	104493	104498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083230
1106	NC_011984	ACC	2	6	104523	104528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083230
1107	NC_011984	TGA	2	6	104566	104571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083230
1108	NC_011984	TCG	2	6	104661	104666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083230
1109	NC_011984	GCC	2	6	104726	104731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083230
1110	NC_011984	AAT	2	6	104909	104914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222083230
1111	NC_011984	GAG	2	6	105014	105019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083230
1112	NC_011984	CGC	2	6	105076	105081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083230
1113	NC_011984	CGA	2	6	105143	105148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083230
1114	NC_011984	TCC	2	6	105200	105205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083231
1115	NC_011984	AAC	2	6	105306	105311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083231
1116	NC_011984	GAT	2	6	105321	105326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083231
1117	NC_011984	GCG	3	9	105327	105335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083231
1118	NC_011984	CTT	2	6	105447	105452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083231
1119	NC_011984	GAC	2	6	105502	105507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083231
1120	NC_011984	GCT	2	6	105672	105677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083231
1121	NC_011984	CCG	2	6	105683	105688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083231
1122	NC_011984	AGG	2	6	105749	105754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083231
1123	NC_011984	CGA	2	6	105756	105761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083231
1124	NC_011984	TCT	2	6	105831	105836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083231
1125	NC_011984	GCT	2	6	105850	105855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083231
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1238	NC_011984	TCG	2	6	115421	115426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083238
1239	NC_011984	CGC	2	6	115440	115445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083238
1240	NC_011984	CAG	2	6	115515	115520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083238
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1242	NC_011984	TGG	2	6	115560	115565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083238
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1356	NC_011984	CGA	2	6	124269	124274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083246
1357	NC_011984	TCG	2	6	124320	124325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083246
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1475	NC_011984	TGC	2	6	132649	132654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083251
1476	NC_011984	AGC	2	6	132697	132702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083251
1477	NC_011984	CGC	3	9	132716	132724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083251
1478	NC_011984	GAA	2	6	132767	132772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083251
1479	NC_011984	GAT	2	6	132852	132857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083251
1480	NC_011984	AAC	2	6	132930	132935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083251
1481	NC_011984	AAC	2	6	132975	132980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083251
1482	NC_011984	AAG	2	6	132987	132992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083251
1483	NC_011984	CAT	2	6	132998	133003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083251
1484	NC_011984	CAA	2	6	133010	133015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083251
1485	NC_011984	GAA	2	6	133037	133042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083251
1486	NC_011984	AAG	2	6	133149	133154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083251
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1498	NC_011984	AGG	2	6	133726	133731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083251
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