MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 2725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013851	CCAGA	2	10	1267240	1267249	40 %	0 %	20 %	40 %	288940826
1002	NC_013851	GGGCA	2	10	1271492	1271501	20 %	0 %	60 %	20 %	288940829
1003	NC_013851	GCGCC	2	10	1272337	1272346	0 %	0 %	40 %	60 %	288940831
1004	NC_013851	GCGCC	2	10	1273087	1273096	0 %	0 %	40 %	60 %	288940831
1005	NC_013851	TCGGC	2	10	1273111	1273120	0 %	20 %	40 %	40 %	288940831
1006	NC_013851	GCATG	2	10	1273261	1273270	20 %	20 %	40 %	20 %	288940831
1007	NC_013851	TGGGT	2	10	1276036	1276045	0 %	40 %	60 %	0 %	288940832
1008	NC_013851	CCGGA	2	10	1276298	1276307	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1009	NC_013851	CGGCG	2	10	1277609	1277618	0 %	0 %	60 %	40 %	288940834
1010	NC_013851	GTTTG	2	10	1283193	1283202	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_013851	TCGTC	2	10	1283383	1283392	0 %	40 %	20 %	40 %	288940839
1012	NC_013851	GTCGG	2	10	1283408	1283417	0 %	20 %	60 %	20 %	288940839
1013	NC_013851	GTGGC	2	10	1284516	1284525	0 %	20 %	60 %	20 %	288940840
1014	NC_013851	CGTCG	2	10	1285359	1285368	0 %	20 %	40 %	40 %	288940841
1015	NC_013851	ACGGC	2	10	1286990	1286999	20 %	0 %	40 %	40 %	288940841
1016	NC_013851	CTCAT	2	10	1288591	1288600	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1017	NC_013851	GCCCA	2	10	1289933	1289942	20 %	0 %	20 %	60 %	288940843
1018	NC_013851	ATGGG	2	10	1290004	1290013	20 %	20 %	60 %	0 %	288940844
1019	NC_013851	CCAAA	2	10	1290767	1290776	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1020	NC_013851	TGCCT	2	10	1292433	1292442	0 %	40 %	20 %	40 %	288940847
1021	NC_013851	TTTCG	2	10	1292489	1292498	0 %	60 %	20 %	20 %	288940847
1022	NC_013851	ATCCG	2	10	1292531	1292540	20 %	20 %	20 %	40 %	288940847
1023	NC_013851	GGCGC	2	10	1294271	1294280	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1024	NC_013851	CGCAC	2	10	1298412	1298421	20 %	0 %	20 %	60 %	288940852
1025	NC_013851	CGGCG	2	10	1299724	1299733	0 %	0 %	60 %	40 %	288940853
1026	NC_013851	GGGGC	2	10	1304261	1304270	0 %	0 %	80 %	20 %	288940859
1027	NC_013851	GAGGC	2	10	1305559	1305568	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1028	NC_013851	GGCGG	2	10	1305872	1305881	0 %	0 %	80 %	20 %	288940861
1029	NC_013851	TCGCG	2	10	1308541	1308550	0 %	20 %	40 %	40 %	288940863
1030	NC_013851	GATCG	2	10	1308755	1308764	20 %	20 %	40 %	20 %	288940864
1031	NC_013851	GTCGG	2	10	1308766	1308775	0 %	20 %	60 %	20 %	288940864
1032	NC_013851	GTGCG	2	10	1309468	1309477	0 %	20 %	60 %	20 %	288940864
1033	NC_013851	CCGGA	2	10	1310433	1310442	20 %	0 %	40 %	40 %	288940865
1034	NC_013851	GGTCG	2	10	1311396	1311405	0 %	20 %	60 %	20 %	288940866
1035	NC_013851	CGCGG	2	10	1312759	1312768	0 %	0 %	60 %	40 %	288940867
1036	NC_013851	GCGCG	2	10	1313813	1313822	0 %	0 %	60 %	40 %	288940868
1037	NC_013851	CCGCG	2	10	1315708	1315717	0 %	0 %	40 %	60 %	288940869
1038	NC_013851	CGGTG	2	10	1317585	1317594	0 %	20 %	60 %	20 %	288940871
1039	NC_013851	CCATC	2	10	1318664	1318673	20 %	20 %	0 %	60 %	288940872
1040	NC_013851	GCCCA	2	10	1318773	1318782	20 %	0 %	20 %	60 %	288940872
1041	NC_013851	CAAGC	2	10	1323602	1323611	40 %	0 %	20 %	40 %	288940878
1042	NC_013851	CATTA	2	10	1325559	1325568	40 %	40 %	0 %	20 %	288940881
1043	NC_013851	AATCC	2	10	1327175	1327184	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1044	NC_013851	GGTCG	2	10	1328855	1328864	0 %	20 %	60 %	20 %	288940886
1045	NC_013851	GCCGC	2	10	1330723	1330732	0 %	0 %	40 %	60 %	288940886
1046	NC_013851	TCCTG	2	10	1332411	1332420	0 %	40 %	20 %	40 %	288940886
1047	NC_013851	CGGAT	2	10	1333701	1333710	20 %	20 %	40 %	20 %	288940886
1048	NC_013851	GGTCT	2	10	1334818	1334827	0 %	40 %	40 %	20 %	288940886
1049	NC_013851	AGCGG	2	10	1336150	1336159	20 %	0 %	60 %	20 %	288940886
1050	NC_013851	TGGCC	2	10	1337800	1337809	0 %	20 %	40 %	40 %	288940889
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1052	NC_013851	CCGAC	2	10	1341127	1341136	20 %	0 %	20 %	60 %	288940890
1053	NC_013851	GGCAC	2	10	1344312	1344321	20 %	0 %	40 %	40 %	288940892
1054	NC_013851	ATGGC	2	10	1347234	1347243	20 %	20 %	40 %	20 %	288940895
1055	NC_013851	AACAC	2	10	1347373	1347382	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1056	NC_013851	GTGCC	2	10	1347390	1347399	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1057	NC_013851	TCCAT	2	10	1349766	1349775	20 %	40 %	0 %	40 %	288940898
1058	NC_013851	GCCGC	2	10	1355827	1355836	0 %	0 %	40 %	60 %	288940902
1059	NC_013851	TGAGC	2	10	1360049	1360058	20 %	20 %	40 %	20 %	288940903
1060	NC_013851	CGGCG	2	10	1361066	1361075	0 %	0 %	60 %	40 %	288940903
1061	NC_013851	GGCGC	2	10	1361106	1361115	0 %	0 %	60 %	40 %	288940903
1062	NC_013851	GGAGC	2	10	1363638	1363647	20 %	0 %	60 %	20 %	288940905
1063	NC_013851	TGCTC	2	10	1363890	1363899	0 %	40 %	20 %	40 %	288940905
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1065	NC_013851	GCTCA	2	10	1366838	1366847	20 %	20 %	20 %	40 %	288940910
1066	NC_013851	CCGCA	2	10	1367577	1367586	20 %	0 %	20 %	60 %	288940911
1067	NC_013851	GCGCC	2	10	1369159	1369168	0 %	0 %	40 %	60 %	288940912
1068	NC_013851	CGACC	2	10	1369186	1369195	20 %	0 %	20 %	60 %	288940912
1069	NC_013851	CCGGT	2	10	1371031	1371040	0 %	20 %	40 %	40 %	288940914
1070	NC_013851	GCAGG	2	10	1372905	1372914	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1071	NC_013851	ATGCG	2	10	1374350	1374359	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1072	NC_013851	GACTG	2	10	1376295	1376304	20 %	20 %	40 %	20 %	288940919
1073	NC_013851	GCCCC	2	10	1378059	1378068	0 %	0 %	20 %	80 %	288940923
1074	NC_013851	GCGCC	2	10	1378174	1378183	0 %	0 %	40 %	60 %	288940923
1075	NC_013851	GCGCG	2	10	1380517	1380526	0 %	0 %	60 %	40 %	288940924
1076	NC_013851	CCAAT	2	10	1380854	1380863	40 %	20 %	0 %	40 %	288940924
1077	NC_013851	CTGGA	2	10	1381618	1381627	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1078	NC_013851	GGCGA	2	10	1381862	1381871	20 %	0 %	60 %	20 %	288940926
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1081	NC_013851	GCTCG	2	10	1385377	1385386	0 %	20 %	40 %	40 %	288940930
1082	NC_013851	GCGGT	2	10	1385819	1385828	0 %	20 %	60 %	20 %	288940930
1083	NC_013851	GGCCA	2	10	1386050	1386059	20 %	0 %	40 %	40 %	288940930
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1085	NC_013851	GCACG	2	10	1387454	1387463	20 %	0 %	40 %	40 %	288940932
1086	NC_013851	AGTCC	2	10	1387949	1387958	20 %	20 %	20 %	40 %	288940932
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1088	NC_013851	GCACG	2	10	1392460	1392469	20 %	0 %	40 %	40 %	288940936
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1095	NC_013851	GGGCA	2	10	1399976	1399985	20 %	0 %	60 %	20 %	288940944
1096	NC_013851	CTCGA	2	10	1401308	1401317	20 %	20 %	20 %	40 %	288940944
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1098	NC_013851	ATCGG	2	10	1406019	1406028	20 %	20 %	40 %	20 %	288940948
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1101	NC_013851	GGTGG	2	10	1408482	1408491	0 %	20 %	80 %	0 %	288940950
1102	NC_013851	CGGCG	2	10	1411350	1411359	0 %	0 %	60 %	40 %	288940953
1103	NC_013851	GCTCA	2	10	1412219	1412228	20 %	20 %	20 %	40 %	288940953
1104	NC_013851	CGACC	2	10	1413001	1413010	20 %	0 %	20 %	60 %	288940954
1105	NC_013851	GGCTG	2	10	1413203	1413212	0 %	20 %	60 %	20 %	288940954
1106	NC_013851	CTTGG	2	10	1413455	1413464	0 %	40 %	40 %	20 %	288940954
1107	NC_013851	CTGCG	2	10	1415449	1415458	0 %	20 %	40 %	40 %	288940956
1108	NC_013851	CGCGG	2	10	1419681	1419690	0 %	0 %	60 %	40 %	288940961
1109	NC_013851	CGGAT	2	10	1420503	1420512	20 %	20 %	40 %	20 %	288940961
1110	NC_013851	CGGGA	2	10	1420601	1420610	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1111	NC_013851	CGGCG	2	10	1424171	1424180	0 %	0 %	60 %	40 %	288940963
1112	NC_013851	GCGTG	2	10	1424537	1424546	0 %	20 %	60 %	20 %	288940963
1113	NC_013851	ATGGC	2	10	1424724	1424733	20 %	20 %	40 %	20 %	288940964
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1116	NC_013851	CGAAA	2	10	1428572	1428581	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1117	NC_013851	ACCCG	2	10	1429404	1429413	20 %	0 %	20 %	60 %	288940970
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1125	NC_013851	CGAGG	2	10	1449598	1449607	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1126	NC_013851	CGCGG	2	10	1450955	1450964	0 %	0 %	60 %	40 %	288940994
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1286	NC_013851	GTCGA	2	10	1644191	1644200	20 %	20 %	40 %	20 %	288941150
1287	NC_013851	CGATT	2	10	1650066	1650075	20 %	40 %	20 %	20 %	288941154
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1498	NC_013851	ACCGA	2	10	1904750	1904759	40 %	0 %	20 %	40 %	288941364
1499	NC_013851	CGCCC	2	10	1906813	1906822	0 %	0 %	20 %	80 %	288941367
1500	NC_013851	CGCGA	2	10	1907930	1907939	20 %	0 %	40 %	40 %	288941367

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