MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 2725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_013851	TGGTG	2	10	2533839	2533848	0 %	40 %	60 %	0 %	288941928
2002	NC_013851	AGCTG	2	10	2535500	2535509	20 %	20 %	40 %	20 %	288941929
2003	NC_013851	GAAGA	2	10	2538521	2538530	60 %	0 %	40 %	0 %	288941932
2004	NC_013851	TCGTC	2	10	2538978	2538987	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2005	NC_013851	CCGGA	2	10	2539787	2539796	20 %	0 %	40 %	40 %	288941933
2006	NC_013851	CCGCG	2	10	2539946	2539955	0 %	0 %	40 %	60 %	288941933
2007	NC_013851	AGCAG	2	10	2541539	2541548	40 %	0 %	40 %	20 %	288941933
2008	NC_013851	TCCAG	2	10	2542045	2542054	20 %	20 %	20 %	40 %	288941934
2009	NC_013851	CTCGG	2	10	2542429	2542438	0 %	20 %	40 %	40 %	288941934
2010	NC_013851	CCGGG	2	10	2543117	2543126	0 %	0 %	60 %	40 %	288941934
2011	NC_013851	GCGCC	2	10	2543583	2543592	0 %	0 %	40 %	60 %	288941935
2012	NC_013851	GGACA	2	10	2546055	2546064	40 %	0 %	40 %	20 %	288941936
2013	NC_013851	GACCA	2	10	2546312	2546321	40 %	0 %	20 %	40 %	288941937
2014	NC_013851	TCCCC	2	10	2547998	2548007	0 %	20 %	0 %	80 %	288941939
2015	NC_013851	CGGCT	2	10	2550398	2550407	0 %	20 %	40 %	40 %	288941941
2016	NC_013851	TCGTC	2	10	2550573	2550582	0 %	40 %	20 %	40 %	288941941
2017	NC_013851	CAGCG	2	10	2551145	2551154	20 %	0 %	40 %	40 %	288941941
2018	NC_013851	GCGTT	2	10	2554814	2554823	0 %	40 %	40 %	20 %	288941946
2019	NC_013851	CCGGA	2	10	2555725	2555734	20 %	0 %	40 %	40 %	288941947
2020	NC_013851	CGTGA	2	10	2556011	2556020	20 %	20 %	40 %	20 %	288941947
2021	NC_013851	GTCGA	2	10	2557090	2557099	20 %	20 %	40 %	20 %	288941949
2022	NC_013851	GCATG	2	10	2557709	2557718	20 %	20 %	40 %	20 %	288941949
2023	NC_013851	GAGTC	2	10	2558126	2558135	20 %	20 %	40 %	20 %	288941949
2024	NC_013851	GCGCG	2	10	2558873	2558882	0 %	0 %	60 %	40 %	288941949
2025	NC_013851	GGCGC	2	10	2559035	2559044	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2026	NC_013851	CGCAG	2	10	2560415	2560424	20 %	0 %	40 %	40 %	288941951
2027	NC_013851	GGTCG	2	10	2562415	2562424	0 %	20 %	60 %	20 %	288941951
2028	NC_013851	CGCGG	2	10	2562571	2562580	0 %	0 %	60 %	40 %	288941951
2029	NC_013851	TGGAC	2	10	2565162	2565171	20 %	20 %	40 %	20 %	288941954
2030	NC_013851	CACGC	2	10	2565623	2565632	20 %	0 %	20 %	60 %	288941956
2031	NC_013851	CGTCG	2	10	2568012	2568021	0 %	20 %	40 %	40 %	288941958
2032	NC_013851	ATGCG	2	10	2568520	2568529	20 %	20 %	40 %	20 %	288941958
2033	NC_013851	TTCGG	2	10	2571488	2571497	0 %	40 %	40 %	20 %	288941962
2034	NC_013851	CCGAG	2	10	2572629	2572638	20 %	0 %	40 %	40 %	288941963
2035	NC_013851	CATGA	2	10	2573176	2573185	40 %	20 %	20 %	20 %	288941963
2036	NC_013851	GCCGC	2	10	2575823	2575832	0 %	0 %	40 %	60 %	288941966
2037	NC_013851	TGCCG	2	10	2577280	2577289	0 %	20 %	40 %	40 %	288941968
2038	NC_013851	GCGCC	2	10	2577367	2577376	0 %	0 %	40 %	60 %	288941968
2039	NC_013851	CGAAC	2	10	2578881	2578890	40 %	0 %	20 %	40 %	288941969
2040	NC_013851	GTTGC	2	10	2581159	2581168	0 %	40 %	40 %	20 %	288941971
2041	NC_013851	CGCGC	2	10	2585570	2585579	0 %	0 %	40 %	60 %	288941975
2042	NC_013851	CGATC	2	10	2586925	2586934	20 %	20 %	20 %	40 %	288941977
2043	NC_013851	GCGCC	2	10	2591356	2591365	0 %	0 %	40 %	60 %	288941981
2044	NC_013851	TGGCC	2	10	2592164	2592173	0 %	20 %	40 %	40 %	288941982
2045	NC_013851	ATGAC	2	10	2592488	2592497	40 %	20 %	20 %	20 %	288941982
2046	NC_013851	TGGTG	2	10	2592979	2592988	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_013851	CGGCG	2	10	2593569	2593578	0 %	0 %	60 %	40 %	288941984
2048	NC_013851	TTCGA	2	10	2596600	2596609	20 %	40 %	20 %	20 %	288941988
2049	NC_013851	CTGGC	2	10	2604038	2604047	0 %	20 %	40 %	40 %	288941994
2050	NC_013851	GCGTG	2	10	2606551	2606560	0 %	20 %	60 %	20 %	288941997
2051	NC_013851	TCGCC	2	10	2607983	2607992	0 %	20 %	20 %	60 %	288941999
2052	NC_013851	GGATC	2	10	2611446	2611455	20 %	20 %	40 %	20 %	288942002
2053	NC_013851	AATCG	2	10	2612468	2612477	40 %	20 %	20 %	20 %	288942003
2054	NC_013851	CGGCG	2	10	2612876	2612885	0 %	0 %	60 %	40 %	288942003
2055	NC_013851	GCCGC	2	10	2613003	2613012	0 %	0 %	40 %	60 %	288942003
2056	NC_013851	TCGGC	2	10	2613607	2613616	0 %	20 %	40 %	40 %	288942003
2057	NC_013851	CTTTG	2	10	2621721	2621730	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2058	NC_013851	CTGAC	2	10	2623236	2623245	20 %	20 %	20 %	40 %	288942013
2059	NC_013851	TGGCG	2	10	2623962	2623971	0 %	20 %	60 %	20 %	288942014
2060	NC_013851	ACGCG	2	10	2624016	2624025	20 %	0 %	40 %	40 %	288942014
2061	NC_013851	TCGGG	2	10	2625285	2625294	0 %	20 %	60 %	20 %	288942014
2062	NC_013851	CGCGC	2	10	2628448	2628457	0 %	0 %	40 %	60 %	288942017
2063	NC_013851	CGGAT	2	10	2630695	2630704	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2064	NC_013851	GCTGA	2	10	2636264	2636273	20 %	20 %	40 %	20 %	288942024
2065	NC_013851	GTGCC	2	10	2636658	2636667	0 %	20 %	40 %	40 %	288942024
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2068	NC_013851	GCATG	2	10	2639447	2639456	20 %	20 %	40 %	20 %	288942026
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2070	NC_013851	CCGCG	2	10	2642832	2642841	0 %	0 %	40 %	60 %	288942027
2071	NC_013851	GGGCG	2	10	2643271	2643280	0 %	0 %	80 %	20 %	288942027
2072	NC_013851	CTGGT	2	10	2643992	2644001	0 %	40 %	40 %	20 %	288942028
2073	NC_013851	CTCGA	2	10	2645078	2645087	20 %	20 %	20 %	40 %	288942028
2074	NC_013851	TGCCC	2	10	2645851	2645860	0 %	20 %	20 %	60 %	288942028
2075	NC_013851	CCGGG	2	10	2646480	2646489	0 %	0 %	60 %	40 %	288942029
2076	NC_013851	GGTCG	2	10	2646492	2646501	0 %	20 %	60 %	20 %	288942029
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2078	NC_013851	GATCC	2	10	2649874	2649883	20 %	20 %	20 %	40 %	288942032
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2080	NC_013851	CGCGC	2	10	2650600	2650609	0 %	0 %	40 %	60 %	288942033
2081	NC_013851	CGGAC	2	10	2650938	2650947	20 %	0 %	40 %	40 %	288942033
2082	NC_013851	CAGCC	2	10	2651757	2651766	20 %	0 %	20 %	60 %	288942034
2083	NC_013851	TCGGA	2	10	2651914	2651923	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2084	NC_013851	CCGTC	2	10	2652166	2652175	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2085	NC_013851	AGCCG	2	10	2652269	2652278	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2086	NC_013851	CGGTG	2	10	2652442	2652451	0 %	20 %	60 %	20 %	288942035
2087	NC_013851	GACCA	2	10	2655010	2655019	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2088	NC_013851	GGCCG	2	10	2655273	2655282	0 %	0 %	60 %	40 %	288942038
2089	NC_013851	CCGAT	2	10	2656385	2656394	20 %	20 %	20 %	40 %	288942039
2090	NC_013851	CGAGC	2	10	2656948	2656957	20 %	0 %	40 %	40 %	288942040
2091	NC_013851	CGCGC	2	10	2659800	2659809	0 %	0 %	40 %	60 %	288942043
2092	NC_013851	CTGGC	2	10	2660531	2660540	0 %	20 %	40 %	40 %	288942043
2093	NC_013851	TCCAG	2	10	2660652	2660661	20 %	20 %	20 %	40 %	288942043
2094	NC_013851	GCGCA	2	10	2661211	2661220	20 %	0 %	40 %	40 %	288942043
2095	NC_013851	CACGG	2	10	2662858	2662867	20 %	0 %	40 %	40 %	288942043
2096	NC_013851	GCGAC	2	10	2666462	2666471	20 %	0 %	40 %	40 %	288942046
2097	NC_013851	GGATC	2	10	2666932	2666941	20 %	20 %	40 %	20 %	288942047
2098	NC_013851	CGCGC	2	10	2668304	2668313	0 %	0 %	40 %	60 %	288942048
2099	NC_013851	CCAGG	2	10	2668632	2668641	20 %	0 %	40 %	40 %	288942049
2100	NC_013851	TTGCC	2	10	2672118	2672127	0 %	40 %	20 %	40 %	288942056
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2102	NC_013851	GCCGG	2	10	2675036	2675045	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2103	NC_013851	TCGAA	2	10	2677254	2677263	40 %	20 %	20 %	20 %	288942068
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2105	NC_013851	CACGC	2	10	2679372	2679381	20 %	0 %	20 %	60 %	288942072
2106	NC_013851	CTCAG	2	10	2679726	2679735	20 %	20 %	20 %	40 %	288942073
2107	NC_013851	GCGCC	2	10	2680942	2680951	0 %	0 %	40 %	60 %	288942074
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2114	NC_013851	CGCAT	2	10	2695225	2695234	20 %	20 %	20 %	40 %	288942082
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2117	NC_013851	CGACC	2	10	2701631	2701640	20 %	0 %	20 %	60 %	288942088
2118	NC_013851	TCGGC	2	10	2702645	2702654	0 %	20 %	40 %	40 %	288942089
2119	NC_013851	CCGAA	2	10	2702820	2702829	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2120	NC_013851	ACTGA	2	10	2704434	2704443	40 %	20 %	20 %	20 %	288942091
2121	NC_013851	TGAGA	2	10	2704472	2704481	40 %	20 %	40 %	0 %	288942091
2122	NC_013851	GGCCA	2	10	2705560	2705569	20 %	0 %	40 %	40 %	288942092
2123	NC_013851	GTTCA	2	10	2705614	2705623	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2497	NC_013851	CCGGC	2	10	3201500	3201509	0 %	0 %	40 %	60 %	288942525
2498	NC_013851	GGCGC	2	10	3202219	3202228	0 %	0 %	60 %	40 %	288942525
2499	NC_013851	GATGC	2	10	3205802	3205811	20 %	20 %	40 %	20 %	288942528
2500	NC_013851	AGCGC	2	10	3207500	3207509	20 %	0 %	40 %	40 %	288942529

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