MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4c

Total Repeats: 2451

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011984	GCC	2	6	51520	51525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083191
502	NC_011984	AGC	2	6	51668	51673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083191
503	NC_011984	GAC	2	6	51798	51803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083191
504	NC_011984	CGA	2	6	51855	51860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083191
505	NC_011984	CGA	2	6	51896	51901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083191
506	NC_011984	CTC	2	6	51954	51959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083191
507	NC_011984	TCA	2	6	51986	51991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083191
508	NC_011984	CGT	2	6	52077	52082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083191
509	NC_011984	CGA	2	6	52286	52291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083191
510	NC_011984	GCA	2	6	52338	52343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083191
511	NC_011984	GCC	2	6	52423	52428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083191
512	NC_011984	GCT	2	6	53018	53023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083192
513	NC_011984	TGG	2	6	53089	53094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083192
514	NC_011984	ATC	2	6	53168	53173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083192
515	NC_011984	CAC	2	6	53234	53239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083192
516	NC_011984	TCG	2	6	53247	53252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083192
517	NC_011984	GGC	2	6	53348	53353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083192
518	NC_011984	GGC	2	6	53396	53401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083192
519	NC_011984	GTC	2	6	53414	53419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083192
520	NC_011984	GCC	2	6	53456	53461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083192
521	NC_011984	TAG	2	6	53467	53472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083192
522	NC_011984	CGG	2	6	53521	53526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083192
523	NC_011984	CAT	2	6	53597	53602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083192
524	NC_011984	GAG	2	6	53629	53634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083192
525	NC_011984	CCG	2	6	53644	53649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083192
526	NC_011984	CGG	2	6	53668	53673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083192
527	NC_011984	GGT	2	6	53779	53784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083192
528	NC_011984	ACG	2	6	53951	53956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083192
529	NC_011984	CGA	2	6	54082	54087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083193
530	NC_011984	CCG	2	6	54110	54115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083193
531	NC_011984	TCG	2	6	54135	54140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083193
532	NC_011984	TAT	2	6	54231	54236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222083193
533	NC_011984	AAG	2	6	54267	54272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083193
534	NC_011984	AGG	2	6	54349	54354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083193
535	NC_011984	GCG	2	6	54415	54420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083193
536	NC_011984	TCG	2	6	56016	56021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083194
537	NC_011984	GCT	2	6	56094	56099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083194
538	NC_011984	TCG	2	6	56112	56117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083194
539	NC_011984	GCA	2	6	56151	56156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083194
540	NC_011984	CAG	2	6	56197	56202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083194
541	NC_011984	TCT	2	6	56244	56249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083194
542	NC_011984	TGG	2	6	56250	56255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083194
543	NC_011984	TTG	2	6	56261	56266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083194
544	NC_011984	ATG	2	6	56314	56319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083194
545	NC_011984	GAA	2	6	56326	56331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083194
546	NC_011984	GCG	2	6	56525	56530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083194
547	NC_011984	GGC	2	6	56637	56642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083194
548	NC_011984	GCA	2	6	56660	56665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083194
549	NC_011984	CCT	2	6	56874	56879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083194
550	NC_011984	TCG	2	6	56903	56908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083194
551	NC_011984	CGC	2	6	57093	57098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083194
552	NC_011984	ACA	2	6	57132	57137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083194
553	NC_011984	CAT	2	6	57175	57180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083194
554	NC_011984	CGG	2	6	57183	57188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083194
555	NC_011984	GTC	2	6	57232	57237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083194
556	NC_011984	TGC	2	6	57262	57267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083194
557	NC_011984	GAT	2	6	57273	57278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083194
558	NC_011984	CCA	2	6	57366	57371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083194
559	NC_011984	TCG	2	6	57419	57424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083194
560	NC_011984	TGA	2	6	57438	57443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083194
561	NC_011984	CGC	2	6	57491	57496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083194
562	NC_011984	GGC	2	6	57498	57503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083194
563	NC_011984	CAT	2	6	57511	57516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083194
564	NC_011984	CGA	3	9	57618	57626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083194
565	NC_011984	GCC	2	6	58043	58048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083194
566	NC_011984	GAT	2	6	58084	58089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083194
567	NC_011984	CAG	2	6	58090	58095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083194
568	NC_011984	AGT	2	6	58575	58580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083195
569	NC_011984	GCC	2	6	58600	58605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083195
570	NC_011984	CGG	2	6	58684	58689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083195
571	NC_011984	CCA	2	6	58813	58818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083195
572	NC_011984	CGG	2	6	58922	58927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083195
573	NC_011984	TGG	2	6	58962	58967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083195
574	NC_011984	CAC	2	6	59164	59169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083195
575	NC_011984	CGT	2	6	59244	59249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083195
576	NC_011984	GAG	2	6	59296	59301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083195
577	NC_011984	GGC	2	6	60381	60386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083196
578	NC_011984	TGC	2	6	60439	60444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083196
579	NC_011984	CGG	2	6	60448	60453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083196
580	NC_011984	CGA	2	6	60474	60479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083196
581	NC_011984	GCC	2	6	60542	60547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083196
582	NC_011984	GCA	2	6	60560	60565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083196
583	NC_011984	CCT	2	6	60573	60578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083196
584	NC_011984	CTG	2	6	60635	60640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083196
585	NC_011984	GGC	2	6	60661	60666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083196
586	NC_011984	CTT	2	6	60928	60933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083196
587	NC_011984	GGC	2	6	61054	61059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083196
588	NC_011984	CGG	2	6	61080	61085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083196
589	NC_011984	ATC	2	6	61112	61117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083196
590	NC_011984	CAA	2	6	61132	61137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083196
591	NC_011984	GGC	2	6	61142	61147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083196
592	NC_011984	ACG	2	6	61184	61189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083196
593	NC_011984	GTC	2	6	61203	61208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083196
594	NC_011984	GCT	2	6	61249	61254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083196
595	NC_011984	TTC	2	6	61274	61279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083196
596	NC_011984	GTC	2	6	61368	61373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083196
597	NC_011984	CGA	2	6	61378	61383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083196
598	NC_011984	GAA	2	6	61460	61465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083196
599	NC_011984	GCC	2	6	61652	61657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083196
600	NC_011984	CCA	2	6	61698	61703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083196
601	NC_011984	CGA	2	6	61744	61749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083196
602	NC_011984	CAG	2	6	61769	61774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083196
603	NC_011984	GCC	2	6	61775	61780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083196
604	NC_011984	GGA	2	6	61786	61791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083196
605	NC_011984	GCC	3	9	61796	61804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083196
606	NC_011984	CTC	2	6	61834	61839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083196
607	NC_011984	GTC	2	6	61948	61953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083196
608	NC_011984	CAT	2	6	61969	61974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083196
609	NC_011984	CGA	2	6	61984	61989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083196
610	NC_011984	TCT	2	6	62008	62013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083196
611	NC_011984	GTC	2	6	62072	62077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083196
612	NC_011984	GCC	2	6	62117	62122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083196
613	NC_011984	GCA	2	6	62332	62337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083196
614	NC_011984	TGG	2	6	62349	62354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083196
615	NC_011984	AAG	2	6	62355	62360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083196
616	NC_011984	GGC	2	6	62588	62593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083196
617	NC_011984	GCA	2	6	62609	62614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083196
618	NC_011984	TGA	2	6	64863	64868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083197
619	NC_011984	ACG	2	6	64954	64959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083197
620	NC_011984	AAG	2	6	64972	64977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083197
621	NC_011984	GTT	2	6	65052	65057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083197
622	NC_011984	GTT	2	6	65064	65069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083197
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994	NC_011984	ACG	2	6	95596	95601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083223
995	NC_011984	CTG	2	6	95719	95724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083223
996	NC_011984	GAG	2	6	95758	95763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083223
997	NC_011984	GCA	2	6	95792	95797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083223
998	NC_011984	ATC	2	6	95827	95832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083223
999	NC_011984	CTA	2	6	95933	95938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083224
1000	NC_011984	GCT	2	6	95975	95980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083224

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