MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4c

Total Repeats: 3065

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011984	CAT	2	6	37683	37688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083178
502	NC_011984	CGG	2	6	37706	37711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083178
503	NC_011984	CCA	2	6	37888	37893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083178
504	NC_011984	GAC	2	6	38017	38022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083178
505	NC_011984	TGT	2	6	38030	38035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083178
506	NC_011984	CGG	2	6	38200	38205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083178
507	NC_011984	CGA	2	6	38226	38231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083178
508	NC_011984	GCG	2	6	38280	38285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083178
509	NC_011984	GGC	3	9	38325	38333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083178
510	NC_011984	AAC	2	6	38339	38344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083178
511	NC_011984	GGA	2	6	38380	38385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083178
512	NC_011984	AGC	2	6	38425	38430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083178
513	NC_011984	CTG	2	6	38461	38466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083178
514	NC_011984	GCC	2	6	38484	38489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083178
515	NC_011984	GCT	2	6	38632	38637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083178
516	NC_011984	CTG	2	6	38695	38700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083178
517	NC_011984	AGC	2	6	38741	38746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083178
518	NC_011984	GCA	2	6	38829	38834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083178
519	NC_011984	CGC	2	6	38898	38903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083178
520	NC_011984	GCC	2	6	38944	38949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083178
521	NC_011984	AGG	2	6	38960	38965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083178
522	NC_011984	CGA	2	6	39060	39065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083178
523	NC_011984	GCC	2	6	39109	39114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083178
524	NC_011984	AGA	2	6	39170	39175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083178
525	NC_011984	CTT	2	6	39330	39335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083178
526	NC_011984	TTC	2	6	39454	39459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083178
527	NC_011984	GAC	2	6	39474	39479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083178
528	NC_011984	GGA	2	6	39524	39529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083178
529	NC_011984	ATC	2	6	39532	39537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083178
530	NC_011984	CTG	2	6	39589	39594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083178
531	NC_011984	GCA	3	9	39702	39710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083178
532	NC_011984	GGC	2	6	39738	39743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083178
533	NC_011984	TGC	2	6	39845	39850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_011984	CAG	2	6	39970	39975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083179
535	NC_011984	AGT	2	6	40014	40019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083179
536	NC_011984	CGG	2	6	40054	40059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083179
537	NC_011984	CAG	2	6	40129	40134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083179
538	NC_011984	CAT	2	6	40191	40196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083179
539	NC_011984	GGC	2	6	40256	40261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083179
540	NC_011984	CGG	2	6	40445	40450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083179
541	NC_011984	GCT	2	6	40504	40509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083179
542	NC_011984	TCC	2	6	40510	40515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083179
543	NC_011984	TCT	2	6	40582	40587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_011984	GAC	2	6	40762	40767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083180
545	NC_011984	GCG	2	6	40775	40780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083180
546	NC_011984	TGC	2	6	40968	40973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083181
547	NC_011984	GCA	2	6	40992	40997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083181
548	NC_011984	GCC	2	6	41109	41114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083181
549	NC_011984	GTC	2	6	41121	41126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083181
550	NC_011984	TGC	2	6	41194	41199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083181
551	NC_011984	TTC	2	6	41200	41205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083181
552	NC_011984	GAC	2	6	41285	41290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083181
553	NC_011984	CGC	2	6	41334	41339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_011984	GGC	2	6	41347	41352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_011984	CAG	2	6	41380	41385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_011984	CGG	2	6	41388	41393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_011984	CGA	2	6	41450	41455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_011984	GTG	2	6	41579	41584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_011984	GCG	2	6	41651	41656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_011984	GAA	2	6	41766	41771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011984	CAA	2	6	41789	41794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_011984	GGC	2	6	41798	41803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_011984	CTG	2	6	41811	41816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_011984	TGA	2	6	41824	41829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_011984	ATC	2	6	41856	41861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_011984	GCA	2	6	41886	41891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_011984	CAA	2	6	41939	41944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_011984	CGC	2	6	42075	42080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_011984	ACA	2	6	42202	42207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083182
570	NC_011984	CGA	2	6	42267	42272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083182
571	NC_011984	GAT	2	6	42370	42375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083182
572	NC_011984	TGC	2	6	42541	42546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083182
573	NC_011984	CTG	2	6	42571	42576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083182
574	NC_011984	GTC	2	6	42595	42600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083182
575	NC_011984	CAC	2	6	42624	42629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083182
576	NC_011984	CCG	2	6	42687	42692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083182
577	NC_011984	GCT	2	6	42827	42832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083182
578	NC_011984	TGC	2	6	42886	42891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083182
579	NC_011984	TCC	2	6	42896	42901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083182
580	NC_011984	CTT	2	6	42907	42912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083182
581	NC_011984	TTC	2	6	42972	42977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083182
582	NC_011984	ATG	2	6	43146	43151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083182
583	NC_011984	GAC	2	6	43538	43543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083182
584	NC_011984	GTT	2	6	43727	43732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_011984	CGG	2	6	44003	44008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083183
586	NC_011984	CAA	2	6	44065	44070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083183
587	NC_011984	TTC	2	6	44165	44170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083183
588	NC_011984	GTG	2	6	44228	44233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083183
589	NC_011984	CGC	2	6	44234	44239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083183
590	NC_011984	GGC	2	6	44298	44303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_011984	CGC	2	6	44435	44440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083184
592	NC_011984	AAG	2	6	44486	44491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083184
593	NC_011984	TCC	2	6	44658	44663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083184
594	NC_011984	TCG	2	6	44665	44670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083184
595	NC_011984	CGC	2	6	44675	44680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083184
596	NC_011984	CGG	2	6	44821	44826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_011984	CTG	2	6	44898	44903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_011984	GCG	2	6	45240	45245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083185
599	NC_011984	GTT	2	6	45320	45325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083185
600	NC_011984	CGG	2	6	45334	45339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083185
601	NC_011984	GCC	2	6	45351	45356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083185
602	NC_011984	GTT	2	6	45357	45362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083185
603	NC_011984	CAG	2	6	45366	45371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083185
604	NC_011984	CAG	2	6	45374	45379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083185
605	NC_011984	TGC	2	6	45435	45440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083185
606	NC_011984	GGA	2	6	45460	45465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083185
607	NC_011984	CGA	2	6	45505	45510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083185
608	NC_011984	TCC	2	6	45540	45545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083185
609	NC_011984	GCC	2	6	45710	45715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083185
610	NC_011984	ACA	2	6	45750	45755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083185
611	NC_011984	CCG	2	6	45822	45827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083185
612	NC_011984	ATC	2	6	45905	45910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083185
613	NC_011984	TAG	2	6	46027	46032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011984	CCG	2	6	46084	46089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_011984	ATC	2	6	46090	46095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_011984	ACG	2	6	46150	46155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_011984	TGA	2	6	46175	46180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011984	ACG	2	6	46402	46407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_011984	TAC	2	6	46558	46563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_011984	GCG	2	6	46669	46674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083186
621	NC_011984	CGA	2	6	46679	46684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083186
622	NC_011984	GGA	2	6	46686	46691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083186
623	NC_011984	TCT	2	6	46706	46711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083186
624	NC_011984	CTT	2	6	46858	46863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083186
625	NC_011984	GGC	2	6	46908	46913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083186
626	NC_011984	GCC	2	6	47046	47051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_011984	GCG	2	6	47110	47115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083187
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