MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 2725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013851	CGATC	2	10	631060	631069	20 %	20 %	20 %	40 %	288940288
502	NC_013851	CCGCG	2	10	631840	631849	0 %	0 %	40 %	60 %	288940290
503	NC_013851	GACCG	2	10	631985	631994	20 %	0 %	40 %	40 %	288940290
504	NC_013851	CAGAC	2	10	632013	632022	40 %	0 %	20 %	40 %	288940290
505	NC_013851	GCGCG	2	10	633005	633014	0 %	0 %	60 %	40 %	288940291
506	NC_013851	CCCGT	2	10	635897	635906	0 %	20 %	20 %	60 %	288940294
507	NC_013851	TCGAT	2	10	636341	636350	20 %	40 %	20 %	20 %	288940295
508	NC_013851	CCGTC	2	10	636682	636691	0 %	20 %	20 %	60 %	288940295
509	NC_013851	GCGCG	2	10	637270	637279	0 %	0 %	60 %	40 %	288940296
510	NC_013851	TGGAT	2	10	637356	637365	20 %	40 %	40 %	0 %	288940296
511	NC_013851	GCGCC	2	10	638163	638172	0 %	0 %	40 %	60 %	288940296
512	NC_013851	CTAAT	2	10	638720	638729	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
513	NC_013851	GCCGA	2	10	640701	640710	20 %	0 %	40 %	40 %	288940299
514	NC_013851	GCCGA	2	10	641177	641186	20 %	0 %	40 %	40 %	288940299
515	NC_013851	AGCTC	2	10	641500	641509	20 %	20 %	20 %	40 %	288940299
516	NC_013851	TGGCC	2	10	642448	642457	0 %	20 %	40 %	40 %	288940299
517	NC_013851	GTGAT	2	10	643110	643119	20 %	40 %	40 %	0 %	288940299
518	NC_013851	GCGCG	2	10	644510	644519	0 %	0 %	60 %	40 %	288940301
519	NC_013851	GTTCG	2	10	645928	645937	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
520	NC_013851	AGAGC	2	10	649439	649448	40 %	0 %	40 %	20 %	288940305
521	NC_013851	CGGGG	2	10	650241	650250	0 %	0 %	80 %	20 %	288940305
522	NC_013851	ACCGA	2	10	650667	650676	40 %	0 %	20 %	40 %	288940305
523	NC_013851	GCCGC	2	10	652480	652489	0 %	0 %	40 %	60 %	288940308
524	NC_013851	GCCGA	2	10	653631	653640	20 %	0 %	40 %	40 %	288940309
525	NC_013851	ACCCG	2	10	656379	656388	20 %	0 %	20 %	60 %	288940310
526	NC_013851	TCGGC	2	10	656425	656434	0 %	20 %	40 %	40 %	288940310
527	NC_013851	CGCGG	2	10	659369	659378	0 %	0 %	60 %	40 %	288940313
528	NC_013851	GATGG	2	10	659425	659434	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
529	NC_013851	GCGCC	2	10	659611	659620	0 %	0 %	40 %	60 %	288940314
530	NC_013851	CCGCG	2	10	661062	661071	0 %	0 %	40 %	60 %	288940315
531	NC_013851	GCCGC	2	10	663959	663968	0 %	0 %	40 %	60 %	288940317
532	NC_013851	GCCGC	2	10	664160	664169	0 %	0 %	40 %	60 %	288940317
533	NC_013851	CGCAG	2	10	664309	664318	20 %	0 %	40 %	40 %	288940317
534	NC_013851	GCCGA	2	10	666180	666189	20 %	0 %	40 %	40 %	288940318
535	NC_013851	CGGCC	2	10	666265	666274	0 %	0 %	40 %	60 %	288940319
536	NC_013851	GACCA	2	10	666722	666731	40 %	0 %	20 %	40 %	288940319
537	NC_013851	AGGCG	2	10	667336	667345	20 %	0 %	60 %	20 %	288940320
538	NC_013851	AGCCG	2	10	667354	667363	20 %	0 %	40 %	40 %	288940320
539	NC_013851	CGGTC	2	10	667471	667480	0 %	20 %	40 %	40 %	288940320
540	NC_013851	TGCTC	2	10	669353	669362	0 %	40 %	20 %	40 %	288940323
541	NC_013851	TCGCC	2	10	669452	669461	0 %	20 %	20 %	60 %	288940323
542	NC_013851	GATCG	2	10	670801	670810	20 %	20 %	40 %	20 %	288940325
543	NC_013851	GTTCA	2	10	673029	673038	20 %	40 %	20 %	20 %	288940327
544	NC_013851	CGCGC	2	10	673614	673623	0 %	0 %	40 %	60 %	288940328
545	NC_013851	GCCGC	2	10	674136	674145	0 %	0 %	40 %	60 %	288940328
546	NC_013851	CGGCG	2	10	674924	674933	0 %	0 %	60 %	40 %	288940328
547	NC_013851	GCGCC	2	10	676236	676245	0 %	0 %	40 %	60 %	288940328
548	NC_013851	CGAAC	2	10	677888	677897	40 %	0 %	20 %	40 %	288940330
549	NC_013851	CTGAC	2	10	678343	678352	20 %	20 %	20 %	40 %	288940331
550	NC_013851	CCGTC	2	10	678667	678676	0 %	20 %	20 %	60 %	288940332
551	NC_013851	AGATG	2	10	680032	680041	40 %	20 %	40 %	0 %	288940332
552	NC_013851	CTAAC	2	10	680626	680635	40 %	20 %	0 %	40 %	288940334
553	NC_013851	GCCGG	2	10	684762	684771	0 %	0 %	60 %	40 %	288940336
554	NC_013851	CGGCC	2	10	685054	685063	0 %	0 %	40 %	60 %	288940336
555	NC_013851	GACCT	2	10	685563	685572	20 %	20 %	20 %	40 %	288940337
556	NC_013851	CCGAG	2	10	686921	686930	20 %	0 %	40 %	40 %	288940337
557	NC_013851	TGGGT	2	10	687982	687991	0 %	40 %	60 %	0 %	288940339
558	NC_013851	CCAGG	2	10	688846	688855	20 %	0 %	40 %	40 %	288940340
559	NC_013851	CTTGC	2	10	689426	689435	0 %	40 %	20 %	40 %	288940341
560	NC_013851	GGATG	2	10	691327	691336	20 %	20 %	60 %	0 %	288940341
561	NC_013851	CCGCG	2	10	691407	691416	0 %	0 %	40 %	60 %	288940341
562	NC_013851	GGCCA	2	10	692933	692942	20 %	0 %	40 %	40 %	288940341
563	NC_013851	CGATC	2	10	693046	693055	20 %	20 %	20 %	40 %	288940341
564	NC_013851	CGATC	2	10	693175	693184	20 %	20 %	20 %	40 %	288940341
565	NC_013851	GGGCG	2	10	693619	693628	0 %	0 %	80 %	20 %	288940341
566	NC_013851	GCGCC	2	10	695595	695604	0 %	0 %	40 %	60 %	288940342
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568	NC_013851	TCGGC	2	10	696845	696854	0 %	20 %	40 %	40 %	288940342
569	NC_013851	GGGTC	2	10	697762	697771	0 %	20 %	60 %	20 %	288940343
570	NC_013851	GCGAC	2	10	700062	700071	20 %	0 %	40 %	40 %	288940345
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573	NC_013851	CGGCC	2	10	702395	702404	0 %	0 %	40 %	60 %	288940346
574	NC_013851	AGATC	2	10	702517	702526	40 %	20 %	20 %	20 %	288940346
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577	NC_013851	GGCGT	2	10	705384	705393	0 %	20 %	60 %	20 %	288940348
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579	NC_013851	ATCGA	2	10	708153	708162	40 %	20 %	20 %	20 %	288940351
580	NC_013851	CGATC	2	10	708488	708497	20 %	20 %	20 %	40 %	288940351
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582	NC_013851	GCATC	2	10	709810	709819	20 %	20 %	20 %	40 %	288940352
583	NC_013851	CGTGC	2	10	710519	710528	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
584	NC_013851	GAGCT	2	10	712087	712096	20 %	20 %	40 %	20 %	288940353
585	NC_013851	CGCCC	2	10	717809	717818	0 %	0 %	20 %	80 %	288940357
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593	NC_013851	TCGGC	2	10	725812	725821	0 %	20 %	40 %	40 %	288940360
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595	NC_013851	CCGCG	2	10	727987	727996	0 %	0 %	40 %	60 %	288940362
596	NC_013851	GGTTC	2	10	728504	728513	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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598	NC_013851	GGCGT	2	10	731284	731293	0 %	20 %	60 %	20 %	288940364
599	NC_013851	GCGCC	2	10	731434	731443	0 %	0 %	40 %	60 %	288940365
600	NC_013851	CATGC	2	10	731919	731928	20 %	20 %	20 %	40 %	288940365
601	NC_013851	CAGAT	2	10	732709	732718	40 %	20 %	20 %	20 %	288940366
602	NC_013851	AACCG	2	10	734892	734901	40 %	0 %	20 %	40 %	288940369
603	NC_013851	GCCCG	2	10	734989	734998	0 %	0 %	40 %	60 %	288940369
604	NC_013851	CGGGC	2	10	735092	735101	0 %	0 %	60 %	40 %	288940369
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606	NC_013851	GAGTC	2	10	737097	737106	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
607	NC_013851	CGTGG	2	10	738049	738058	0 %	20 %	60 %	20 %	288940371
608	NC_013851	GGGCT	2	10	742430	742439	0 %	20 %	60 %	20 %	288940375
609	NC_013851	CCGAC	2	10	743095	743104	20 %	0 %	20 %	60 %	288940376
610	NC_013851	GCGCG	2	10	743546	743555	0 %	0 %	60 %	40 %	288940377
611	NC_013851	TCGCC	2	10	745887	745896	0 %	20 %	20 %	60 %	288940378
612	NC_013851	CGCCC	2	10	747335	747344	0 %	0 %	20 %	80 %	288940379
613	NC_013851	GCCAG	2	10	747480	747489	20 %	0 %	40 %	40 %	288940380
614	NC_013851	GCGCC	2	10	749799	749808	0 %	0 %	40 %	60 %	288940381
615	NC_013851	GCCGG	2	10	751217	751226	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
616	NC_013851	GGCGC	2	10	753112	753121	0 %	0 %	60 %	40 %	288940383
617	NC_013851	CGCCC	2	10	753325	753334	0 %	0 %	20 %	80 %	288940383
618	NC_013851	TCGCC	2	10	753382	753391	0 %	20 %	20 %	60 %	288940383
619	NC_013851	GCCAG	2	10	753985	753994	20 %	0 %	40 %	40 %	288940383
620	NC_013851	GGTGC	2	10	755103	755112	0 %	20 %	60 %	20 %	288940385
621	NC_013851	CTCGA	2	10	755286	755295	20 %	20 %	20 %	40 %	288940385
622	NC_013851	CCGAT	2	10	755584	755593	20 %	20 %	20 %	40 %	288940385
623	NC_013851	GAACG	2	10	759302	759311	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
624	NC_013851	GGAAC	2	10	761131	761140	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
625	NC_013851	TGCTC	2	10	763886	763895	0 %	40 %	20 %	40 %	288940389
626	NC_013851	GGCCG	2	10	764467	764476	0 %	0 %	60 %	40 %	288940390
627	NC_013851	GTCTG	2	10	764926	764935	0 %	40 %	40 %	20 %	288940391
628	NC_013851	GAATG	2	10	766116	766125	40 %	20 %	40 %	0 %	288940392
629	NC_013851	GGAGC	2	10	766604	766613	20 %	0 %	60 %	20 %	288940393
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