MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4c

Total Repeats: 3065

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_011984	TGG	2	6	139814	139819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_011984	TTC	2	6	139960	139965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_011984	GCC	2	6	139979	139984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2004	NC_011984	TCC	2	6	140019	140024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2005	NC_011984	GCG	2	6	140048	140053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_011984	CAC	2	6	140152	140157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083258
2007	NC_011984	CAT	2	6	140173	140178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083258
2008	NC_011984	CCG	2	6	140268	140273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083258
2009	NC_011984	ACG	2	6	140316	140321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083258
2010	NC_011984	CGA	2	6	140347	140352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083258
2011	NC_011984	CCG	2	6	140465	140470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2012	NC_011984	GCG	2	6	140617	140622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_011984	CTC	2	6	140634	140639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2014	NC_011984	GGC	2	6	140648	140653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2015	NC_011984	TCC	2	6	140668	140673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2016	NC_011984	CGC	2	6	140677	140682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2017	NC_011984	CGG	2	6	140686	140691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_011984	CGT	2	6	140738	140743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_011984	GAC	2	6	140763	140768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2020	NC_011984	GCC	2	6	140843	140848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083259
2021	NC_011984	CGG	2	6	140855	140860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083259
2022	NC_011984	GGC	2	6	140908	140913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083259
2023	NC_011984	CCT	2	6	140929	140934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083259
2024	NC_011984	AGG	2	6	140939	140944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083259
2025	NC_011984	CAT	2	6	140949	140954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2026	NC_011984	CTT	2	6	141030	141035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083260
2027	NC_011984	CGC	2	6	141039	141044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083260
2028	NC_011984	TCG	2	6	141053	141058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083260
2029	NC_011984	CGA	2	6	141182	141187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083260
2030	NC_011984	GAA	2	6	141316	141321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_011984	TGC	2	6	141406	141411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083261
2032	NC_011984	CGT	2	6	141429	141434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083261
2033	NC_011984	GAT	2	6	141481	141486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083261
2034	NC_011984	CAT	2	6	141497	141502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083261
2035	NC_011984	GCC	2	6	141509	141514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083261
2036	NC_011984	CCG	2	6	141552	141557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083261
2037	NC_011984	TGA	2	6	141733	141738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_011984	CGC	2	6	141768	141773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2039	NC_011984	CGG	2	6	141857	141862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2040	NC_011984	TCG	2	6	141999	142004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083262
2041	NC_011984	AGA	2	6	142041	142046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083262
2042	NC_011984	GCC	2	6	142065	142070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083262
2043	NC_011984	CGA	2	6	142174	142179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083262
2044	NC_011984	GCG	2	6	142190	142195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083262
2045	NC_011984	CAC	2	6	142201	142206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083262
2046	NC_011984	CAC	2	6	142256	142261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083262
2047	NC_011984	CAT	2	6	142271	142276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083262
2048	NC_011984	CGC	2	6	142297	142302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083263
2049	NC_011984	CTG	2	6	142321	142326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083263
2050	NC_011984	TCC	2	6	142385	142390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083263
2051	NC_011984	CGG	2	6	142462	142467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083263
2052	NC_011984	GTG	2	6	142548	142553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083263
2053	NC_011984	ATC	2	6	142622	142627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083263
2054	NC_011984	TCC	2	6	142656	142661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083263
2055	NC_011984	CCG	2	6	142747	142752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083264
2056	NC_011984	GCG	2	6	142805	142810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083264
2057	NC_011984	TCG	2	6	142837	142842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083264
2058	NC_011984	CGG	2	6	142882	142887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083264
2059	NC_011984	GCT	2	6	142892	142897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083264
2060	NC_011984	CGA	2	6	142911	142916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083264
2061	NC_011984	GGT	2	6	142959	142964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083264
2062	NC_011984	ATC	2	6	143107	143112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083264
2063	NC_011984	TCG	2	6	143188	143193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083264
2064	NC_011984	AGC	2	6	143248	143253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083264
2065	NC_011984	CCG	2	6	143329	143334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083264
2066	NC_011984	GAA	2	6	143658	143663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083264
2067	NC_011984	GTC	2	6	143664	143669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083264
2068	NC_011984	CCG	2	6	143785	143790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083264
2069	NC_011984	GTC	2	6	143926	143931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083264
2070	NC_011984	CCG	2	6	143938	143943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083264
2071	NC_011984	GAT	2	6	143968	143973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083264
2072	NC_011984	GCC	2	6	144009	144014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083264
2073	NC_011984	GGC	2	6	144054	144059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083264
2074	NC_011984	GCC	2	6	144102	144107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083264
2075	NC_011984	GCC	2	6	144127	144132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083264
2076	NC_011984	TGA	2	6	144254	144259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083264
2077	NC_011984	ATC	2	6	144277	144282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083264
2078	NC_011984	GAT	3	9	144372	144380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083264
2079	NC_011984	CGG	2	6	144413	144418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083264
2080	NC_011984	CGG	2	6	144470	144475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083264
2081	NC_011984	CAA	2	6	144476	144481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083264
2082	NC_011984	GCC	2	6	144544	144549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083264
2083	NC_011984	GCT	2	6	144554	144559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083264
2084	NC_011984	CGC	2	6	144582	144587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083264
2085	NC_011984	TCG	2	6	144686	144691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083265
2086	NC_011984	CCG	2	6	144707	144712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083265
2087	NC_011984	CCG	2	6	144776	144781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083265
2088	NC_011984	CTT	2	6	144805	144810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083265
2089	NC_011984	CCT	2	6	145003	145008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083266
2090	NC_011984	TTC	2	6	145109	145114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083266
2091	NC_011984	CTT	2	6	145133	145138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083266
2092	NC_011984	TCC	2	6	145192	145197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083266
2093	NC_011984	TGG	2	6	145250	145255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_011984	CGA	2	6	145354	145359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083267
2095	NC_011984	ATC	2	6	145417	145422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083267
2096	NC_011984	GTG	2	6	145444	145449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083267
2097	NC_011984	TGC	2	6	145532	145537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083267
2098	NC_011984	GAG	2	6	145540	145545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083267
2099	NC_011984	TGA	2	6	145823	145828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083267
2100	NC_011984	AAG	2	6	145867	145872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083267
2101	NC_011984	ACC	2	6	145997	146002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083267
2102	NC_011984	CGG	2	6	146013	146018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083267
2103	NC_011984	AAC	2	6	146123	146128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083267
2104	NC_011984	GAA	2	6	146167	146172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083267
2105	NC_011984	CGC	2	6	146173	146178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083267
2106	NC_011984	CGC	2	6	146191	146196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083267
2107	NC_011984	TGC	2	6	146276	146281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083267
2108	NC_011984	CGA	2	6	146292	146297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083267
2109	NC_011984	CCG	2	6	146300	146305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083267
2110	NC_011984	CAG	2	6	146311	146316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083267
2111	NC_011984	CAT	2	6	146328	146333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083267
2112	NC_011984	GAT	2	6	146421	146426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083267
2113	NC_011984	CGA	2	6	146438	146443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083267
2114	NC_011984	GGT	2	6	146496	146501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083267
2115	NC_011984	GGC	2	6	146519	146524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083267
2116	NC_011984	GGC	2	6	146528	146533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083267
2117	NC_011984	GGA	2	6	146538	146543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083267
2118	NC_011984	AGC	2	6	146550	146555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083267
2119	NC_011984	CGC	2	6	146586	146591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083267
2120	NC_011984	GTC	2	6	146593	146598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083267
2121	NC_011984	GAT	2	6	146625	146630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083267
2122	NC_011984	GGC	2	6	146634	146639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083267
2123	NC_011984	GTC	2	6	146671	146676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083267
2124	NC_011984	GCG	2	6	146698	146703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083267
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2127	NC_011984	CGT	2	6	146862	146867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083267
2128	NC_011984	AGC	2	6	146906	146911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083267
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2130	NC_011984	TCG	2	6	147242	147247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083267
2131	NC_011984	ACG	2	6	147290	147295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083267
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2141	NC_011984	TGC	2	6	147761	147766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083267
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2149	NC_011984	CTG	2	6	148480	148485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083267
2150	NC_011984	CAG	2	6	148597	148602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083267
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2208	NC_011984	TAT	2	6	152792	152797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2209	NC_011984	GCG	2	6	152871	152876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083273
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2219	NC_011984	TCG	2	6	153824	153829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083274
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2226	NC_011984	TCG	2	6	154337	154342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083274
2227	NC_011984	GAT	2	6	154366	154371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083274
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2232	NC_011984	TGA	2	6	154898	154903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083275
2233	NC_011984	GCC	2	6	154909	154914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083275
2234	NC_011984	TGT	2	6	154958	154963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083275
2235	NC_011984	TGC	3	9	154988	154996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083275
2236	NC_011984	TCA	2	6	155315	155320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083275
2237	NC_011984	GAA	2	6	155604	155609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083275
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2239	NC_011984	CTC	2	6	155700	155705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083276
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2481	NC_011984	GAT	2	6	173121	173126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083287
2482	NC_011984	GAC	2	6	173127	173132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083287
2483	NC_011984	CGC	2	6	173151	173156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083287
2484	NC_011984	TCG	2	6	173291	173296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083287
2485	NC_011984	GGC	2	6	173323	173328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083287
2486	NC_011984	TCG	2	6	173390	173395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083287
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