MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 2725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013851	CGGCG	2	10	3210026	3210035	0 %	0 %	60 %	40 %	288942531
2502	NC_013851	CGGCG	2	10	3212540	3212549	0 %	0 %	60 %	40 %	288942534
2503	NC_013851	CGGCG	2	10	3214507	3214516	0 %	0 %	60 %	40 %	288942536
2504	NC_013851	CCGCG	2	10	3216623	3216632	0 %	0 %	40 %	60 %	288942539
2505	NC_013851	CCGCG	2	10	3216740	3216749	0 %	0 %	40 %	60 %	288942539
2506	NC_013851	CGCGG	2	10	3218632	3218641	0 %	0 %	60 %	40 %	288942541
2507	NC_013851	AGCCG	2	10	3218905	3218914	20 %	0 %	40 %	40 %	288942542
2508	NC_013851	GTTCG	2	10	3219078	3219087	0 %	40 %	40 %	20 %	288942542
2509	NC_013851	GACGC	2	10	3220140	3220149	20 %	0 %	40 %	40 %	288942544
2510	NC_013851	CGATC	2	10	3220332	3220341	20 %	20 %	20 %	40 %	288942544
2511	NC_013851	TAGAC	2	10	3220552	3220561	40 %	20 %	20 %	20 %	288942544
2512	NC_013851	CCACT	2	10	3222480	3222489	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2513	NC_013851	CCTGA	2	10	3222728	3222737	20 %	20 %	20 %	40 %	288942547
2514	NC_013851	GCGCG	2	10	3224408	3224417	0 %	0 %	60 %	40 %	288942549
2515	NC_013851	GGCCC	2	10	3226835	3226844	0 %	0 %	40 %	60 %	288942552
2516	NC_013851	GGACT	2	10	3227055	3227064	20 %	20 %	40 %	20 %	288942552
2517	NC_013851	CTCGA	2	10	3227446	3227455	20 %	20 %	20 %	40 %	288942552
2518	NC_013851	GCGTC	2	10	3227650	3227659	0 %	20 %	40 %	40 %	288942553
2519	NC_013851	CGGCG	2	10	3228784	3228793	0 %	0 %	60 %	40 %	288942553
2520	NC_013851	CTCGT	2	10	3230085	3230094	0 %	40 %	20 %	40 %	288942554
2521	NC_013851	CGGCC	2	10	3230282	3230291	0 %	0 %	40 %	60 %	288942554
2522	NC_013851	TCGGC	2	10	3231682	3231691	0 %	20 %	40 %	40 %	288942556
2523	NC_013851	ATTCG	2	10	3232383	3232392	20 %	40 %	20 %	20 %	288942557
2524	NC_013851	GGGTT	2	10	3233490	3233499	0 %	40 %	60 %	0 %	288942558
2525	NC_013851	CTTTC	2	10	3234708	3234717	0 %	60 %	0 %	40 %	288942559
2526	NC_013851	ACGCG	2	10	3240314	3240323	20 %	0 %	40 %	40 %	288942566
2527	NC_013851	GAGCC	2	10	3240675	3240684	20 %	0 %	40 %	40 %	288942567
2528	NC_013851	ACGAG	2	10	3242017	3242026	40 %	0 %	40 %	20 %	288942567
2529	NC_013851	CTAGG	2	10	3242096	3242105	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2530	NC_013851	CGTCT	2	10	3242843	3242852	0 %	40 %	20 %	40 %	288942568
2531	NC_013851	GCTGG	2	10	3245906	3245915	0 %	20 %	60 %	20 %	288942570
2532	NC_013851	GCCGC	2	10	3247066	3247075	0 %	0 %	40 %	60 %	288942572
2533	NC_013851	TCGAC	2	10	3247201	3247210	20 %	20 %	20 %	40 %	288942572
2534	NC_013851	TTGCC	2	10	3250969	3250978	0 %	40 %	20 %	40 %	288942572
2535	NC_013851	GGCCC	2	10	3252937	3252946	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2536	NC_013851	GGCGA	2	10	3255506	3255515	20 %	0 %	60 %	20 %	288942576
2537	NC_013851	GCCCT	2	10	3257244	3257253	0 %	20 %	20 %	60 %	288942578
2538	NC_013851	CCGCG	2	10	3259545	3259554	0 %	0 %	40 %	60 %	288942579
2539	NC_013851	CCGCG	2	10	3261645	3261654	0 %	0 %	40 %	60 %	288942579
2540	NC_013851	ATCGA	2	10	3262042	3262051	40 %	20 %	20 %	20 %	288942579
2541	NC_013851	TCAGC	2	10	3266300	3266309	20 %	20 %	20 %	40 %	288942584
2542	NC_013851	CGGTC	2	10	3269095	3269104	0 %	20 %	40 %	40 %	288942586
2543	NC_013851	ACGGC	2	10	3269595	3269604	20 %	0 %	40 %	40 %	288942586
2544	NC_013851	GCCGC	2	10	3270013	3270022	0 %	0 %	40 %	60 %	288942587
2545	NC_013851	TGGTC	2	10	3270397	3270406	0 %	40 %	40 %	20 %	288942587
2546	NC_013851	TGCTG	2	10	3271958	3271967	0 %	40 %	40 %	20 %	288942589
2547	NC_013851	CGCGC	2	10	3273177	3273186	0 %	0 %	40 %	60 %	288942592
2548	NC_013851	CTTGG	2	10	3277230	3277239	0 %	40 %	40 %	20 %	288942596
2549	NC_013851	TGCCG	2	10	3278161	3278170	0 %	20 %	40 %	40 %	288942597
2550	NC_013851	CTCCC	2	10	3280144	3280153	0 %	20 %	0 %	80 %	288942600
2551	NC_013851	GCGCC	2	10	3281012	3281021	0 %	0 %	40 %	60 %	288942601
2552	NC_013851	CCAGC	2	10	3281310	3281319	20 %	0 %	20 %	60 %	288942601
2553	NC_013851	GCACC	2	10	3281507	3281516	20 %	0 %	20 %	60 %	288942601
2554	NC_013851	TGGTC	2	10	3281812	3281821	0 %	40 %	40 %	20 %	288942602
2555	NC_013851	GCCCG	2	10	3282165	3282174	0 %	0 %	40 %	60 %	288942602
2556	NC_013851	TCGGC	2	10	3283778	3283787	0 %	20 %	40 %	40 %	288942603
2557	NC_013851	GCGAG	2	10	3284206	3284215	20 %	0 %	60 %	20 %	288942603
2558	NC_013851	GGGCA	2	10	3284219	3284228	20 %	0 %	60 %	20 %	288942603
2559	NC_013851	GCGCT	2	10	3284518	3284527	0 %	20 %	40 %	40 %	288942604
2560	NC_013851	GCGCG	2	10	3287347	3287356	0 %	0 %	60 %	40 %	288942607
2561	NC_013851	CTGGT	2	10	3290808	3290817	0 %	40 %	40 %	20 %	288942611
2562	NC_013851	CGTCG	2	10	3291614	3291623	0 %	20 %	40 %	40 %	288942612
2563	NC_013851	GCCGA	2	10	3291847	3291856	20 %	0 %	40 %	40 %	288942612
2564	NC_013851	GGATC	2	10	3292013	3292022	20 %	20 %	40 %	20 %	288942612
2565	NC_013851	GCGCC	2	10	3292197	3292206	0 %	0 %	40 %	60 %	288942612
2566	NC_013851	GCTCG	2	10	3292434	3292443	0 %	20 %	40 %	40 %	288942613
2567	NC_013851	CGCGG	2	10	3293558	3293567	0 %	0 %	60 %	40 %	288942614
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2571	NC_013851	GACCA	2	10	3301649	3301658	40 %	0 %	20 %	40 %	288942621
2572	NC_013851	GGCAT	2	10	3301923	3301932	20 %	20 %	40 %	20 %	288942621
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2578	NC_013851	TCAGC	2	10	3318122	3318131	20 %	20 %	20 %	40 %	288942634
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2580	NC_013851	GCCGC	2	10	3318404	3318413	0 %	0 %	40 %	60 %	288942634
2581	NC_013851	CGGAT	2	10	3318540	3318549	20 %	20 %	40 %	20 %	288942634
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2591	NC_013851	TCAGT	2	10	3337560	3337569	20 %	40 %	20 %	20 %	288942651
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2595	NC_013851	CGCGC	2	10	3343660	3343669	0 %	0 %	40 %	60 %	288942654
2596	NC_013851	GCCGA	2	10	3344202	3344211	20 %	0 %	40 %	40 %	288942654
2597	NC_013851	ATGGC	2	10	3345532	3345541	20 %	20 %	40 %	20 %	288942656
2598	NC_013851	CCGCC	2	10	3347113	3347122	0 %	0 %	20 %	80 %	288942656
2599	NC_013851	ATCGC	2	10	3351559	3351568	20 %	20 %	20 %	40 %	288942660
2600	NC_013851	CGCGC	2	10	3351938	3351947	0 %	0 %	40 %	60 %	288942660
2601	NC_013851	GTCCC	2	10	3353861	3353870	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2602	NC_013851	CCCTT	2	10	3354127	3354136	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2603	NC_013851	CCATG	2	10	3354245	3354254	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2604	NC_013851	GCCGC	2	10	3357138	3357147	0 %	0 %	40 %	60 %	288942666
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2606	NC_013851	CCGAC	2	10	3361077	3361086	20 %	0 %	20 %	60 %	288942669
2607	NC_013851	TGGCG	2	10	3361255	3361264	0 %	20 %	60 %	20 %	288942669
2608	NC_013851	CGCGC	2	10	3365406	3365415	0 %	0 %	40 %	60 %	288942674
2609	NC_013851	TCGAG	2	10	3366176	3366185	20 %	20 %	40 %	20 %	288942674
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2611	NC_013851	CGGGT	2	10	3367995	3368004	0 %	20 %	60 %	20 %	288942677
2612	NC_013851	GCCGC	2	10	3372818	3372827	0 %	0 %	40 %	60 %	288942680
2613	NC_013851	GCCGC	2	10	3374730	3374739	0 %	0 %	40 %	60 %	288942682
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2617	NC_013851	GCGCG	2	10	3378072	3378081	0 %	0 %	60 %	40 %	288942686
2618	NC_013851	CCCGA	2	10	3380421	3380430	20 %	0 %	20 %	60 %	288942688
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2622	NC_013851	TCGGG	2	10	3388249	3388258	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2623	NC_013851	GCTGG	2	10	3388719	3388728	0 %	20 %	60 %	20 %	288942695
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