MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 2725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013851	GCTCT	2	10	1908616	1908625	0 %	40 %	20 %	40 %	288941369
1502	NC_013851	GTCCA	2	10	1909268	1909277	20 %	20 %	20 %	40 %	288941369
1503	NC_013851	GACGC	2	10	1909519	1909528	20 %	0 %	40 %	40 %	288941369
1504	NC_013851	CGGCG	2	10	1909686	1909695	0 %	0 %	60 %	40 %	288941369
1505	NC_013851	CCCAT	2	10	1910235	1910244	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1506	NC_013851	AGCCG	2	10	1910961	1910970	20 %	0 %	40 %	40 %	288941370
1507	NC_013851	TCGGG	2	10	1911567	1911576	0 %	20 %	60 %	20 %	288941371
1508	NC_013851	GCGCA	2	10	1913359	1913368	20 %	0 %	40 %	40 %	288941373
1509	NC_013851	CCAGC	2	10	1913670	1913679	20 %	0 %	20 %	60 %	288941374
1510	NC_013851	ACCGG	2	10	1913724	1913733	20 %	0 %	40 %	40 %	288941374
1511	NC_013851	GCCAC	2	10	1917828	1917837	20 %	0 %	20 %	60 %	288941379
1512	NC_013851	TGGGT	2	10	1918477	1918486	0 %	40 %	60 %	0 %	288941379
1513	NC_013851	GCGCC	2	10	1918958	1918967	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1514	NC_013851	GACTG	2	10	1919328	1919337	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1515	NC_013851	AAGGC	2	10	1920005	1920014	40 %	0 %	40 %	20 %	288941382
1516	NC_013851	CGGCG	2	10	1924640	1924649	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1517	NC_013851	GAGCG	2	10	1924713	1924722	20 %	0 %	60 %	20 %	288941388
1518	NC_013851	CGGAC	2	10	1925263	1925272	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1519	NC_013851	CGATC	2	10	1925358	1925367	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1520	NC_013851	CGCGC	2	10	1925688	1925697	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1521	NC_013851	CTGCC	2	10	1926058	1926067	0 %	20 %	20 %	60 %	288941390
1522	NC_013851	AACAG	2	10	1926453	1926462	60 %	0 %	20 %	20 %	288941391
1523	NC_013851	GCACC	2	10	1926844	1926853	20 %	0 %	20 %	60 %	288941392
1524	NC_013851	CGCCC	2	10	1928264	1928273	0 %	0 %	20 %	80 %	288941392
1525	NC_013851	TCGCC	2	10	1930290	1930299	0 %	20 %	20 %	60 %	288941394
1526	NC_013851	GGATG	2	10	1932002	1932011	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_013851	CGGGG	2	10	1933007	1933016	0 %	0 %	80 %	20 %	288941396
1528	NC_013851	GGCCG	2	10	1934281	1934290	0 %	0 %	60 %	40 %	288941396
1529	NC_013851	CTCGC	2	10	1935778	1935787	0 %	20 %	20 %	60 %	288941398
1530	NC_013851	CCTGG	2	10	1936206	1936215	0 %	20 %	40 %	40 %	288941398
1531	NC_013851	CCGGA	2	10	1936711	1936720	20 %	0 %	40 %	40 %	288941399
1532	NC_013851	TCCGC	2	10	1938449	1938458	0 %	20 %	20 %	60 %	288941401
1533	NC_013851	TGCCC	2	10	1940573	1940582	0 %	20 %	20 %	60 %	288941402
1534	NC_013851	GTCGG	2	10	1940718	1940727	0 %	20 %	60 %	20 %	288941403
1535	NC_013851	GGGTG	2	10	1941161	1941170	0 %	20 %	80 %	0 %	288941404
1536	NC_013851	GCCGA	2	10	1942235	1942244	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1537	NC_013851	ACGCC	2	10	1942951	1942960	20 %	0 %	20 %	60 %	288941406
1538	NC_013851	CGACT	2	10	1944310	1944319	20 %	20 %	20 %	40 %	288941408
1539	NC_013851	CGGCG	2	10	1945044	1945053	0 %	0 %	60 %	40 %	288941408
1540	NC_013851	CGATC	2	10	1946373	1946382	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1541	NC_013851	GGGCG	2	10	1948509	1948518	0 %	0 %	80 %	20 %	288941414
1542	NC_013851	CGGCG	2	10	1948980	1948989	0 %	0 %	60 %	40 %	288941415
1543	NC_013851	GGCGC	2	10	1949501	1949510	0 %	0 %	60 %	40 %	288941415
1544	NC_013851	TAAAA	2	10	1951963	1951972	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_013851	TCGTC	2	10	1952481	1952490	0 %	40 %	20 %	40 %	288941417
1546	NC_013851	GCACG	2	10	1953499	1953508	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1547	NC_013851	GGCGC	2	10	1954703	1954712	0 %	0 %	60 %	40 %	288941419
1548	NC_013851	TCGGT	2	10	1954853	1954862	0 %	40 %	40 %	20 %	288941419
1549	NC_013851	CGCTG	2	10	1958189	1958198	0 %	20 %	40 %	40 %	288941426
1550	NC_013851	GCCGA	2	10	1959674	1959683	20 %	0 %	40 %	40 %	288941426
1551	NC_013851	GTCTG	2	10	1961038	1961047	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1552	NC_013851	GAGTC	2	10	1961388	1961397	20 %	20 %	40 %	20 %	288941427
1553	NC_013851	CGACC	2	10	1963606	1963615	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1554	NC_013851	CACGC	3	15	1965339	1965353	20 %	0 %	20 %	60 %	288941431
1555	NC_013851	TGTTT	2	10	1967248	1967257	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_013851	GCCCC	2	10	1970912	1970921	0 %	0 %	20 %	80 %	288941440
1557	NC_013851	GACGA	2	10	1970993	1971002	40 %	0 %	40 %	20 %	288941440
1558	NC_013851	CGGCG	2	10	1975808	1975817	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1559	NC_013851	ATCAC	2	10	1976391	1976400	40 %	20 %	0 %	40 %	288941446
1560	NC_013851	GGGCG	2	10	1977860	1977869	0 %	0 %	80 %	20 %	288941448
1561	NC_013851	ACAGC	2	10	1978787	1978796	40 %	0 %	20 %	40 %	288941448
1562	NC_013851	TCGGC	2	10	1979162	1979171	0 %	20 %	40 %	40 %	288941449
1563	NC_013851	TCGCC	2	10	1979222	1979231	0 %	20 %	20 %	60 %	288941449
1564	NC_013851	TGGCC	2	10	1979237	1979246	0 %	20 %	40 %	40 %	288941449
1565	NC_013851	CTGAG	2	10	1979393	1979402	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1566	NC_013851	GCGCC	2	10	1981599	1981608	0 %	0 %	40 %	60 %	288941451
1567	NC_013851	CGCGC	2	10	1982756	1982765	0 %	0 %	40 %	60 %	288941452
1568	NC_013851	GCGAT	2	10	1983620	1983629	20 %	20 %	40 %	20 %	288941452
1569	NC_013851	GCCGC	2	10	1983828	1983837	0 %	0 %	40 %	60 %	288941452
1570	NC_013851	GCGCC	2	10	1984159	1984168	0 %	0 %	40 %	60 %	288941452
1571	NC_013851	TCGGC	2	10	1986691	1986700	0 %	20 %	40 %	40 %	288941454
1572	NC_013851	CCGCT	2	10	1986849	1986858	0 %	20 %	20 %	60 %	288941454
1573	NC_013851	ACGAC	2	10	1989137	1989146	40 %	0 %	20 %	40 %	288941458
1574	NC_013851	GATCG	2	10	1990678	1990687	20 %	20 %	40 %	20 %	288941460
1575	NC_013851	TCGCG	2	10	1992561	1992570	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1576	NC_013851	ATCGG	2	10	1992580	1992589	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1577	NC_013851	CAGTC	2	10	1993067	1993076	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1578	NC_013851	CGGTG	2	10	1993595	1993604	0 %	20 %	60 %	20 %	288941465
1579	NC_013851	GTCGC	2	10	1994737	1994746	0 %	20 %	40 %	40 %	288941466
1580	NC_013851	TCGAT	2	10	1995503	1995512	20 %	40 %	20 %	20 %	288941466
1581	NC_013851	TGATC	2	10	1995598	1995607	20 %	40 %	20 %	20 %	288941467
1582	NC_013851	CGAGG	2	10	1996670	1996679	20 %	0 %	60 %	20 %	288941467
1583	NC_013851	CGTCC	2	10	1996743	1996752	0 %	20 %	20 %	60 %	288941467
1584	NC_013851	TCGCC	2	10	1996759	1996768	0 %	20 %	20 %	60 %	288941467
1585	NC_013851	CGGCG	2	10	1999435	1999444	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1586	NC_013851	CGTCT	2	10	2000434	2000443	0 %	40 %	20 %	40 %	288941470
1587	NC_013851	CGCTG	2	10	2000930	2000939	0 %	20 %	40 %	40 %	288941471
1588	NC_013851	CGGTG	2	10	2001122	2001131	0 %	20 %	60 %	20 %	288941471
1589	NC_013851	GATCC	2	10	2001321	2001330	20 %	20 %	20 %	40 %	288941471
1590	NC_013851	TCCCC	2	10	2001580	2001589	0 %	20 %	0 %	80 %	288941471
1591	NC_013851	CAGAT	2	10	2005592	2005601	40 %	20 %	20 %	20 %	288941473
1592	NC_013851	GCCGG	2	10	2006465	2006474	0 %	0 %	60 %	40 %	288941474
1593	NC_013851	GATCG	2	10	2008217	2008226	20 %	20 %	40 %	20 %	288941476
1594	NC_013851	CAGGA	2	10	2011283	2011292	40 %	0 %	40 %	20 %	288941478
1595	NC_013851	CGGCG	2	10	2011397	2011406	0 %	0 %	60 %	40 %	288941478
1596	NC_013851	TGGCG	2	10	2011522	2011531	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1597	NC_013851	GATCG	2	10	2011813	2011822	20 %	20 %	40 %	20 %	288941479
1598	NC_013851	ATCTG	2	10	2012361	2012370	20 %	40 %	20 %	20 %	288941479
1599	NC_013851	AGCCG	2	10	2013217	2013226	20 %	0 %	40 %	40 %	288941479
1600	NC_013851	TCGAC	2	10	2013927	2013936	20 %	20 %	20 %	40 %	288941480
1601	NC_013851	TCGGT	2	10	2015040	2015049	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1602	NC_013851	TCCAT	2	10	2015589	2015598	20 %	40 %	0 %	40 %	288941482
1603	NC_013851	GCCGG	2	10	2016103	2016112	0 %	0 %	60 %	40 %	288941483
1604	NC_013851	TGAAT	2	10	2016498	2016507	40 %	40 %	20 %	0 %	288941483
1605	NC_013851	CCGAG	2	10	2018880	2018889	20 %	0 %	40 %	40 %	288941484
1606	NC_013851	CGGGA	2	10	2021971	2021980	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1607	NC_013851	ATCTT	2	10	2022215	2022224	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1608	NC_013851	ACCCA	2	10	2023370	2023379	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1609	NC_013851	TCAGG	2	10	2024828	2024837	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1610	NC_013851	AGCCC	2	10	2025847	2025856	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1611	NC_013851	CACGA	2	10	2025992	2026001	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1612	NC_013851	AGTCC	2	10	2028053	2028062	20 %	20 %	20 %	40 %	288941487
1613	NC_013851	AATCC	2	10	2028648	2028657	40 %	20 %	0 %	40 %	288941487
1614	NC_013851	CACGC	2	10	2030807	2030816	20 %	0 %	20 %	60 %	288941490
1615	NC_013851	CGCGC	2	10	2032913	2032922	0 %	0 %	40 %	60 %	288941493
1616	NC_013851	CCGGA	2	10	2034708	2034717	20 %	0 %	40 %	40 %	288941495
1617	NC_013851	AGTGT	2	10	2035392	2035401	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_013851	GCGAC	2	10	2036701	2036710	20 %	0 %	40 %	40 %	288941497
1619	NC_013851	GGCGT	2	10	2038490	2038499	0 %	20 %	60 %	20 %	288941499
1620	NC_013851	ATGGC	2	10	2040956	2040965	20 %	20 %	40 %	20 %	288941500
1621	NC_013851	GTCCA	2	10	2041639	2041648	20 %	20 %	20 %	40 %	288941501
1622	NC_013851	GGGCA	2	10	2042402	2042411	20 %	0 %	60 %	20 %	288941501
1623	NC_013851	CCAGA	2	10	2042459	2042468	40 %	0 %	20 %	40 %	288941501
1624	NC_013851	GATGC	2	10	2043817	2043826	20 %	20 %	40 %	20 %	288941502
1625	NC_013851	GATCC	2	10	2044953	2044962	20 %	20 %	20 %	40 %	288941504
1626	NC_013851	CGAAT	2	10	2046148	2046157	40 %	20 %	20 %	20 %	288941505
1627	NC_013851	CATCC	2	10	2046825	2046834	20 %	20 %	0 %	60 %	288941505
1628	NC_013851	CACGA	2	10	2047557	2047566	40 %	0 %	20 %	40 %	288941506
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1631	NC_013851	GCCGG	2	10	2051790	2051799	0 %	0 %	60 %	40 %	288941509
1632	NC_013851	CGATC	2	10	2052026	2052035	20 %	20 %	20 %	40 %	288941510
1633	NC_013851	GTCGA	2	10	2052129	2052138	20 %	20 %	40 %	20 %	288941510
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1748	NC_013851	GCGTC	2	10	2211939	2211948	0 %	20 %	40 %	40 %	288941650
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1751	NC_013851	CTGGC	2	10	2213837	2213846	0 %	20 %	40 %	40 %	288941652
1752	NC_013851	TCCAG	2	10	2215994	2216003	20 %	20 %	20 %	40 %	288941654
1753	NC_013851	ACGCA	2	10	2216068	2216077	40 %	0 %	20 %	40 %	288941654
1754	NC_013851	CTGCA	2	10	2216228	2216237	20 %	20 %	20 %	40 %	288941654
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1756	NC_013851	CGATC	2	10	2218939	2218948	20 %	20 %	20 %	40 %	288941656
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1758	NC_013851	AAATT	2	10	2220964	2220973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1759	NC_013851	ATCTT	2	10	2222119	2222128	20 %	60 %	0 %	20 %	288941659
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1786	NC_013851	CCGCG	2	10	2265593	2265602	0 %	0 %	40 %	60 %	288941693
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1807	NC_013851	AGGCC	2	10	2296243	2296252	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1808	NC_013851	ACGGA	2	10	2296582	2296591	40 %	0 %	40 %	20 %	288941713
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1833	NC_013851	CAGCC	2	10	2327076	2327085	20 %	0 %	20 %	60 %	288941744
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1837	NC_013851	GCCCC	2	10	2333160	2333169	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1838	NC_013851	TCGCT	2	10	2333721	2333730	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1844	NC_013851	CGGCG	2	10	2339624	2339633	0 %	0 %	60 %	40 %	288941755
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1981	NC_013851	GCCGA	2	10	2500107	2500116	20 %	0 %	40 %	40 %	288941901
1982	NC_013851	CGCGC	2	10	2500263	2500272	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1983	NC_013851	GGCCG	2	10	2501788	2501797	0 %	0 %	60 %	40 %	288941903
1984	NC_013851	GGCGC	2	10	2503775	2503784	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1985	NC_013851	CGGCC	2	10	2505391	2505400	0 %	0 %	40 %	60 %	288941907
1986	NC_013851	GACGT	2	10	2505535	2505544	20 %	20 %	40 %	20 %	288941907
1987	NC_013851	ACGGC	2	10	2506258	2506267	20 %	0 %	40 %	40 %	288941908
1988	NC_013851	GCCGA	2	10	2512332	2512341	20 %	0 %	40 %	40 %	288941915
1989	NC_013851	GCCAC	2	10	2514466	2514475	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1990	NC_013851	GCCAC	2	10	2514645	2514654	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1991	NC_013851	AGCCC	2	10	2515183	2515192	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1992	NC_013851	GCGCG	2	10	2521107	2521116	0 %	0 %	60 %	40 %	288941920
1993	NC_013851	GACAG	2	10	2521761	2521770	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1994	NC_013851	AGAGC	2	10	2525217	2525226	40 %	0 %	40 %	20 %	288941922
1995	NC_013851	CGGGG	2	10	2525695	2525704	0 %	0 %	80 %	20 %	288941922
1996	NC_013851	CATGA	2	10	2525767	2525776	40 %	20 %	20 %	20 %	288941922
1997	NC_013851	ACCCG	2	10	2530109	2530118	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1998	NC_013851	CGCCT	2	10	2530818	2530827	0 %	20 %	20 %	60 %	288941926
1999	NC_013851	GCCCC	2	10	2533120	2533129	0 %	0 %	20 %	80 %	288941928
2000	NC_013851	ATCGC	2	10	2533169	2533178	20 %	20 %	20 %	40 %	288941928

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