MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 46649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017167	GAC	2	6	357820	357825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134135
5502	NC_017167	AGC	3	9	357879	357887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134135
5503	NC_017167	GAC	2	6	357893	357898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134135
5504	NC_017167	TAC	2	6	357899	357904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134135
5505	NC_017167	CTA	2	6	357907	357912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134135
5506	NC_017167	GCC	2	6	357916	357921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134135
5507	NC_017167	GTG	2	6	357932	357937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134135
5508	NC_017167	CAG	2	6	357944	357949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134135
5509	NC_017167	GAG	2	6	358115	358120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134135
5510	NC_017167	GAT	2	6	358199	358204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134135
5511	NC_017167	AGC	2	6	358317	358322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134135
5512	NC_017167	TCG	2	6	358552	358557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134136
5513	NC_017167	CGG	2	6	358587	358592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134136
5514	NC_017167	GCG	2	6	358697	358702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134136
5515	NC_017167	CGA	2	6	358721	358726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134136
5516	NC_017167	AAC	2	6	358816	358821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134136
5517	NC_017167	CAA	2	6	358878	358883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134136
5518	NC_017167	ACT	2	6	359003	359008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134136
5519	NC_017167	GGT	2	6	359016	359021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134136
5520	NC_017167	GAT	2	6	359235	359240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134136
5521	NC_017167	CGA	3	9	359258	359266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134136
5522	NC_017167	GCG	2	6	359267	359272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134136
5523	NC_017167	CGA	2	6	359361	359366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134136
5524	NC_017167	TCG	2	6	359384	359389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134136
5525	NC_017167	CGA	2	6	359602	359607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134137
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5527	NC_017167	CGG	2	6	359647	359652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134137
5528	NC_017167	GCA	2	6	359669	359674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134137
5529	NC_017167	GTT	2	6	359723	359728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134137
5530	NC_017167	GGC	2	6	359798	359803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134137
5531	NC_017167	CGA	2	6	359830	359835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134137
5532	NC_017167	CAC	2	6	359843	359848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134137
5533	NC_017167	AAC	2	6	359850	359855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134137
5534	NC_017167	GCG	2	6	359901	359906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134137
5535	NC_017167	GTG	2	6	359980	359985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134137
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5537	NC_017167	ACT	2	6	360118	360123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134137
5538	NC_017167	TGG	2	6	360278	360283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134137
5539	NC_017167	CGT	2	6	360316	360321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134137
5540	NC_017167	AGT	2	6	360409	360414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_017167	TCA	2	6	360461	360466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134138
5542	NC_017167	CGG	2	6	360530	360535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134138
5543	NC_017167	GCC	2	6	360755	360760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134138
5544	NC_017167	ACG	2	6	360792	360797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134138
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5546	NC_017167	CGA	2	6	360851	360856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134138
5547	NC_017167	GAG	2	6	360914	360919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134138
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5549	NC_017167	CGA	2	6	361003	361008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134138
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5551	NC_017167	CAT	2	6	361135	361140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134138
5552	NC_017167	GAG	2	6	361151	361156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134138
5553	NC_017167	TCA	2	6	361188	361193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134138
5554	NC_017167	ACG	2	6	361354	361359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134138
5555	NC_017167	CCT	2	6	361513	361518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134138
5556	NC_017167	CGA	2	6	361534	361539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134138
5557	NC_017167	CGG	2	6	361591	361596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134138
5558	NC_017167	CCA	2	6	361828	361833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5559	NC_017167	CTT	2	6	361835	361840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_017167	CAG	2	6	361927	361932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_017167	ACG	2	6	362019	362024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_017167	TGT	2	6	362069	362074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_017167	GTG	2	6	362096	362101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_017167	GTC	2	6	362234	362239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134139
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5567	NC_017167	TGC	2	6	362402	362407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134139
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5574	NC_017167	GAC	2	6	363576	363581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134140
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5579	NC_017167	ATA	2	6	363891	363896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384134140
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5601	NC_017167	CGC	2	6	365338	365343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134140
5602	NC_017167	CAT	2	6	365371	365376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134140
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5606	NC_017167	GCG	2	6	365654	365659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_017167	TCA	2	6	365857	365862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134141
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5609	NC_017167	CAT	2	6	365917	365922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134141
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5616	NC_017167	TCG	2	6	366488	366493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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